贵妃鸡MHC-B区域微卫星位点LEI0258遗传多样性研究

为研究贵妃鸡的遗传多样性,试验应用主要组织相容性复合体B区域（MHC-B）复合微卫星位点LEI0258测定了贵妃鸡的等位基因信息,结合已发表的序列,进行等位基因与核苷酸多态性、单倍型中介网络图分析。40份样品中共检测到9个等位基因,长度为193~297 bp,其中5个为贵妃鸡特有。观察杂合度（Ho）、期望杂合度（He）和多态信息含量（PIC）分别为0.625、0.716和0.666。3个等位基因与6种已知MHC血清型相匹配。基于侧翼区变异信息的中介网络图将等位基因分为5个进化枝,贵妃鸡9个等位基因分布于A和B进化枝中,这2个进化枝同样存在于红原鸡中。研究结果表明贵妃鸡保持着中等偏上的遗传多样性水平,可能起源于红原鸡。     

麒麟鸡MHC-B区域微卫星位点LEI0258遗传多样性研究

应用MHC-B区域复合微卫星位点LEI0258研究麒麟鸡的遗传多样性与进化,40份麒麟鸡样品用于等位基因与核苷酸多态性分析与构建中介网络图。共检测到12个等位基因,长度范围为193~489 bp,其中6个为麒麟鸡所特有。观察杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别为0.800、0.840和0.811。5个等位基因与11种已知MHC血清型相对应。联合已发表的序列,基于侧翼区变异信息的中介网络图将等位基因分为5个进化枝,麒麟鸡在这些进化枝均有分布,A、B和E进化枝同样存在于红原鸡中。结果表明麒麟鸡保持着较高的遗传多样性水平,提示可能存在多起源,其祖先为红原鸡。     

重庆地方鸡微卫星遗传多样性研究

为了研究重庆地方鸡品种的遗传多样性,试验采用将微卫星标记与荧光标记引物测序相结合的技术进行基因分型,计算各群体在每个位点上的等位基因频率,以及各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ne)。结果表明:在12个微卫星位点中共检测到88个等位基因,Ne在3.158 5～8.480 6之间,位点平均杂合度在0.416 7～0.875 0之间,品种平均杂合度在0.587 3～0.722 5之间,平均杂合度最高的是南川鸡,最低的是城口山地鸡;3个鸡品种在12个微卫星位点上的基因频率存在明显差异,H为0.659 9,PIC为0.741 2;聚类分析显示,南川鸡和大宁河鸡聚为一类,城口山地鸡独自聚为一类。     

边鸡微卫星DNA标记遗传多样性的研究

利用鸡基因组中5个微卫星标记,检测了边鸡群体的遗传多样性,并以大骨鸡做了比较分析。同时探讨了边鸡在国内5个地方鸡种中的系统地位。结果表明,5个微卫星位点共检测到38个等位基因,其中ADL0146位点的等位基因数最少(5个),而ADL0136和ADL0185两个位点的等位基因数最多(9个),平均等位基因数为7.6个.边鸡群体内比大骨鸡群体有更丰富的遗传多样性。聚类分析结果显示,边鸡与大骨鸡亲缘关系最近。而与鲁西斗鸡亲缘关系最远。     

四川白鹅微卫星遗传多样性研究

为了解四川白鹅的遗传多样性,揭示其群体内遗传结构,采用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,选用15个微卫星标记对分布在重庆地区的四川白鹅的基因型进行检测。结果表明:微卫星标记CKW 12、CKW 21和TTUCG5 3个位点共检测到10个等位基因;平均遗传杂合度为0.643 0,平均多态信息含量为0.580 5,呈高度多态。这3个标记均可用于四川白鹅的遗传多样性评估和分子辅助选择标记。     

贵妃鸡与麒麟鸡杂交后代公鸡生长性能测定

本研究以贵妃鸡（G）和麒麟鸡（K）为素材,比较贵妃鸡♂×麒麟鸡♀（GK）、麒麟鸡♂×贵妃鸡♀（KG）两种组合公鸡的体重、饲料报酬以及生长速率。结果表明：①体重：GK、KG组合的出壳重分别为34.76g和28.99g,差异极显著（P〈0.01）。16周龄GK、KG组合体重分别为1464.81g和1433.62g,差异显著（P〈0.05）;②饲料报酬：16周龄GK、KG组合公鸡的料重比分别为5.36和4.33。总体来讲,1-9周龄KG组合公鸡饲料转化率不如GK组合,而10-16周龄KG组合公鸡饲料转化率优于GK组合;③生长速率：GK组合公鸡的生长速率均高于KG组合,1周龄内的相对生长速率最大。随着日龄的增加,相对生长速率均呈现逐渐下降的趋势。     

