连翘叶片总DNA提取方法的比较

以连翘[Forsythia suspensa(Thunb.)Vahl]的新鲜叶片为材料,分别采用CTAB法、高盐低pH法和SDS法3种不同方法提取其总DNA,用琼脂糖凝胶电泳检测获得的DNA的质量,以期从中找出提取连翘总DNA的最适方法。结果表明对于连翘的新鲜叶片,无论从产率上还是质量上,CTAB法都明显优于其他两种方法。     

金柑叶片和果实总DNA提取方法比较

为了研究不同提取方法对金柑总DNA提取质量的影响,以融安金柑等3个金柑品种的叶片和果实为材料,采用SDS提取法、CTAB提取法、试剂盒法提取金柑总DNA,并对所提取DNA的总浓度、A_(260/280)、A_(260/230)、凝胶电泳结果、SCo T扩增产物进行比较分析。结果表明:CTAB提取法和试剂盒提取法能较好地去除金柑叶片和果实中的蛋白质、RNA、多酚、多糖、单宁、色素等大分子物质以及盐类等小分子杂质。提取的总DNA浓度最高达178 ng/μL,A_(260/280)在1.82~1.94之间,A_(260/230)在1.89~2.04之间。SDS提取法、CTAB提取法和试剂盒提取法所提取的金柑叶片和果实总DNA的扩增效果图谱清晰,多态性高。3种提取方法中,CTAB提取法所提取总DNA浓度较高,纯度最好,可用于后续相关研究。     

无患子总DNA提取方法研究

针对无患子富含多酚、多糖、蛋白质及其他次生代谢物质的特点,以无患子叶片为材料,分别采用改良的CTAB法和CTAB与SDS相结合法提取不同种源无患子的总DNA。结果显示,改良的CTAB法提取的总DNA,得率较高,纯度好,可用于酶切、PCR扩增等后续试验,并能获得清晰、稳定的扩增产物。而采用CTAB与SDS相结合的方法得到的基因组DNA效果不稳定,无法检测出DNA。改良的CTAB法具有简单、经济的特点,可用于无患子总DNA的提取,成功地进行SRAP分子标记分析,为研究无患子遗传资源多样性奠定基础。     

核桃总DNA提取方法研究

研究了适于核桃基因组DNA的提取方法,并对DNA初步进行了质量检测,结果表明此方法可有效去除次生物质对DNA的干扰,可用于随机引物RAPD扩增和随后的各种遗传学分析.     

芒果属植物叶绿体DNA提取方法的研究

为了探究不同提取方法对芒果属植物叶绿体DNA提取质量的影响,以芒果和扁桃的成熟叶片为材料,比较植物叶绿体DNAout试剂盒法和高盐-低p H法分离叶绿体及提取叶绿体DNA效果。结果表明:叶绿体DNAout试剂盒法能够较好地去除蛋白质、酚类、多糖等代谢物质,OD260/OD230大于2.000,OD260/OD280在1.800~1.900之间。高盐-低p H法提取叶绿体DNA产率高达75.8 ng/μL,远大于叶绿体DNAout试剂盒法提取叶绿体DNA最高产率42.8 ng/μL,2种方法所得模板电泳图和SSR标记图谱谱带完整性皆好。显微镜下观察叶绿体,2种方法都可以得到杂质少、背景清晰的叶绿体显微成像效果,但高盐-低p H法提取的叶绿体细胞器密度更高。2种方法获得的叶绿体DNA均可满足后续研究工作的需要。     

大叶栎总DNA两种提取方法的比较

对大叶栎的总DNA两种提取方法进行对比试验,从外观、浓度、A260/A280、A260/A230、电泳检查和ISSR扩增对所提取到的DNA进行对比,结果显示用改良CTAB法提取的DNA在各方面都达到ISSR扩增的要求,是大叶栎总DNA提取的较好方法。     

