蛋白质相互作用的表征手段与结构域研究进展

经典的蛋白质相互作用的研究方法包括遗传学方法、分子生物学方法和生物物理学方法。随着物理学、化学和信息学技术的不断渗透,有些新兴技术突飞猛进,这些技术很可能在蛋白质相互作用的研究领域中发挥重要作用。另外,一些结构域介导了某些蛋白质的相互作用,受到了越来越多的关注。     

蛋白质相互作用数据库系统的设计与实现

蛋白质相互作用的研究是当前生命科学的前沿和热点,随着研究逐渐深入,已经产生了大量的实验数据。为了保存、利用这些宝贵的数据,给有关研究工作提供一个便捷的工具,基于Apache、MySQL、CakePHP开发环境,初步构建了蛋白质相互作用数据库系统,具备信息远程增、删、改、查功能,并优化了人机界面,从而为设计功能更加强大的蛋白质相互作用数据库研究平台创造了有利条件。     

蛋白质相互作用数据库系统的设计与实现

蛋白质相互作用的研究是当前生命科学的前沿和热点,随着研究逐渐深入,已经产生了大量的实验数据。为了保存、利用这些宝贵的数据,给有关研究工作提供一个便捷的工具,基于Apache、MySQL、CakePHP开发环境,初步构建了蛋白质相互作用数据库系统,具备信息远程增、删、改、查功能,并优化了人机界面,从而为设计功能更加强大的蛋白质相互作用数据库研究平台创造了有利条件。     

蛋白质相互作用网络研究的引文分析

目的：通过对蛋白质相互作用网络文献的同被引分析,得出其研究热点。方法：下载SCI数据库中蛋白质相互作用网络文献及其引文,统计引文频次,取被引频次超过33、累计百分比约为10%的58篇文献作为高被引论文,对来源-引文矩阵进行层次聚类分析,利用Ucinet软件对高被引文献的同被引矩阵进行k核分析,阅读文献得到该主题的研究热点。结果：高被引文献聚类分析得到6个研究热点。结论：蛋白质相互作用网络的热点主要集中于蛋白质相互作用网络数据的分析处理、生物网络中功能模块的研究、蛋白质相互作用的数据库建立、蛋白质相互作用网络拓扑结构的分析、关于蛋白质相互作用数据的分析软件、蛋白质相互作用网络的预测。     

蛋白质相互作用检测新方法——蛋白片段互补

介绍了报告蛋白互补(Protein Complementation Assay,PCA)的原理,对PCA关键步骤报告蛋白的选择进行了说明,并详细阐述PCA方法的应用。     

枸杞叶黄酮与不同蛋白质的相互作用及体外抗氧化活性比较

采用自由基诱导法制备蛋白质—枸杞叶黄酮复合物，通过紫外光谱、荧光光谱、傅里叶变换红外光谱、电镜等方法表征5种蛋白质（醇溶蛋白、大豆蛋白、酪蛋白、牛血清蛋白和乳清蛋白）与枸杞叶黄酮共价结合前后蛋白质结构的变化并进行了抗氧化性的分析。结果表明，5种蛋白质都与枸杞叶黄酮发生了不同程度地相互作用，并使蛋白质的结构发生改变。枸杞叶黄酮与蛋白质共价结合，导致蛋白质荧光淬灭，改变了酪氨酸或色氨酸数量。傅里叶变换红外光谱中酰胺A带、Ⅰ带、Ⅱ带的特征峰发生偏移，表明蛋白质在共价复合枸杞叶黄酮后二级结构发生了改变。扫描电镜直观显示了共价复合物微观结构的变化，可形成球状、片状、棒状或不规则颗粒状。综合比较发现，醇溶蛋白、乳清蛋白与枸杞叶黄酮结合能力较强，对蛋白质的二级结构影响较大，且体外抗氧化活性较强。研究结果为进一步分析枸杞叶黄酮与蛋白质共价复合物的性质以及枸杞叶黄酮类化合物作为天然抗氧化剂的应用提供理论基础。     

蛋白质互作技术研究进展

蛋白质作为细胞活性及功能的执行者,以复杂有序的动态互作协调着细胞的增殖与分化、衰老与死亡以及环境应答等各种重要生理过程。重点介绍了酵母双杂交系统、双分子荧光互补、噬菌体展示技术、荧光共振能量转移技术、谷胱甘肽巯基转移酶融合蛋白沉降技术、免疫共沉淀技术等蛋白质互作研究技术的原理及在生物学中的应用,以及生物信息学在蛋白质互作研究中的应用,并对目前及未来蛋白质互作技术的发展方向进行了探讨。     

农药相互作用研究进展

从农药相互作用类型、相互作用机制及相互作用结果的影响因子三方面对农药相互作用研究进展作了综述 .为充分发挥农药在农业可持续发展战略中的作用 ,应继续开展农药相互作用研究 .     

基于序列功能注释的蛋白质相互作用预测方法研究

蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)是大多数细胞过程和生物功能的基础.该研究基于蛋白质功能注释方法(FNM)首次提出了结合蛋白的重要性的方法、结构域相互作用、基因本体论注释序列和注释;然后融合不同的策略,分别建立了3种方法结合的蛋白质序列特征与FNM功能注释功能.利用蛋白质相互作用预测构建蛋白质相互作用网络是进一步理解蛋白质功能的必要前提,也是理解细胞新陈代谢及复杂疾病形成发生的基础和关键.     

