杏仁基因组DNA微量提取的改良方法

基于报道的大豆干种子提取方法,对高脂肪的杏仁进行了基因组DNA提取方法的改良研究,并以提取的基因组为模板进行了PCR扩增验证。结果表明:改良的SDS法提取的杏仁基因组DNA具有纯度和浓度高、条带清晰、降解少等优点,并在高倍稀释条件下仍能获得有效扩增。     

扩展青霉基因组DNA五种提取方法比较

为寻找一种适合于扩展青霉基因组DNA的提取方法,比较了固体培养、液体静置培养和液体振荡培养3种培养方式的提取效果,分别采用氯化苄法、蜗牛酶法、CTAB法、SDS法及异硫氰酸胍法提取扩展青霉菌基因组DNA,经DNA质量浓度测定及电泳分析,比较5种方法的差异,并利用扩展青霉的多聚半乳糖醛酸酶(Polygalacturonase)基因内一段保守序列,设计PCR引物,扩增大小为288 bp的特异目的基因,检测其灵敏性.结果表明:固体培养的方式较适合扩展青霉基因组DNA的提取,另外5种提取方法均能提取出扩展青霉菌基因组DNA,扩增出目的条带,其中氯化苄法和蜗牛酶法所提DNA的纯度均较好,但蜗牛酶法所提DNA量较少.因此,氯化苄法是5种提取方法中最可靠的DNA提取方法,所提DNA浓度高、纯度好、结果稳定,可作为PCR反应的模板进行特异性扩增,且该方法的最低检测限大约为1.01×10-1μg/mL.     

快速粗提取致病疫霉菌菌丝DNA的方法

为满足规模分析病菌群体、认识病菌的群体遗传变异特征,以致病疫霉菌(Phytoph-thorainfestans)为材料,建立快速、简便的用于PCR扩增的病菌基因组DNA。分别大量和微量提取基因组DNA,比较2种方法所提取的DNA用于SSR标记的PCR扩增效果。结果表明:以微量粗提法所得的病菌基因组DNA质量足以用于PCR扩增,与大量提取所得的DNA的PCR扩增非常一致,并且粗提的DNA与大提的DNA一样都可以在-20℃条件下保存。基于PCR扩增的遗传标记广泛用于病菌群体的分析,该研究建立的基于玻璃珠振荡法提取疫霉菌菌丝基因组DNA的微量提取方法需材少、简便且快速有效,为规模分析疫霉菌群体奠定了基础。     

不同方法提取野生荔枝基因组DNA效果的比较

以广东、广西地区的3个野生龙眼的幼嫩叶片为试材,采用SDS法、常规CTAB法和改良2× CTAB法提取荔枝叶片基因组DNA,比较研究从富含多酚、多糖和色素等次生代谢物质的野生荔枝叶片中获得高质量DNA的提取方法.结果表明:采用改良的2×CTAB法提取的荔枝叶片基因组DNA纯度最高、质量最佳,可直接用于荔枝叶绿体DNA trnL-F基因的PCR扩增分析,且扩增后条带清晰.表明改良的2×CTAB方法获得的DNA纯度和产率较高,符合进行野生分子标记的实验要求.     

基于纤维素膜吸附的黄瓜基因组DNA快速提取方法

为快速获取与鉴定黄瓜基因组DNA,建立一种基于纤维素膜吸附的黄瓜基因组DNA快速提取方法,以市售华北型黄瓜为材料,制备纤维素膜片,筛选黄瓜裂解试剂,优化提取反应条件,建立了包括黄瓜裂解、膜片吸附、膜片清洗、核酸洗脱等步骤的黄瓜基因组DNA提取方法,可以在5 min内从黄瓜果实中提取基因组DNA用于PCR扩增。黄瓜果实的表皮、表层果肉和中心果肉都可以实现基因组DNA提取和PCR扩增,最少可以从13 mg黄瓜果实中提取并检测到黄瓜管家基因Act1片断。利用膜吸附DNA提取技术实现了黄瓜基因组DNA的快速提取,为黄瓜基因研究与快速鉴定提供了一种简便方法。     

菊芋基因组DNA提取方法的比较

采用改良CTAB法、改进的高盐SDS法及两种植物基因组DNA提取试剂盒法等４种方法提取菊芋基因组DNA,并进行电泳分析、质量检测及ISSR引物扩增检测。结果表明,改良CTAB法优于其他3种方法,提取的DNA质量较好、纯度较高,能够满足ISSR-PCR扩增要求。     