平菇DNA不同提取方法比较

以野外采集的平菇为样本,经菌丝培养后,用FDEB法、FDEB-CTAB法、改良CTAB法和改良SDS法提取DNA,并进行琼脂糖凝胶电泳检测、紫外分光光度计分析和标准差及标准误分析,结果表明:FDEB法提取的平菇DNA产率最高,但存在较严重RNA的污染,标准差和标准误比较大,稳定性差;改良CTAB法综合效果不错,提取稳定性高;改良SDS法提取的平菇DNA的纯度最好,标准差和标准误最低,提取效果稳定性最好,但产量相对较低;FDEB-CTAB法提取平菇DNA,去多糖的效果很好,标准差和标准误适中,但产量较低。综合以上结果,改良CTAB法提取蘑菇DNA综合效果最好。     

不同方法提取三种生态型沙地云杉总DNA的比较

沙地云杉为内蒙古特有树种,干旱适应性强,是我国西部重要造林树种。在长期适应干旱生态条件的过程中沙地云杉形成了紫果型、绿果型和红果型3种生态型。前期研究证明:紫果型沙地云杉有更强的抗旱能力,绿果型抗旱能力弱,红果型处于二者之间,是一个比较典型的过渡类型。本文从分子生物学的角度,详细叙述了沙地云杉总DNA的提取过程、方法,并对已知的植物DNA提取方法作了针对性的改良;对实验过程提取DNA的影响作了分析。为今后针对进行沙地云杉的植物基因研究和生物工程打下基础,对扩大沙地云杉造林面积和西部大开发的生态环境建设具有重要的指导意义。     

福建山樱花总RNA提取方法比较分析

以福建山樱花嫩叶为试验材料,采用Trizol法、CTAB法、CTAB-Li Cl法、百泰克试剂盒法和天根试剂盒法5种方法提取福建山樱花叶片RNA,用琼脂糖凝胶电泳检测总RNA的完整性,以微量紫外分光系统检测总RNA的纯度和浓度。结果表明:Trizol法和天根试剂盒法不适于福建山樱花叶片RNA的提取;CTAB法和百泰克试剂盒法提取的RNA完整性好,纯度及浓度高,但百泰克试剂盒法提取的RNA有DNA污染;CTAB-Li Cl法提取的RNA浓度低,且含杂质。RT-PCR试验结果进一步表明CTAB法提取的RNA能够用于后续的分子生物学研究,是福建山樱花叶片RNA提取的最佳方法。     

不同提取方法的铁线莲属叶片总DNA提取效果

以铁线莲属植物的叶片为材料,采用CTAB-SDS法、简易CTAB法、改良CTAB法等3种提取方法,比较耗时、纯度、得率、浓度和质量等指标,以期为铁线莲属植物叶片总DNA的提取筛选适宜方法.结果表明,在纯度和浓度方面CTAB-SDS法＞简易CTAB法＞改良CTAB法,在节省提取时间方面改良CTAB法＞CTAB-SDS法＞简易CTAB法.以CTAB-SDS法所提取的9种铁线莲DNA为模板,进行PCR扩增,CTAB-SDS法提取的DNA得率高、质量好,PCR扩增成功率也较高.综合比较,采用CTAB-SDS法进行铁线莲属叶片总DNA提取效果更佳.     

木本植物根系总RNA提取方法的比较和分析

以杂种马褂木不定根和杨树、柳树、柽柳根系组织为材料,比较异硫氰酸胍法、Tiangen试剂盒、CTAB改良法、Trizol法和改良Trizol法提取总RNA的效果。结果表明,改良Trizol法通过在离心后的匀浆上清液中加入低浓度的无水乙醇以及结合后续的高盐溶液,能有效去除多糖,提取的RNA中28S rRNA亮度约为18S rRNA的两倍,OD260/OD280值介于1.7～2.1之间,各林木树种根系组织RNA得率均大于150μg/g,而且整个提取时间只要2～3 h。表明改良Trizol法方便、快捷、高效,完全适用于林木树种根系组织RNA的提取。     