微卫星荧光标记分析坝上长尾鸡与3个地方品种鸡遗传多样性

为评估坝上长尾鸡保种群的遗传结构和其他地方品种鸡的遗传关系,本研究利用20个微卫星DNA标记,采用微卫星荧光标记与毛细管电泳相结合的方法,检测了4个地方鸡品种共120个个体的遗传多样性。结果表明:20个微卫星位点中有19个微卫星位点均为高度多态,120个个体中共检测到253个等位基因,单个位点的等位基因数从4(MCW0103)~27(LEI0094)不等,平均为12.65。所有位点的平均期望杂合度和平均多态信息含量分别为0.697 5和0.673 6;所有群体均显示较高的期望杂合度,坝上长尾鸡最高,为0.747 2,太行鸡相对比较低,为0.698 0,平均遗传分化系数为0.098,群体内的近交系数为20.4%,杂合子缺失的水平不高;群体的Nei′s遗传距离从0.059 7(广西麻鸡-太行鸡)~0.689 0(北京油鸡-太行鸡)不等。UPGMA系统发生树中,广西麻鸡和太行鸡聚为一类,然后又于坝上长尾鸡聚在一起。北京油鸡独自聚为一类。UPGMA系统发育树结果与这些鸡品种的外貌形态相吻合。     

海南中蜂微卫星DNA遗传多样性研究

本研究利用微卫星DNA方法对海南中蜂蜜蜂群体多态性进行研究,评估品种内的遗传变异。结果共检测到55个等位基因,平均每个位点的等位基因数为11,单个位点的等位基因数从8到13不等。所有位点的平均PIC值与平均期望杂合度分别为0.7569(0.0330)与0.8577(0.0267)。表明海南中蜂群体具有较高的多态性,显示出丰富的遗传多样性和较高的选择潜力,可为分析遗传多样性提供充分的信息。     

中国热带地区三个鸡品种遗传多样性的微卫星分析

为了解中国热带主要鸡品种的遗传资源现状,应用21对微卫星引物,检测了文昌鸡、粤黄882和海南黎鸡3个群体,共138个体(公母各半)的遗传多样性水平.21个微卫星位点在三个群体检测的平均等位基因数为12.48,从3到32不等;三个群体平均遗传杂合度分别为0.840、0.768、0.825;多态信息含量分别为0.809、0.738、0.770,结果表明文昌鸡、粤黄882和海南黎鸡均具有较大的遗传变异,且遗传多样性较为丰富.为中国热带鸡品种资源保护与开发提供了科学依据.     

济宁百日鸡群体遗传多样性的微卫星标记分析

采用微卫星标记技术,在分布于家鸡的22条染色体的25对微卫星引物中,筛选出10对多态性丰富的微卫星位点,对60个个体的DNA多样性进行了检测。结果共检测到29个等位基因,每个微卫星座位的等位基因数目为2~5个,平均等位基因数为2.90,该鸡群的平均基因杂合度(H)为0.348,多态性信息含量(PIC)为0.511。表明所检测的济宁百日鸡群体的遗传多样性较丰富,具有一定的选择潜力,可以做进一步的选择利用。     

浦东鸡遗传多样性和进化的微卫星分子标记分析

利用15个微卫星DNA分子标记对浦东鸡及其它6个鸡品种的群体遗传多样性和进化关系进行了检测分析。结果表明,在15个微卫星位点上群体平均观测杂合度为0.5957,期望杂合度为0.6025,多态信息含量为0.5757;7个品种鸡群的遗传距离差异程度较大(0.1872～0.6003)。其中,浦东鸡同其它6个群体间存在显著的遗传差异。试验结果在一定程度上反映了浦东鸡独特的遗传组成和品种形成过程,而且所选择的15个微卫星DNA分子标记能够有效地分析鸡群的遗传基础。     

中国热带地区三个鸡品种遗传多样性的微卫星分析

为了解中国热带主要鸡品种的遗传资源现状,应用21对微卫星引物,检测了文昌鸡、粤黄882和海南黎鸡3个群体,共138个体(公母各半)的遗传多样性水平。21个微卫星位点在三个群体检测的平均等位基因数为12.48,从3到32不等;三个群体平均遗传杂合度分别为0.840、0.768、0.825;多态信息含量分别为0.809、0.738、0.770,结果表明文昌鸡、粤黄882和海南黎鸡均具有较大的遗传变异,且遗传多样性较为丰富。为中国热带鸡品种资源保护与开发提供了科学依据。     

