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产芽孢木质素降解菌株N13的分离与鉴定 总被引:5,自引:1,他引:4
研究旨在从牛粪中筛选出1株对木质素有降解能力的细菌,并对其鉴定到种。对其形态和生理生化特征进行研究,发现其特征与解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)很相近。将所测得的16S rDNA序列用BLAST软件在GenBank数据库中进行比对,选取序列相似性高的菌株,用ClustalX(1.8)软件进行16S rDNA相似性分析,Neighbor-Joining法构建系统发育树。N13菌株与Bacillus amyloliquefaciens的相似性达到99.85%,鉴定该菌为解淀粉芽孢杆菌。 相似文献
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通过筛选获得高产纤维素酶细菌菌株,为纤维素酶制剂研制及纤维素酶工程菌构建提供试验材料。采用刚果红平板从牛羊粪便及腐败的玉米秸秆和木屑中分离产纤维素酶菌株,以DNS法测定酶活,根据酶活复筛产纤维素酶分离菌株;观察分离菌株的形态、染色与培养特性;应用16S rDNA通用引物扩增菌株基因组DNA,测序结果提交GenBank数据库进行Blast比对分析和相似性搜索,作出复筛菌株种的鉴定。结果表明:分离获得16株纤维素酶产量较高的细菌菌株,均为革兰氏阳性菌,菌体呈短杆状、具中央芽孢,经16S rDNA序列比对分析和相似性搜索,鉴定为10株枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、6株解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)。 相似文献
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对两种市售水产养殖用复合微生物粉剂中微生物菌种进行鉴定。利用平板分离技术对粉剂中的微生物进行分离纯化,进行了形态学观察、16S rDNA和26S rDNA序列分析,并构建系统发育树。结果表明,两种微生物粉剂中菌群结构存在一定差异,S1粉剂中鉴定出5株芽孢杆菌和2株酵母菌,分别为枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌或索诺拉沙漠芽孢杆菌、葡萄牙棒孢酵母和库德里阿兹威毕赤酵母;S2粉剂中鉴定出3株芽孢杆菌、1株放线菌、2株酵母菌和3株肠球菌,分别为解木糖赖氨酸芽孢杆菌、环状芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌或索诺拉沙漠芽孢杆菌、芬氏纤维微菌、酿酒酵母、库德里阿兹威毕赤酵母、鹑鸡肠球菌、屎肠球菌或乳酸肠球菌。明确水产养殖用复合微生物粉剂的菌群结构为同类产品的安全性及有效性评估提供理论基础。 相似文献
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枯草芽孢杆菌Pab02产纤维素酶活性的研究 总被引:8,自引:0,他引:8
试验主要对目前饲料领域应用广泛的枯草芽孢杆菌进行产纤维素酶能力筛选及发酵优化条件的研究,为枯草芽孢杆菌Pab02开发成微生态制剂及生产纤维素酶提供理论依据。通过羧甲基纤维素钠培养基筛选分离到具有产纤维素酶能力的枯草芽孢杆菌Pab02。通过分析初始pH、发酵温度和发酵时间对枯草芽孢杆菌Pab02产纤维素酶活性的影响,得出最佳初始pH为8.0、发酵温度为37℃、发酵时间为48h。在该条件下发酵液酶活达到358.751u/mL酶液,比优化前提高了2.1倍。 相似文献
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广州桑树植原体分子检测及多样性初探 总被引:3,自引:1,他引:2
采用植原体16S-23S rDNA区段的通用引物对P1/P7和巢式引物对Rm16F2/Rm16R1,建立了快速准确的桑树植原体巢式PCR检测技术。对广州的两个桑树品种资源圃中的部分桑树品种进行了植原体分子检测,结果在两个资源圃中均发现有植原体存在。对巢式PCR的扩增产物(16S rDNA片段)进行了限制性片断长度多态性(RFLP)分析,显示出3种RFLP带型,暗示桑树植原体存在多样性。对所得植原体16S rDNA片段进行序列测定,并与其它植物植原体作亲缘关系分析,结果表明该植原体的16S rDNA序列与其它植物病原植原体之间的同源性为83.3%~99.9%,并初步判断所检测到的桑树植原体属于16S rI组。 相似文献
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Sasaki H Kawamoto E Ueshiba H Amao H Sawada T 《The Journal of veterinary medical science / the Japanese Society of Veterinary Science》2006,68(6):639-641