不同提取方法对厚朴叶片总DNA提取效果的影响

以厚朴(Magnolia officinalis Rehd.et Wils)叶片为材料,采用SDS-CTAB结合法、高盐低pH值法、CTAB法、SDS法等4种方法分别对2种方法保存的样品及对照样(鲜叶)进行了基因组DNA提取效果的比较,并进行ISSR-PCR检测。结果表明:4种方法均能从厚朴叶片中获得高质量的DNA,其中以SDS-CTAB结合法所得的DNA纯度最高,高盐低pH值法次之,CTAB法提取的厚朴叶片DNA纯度最低;高浓度NaAc的引入及相应的冻融,可以提高所得厚朴基因组DNA的纯度;硅胶干燥和-70℃超低温保存的样品与鲜叶相比,所提DNA的质量无明显差异,均能满足PCR扩增的要求。     

山核桃基因组DNA提取方法的比较研究

植物体内所含的蛋白质、单宁、酚类、多糖及色素等次生代谢物质影响TaqDNA聚合酶的活性,是导致PCR扩增反应失败的主要因素。以山核桃嫩叶为材料,对分别用经过改良的SDS法、改良的CTAB法、简易CTAB法及改良的高盐低pH法提取的基因组DNA进行检测比较,结果显示,改良的SDS法更适合于山核桃基因组DNA的提取,此方法提取的DNA能很好地用于PCR扩增。     

华山松针叶基因组DNA不同提取方法比较

以华山松(Pinus armandi)针叶为实验材料,分别采取经典CTAB法、简易CTAB法、改良CTAB法和Zigenhagen法提取华山松基因组DNA,并通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计分析、标准差和标准误、卡方检验和SPSS软件分析。通过对实验数据进行卡方检验,所有数据的差异是由DNA提取方法所引起的,不是偶然误差造成的。对(OD260-OD320)/(OD280-OD320)的标准差和标准误分析表明:改良CTAB法的标准差和标准误最小,经典CTAB法次之,再其次是简易CTAB法,说明改良CTAB法稳定性最好,数据精确度最好。通过紫外分光光度计和SPSS分析,经典CTAB法存在RNA污染,(OD260-OD320)/(OD280-OD320)的比值大于1.90,简易CTAB法和Zigenhagen法存在少量蛋白质污染,(OD260-OD320)/(OD280-OD320)的比值小于1.80,而改良CTAB法(OD260-OD320)/(OD280-OD320)的比值是1.855,接近理论值(1.80),且标准差和标准误最小,数据稳定性和精确性最好,提取DNA纯度最好。     

平邑甜茶基因组DNA提取方法的比较

为获得高质量的基因组DNA,以平邑甜茶及其与扎矮山定子杂交所得四倍性矮生后代33#、45#新鲜叶片为试材,分别采用常规CTAB法、改良的CTAB法和基因组试剂盒法提取平邑甜茶总DNA,进行琼脂糖凝胶电泳,使用核酸蛋白仪对DNA质量和纯度进行检测。结果表明:利用基因组试剂盒法、常规CTAB法和改良CTAB法均可获得DNA,但获得的DNA质量和纯度存在一定的差异。试剂盒法和CTAB法可以获得较高质量的DNA。但由于基因组试剂盒法成本相对较高,改良CTAB法较耗时,建议采用常规CTAB法提取平邑甜茶及其杂交后代33#、45#品种基因组DNA。     

槭属树种DNA提取方法比较研究

采用3种DNA提取方法对8种槭属树种基因组DNA进行质量、浓度和纯度对比研究,结果表明,3种方法提取的基因组DNA差异较大,浓度由高到低依次为改良CTAB法TIANGEN试剂盒法改良SDS法;提取的基因组DNA纯度为TIANGEN试剂盒法CTAB法SDS法。3种方法中TIANGEN试剂盒法提取的槭属树种基因组DNA含有的杂质最少,但成本较高;改良CTAB法提取的基因组DNA质量、浓度和纯度均优于改良SDS方法,适用于槭属树种的后续研究。     

