玉米杂交种SSR标记纯度鉴定方法研究

以常规种子贮藏蛋白质电泳技术难以鉴定纯度的4个玉米杂交种、21个自交系和9对玉米SSR位点引物为材料,运用SSR分子标记技术分别筛选出适合这些不同杂交种纯度鉴定的SSR位点引物,建立了一套仪器设备要求相对较低、程序简单、较为快速地利用SSR标记进行玉米杂交种纯度鉴定的技术规程,并对利用SSR标记进行玉米杂交种纯度鉴定的可行性进行了分析。     

基于SNP分子标记的玉米杂交种基因型分析与纯度鉴定

为研究SNP 分子标记鉴定玉米杂交种纯度的方法,选用甘肃省推广的6 份玉米杂交种为试验材料,通过应用SNP 分子标记的KASP 技术鉴定玉米杂交种的基因型和纯度,试验结果为95.83%-98.96%之间,说明SNP 分子标记KASP 技术结果可靠,实现了高效率、高灵活性、简便快捷、低成本的技术优势,可以作为玉米杂交种纯度检测的新方法,并在今后基于SNP 标记的玉米品种分子鉴定中发挥越来越重要的作用,能够有效为我省乡村振兴战略背景下玉米制种品种质量监测技术研究提供技术参考。     

SSR分子标记鉴定玉米杂交种纯度的研究及应用综述

从玉米基因组DNA提取、引物的筛选、PCR反应体系优化、部分推广玉米品种纯度鉴定引物信息等方面综述了SSR分子标记在玉米杂交种纯度鉴定方面的研究及应用。     

玉米杂交种子纯度的SSR检测与田间鉴定的比较研究

为发展分子标记技术在玉米杂交种子纯度鉴定上的应用,文章对吉林省2005年玉米省级区试的30个品种进行了SSR分子标记的纯度分析,筛选出11时多态性好的引物,并与田间纯度鉴定结果进行了比较.通过相关分析和差异显著性分析表明:SSR鉴定的(平均)纯度与田间纯度鉴定结果较为一致,相关系数达到0.798,而且两者无显著差异,因此,SSR分子标记可以用于玉米田间纯度的鉴定;引物umc1069和引物umc2373所标记的结果能较好的代表田间纯度鉴定的结果.     

利用SSR分子标记鉴定甜瓜杂交种纯度

以2个甜瓜杂交种东之星、含香雪及其亲本为材料,利用SSR标记对2组杂交种进行纯度鉴定。从供试的72对SSR引物中筛选到亲本间具有多态性的引物,东之星为3对,含香雪为3对,其中1对引物在2个杂交种的亲本间均存在多态性。对2个杂交种东之星和含香雪分别用筛选出的3个多态性的SSR引物进行甜瓜杂交种子纯度鉴定,鉴定结果分别为992%和972%。     

山西省主推玉米杂交种纯度鉴定SSR核心引物的筛选

选用10对SSR核心引物对18份山西省玉米杂交种进行DNA指纹分析,并综合考虑多态性和杂合率,认为umc1590和umc1196这2对引物可鉴定17个品种纯度,phi402893,phi102228,phi233376,p-phi072,umc1066和phi022也可作为纯度鉴定的引物。建议采用umc1590,phi402893,phi233376,phi022这4对引物对18个杂交种纯度进行检测。     

SSR分子标记鉴定青花菜杂交种‘津青一号’的纯度

以青花菜新品种‘津青一号’及其亲本为试验材料,用SSR分子标记技术鉴定杂交种种子纯度,从50对SSR引物中,筛选出了1对在杂交种和父、母本之间存在显著差异的引物(L21),该引物扩增片段电泳条带清晰可辨,且杂交种含有父、母本的特异互补带型。利用该引物对108株‘津青一号’杂交种进行纯度鉴定,结果为96.30%,与大田形态鉴定结果 98.15%相比,SSR标记与大田种植鉴定结果基本一致。这表明,引物L21可用于‘津青一号’的纯度鉴定。     

基于SSR分子标记的普通丝瓜杂交种子纯度鉴定

为了建立一种高效、准确的普通丝瓜品种纯度检测方法,以普通丝瓜丝盛2号及其亲本为试验材料,利用SSR分子标记技术鉴定杂交种种子纯度,从106对SSR引物中筛选出1对引物(SGSSR4),其在杂交种和双亲之间存在显著差异条带,且杂交种含有父、母本的特异互补带型。利用该引物对26株丝盛2号杂交种进行纯度鉴定,鉴定结果为96.15%,与大田种植鉴定结果一致,表明该引物可用于丝盛2号杂交一代种子纯度的快速检测和准确鉴定。     

应用SSR标记技术鉴定玉米杂交种的纯度

以利用常规盐溶蛋白电泳技术难以进行纯度鉴定的强盛1号玉米杂交种及相应亲本自交系和6对玉米SSR位点引物为材料,筛选出适合该杂交种纯度鉴定的SSR位点引物,结果表明,bilg 116引物的扩增产物呈现双亲互补的特征谱带,易于区分杂交种和亲本自交系。并通过对单子粒DNA提取等技术环节的改进,建立了一套简单、快速、准确、可靠的种子纯度鉴定方法。     

杂交水稻种子SSR分子标记纯度鉴定

该研究优化了SDS的DNA提取方法,采用SSR分子标记技术建立了一种准确、稳定、快捷、规模化的杂交水稻种子纯度检测流程,为大规模杂交水稻种子纯度检测提供了高效简便的方法.     

