基于EST-SSR和种子特征的苇状羊茅遗传分析

苇状羊茅(Festuca arundinacea)是重要的冷季型草坪草和牧草,被广泛用于牧草生产、草坪绿化、生态修复等方面。本研究收集了36份不同来源苇状羊茅种质材料,利用表达序列标签-简单序列重复(EST-SSR)引物对材料进行遗传多样性分析,并结合种子表型特征,对它们的种质资源遗传多样性进行了综合评价与分析。结果表明:14对EST-SSR引物共扩增出140条带,多态条带总数为133条,多态带百分率95%;聚类结果具有一定的地域性趋势,但是不明显。当遗传距离在0.54时其聚类结果与种子特征的K均值聚类结果相似;欧洲群体的种子厚度和千粒重的变异系数最大,分别为25.02%和23.35%,其千粒重显著低于亚洲、北美洲群体(P<0.05)。多角度遗传分析表明36份材料具有高度异质性。本研究对苇状羊茅遗传资源的科学评价、核心种质创新和新品种选育具有重要意义。     

菊苣EST-SSR分子标记开发及通用性分析

为了开发菊苣(Cichorium intybus)简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)分子标记,采用菊苣表达序列标签(Expressed sequence tags,EST)序列设计EST-SSR引物,并验证引物的有效性和通用性.结果表明:菊苣EST序列中共搜索到648个SSR位点,14...     

多年生黑麦草和苇状羊茅幼苗对Fenoxaprop的抗性

夏型一年生杂草危害能限制寒地型草坪草在春天或夏天建坪的成功。Fenoxaprop是一种对夏型一年生杂草有明显作用,而对成熟的多年生黑麦草或苇状羊茅草坪安全的芽后除草剂。大量的研究已证实了多年生黑麦草和苇状羊茅幼苗对Fenoxaprop具有一定的抗性。“Citation”和“palmer”多年生黑麦草以及“Olympic”和“Houndog”苇状羊茅分别播种于Chillum砂壤土(细砂、混合mesic Typl Hapluluts)上或Beltsrille砂壤土(细壤、混合mesic Typic Fragiudults)上,通过两年多的试验表明,在六种喷撒日期中仅有一日,喷撒Fenozaprop时才能引起以上二种草坪种的幼苗变黄。用0.09～0.28千克/公顷Fenoxaprop处理后的草坪,我们没有见到草坪质量降低或其它明显不利现象的发生,以0.09千克/公顷的量喷撒Fenoxaprop在2～4分蘗期才能有效地防除无毛马唐,在此喷撒量和日期中,单独喷撒Fenoxaprop均能降低无毛马唐的竞争,并能获得好(89％)到极好(99％)的草坪草覆盖度。     

苇状羊茅及多年生黑麦草内生真菌的研究进展

本文介绍了重要禾本科牧草苇状羊茅及多年生黑麦草内生真菌对家畜的影响、对寄主本身的影响及内生真菌的传播、控制、鉴定和运用。苇状羊茅与多年生黑麦草内生真菌同属枝顶孢霉属(Acremonium),极为相似。苇状羊茅内生真菌导致牛的苇状羊茅中霉症。多年生黑麦草内生真菌造成羊及其它家畜的黑麦草蹒跚病。内生真菌可促进寄主的生长、延长寄主的寿命、抵抗病虫的侵害。内生真菌通过种子传递给牧草后代,牧草生产中用种子贮藏、种子高温处理、种子或植株药物处理控制内生真菌,防止牛的苇状羊茅中毒症和羊的黑麦草蹒跚病。草坪生产中通过接种内生真菌增加草坪草的抗虫、抗病能力,并延长其寿命。     

苇状羊茅及多年生黑麦草内生真菌的研究进展

本文介绍了重要禾本科牧草苇状羊茅及多年生黑麦草内生真菌对家畜的影响，对寄主本身的影响及内生真菌的传播，控制，鉴定和运用。苇状羊茅与多年生黑麦草内生真菌同属枝顶孢霉属，极为相似，苇状羊茅内生真菌导致牛的苇状羊茅中霉症。多年生黑麦草内生真菌造成羊及其它家畜的黑麦草蹒跚病，内生真可促进寄主的生长，延长寄主的寿命，抵抗病虫的侵害。内生真菌通过种子传递给牧草后代，牧草生产中用种子贮藏，种子高温处理，种子或植     

内生真菌对苇状羊茅和多年生黑麦草影响的研究进展

综述了内生真菌的分类及其在宿主苇状羊茅Festuca arundinacea和多年生黑麦草Lolium perenne中的分布与传播方式,阐述了内生真菌对苇状羊茅和多年生黑麦草生长、抗生物(病虫害)和非生物胁迫(P胁迫和干旱胁迫等)、以及对其他草类的竞争他感作用的影响,并提出今后的研究方向.     