芍药基因组DNA不同提取方法的比较及PCR验证

提取基因组DNA是开展芍药分子生物学研究中一项最为基础的工作。本研究通过常规CTAB法和近几年应用较为普遍的试剂盒法,对芍药基因组DNA进行了提取,并对2种方法所提取的DNA进行了浓度、程度、琼脂糖凝胶电泳和PCR扩增比较。结果表明,常规CTAB法提取的DNA浓度较高,为128.08-253.63 ng/ul,但纯度较低,而试剂盒法提取的DNA虽平均浓度较低,为3.51ng/ul,但纯度较高;电泳和PCR结果均表明,试剂盒法提取的DNA能扩增出目的片段,是较好的一种提取方法。     

Chlex-100法快速提取甜瓜白粉病菌基因组DNA

现以白粉病菌分生孢子为材料,用Chlex-100法快速提取白粉病菌基因组DNA,并以此为模板PCR扩增出5.8S-ITS rDNA区段,以建立快速提取甜瓜白粉病菌基因组DNA的方法。结果表明:Chlex-100法是快速提取白粉病菌基因组DNA的高效方法。     

适于ISSR-PCR扩增的百合基因组DNA的提取

为了方便稳定地获得适合于ISSR-PCR扩增的高质量百合基因组DNA,以卷丹百合为试材,在传统的CTAB法基础上进行了改良和优化,筛选出较理想的DNA提取方法.结果表明:用改良CTAB法提取的百合基因组DNA电泳条带清晰,无降解现象,OD260/OD280值在1.7～2.0之间,用于ISSR-PCR扩增时其稳定性和可重复性都很好,说明DNA纯度和产率完全满足百合ISSR-PCR扩增分析的要求,为百合属植物遗传多样性分析和品种分子鉴别等研究奠定了基础.     

节瓜基因组DNA提取方法比较研究

以节瓜的成熟干种子、子叶和不同发育阶段的真叶为材料,选用尿素提取法、高盐低pH值法、SDS法和CTAB法等4种DNA提取方法进行比较。结果表明:不同节瓜材料均可以提取到基因组DNA,其中子叶和第1片真叶的提取效果最好;尿素提取法提取种子DNA最为简便快捷,CTAB法提取叶片能得到纯度较高的基因组DNA。经PCR检验,干种子和子叶提取的基因组DNA都可用于PCR扩增。     

茭白黑粉菌及茭白植株中DNA的提取方法

研究了茭白黑粉菌及茭白植株中基因组DNA的高效提取方法。采用改进的CTAB（十六烷基三甲基溴化铵）法提取DNA,根据琼脂糖凝胶电泳检测、A260/A280的测定和PCR扩增结果表明,用改进的CTAB法提取茭白黑粉菌及茭白植株基因组DNA,所得DNA无论是纯度还是完整性都比较好,适合于酶切和PCR扩增,可以用于分子生物学研究。     

氯化苄法提取植物内生放线菌基因组DNA

以植物内生放线菌菌株GL0806123为试材,用氯化苄快速提取植物内生放线菌菌株GL0806123基因组DNA。建立用氯化苄提取植物内生放线菌基因组DNA的方法。结果表明:用氯化苄法能够成功提取植物内生放线菌菌株GL0806123基因组DNA,以此为模板PCR扩增出16S rDNA区段,测序后可用于菌种鉴定。氯化苄法是一种快速提取植物内生放线菌基因组DNA的方法。     

不同保存方法对石榴成熟叶片基因组DNA提取效果的影响

以石榴(Punica granatum L.)成熟叶片为试材,设置6种保存方法,采用改良的CTAB法提取石榴基因组DNA,研究了不同保存方法对石榴叶片基因组DNA提取效果的影响。结果表明:采用改良的CTAB法,新鲜叶片、-70℃保存6个月、4℃保存5d的样品均能得到浓度较高的DNA;-20℃保存7d和14d的样品均能得到完整DNA,但浓度略低;硅胶干燥常温保存5个月的样品用同样的方法未能提取到DNA,在对提取方法进行优化后,可提取纯度较高的基因组DNA,但其浓度仅约为鲜叶的50%。上述方法保存的样品提取的基因组DNA均能得到清晰、稳定的SRAP-PCR扩增图谱。     

适于宁夏枸杞RAPD分析的DNA高效提取方法

采用优化的CTAB法提取枸杞叶片基因组DNA.利用紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳检测所得DNA的浓度和纯度,并进行了RAPD初步扩增分析.DNA浓度在300 μg /mL,可达400 μg/g(叶片鲜重).OD260/OD280比值为1.44～1.6(理想值为1.8).结果表明:优化CTAB法所提取枸杞总DNA的纯度高、完整、量大,能满足RAPD扩增,条带清晰、稳定,并且提取操作的程序快速、简便,试验成本低、效率高.优化的CTAB法高效提取的枸杞基因组DNA不需经氯化铯梯度离心或柱层析纯化,可以直接用于RAPD分析.     

