小尾寒羊产羔性状的微卫星标记研究

选用位于绵羊第6号染色体上与多胎基因(FecB)紧密连锁的微卫星OarAE101、BM1329、BM143和OarHH55以及位于第4号染色体上的OarHH35对小尾寒羊的产羔性状进行标记研究,结果发现5个微卫星基因座在小尾寒羊的PIC都达到了高度多态(PIC>0 5)水平。5个微卫星基因座标记小尾寒羊的产羔性状,以OarAE101效果最好,找到了6个显著标记;其次为BM1329,找到了4个显著标记;BM143和OarHH35分别找到了2个和3个显著标记;在OarHH55基因座上没有找到显著标记。以上所产生的15个显著标记中,与产羔数有极显著正相关(P<0 01)的标记有5个,其相关大小顺序依次为OarAE101的等位基因113bp、BM143的基因型118bp/106bp、OarHH35的等位基因139bp、OarAE101的等位基因103bp和OarAE101的基因型113bp/103bp;与产羔数呈显著正相关(P<0 05)的标记有2个,其相关大小顺序依次为OarHH35的基因型139bp/127bp、BM1329等位基因170bp;与产羔数呈极显著负相关(P<0 01)的标记有4个,其负相关强弱顺序依次为OarAE101基因型111bp/101bp、OarAE101的等位基因111bp、BM1329的等位基因168bp、OarAE101的等位基因101bp;与产羔数呈显著负相关(P<0 05)的标记有4个,其负相关强弱顺序依次为BM143等位基因116bp、BM1329的等位基因186bp、BM1329基因型186bp/168bp、Oa     

微卫星标记OarAE101和BM143在4个山羊品种中的研究

选择与Booroola羊高繁殖力主效基因Fec^B紧密连锁的2个微卫星标记OarAE101和BM143，分析其在湘东黑山羊、南江黄羊、贵州黑山羊、波尔山羊中的多态分布情况。结果表明微卫星标记OarAE101在4个山羊品种中的等位基因数分别为10、8、6和8，BM143在4个山羊品种中的等位基因数分别为10、8、6和8，OarAE101／BM143在湘东黑山羊、南江黄羊、贵州黑山羊、波尔山羊中的多态信息含量值分别为0．8742／0．8052，0．7969／0．8093，0．7564／0．7462和0．7964／0．7340。湘东黑山羊OarAE101基因型为107bp／111bp基因型所对应的产羔数最小二乘均值最高（4．0头／胎），纯合基因型109bp／109bp、107bp／107bp、119bp／119bp、111bp／111bp和125bp／125bp所对应的产羔数最小二乘平均值较高，分别为2．67、2．5、2．4、2．33和2．25只／胎，故等位基因107、109、111、119和125bp对湘东黑山羊产羔数具有正效应。湘东黑山羊BM143基因型为100bp／106bp和106bp／112bp所对应的产羔数最小二乘平均值达3只／胎，BM143等位基因104、106和110bp与湘东黑山羊产羔数有显著正效应。     

黄淮山羊微卫星多态性及其与产羔数相关性的研究

以绵羊FecB、GDF9和BMP15为候选基因,同时选择绵羊6号染色体与FecB基因紧密连锁的6个微卫星标记,分析其在黄淮山羊中的多态性及其与产羔数的关系。结果表明:在黄淮山羊中均未发现FecB、GDF9基因和BMP15基因突变。微卫星Lscv043、BMS2508、300U、GC101均为多态位点;而GC101与产羔数具有较强的相关性,在GC1013种基因型中200bp/238bp基因型群体对应的第1胎产羔数和第2胎产羔数均显著高于其他2种基因型群体的对应产羔数(P<0.05);但是各基因型群体之间第3胎产羔数差异不明显;同样基因型200bp/238bp对应群体的平均产羔数极显著高于其他2种基因型群体的平均产羔数(P<0.01)。其他位点的不同基因型群体之间产羔数差异均不明显。这些结果表明,FecB基因所在区域位点对山羊产羔数亦具有一定影响,可以作为山羊早期选育的理论依据。     