基于EST-SSR标记的柞蚕遗传多样性分析

利用4个EST-SSR分子标记分析11个柞蚕品系的遗传多样性。结果显示,4个位点共检测到28个等位基因,平均有效等位基因数(effective number of allele,Ne)为2416个,基因观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)为0182～0400,期望杂合度(expected heterozygosity,He)为0524～0658,Shannon信息指数(Shannons information index,I)为0909～1363,群体分化系数(population differentiation coefficient,FST)均值为0337。群体的平均多态性信息含量(polymorphic information content,PIC)为0239～0477,遗传距离为0085～1305。对11个柞蚕品系的遗传多样性分析进一步确认了柞蚕中等程度的遗传多样性,且近60%的遗传变异存在于品系内个体间。研究结果表明EST-SSR标记可用于柞蚕的分子系统学研究。     

细胞悬浮法培养苇状羊茅、多年生黑麦草和多花黑麦草再生植株

本文就细胞悬浮法培养牧草再生植株的方法进行了研究,并成功地用此法从苇状羊茅、多年生黑麦草和多花黑麦草原生质体细胞克隆中获得了再生植株,而且进一步使苇状羊茅和多年生黑麦草在土壤中建植。     

青藏高原中华羊茅种质资源遗传多样性的EST-SSR分析

采用EST-SSR分子标记对来自四川、西藏、青海的24份中华羊茅(Festuca sinensis)进行了遗传多样性和亲缘关系的研究。研究结果表明,筛选的17条引物共检测到102个位点,多态性位点每条引物5~8个;平均多态性位点6个,平均多态性位点百分率(PPB)93%;遗传距离变幅范围0.188~0.675,平均值0.486,多态性信息含量指数PIC值在0.240~0.470变化,平均值为0.381,这揭示了供试的中华羊茅种质资源具有较为丰富的遗传多样性。聚类分析和主成分分析结果表明,供试材料间亲缘关系与其地理来源等相关性较低,其中I-2-23-7和I-14-1-1野生材料表现出了独特的遗传特性,与其他供试材料间均具有较远的亲缘关系。通过地理海拔的分析,发现分布于中度海拔(3 000-3500m)的中华羊茅种质具有最高的Nei’s基因多样性(0.304 3)和香农多样性(0.462 2),遗传变异较高。本研究结果为青藏高原中华羊茅种质资源的保护和利用提供了重要的参考。     

栽培金鸡菊EST-SSR分子标记开发与亲缘关系分析

为了开发适用于栽培金鸡菊的EST-SSR分子标记,采用二代高通量测序技术对剑叶金鸡菊‘斯丹泰勒’(Coreopsis lanceolata‘Sterntaler’)的叶片进行转录组测序。结果表明：通过转录组测序共得到42 958条Unigene,利用MISA软件共检测出个6 546个SSR位点,平均分布距离6.36 kb。除单核苷酸外,重复类型以二核苷酸和三核苷酸为主,分别占总数的19.28%和30.13%,二者优势重复单元和占比分别为AG/CT(57.30%)和AAT/ATT(27.94%)。通过Primer3软件设计得到4 499条引物,在随机筛选的50对引物中成功开发出22对多态性较好的引物,扩增出的166个条带全部具有多态性。通过UPGMA聚类分析,在遗传距离为0.460时可将100个栽培金鸡菊种质划分为7类,其遗传相似系数介于0.542 2～1之间,平均为0.747 6。金鸡菊组、两色组、歧序组和轮叶组相关的种质可作为金鸡菊远缘杂交育种的材料。本研究为栽培金鸡菊的分类鉴定、杂交育种和绘制指纹图谱提供了理论依据。     

EST-SSR标记的开发及在动物研究中的应用

近年来大量ESTs数据的出现已成为开发SSR标记的重要来源。EST-SSR作为一种新型的分子标记, 不仅具备传统基因组SSR标记的特点, 而且以其开发经济和通用性高等优势已在植物和动物中得到开发和应用。作者就EST-SSR标记特点，开发步骤及在动物中的应用和发展前景进行了综述。     

柱花草EST-SSR标记在山蚂蝗中的可转移性与应用

为鉴定山蚂蝗(Desmodium)种质资源的遗传背景及亲缘关系,选取92对柱花草(Stylosanthes spp.)EST-SSR标记和来自8个种的16份山蚂蝗材料,分析柱花草EST-SSR标记在山蚂蝗中的通用性,并对8种山蚂蝗进行亲缘关系分析。研究结果表明,柱花草EST-SSR标记在8种山蚂蝗种的可转移率为63.04%~73.91%,其中50对可在全部8种山蚂蝗中进行有效扩增。16对多态性EST-SSR标记在16份山蚂蝗种质中共检测到等位基因35个,平均2.19个。聚类分析表明,16份山蚂蝗种质可分为5类,与形态学划分结果相似。可见,柱花草EST-SSR标记在山蚂蝗上具有较高的可转移性,可应用于山蚂蝗种质资源评价及亲缘关系研究。     

