高羊茅杂交后代ISSR遗传变异研究

利用ISSR分子标记对高羊茅(Festuca arundinacea)杂交后代进行遗传多样性及亲缘关系分析.19个ISSR引物共扩增出255条重复性好、清晰的条带,其中200条是多态条带,多态条带比率(PPL)为78.4％,平均每个引物扩增多态条带数为10.5条,扩增片段大小范围为100～2 000 bp.结果表明,高羊茅杂交后代的多态性较高,遗传多样性较丰富.高羊茅杂交后代遗传相似性系数为0.647 1～0.851 0,聚类分析将高羊茅杂交后代划分为4个大类,有相同亲本的杂交后代先聚类.总之,ISSR标记可以有效地对高羊茅杂交后代进行“亲缘跟踪”和定向选择,为杂交育种提供分子依据.     

‘寒富’ב四倍体嘎拉’苹果的三倍性杂交后代ISSR和AFLP分析

利用ISSR及AFLP分子标记技术研究了‘寒富’ב四倍体嘎拉’苹果的7份三倍性后代及其亲本的遗传变异。结果表明ISSR扩增得到的遗传多样性指数中扩增多态性比率(PPB)为60.00%,观察等位基因数(Na)为1.600,有效等位基因数(Ne)为1.420,Nei’s基因多样性指数(H)为0.236,Shannon信息指数(I)为0.346;均小于AFLP扩增的遗传多样性指数66.54%、1.665、1.421、0.240和0.357。根据ISSR和AFLP得到的UPGMA聚类图显示这7份三倍性杂交后代倾向于母本‘寒富’。在三倍性苹果遗传多样性检测上AFLP优于ISSR,且这7份三倍性新种质在遗传上倾向于母本遗传。为三倍性苹果育种的亲本选择提供依据。     

‘寒富’ב岳帅’苹果杂交后代遗传多样性的SSR分析

本研究通过SSR标记,分析‘寒富’ב岳帅’杂交后代的遗传多样性。研究结果显示:20条SSR引物共扩增出54条带,其中多态性条带49条,多态性比率为90.7%,供试样品的基因多样性(H)和Shannon信息指数(I)分别为0.52和0.83。研究结果表明通过杂交,‘寒富’ב岳帅’杂交组合发生了基因的分离和重组,产生了丰富的遗传变异,可为今后育种提供优异种质材料。     

桂南木莲和马关木莲正反交杂种的ISSR鉴定

以桂南木莲、马关木莲及两者的杂交后代(正反交)共32株为试验材料,运用ISSR分子标记技术鉴定杂交后代的真实性。结果如下:从16条引物中筛选出4条引物用于杂种鉴定,试验表明30株杂交后代为真杂种,真实杂种率为100%;4条引物在正交杂种和亲本中扩增出46个位点,多态性位点率(PPB)为84.78%,材料间遗传相似系数为0.476～0.863,变幅为0.387。遗传相似系数0.714把亲本和正交种分为偏母本型、中间型和父本;4条引物在反交种和亲本中扩增出44个位点,多态性位点率(PPB)为88.78%,材料间遗传相似系数为0.400～0.872,变幅为0.472。遗传相似系数0.594把亲本和反交种分为偏母本型和偏父本型。30株杂交后代遗传多样性丰富,是培育木兰科新品种培育的重要材料。     

荔枝SCoT-PCR反应体系的建立及其在遗传分析中的应用

建立适于荔枝的SCoT反应体系,并利用SCoT体系对‘紫娘喜’、‘无核荔’及其杂交后代进行真假杂种鉴定和遗传多样性分析。采用正交设计方法对影响荔枝SCoT-PCR反应的rTaq酶、Mg2+浓度、模板DNA用量、dNTPs浓度和引物等因素进行体系优化。优化的荔枝SCoT反应体系为：20μL反应体系中含有模板DNA 30 ng,rTaq酶1 U,引物0.75μmol/L,Mg2+ 3 mmol/L,dNTPs 0.3 mmol/L。最适退火温度为50.6℃。利用该体系对‘紫娘喜’、‘无核荔’及其杂交后代进行遗传分析,结果显示,32条引物共扩增出280个位点,多态性位点有131个,占总位点数46.78%。4条引物就可以将60株杂交后代鉴定出来。UPGMA聚类分析显示,SCoT标记能将30株杂交后代区分开,遗传相似系数在0.406~0.867,在相似系数0.68时,30株杂交后代可聚为3类。优化建立的荔枝SCoT体系结果稳定,重复性好,为荔枝遗传育种提供了新的技术支持。     

肺形侧耳杂交后代群体灰色关联度与遗传分析

通过对肺形侧耳(Pleurotus pulmonarius)杂交后代群体进行农艺性状的综合评价和遗传分析,为肺形侧耳杂交品种选育和应用提供指导。应用灰色关联度分析法对肺形侧耳杂交后代群体及其亲本进行综合评价分析,并利用序列相关扩增多态性(SRAP)标记技术进行杂交菌株及其亲本的遗传分析。结果表明,在杂交后代群体中菌株H155和H232的关联度排名高于亲本,综合农艺性状表现最好,综合评估结果与杂交后代实际栽培表现相一致。18对SRAP引物共扩增出218个条带,其中多态性条带总共为147个,占总条带数的67.43%,有效等位基因数Nei’s基因多态性指数和Shannon信息指数的平均值分别为1.384 1、0.224 9和0.338 9。供试菌株间遗传相似系数(GS)值变化范围为0.63～0.93,在遗传相似系数为0.77时,可将亲本菌株及其杂交后代群体分为Ⅳ个类群,供试菌株在DNA水平上存在一定的遗传差异,SRAP适用于肺形侧耳单孢杂交后代群体的鉴别。研究结果为肺形侧耳杂交后代的筛选及遗传分析提供了一定的理论依据和技术参考。     