A 1344 bp fragment of the 16S ribosomal DNA (rDNA) sequence was used to determine the genetic relationship of Pasteurella pneumotropica isolates from laboratory rodents. A total of 30 nucleotide sequences of P. pneumotropica, including 24 wild strains, 3 reference strains, and 3 nucleotide sequences deposited in GenBank, were examined for heterogeneity of their 16S rDNA sequences. Phylogenetic analysis based on 16S rDNA sequence discriminated 5 types of branching lineages. Of these 5 types, 3 types had significant associations with mice or rats, and 2 had significant associations with the beta-hemolytic phenotype. These results suggest that 16S rDNA sequencing of P. pneumotropica isolates demonstrates genetic heterogeneity and phylogenetic discrimination in terms of their hemolytic phenotype and host associations. 相似文献
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为探明贵州省某猪场引起猪体表脓肿的原因,本研究对该猪场脓肿部位的脓汁进行细菌分离培养,并对分离所得的细菌进行革兰氏染色镜检、生化试验、药敏试验、16S rDNA序列分子分析及动物感染试验。结果显示,从脓汁中成功分离到了3株菌落形态不一的菌株,分别为金黄色葡萄球菌、化脓隐秘杆菌、停乳链球菌类马亚种,根据分离地点和时间将其分别命名为GZGP2018-1、GZGP2018-2和GZGP2018-3;GZGP2018-1菌株与NCBI上金黄色葡萄球菌的同源性高达99.9%,GZGP2018-2菌株与NCBI上化脓隐秘杆菌的同源性高达99.9%,GZGP2018-3菌株与NCBI上停乳链球菌类马亚种的同源性高达100%;3株分离菌株对头孢拉定、环丙沙星、磺胺间甲氧嘧啶和氟苯尼考较敏感,对青霉素类药物和红霉素耐药;3株分离菌株对试验小鼠均具有致死性。本研究为该猪场猪体表脓肿的发病原因、实验室诊断方法及日常防控提供了理论参考。 相似文献
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选取48羽7日龄艾维茵肉公鸡随机分为对照组和试验组,试验组动物房内每日8时喷雾1mL/m3的枯草芽孢杆菌Pab02制剂(108 CFU/mL),对照组同法喷雾100mL蒸馏水。28日龄时对肉鸡测体质量,采用活菌计数法和PCR-DGGE法对28,49日龄肉鸡呼吸道菌群进行检测,石蜡组织切片法对肺部结构进行观察。结果显示,喷雾枯草芽孢杆菌Pab02对28日龄肉鸡的采食量、日增重、料肉比等生长性能有所提高,但不显著(P〉0.05);喷雾Pab02能增加49日龄呼吸道细菌数量(P〈0.01),提高同一生态位菌群的稳定性和呼吸道菌群的多样性;Pab02喷雾剂不引起肺组织损伤,能使淋巴小结增多。结果表明,芽孢杆菌Pab02喷雾剂不能显著改善肉鸡的生长性能,但是能调节呼吸道菌群的结构,增强肺脏的免疫功能。 相似文献
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Wakita Y Kawano J Shimizu A Hajek V Tomisaka E Yasuda R Matsuo E 《The Journal of veterinary medical science / the Japanese Society of Veterinary Science》2002,64(7):603-605
The development of a PCR assay based on the 16S ribosomal RNA gene (rDNA) sequence was carried out for the identification of Staphylococcus intermedius. Sixty-six strains of S. intermedius, 70 of Staphylococcus aureus and 2 of Staphylococcus hyicus were examined for the assay. The 16S rDNA, of which the PCR target fragment makes up 901 bp corresponding to the sequence data of the gene, was detected in all strains of S. intermedius, but it was not detected in any strains of either S. aureus or S. hyicus. These results suggest that the PCR allows a simple and precise identification of S. intermedius. 相似文献