江西7个地方鸡品种遗传多样性的微卫星分析

选用30个多态性较好的微卫星标记．检测了丝毛鸟骨鸡、康乐鸡、宁都三黄鸡、余干乌骨鸡、瓦灰鸡、崇仁麻鸡、东乡绿壳蛋鸡等江西省7个地方鸡品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度（h）、多态信息含量（PIC）、群体间的Nei氏标准遗传距离（Ds）和DA遗传距离。结果表明．30个微卫星位点中有24个微卫星位点在7个鸡群体中的多态信息含量均为高度多态．可作为有效的遗传标记用于鸡品种的遗传多样性和系统发生关系的分析；在7个品种中．杂合度最低的是余干乌骨鸡．为0．6155．杂合度最高的是崇仁麻鸡．为0．6525，各地方鸡品种的杂合度都偏高，反映了群体的遗传多样性非常丰富；7个鸡品种间的DA、Ds遗传距离远近关系一致．但DA距离均比Ds距离大；用UPGMA法对DA和Ds的聚类结果相同．7个鸡品种被聚为3类．余干乌骨鸡、瓦灰鸡、康乐鸡、宁都三黄鸡聚为一类．崇仁麻鸡、东乡绿壳蛋鸡聚为一类．丝毛乌骨鸡独自为一类。     

固始鸡不同品系及部分外来鸡种遗传多样性的微卫星分析

利用10个微卫星标记,对固始鸡5个系和4个非固始鸡品系共9个群体的等位基因频率、遗传杂合度、群体间的遗传距离等进行了分析,并根据遗传距离进行了聚类分析。结果表明:星红褐鸡与绿壳蛋鸡被聚为一类,固始鸡慢羽系与快羽系被聚为一类,固始鸡被聚为一大类,罗曼鸡自成一类,艾维茵鸡也自成一类。     

陇东绒山羊微卫星DNA遗传多样性的研究

利用9个微卫星座位,8％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳PCR扩增产物,对120只陇东绒山羊基因组DNA的遗传多样性进行了检测,对其群体遗传学特性进行分析。结果表明：陇东绒山羊在9个微卫星座位中共检测到90个等位基因,其中微卫星座位LSCV24等位基因数最多,为14个;BMS1248多态信息含量最高,PIC为0．88;DB6座位多态信息含量最低,PIC为0．79。在所标记群体中平均有效等位基因数为7．69±1．65个,平均多态信息含量为0．84±0．03;遗传杂合度均值为0．86±0．03,均高于国内外部分研究结果。说明陇东绒山羊品种遗传多样性丰富,群体遗传变异程度高,育种潜力大。     

布拖黑绵羊微卫星标记遗传多样性研究

本文旨在研究布拖黑绵羊群体的遗传特性,选择了位于绵羊染色体上的30个微卫星标记,统计等位基因、多态信息含量、杂合度等,分析布拖黑绵羊群体的遗传多样性。结果表明,布拖黑绵羊群体30个微卫星标记具有4~13个等位基因,平均为7.27个等位基因;30个微卫星标记的观察杂合度为0.3269~0.8846,平均为0.6269;期望杂合度为0.3620~0.8865,平均为0.6769;多态信息含量为0.3338~0.8660,平均为0.6257,显示布拖黑绵羊群体具有丰富的遗传多样性。     

利用微卫星标记分析乌骨大骨鸡的遗传多样性

利用微卫星标记分析了乌骨大骨鸡的遗传多样性和遗传结构,筛选了鸡基因组7条染色体上的7个微卫星标记位点,随机选取24羽乌骨大骨鸡个体,进行多态性检测,共检测到23个等位基因,每个座位等位基因数目从2个到5个不等,平均等位基因数为3.3个。该群体平均多态信息含量和平均杂合度分别为0.660 3和0.717 6。结果表明乌骨大骨鸡属多态性较丰富的群体。     

利用微卫星标记分析贵州5个地方鸡品种遗传多样性

通过选用30个多态性较好的微卫星标记,检测了贵州省5个地方鸡品种:竹乡鸡、威宁鸡、黔东南小香鸡、高脚鸡、乌蒙乌骨鸡的遗传多样性。计算了各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和群体间的DA遗传距离。结果表明:在5个品种中,杂合度最低的是高脚鸡,为0.501,杂合度最高的是竹乡鸡,为0.673,因此贵州各地方鸡品种的杂合度相差较大,据分析可能是由于交通闭塞,形成了家禽品种的多种多型,而且杂合度的高低与PIC值的大小体现了较高的一致性;用UPGMA法进行聚类分析,结果6个鸡品种被聚为3类:竹乡鸡、黔东南小香鸡和威宁鸡聚为一类,乌蒙乌骨鸡自聚为一类;高脚鸡独自聚为一类。这与几个鸡品种的来源、分化、选育历史及地理分布是一致的。     

基于线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)序列分析贵妃鸡的遗传多样性

采用PCR产物直接测序技术对30只贵妃鸡样品的线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)第Ⅰ高变区序列进行了分析。结果表明,在所分析的D-loop区部分序列中(520 bp),A、G、C、T平均含量分别为26.8%、13.0%、31.1%和29.1%;共发现13个核苷酸多态位点,均为转换位点,未检测到插入/缺失和颠换,核苷酸多样度(Pi)为0.0059,单倍型变异度(Hd)为0.538,中性检验Tajima’s D值为-0.67065。通过群体构建的NJ聚类图分子系统树发现,贵妃鸡起源于红原鸡。