蛋白质互作组学技术及其在植物 研究中的应用进展

蛋白质互作组学技术是一门鉴定和量化蛋白质与其他代谢物或蛋白质等分子相互作用的前沿技 术,已成为研究植物系统生物学和多组学研究的重要组成部分。近年来,基于质谱的组学技术迅速发展,也促 进蛋白质 - 代谢物相互作用（Protein-metabolite interaction, PMI）、蛋白质 - 蛋白质相互作用（ Protein-protein interaction, PPI）的发现和验证方法取得巨大进步 , 这些蛋白质互作组学技术在功能基因组和功能代谢组研究中 逐渐展示出巨大的应用潜力。系统总结了过去 10 年不同蛋白质互作组学技术（主要包括 PMI 和 PPI）的分析策略, 并详细分析了它们各自的优缺点和适用的相互作用类型,综述了蛋白质互作组学技术在植物研究领域的应用进 展,对植物蛋白质互作组学技术的应用策略和需要攻克的关键技术瓶颈进行了总结。蛋白质互作组学技术的不 断发展将进一步推动植物胞内信号转导及代谢调控通路的解析,而精准解析信号网络中关键相互作用将为植物 自身生长发育以及适应外界环境等机制研究提供重要的信息。     

嫁接树砧穗互作研究进展

从砧木对接穗和接穗对砧木两个方面概括作物砧穗互作研究成果．并提出今后砧穗互作的研究方向。     

玉米螟综合防治技术研究进展

综述了玉米螟防治方法,着重介绍玉米螟的农业防治、抗虫育种、物理防治、生物防治和化学防治技术的研究现状,并分析目前防治中所存在的问题,以提高玉米螟的综合防治效果。     

棉花育种方法研究进展(文献综述)

对国内外棉花育种方法的研究进展作了评述。内容包括:(1)常规育种、(2)改良回交、(3)随机互交、(4)轮回选择、(5)改良互交、(6)选择指数;(7)分裂选择、(8)单倍体育种(半配生殖)、(9)生物技术、(10)突变育种和(11)杂种优势利用等。     

Effect of Nitric Oxide on the Interaction Between Mitochondrial Malate Dehydrogenase and Citrate Synthase

Mitochondrial malate dehydrogenase （mMDH） and citrate synthase （CS） are sequential enzymes in Krebs cycle. mMDH, CS and the complex between mMDH and CS （mMDH＋CS） were treated with nitric oxide solution. The roles of notric oxide （NO） on the secondary structures and the interactions between mMDH and CS were studied using circular diehroism （CD） and Fourier transform surface plasmon resonance （FT-SPR）, respectivley. The effects of NO on the activities of mMDH, CS and mMDH＋CS were also studied. And the regulations by NO on mMDH and CS were simulated by PyMOL software. The results of SPR conifrmed that strong interaction between mMDH and CS existed and NO could signiifcantly regulate the interaction between the two enzymes. NO reduced the mass percents ofα-helix and increased that of random in mMDH, CS and mMDH＋CS. NO increased the activities of CS and mMDH＋CS, and inhibited the activity of mMDH. Graphic simulation indicated that covalent bond was formed between NO and Asn242 in active site of CS. However, there was no direct bond between NO and mMDH. The increase in activity of mMDH＋CS complex depended mostly on the interaction between NO and CS. All the results suggested that the regulations by NO on the activity and interaction between mMDH and CS were accord with the changes in mMDH, CS and mMDH＋CS caused by NO.     

酸性土壤植物磷铝互作研究进展

铝毒和缺磷是酸性土壤上作物生产的2个主要限制因子,解决酸性土壤铝毒和缺磷问题是提高作物产量及保障粮食安全的重要途径。酸性土壤中铝毒和缺磷经常共存,磷与铝在土壤、根-土界面和植物体内关系密切,其相互作用对植物生长发育具有重要影响。该文总结了酸性土壤中铝的存在形式、磷的现状及存在形式,简述了近年来磷与铝元素交互作用对植物生长发育的影响,并对进一步的研究作了展望。     

生态足迹研究进展

在回顾生态足迹发展历程的基础上,从理论研究和应用研究2方面把握生态足迹发展的总体脉络。结合当前生态足迹研究的现状和趋势,提出存在的主要问题,并指出后续应在研究尺度更微观、改进计算方法和多种研究方法相结合等方面开展工作。     

交互特征研究与设计应用

交互是人和产品之间的关系和行为,是目前信息与交互设计领域的主要对象之一。本文以支持设计实践为出发点,对“交互”这一设计对象的形式出发,通过特征提取实验方法,得到交互特征的定义、描述以及交互特征和用户体验的关系,并在具体的设计实例中进行应用。     

植物根际分泌物与土壤微生物互作关系的机制研究进展

近年来对土壤微生物和植物之间互作关系的研究越来越受到关注,植物的根际分泌物直接或间接的影响了根际微生物群落结构,同样,根际微生物也以各种不同方式影响着植物根际的土壤理化性质、根际分泌物释放、土壤物质循环等。本文从根际有益微生物对植物生长发育的促进作用以及植物根际分泌物对土壤微生物多样性的影响这两方面对土壤根际微生物与植物之间相互影响的途径与机制进行了综述。