茄子SSR多态性标记筛选及杂交种纯度鉴定

[目的]建立一套快速、准确、高效的茄子杂交种纯度鉴定方法,为其制种过程中除伪存真及大面积推广应用提供技术支持.[方法]挑选已公布的48对SSR引物对2个茄子杂交种15-16和1-7的亲本进行多态性标记筛选,选取有效引物对茄子杂交种进行纯度鉴定,并结合田间植株纯度鉴定,验证SSR分子标记纯度鉴定的有效性.[结果]在48对SSR引物中,有12对引物在杂交种15-16亲本材料中存在多态性,其多态性引物带型呈互补带型的有8对(SM14、SM15、SM17、SM20、SM29、SM30、SM34和SM45);有5对引物在杂交种1-7亲本材料中存在多态性,其多态性引物带型呈互补带型的有4对(SM15、SM20、SM24和SM29).分别选取2对呈互补带型的SSR引物进行杂交种纯度鉴定,结果显示杂交种15-16和1-7的纯度分别为99%和100%,与田间种植鉴定结果一致.[结论]采用SSR分子标记检测茄子杂交种纯度具有准确、高效的特点,可为茄子杂交制种过程中真假杂种鉴定提供技术支持.     

玉米自交系遗传多样性的SSR分析

对33个不同来源的玉米自交系的遗传多样性进行SSR分析,其结果为,自交系间遗传距离在0.1763-0.9490,平均为0.3228。除贞367遗传距离为大于0.90外,其他32个的遗传距离均小于0.51,表明玉米自交系间遗传基础狭窄。33个自交系的遗传距离按类平均法可聚为6类,其中Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ类又分为两个亚类。提高玉米的杂种优势利用水平,必须丰富亲本的遗传基础,扩大其遗传差异。     

宁夏常用玉米自交系的SSR遗传分析

[目的]对宁夏常用的82份玉米（Zea may L.）自交系进行遗传分析,划分自交系类群,以提高玉米育种效率。[方法]利用SSR标记中可用于遗传多样性分析的20对SSR引物对材料进行分析。[结果]82份自交系中共检测出335个等位基因,其中具有多态性的为108个,每对引物检测出3～10个多态性位点,平均为5.4个。SSR引物的多态性信息量（PIC）介于0.523 3～0.858 9,平均为0.7123。[结论]82份自交系划分为5个类群,分类结果基本与系谱来源一致。     

SSR标记技术在甘蓝型油菜杂交种纯度鉴定中的应用

利用简化的SSR标记技术对甘蓝型油菜杂交种丰油701、丰油730和湘杂油4号的制种样进行纯度分析,并将丰油701收获样各单株的SSR分析结果与其育性表现进行了比对.结果筛选了38对SSR引物,其中引物Na10-D09在3个品种的不育系与恢复系间的扩增片段大小均存在差异.种植鉴定和SSR鉴定的纯度比较分析表明,SSR技术得到的纯度鉴定结果较种植鉴定的结果更为可靠.     

玉米杂种优势类群划分高多态SSR引物筛选

【目的】 研究玉米杂种优势类群划分高多态SSR引物筛选。【方法】 遴选均匀分布在玉米10个连锁群上160对SSR引物,在104份玉米自交系DNA中扩增,根据引物的染色体分布和PIC值,分别取40、30、20和10对高多态引物建立4套新引物体系,检测104份自交系的分类效果。【结果】 (1)160对引物中的63对引物带型稳定,多态性高,最高PIC值0.762 3,高于过去常用核心SSR引物,63对引物中过去常用核心SSR引物仅保留40%左右;(2)4套引物体系中,40和30对引物体系的分类结果与已知自交系类群高度吻合,20对体系与40对体系比较具90.5%一致性,10对体系与40对体系比较的一致性81.0%;(3)40对体系分类104份材料为5大类群,分别是瑞德、改良瑞德、兰卡斯特、黄改和和旅大红骨,与目前国内利用的优势群划分结果一致,也能鉴别出每个群中亲缘关系最远的亚群是相近群间二环系来源的混合基因型;(4) 各群的代表自交系是单一遗传结构成分,亚群是多遗传结构成分。【结论】 部分SSR引物的多态性在新自交系中会出现下降,建立的新的40对引物体系有精确的分类功能,可应用于类群划分,20对体系的分类精确性稍低,但检测工作量减半,在批量材料分类中有利用价值。     