多花黑麦草×苇状羊茅属间杂种的细胞学研究

在法国农研所吕尼西昂饲用植物育种站，通过远缘杂交以及多倍体人工诱导，获得了多花黑麦草（2X）与苇状羊茅（4X）间的三倍体、四倍体和六倍体属间杂种。这些杂种的细胞学资料表明，苇状羊茅的两个染色体组及其与黑麦草染色体组相互之间均存在着一定程度的亲缘关系；保持并利用四倍化的双二倍体是可行的，但六倍化双二倍体的前景则难以予测。总之，苇状羊茅与黑麦草染色体之间可以交换的事实得以将多花黑麦草的基因导入到苇状羊茅中，进而使后者得以改良。     

草坪用黑麦草与高羊茅属间杂种细胞学研究

进行了草坪用"Derby"黑麦草和"Houndog"高羊茅的属间杂交,未经胚培养成功地获得了它们间的杂种.杂种F1代花粉母细胞减数分裂中期Ⅰ染色体配对平均构型为:2.80 Ⅰ+10.33Ⅱ+0.85Ⅲ+0.50Ⅳ.染色体配对结果表明,"Derby"与"Houndog"染色体组之间存在一定程度的亲缘关系,对黑麦草与高羊茅的属间杂交改良是完全可行的.     

黑羽鹌鹑的EST-SSR标记开发与应用

本研究旨在加速分子标记在黑羽鹌鹑遗传育种等方面的应用,开发黑羽鹌鹑的EST-SSR标记。随机选取100只黑羽鹌鹑,心脏采血2mL,采用生物信息学方法开发黑羽鹌鹑的EST-SSR新标记,并检测EST-SSR标记在黑羽鹌鹑群体中的多态性。结果显示,在黑羽鹌鹑中成功的开发出了6个EST-SSR标记,EST-SSR标记检测到的观测等位基因数为2~6个,6个EST-SSR标记在黑羽鹌鹑的平均多态信息含量(PIC)为0.4962,平均期望杂合度(He)为0.5759。6个EST-SSR标记中P1和P2个为高度多态标记,其他4个EST-SSR为中度多态标记。新开发的6个EST-SSR标记可用于黑羽鹌鹑的遗传多样性分析,6个EST-SSR标记与鹌鹑的糖类代谢、黑色素的合成等有关系,但具体的机理还有待进一步分析。     

Development and Application of EST-SSR Markers of Black Quail

The purpose of this study was to accelerate the application of molecular markers in genetic breeding and other aspects of Black quail to develop EST-SSR markers for Black quail.100 Black quail were randomly chosen and blood samples were collected to develop EST-SSR new markers and determined the genetic polymorphism using bioinformatics.The results showed that there were 6 EST-SSR markers in the Black quail, the number of observed alleles in EST-SSR was 2 to 6.The average PIC of 6 EST-SSR markers in the Back quail was 0.4962 and the average He was 0.5759.Markers P1 and P2 were highly polymorphic markers among 6 EST-SSR and the rest EST-SSR markers were moderately polymorphic markers.These developed markers could be used for genetic diversity analysis of Black quail and the EST-SSR markers had some relationship with the carbohydrate metabolism, synthesis of melanin in Black quail, but the mechanism needed the further analysis.     

海盐胁迫对苇状羊茅和多花黑麦草种子发芽的影响

用不同浓度的海盐溶液处理,研究了苇状羊茅Festuca arundinacea和多花黑麦草Lolium multiflorum种子在发芽阶段对海盐胁迫的反应.结果表明,海盐浓度低于6.4 g/L时,2种牧草种子的发芽不受影响;随海盐处理浓度增高,种子发芽率和种子活力指数逐渐下降.2种牧草相比,多花黑麦草种子发芽阶段对海盐的耐受性高于苇状羊茅.苇状羊茅和多花黑麦草种子发芽率降至50%的农业盐渍临界值的海盐浓度分别为19.98和22.78g/L.     

偃麦草EST-SSR标记开发及应用

利用NCBI数据库中偃麦草(Elytrigia repens)EST序列开发偃麦草EST-SSR引物,并对47份偃麦草资源进行遗传多样性分析,验证所开发EST-SSR引物在偃麦草上的可应用性。结果显示,在27 891条偃麦草EST序列中可以搜索到SSR位点1 068个;其中六核苷酸重复序列最多,占总SSR的53.83%;二、三、四、五、六核苷酸优势重复基元及出现频率分别为AC/TG(2.72%)、CGC/GCG(1.87%)、CGAC/GCTG(5.24%)、CCGCC/GGCGG(0.37%)、CAGCTC/GTCGAG(3.37%)。开发的105对偃麦草EST-SSR引物中有64对引物(60.95%)可以有效扩增;随机选取18对多态性引物对47份偃麦草进行遗传多样性分析,其多态性百分率为78.64%,多态性指数(PIC)为0.22~0.83。以上结果表明,开发的偃麦草EST-SSR标记是有效的,有较高的应用价值,为偃麦草遗传多样性、重要性状关联分析研究奠定了基础。