菠萝叶片总RNA提取方法的比较

为了探究不同提取方法对菠萝叶片组织总RNA提取质量的影响,以‘台农16号’菠萝品种的叶片为材料,采用改良Tirs-硼酸法、改良SDS法、试剂盒法提取菠萝叶片组织总RNA,并对提取的总RNA浓度、OD260/OD230、OD260/OD280、琼脂糖电泳结果进行了比较分析。结果表明:改良Tris-硼酸法和试剂盒法能较好地去除菠萝叶片组织的多糖、皂苷元、蛋白质以及纤维等次生代谢物质,OD260/OD230大于2.000,OD260/OD280在1.900~2.100之间。改良SDS法提取总RNA产率最高,达到290.9μg/m L。试剂盒法提取总RNA产率为30.1μg/m L,远小于其它2种提取方法所得总RNA产率。改良Tris-硼酸法所得电泳图谱条带完整度最好。比较分析3种提取总RNA方法的结果,以改良Tris-硼酸法提取总RNA的效果较理想,可满足后续研究工作的需要。     

枣花蕾总RNA提取方法的比较

为了探究枣花蕾总RNA提取的最优方法,以沾化冬枣的花蕾为材料,利用改良CTAB法、Trizol法和2种RNA提取试剂盒(PureLinkTMRNA小提试剂盒和北京奥莱博生物技术有限公司提供的植物RNA提取试剂盒)分别提取花蕾的总RNA,并对RNA浓度和电泳图谱进行比较分析,利用奥莱博生物技术有限公司提供的植物RNA提取试剂盒法可提取到纯度较高,完整性好的总RNA,并可用于Northern杂交、cDNA文库构建和半定量RT-PCR等分子生物学试验。     

金柑果肉组织总RNA提取方法比较

为给高通量测序等对RNA质量要求较高的后续试验提供基础,以‘桂金柑一号’等5个金柑品种的果实为材料,采用异硫酸胍提取法、CTAB提取法、SDS提取法、试剂盒提取法提取金柑果实总RNA,并对所提取的总RNA浓度、A260/A280、A260/A230、凝胶电泳结果、RT-PCR扩增产物等指标进行比较分析。结果表明:CTAB提取法、SDS提取法和试剂盒提取法能较好地去除金柑果实中的蛋白质、金柑甙、柠檬萜、DNA、多酚、多糖、单宁、色素等大分子物质以及盐类等小分子杂质。采用异硫酸胍提取法所提取的总RNA浓度最高,达到95.9μg/g,其A260/A280在1.69～1.73之间,A260/A230 2.14;其它RNA提取方法所提取的总RNA浓度最高达到76.9μg/g,其A260/A280分布在1.88～1.97之间,A260/A230分布在2.00～2.09之间,符合高质量RNA的要求范围。除了异硫酸胍提取法所提取的RNA琼脂糖电泳结果未见清晰的5S条带,其余方法所提取的RNA经琼脂糖电泳均可以观察到清晰的28S、18S、5S条带。但采用异硫酸胍提取法、CTAB提取法、SDS提取法和试剂盒提取法所提取的金柑果实总RNA进行反转录均可以得到清晰的扩增产物。在4种提取方法中,采用CTAB提取法所提取金柑果实总RNA浓度较高,纯度也较理想,琼脂糖电泳和RT-PCR效果好,是进行后续相关研究的较佳选择。     

两种方法提取杏基因组DNA的比较

以改良CTAB法和改良SDS法提取辽杏等6个杏品种的基因组DNA。经检测,结果表明:两种方法均可提取到较高质量的杏基因组DNA,可用于SSR-PCR扩增,满足后续分子生物学研究需要。改良CTAB法提取的各品种DNA产率和纯度具有更高的稳定性,因此,更适用于杏基因组DNA的提取。