7个柱花草品种的AFLP和SSR遗传多样性分析

旨在阐明不同柱花草品种的遗传差异。利用AFLP、SSR两种分子标记技术对7个柱花草品种进行遗传多样性分析。12对AFLP引物组合共扩出966个条带,其中多态性条带有850条,平均每对引物的多态性条带为70.8条,多态性比率为87.99%。10对SSR引物共扩出26个条带,其中多态性条带有23个,多态性比率为88.46%;10对引物的观察杂合度(Ho)的范围是0~0.7143,平均为0.1857,Shannon’s遗传多样性指数(I)平均值为0.6545,平均多态性含量(PIC)为0.727。根据非加权成对平均数法(UPGMA)进行聚类分析,获得品种聚类树形图,AFLP与SSR分析的聚类图相似性显著,7个品种明显分成两类。‘矮柱花草’与‘西卡柱花草’的遗传关系最为疏远,‘奥克雷柱花草’与‘爱德华柱花草’、‘格拉姆柱花草’与‘热研5号柱花草’关系最为密切。     

基于ISSR标记的四照花栽培品种指纹图谱构建及亲缘关系分析

四照花观赏价值极高,其栽培品种繁多且难以区分。为了快速有效地鉴定四照花栽培品种,本研究利用ISSR标记,建立了44个四照花主要栽培品种及其亲本的指纹图谱,并分析了其亲缘关系,为四照花的推广应用提供依据。利用优化的ISSR-PCR体系,从100条ISSR引物中筛选出7条,对44个四照花样本的基因组DNA进行PCR扩增。通过2条引物UBC834和UBC847的扩增,建立了品种特异性指纹码,可将44个样本中的42个加以区分。7条ISSR引物共获得91条扩增带,其中多态性条带90条,多态性比例为98.9%,平均每个引物扩增出13个位点;在遗传距离为0.60处,可以将44个样本分为3类:第1类包括大花四照花原种、所有大花四照花栽培品种和以大花四照花为母本的杂交品种37号(C.‘Rutban’)和38号(C.‘Celestial Shadow’);第2类为所有日本四照花和中国四照花及其两者的栽培品种、以日本四照花为亲本的杂交品种36(C./Ruth Ellen/‘Rutlan’)、39(C.‘Rutcan’Constellation)、40(C.‘KN4-43’Starlight),和未知品种41号;第3类,未知样本42号单独聚为一类,但在遗传距离为0.62处与第1类聚到一起,推测其可能是源于大花四照花的品种。本研究基于ISSR标记构建的指纹图谱可有效用于四照花栽培品种鉴定,并揭示其亲缘关系。     

基于ISSR标记的16份榧树种质亲缘关系分析

榧树(Torreya grandis)为中国特有的优良经济树种,种质资源十分丰富,揭示种质间的亲缘关系有利于对其进行有效保护与利用。采用ISSR分子标记技术,对16份榧树种质亲缘关系进行分析。通过对100条引物的筛选,获得13条重复性好且多态性高的引物,经扩增共得到75条清晰可辨条带,其中多态性条带41条,总多态性条带百分率P为54.67%,平均为57.04%。每条引物扩增条带数介于2～13条,平均5.77条。16份榧树种质总Shannon信息指数I为0.230 9,平均为0.242 8;总Nei基因多样性(H)为0.145 9,平均为0.153 5。P、I、H均表明16份榧树种质总体水平的遗传多样性较高。16份榧树种质的遗传距离介于0.027 0～0.385 7,平均为0.172 2;遗传相似度介于0.680 0～0.973 3,平均为0.844 3。根据遗传距离进行UPGMA聚类分析,可将16份榧树种质分为3个类群,其中第一个类群由‘东白珠’和‘细珍珠’组成;第二个类群包括‘象牙榧’、‘龙凤细榧’、‘新昌1号’、‘东榧1号’、‘东榧4号’、‘磐安20301’、‘磐安20302’、‘...     

人工栽培石斛的ISSR标记分析

为了给石斛品种的人工选育和杂交育种提供参考,利用ISSR分子标记技术对9种药用栽培石斛的遗传多样性进行了研究。从备选的引物中筛选出14条多态性引物,共检测到179个多态性位点,多态性比率为94.71%。Jaccard相似性指数显示：15个铁皮石斛样本的相似度介于0.264~0.536之间,6个齿瓣石斛样本的相似度介于0.351~0.561之间,不同种间的相似度介于0.115~0.371之间。虽然种内与种间的相似度值存在一些交叉情况,但UPGMA聚类分析表明,不同种的石斛之间并不存在明显的杂交情况。ISSR标记检测结果显示,源于不同栽培地区栽培的的石斛属植物的遗传多样性非常丰富。