与黄麻炭疽病抗性相关的SSR分子标记筛选及新型SNP标记开发

为筛选出与黄麻炭疽病抗性相关的新型分子标记,本研究在前期黄麻炭疽病抗性QTL定位结果的基础上,开发出7对可能与黄麻炭疽病抗性基因连锁的新型SNP标记.同时,在前期对重组自交系群体进行田间炭疽病抗性鉴定的基础上,分别以6个抗病株系和6个感病株系的基因组DNA构建了抗池和感池.以抗、感池的DNA为模板,对36对SSR引物和7对SNP引物进行了多态性筛选,从中初步筛选出具有多态性的SSR引物15对,SNP引物2对.继而,分别以12份抗病和感病株系的基因组DNA为模板,对上述具有多态性的SSR和SNP引物进行进一步验证,最终获得1对与黄麻炭疽病抗性相关的SNP标记,其产生的多态性片段大小约为600 bp.     

SSR分子标记在玉米品种真实性鉴定上的应用

跟田间种植鉴定相比,SSR 分子标记鉴定品种真实性具有快速、准确、不受环境影响等特点,是打击套 牌侵权、维护品种权人合法权益的有效途径。利用20 对核心引物对玉米品种进行真实性鉴定,有9 对核心引物扩增 产物出现明显差异,11 对核心引物扩增产物没差异,表明利用SSR 分子标记鉴定玉米品种真实性是可行的。     

利用SSR标记鉴定玉米杂交种南校18号种子纯度

以南校18号玉米杂交种及其亲本自交系为材料,对胚芽和干种子的DNA进行提取,对24对SSR引物进行筛选,获得适合该杂交种纯度鉴定的SSR引物。结果表明,在快速检测中,从干种子胚提取DNA更加便捷、快速,无DNA降解,可用于PCR扩增反应;24对SSR引物中,有3对特异性引物6mmc0241、umc2025、phi323152可用于南校18号杂交种和亲本自交系的纯度鉴定。因此,应用SSR标记结合单籽粒DNA快速提取方法,可以快捷、准确地鉴定玉米杂交种种子纯度。     

A genetic linkage map with 178 SSR and 1901 SNP markers constructed using a RIL population in wheat (Triticum aestivum L.)

The construction of high density genetic linkage map provides a powerful tool to detect and map quantitative trait loci(QTLs) controlling agronomically important traits. In this study, simple sequence repeat(SSR) markers and Illumina 9K i Select single nucleotide polymorphism(SNP) genechip were employed to construct one genetic linkage map of common wheat(Triticum aestivum L.) using 191 recombinant inbred lines(RILs) derived from cross Yu 8679×Jing 411. This map included 1 901 SNP loci and 178 SSR loci, covering 1 659.9 c M and 1 000 marker bins, with an average interval distance of 1.66 c M. A, B and D genomes covered 719.1, 703.5 and 237.3 c M, with an average interval distance of 1.66, 1.45 and 2.9 c M, respectively. Notably, the genetic linkage map covered 20 chromosomes, with the exception of chromosome 5D. Bioinformatics analysis revealed that 1 754(92.27%) of 1 901 mapped SNP loci could be aligned to 1 215 distinct wheat unigenes, among which 1 184(97.4%) were located on o ne single chromosome, and the rest 31(2.6%) were located on 2 to 3 chromosomes. By performing in silico comparison, 214 chromosome deletion bin-mapped expressed sequence tags(ESTs), 1 043 Brachypodium genes and 1 033 rice genes were further added onto the genetic linkage map. This map not only integrated genetic and physical maps, SSR and SNP loci, respectively, but also provided the information of Brachypodium and rice genes corresponding to 1 754 SNP loci. Therefore, it will be a useful tool for comparative genomics analysis, fine mapping of QTL/gene controlling agronomically important traits and marker-assisted selection breeding in wheat.     

杂交稻种子纯度的SSR分子检测及应用研究

利用SSR标记构建了15份恢复系和11份不育系共26份籼型杂交水稻亲本的DNA指纹图谱,筛选出了冈优725和Ⅱ优838两个杂交种亲本的共显性SSR标记。同时对四川省6家种子企业生产的两个杂交水稻品种冈优725、Ⅱ优838及其亲本进行田间和SSR标记纯度鉴定。结果表明两种鉴定方法无显著差异,均可应用于种子纯度检测,但分子标记纯度检测的结果更准确、可靠。不同来源的种子纯度存在显著差异,6家种子企业提供的亲本及杂交种的纯度普遍较低,多数未达国家标准。