甜菜干种子DNA提取的不同方法比较

分别采用SDS法、CTAB法及碱裂解法对甜菜干种子基因组DNA进行提取．并利用1％琼脂糖判断DNA的纯度,λDNA判断DNA的含量,结果表明,SDS法和CTAB法提取的甜菜基因组DNA含量较高,提取的DNA总量接近,碱裂解法提取的DNA含量较低。3种方法提取的DNA均能够满足SSR—PCR的要求,并且扩增务带没有差异,由于碱裂解法提取DNA快速和简单,因此适合大群体DNA的提取及对模板要求不高的PCR反应中,而SDS法及CTAB法适合一次性大量提取甜菜基因组DNA以及对于DNA纯度要求较高的PCR反应中。     

观赏凤梨DNA提取方法研究

观赏凤梨(Bromelia ceae)叶片呈革质化且多纤维,含大量次生代谢产物,常常导致提取的DNA产量低、质量差,影响后续的酶切和PCR扩增.针对观赏凤梨多个属的植物,通过多种不同因素包括提取液、提取部位、研磨方法、沉淀时间等的对比,对观赏凤梨的基因组DNA提取方法进行研究,成功地掌握了高效的凤梨叶片DNA提取方法,为凤梨后期分子标记等基因组研究打下一定的基础.     

不同方法提取牛心朴子基因组DNA效果的比较研究

以牛心朴子的叶片、茎段、根为试材,采用改良的CTAB法Ⅰ、CTAB法Ⅱ和SDS法对其进行了基因组DNA提取效果的比较分析.结果表明.CTAB法Ⅰ从3个部位都能提出较高浓度的DNA,电泳条带完整清晰;CTAB法Ⅱ从3个部位都能提出DNA,条带明亮,但有明显拖尾现象;SDS法从叶片中能提出较高的DNA,但从茎和根中所提的DNA含量较小,电泳条带暗;3种方法所提的DNA其RAPD扩增效果以CTAB法Ⅰ最好,CTAB法Ⅱ次之,SDS法最差.叶片提取的DNA平均纯度、浓度和得率为最高,RAPD扩增效果最好,茎次之,根最低.说明CTAB法工是牛心朴子DNA的高效提取方法,不同部位以牛心朴子叶子提取的DNA得率高,扩增效果最好.     

贡水白柚基因组DNA提取方法研究

以"贡水白柚"为试材,采用盐乙醚处理法、苯酚氯仿处理法、基本CTAB处理法3种DNA提取方法来处理"贡水白柚"基因组DNA,研究不同提取方法对DNA样品的产率、外观、酶切电泳等方面的影响。结果表明:用盐乙醚法所提DNA外观呈纯白色,冷冻沉淀为纤维状,效果最好;用苯酚氯仿法处理幼穗期柚叶片基因组提取DNA产率最高,DNA浓度达118ng/μL;EcoRⅠ酶切图谱用CTAB处理法和盐乙醚处理法效果均较好,苯酚氯仿处理法则拖尾严重,效果差;RAPD引物PCR扩增效果图表明,3种方法均能扩增出清晰条带,均适合于有关"贡水白柚"基因组的相关研究。     

柑橘苗期SSR鉴定分析体系的优化及初步应用

以柑橘幼苗微量叶片（3～5mg）为材料,改进柑橘基因组DNA提取方法,并对3种PAGE凝胶浓度和3种银染色方法进行了筛选和优化,建立了一种经济,高效的柑橘苗期SSR分析体系。试验结果表明：该微量叶片提取方法需材少,用时短,所提取基因组DNA质量好、纯度高,完全适用于SSR—PCR扩增反应。     

彩色甜椒基因组DNA提取方法的优化

以不同颜色的甜椒为试验材料，采用CTAB法、SDS法、ROSE法和氯化苄法提取彩色甜椒基因组DNA。结果表明，CTAB法所提取DNA的质量和纯度较高，以此DNA为模板进行RAPD—PCR分析，DNA扩增效果较好，带形清晰、整齐，说明CTAB法提取的DNA较为完整，