西农莎能奶山羊和波尔山羊GDF9基因多态性与产羔数的相关分析

为了研究西农萨能奶山羊和波尔山羊生长分化因子9(GDF9)基因遗传多态性及其与产羔数和生长体重的相关性。根据绵羊GDF9基因序列设计4对引物,采用PCR-SSCP技术检测GDF9基因的多态性,同时用最小二乘法研究了其多态性与产羔数和生长体重的关系。所研究的西农萨能奶山羊群体和波尔山羊群体P1扩增片段存在多态性,分别定义为AA、AG和GG3种基因型;P2、P3和P4扩增片段均不存在多态性,只出现一种带型。通过测序发现:GG型与AA型相比在外显子2的792 bp处有1个G→A的单碱基突变,结果导致第396位氨基酸由缬氨酸变为异亮氨酸。在西农莎能奶山羊群体中,AA基因型产羔数最小二乘均值均极显著高于AG基因型和GG基因型;AG基因型显著高于GG基因型。此外,在西农莎能奶山羊中还发现AA基因型的个体各个生长阶段的体重和GG型和AG型的相比差异均不显著。在波尔山羊群体中,AA基因型产羔数最小二乘均值均极显著高于AG基因型和GG基因型,AG基因型的高于GG型,但没达到显著水平。结果表明,GDF9基因对西农莎能奶山羊和波尔山羊的产羔数均有显著影响,因此认为GDF9基因外显子2第792 bp处G→A的突变可作为西农莎能奶山羊和波尔山羊多胎性状的有效分子标记。     

湖羊产羔性状的微卫星标记与可能生产力的关联性分析

选择位于绵羊第6号染色体上与多胎基因（Fec^B）紧密连锁的微卫星OarAE101、BM1329、BM143和OarHH55标记以及位于第4号染色体上的OarHH35标记对湖羊的产羔性状进行研究,结果显示：湖羊的5个微卫星座位都达到了高度多态水平（PIC〉0．5）,5个微卫星座位可以用于湖羊产羔性状的遗传多样性的评估。方差分析结果表明：5个基因座中OarAE101、BM143各基因型产羔数生产力之间存在极显著差异（P〈0．01）,OarHH35各基因型产羔数可能生产力之间存在显著差异（0.01〈P〈0．05）,BM1329、OarHH55各基因型产羔数可能生产力之间差异不显著（P〉0．05）。在OarAE101标记中107／113的产羔数最小二乘平均值为最大,与基因型103／113、107／107、101／111、113／113、107／111和103／103之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异不显著（P〉0．05）,但与101／101和103／107之间产羔数最小二乘平均值差异显著（O．01〈P〈0．05）,与115／115和111／111之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异极显著（P〈0．01）。在OarHH35标记中139／139的产羔数可能生产力最小二乘平均值为最大,与基因型139／141、139／127、137／125之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异不显著（P〉0．05）,但与127／127、125／125和139／125之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异极显著（P〈0．01）。在BM143标记中118／118的产羔数可能生产力最小二乘平均值为最大,与基因型118／106、118／110、106／104和112／114之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异不显著（P〉0．05）,但与118／116和102／106之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异显著（0.01〈P〈0．05）,与102／104、112／102和116／112之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异极显著（P〈0．01）。研究将在今后湖羊品种的标记辅助选择和分子育种中具有重要的应用价值。     

探讨微卫星作为地方山羊品种生长性状的遗传标记

采用微卫星技术及最小二乘拟合线性模型，利用崂山奶山羊、济宁青山羊、鲁北白山羊和莱芜黑山羊4个地方山羊品种中的10个多态性微卫星基因座，分析了微卫星基因座及其等位基因对山羊生长性状的关联效应。结果表明：与品种、性别和年龄等因子比较，标记因子对山羊体重和体尺性状的影响较小，但发现BM6404、BM1818、BM812和BM6444基因座对体重有显著影响（P〈0．05或P〈0．01），BM6404、BM1818、BMS12484、MAF70基因座对主要体尺性状有显著影响（P〈0．05或P〈O．01）。BM6404基因座的等位基因130可能对山羊的胸围、体高、尻宽均有正效应；120对胸围有较强的负效应，而对体高、尻长则有较强的正效应；168对尻长、尻宽均表现为负效应。MAF70基因座的等位基因142对体长有正效应，178对体长有负效应。BMS1248基因座的等位基因128对管围有正效应。     

波尔山羊2号和8号染色体微卫星标记与产羔性状的关联研究

根据山羊2号和8号染色体遗传连锁图谱,选取8个微卫星标记INRA040、LSCV22、LSCV37、IDVGA64、FCB011、INRA129、SRCRSP10和CSSM47,分析它们与波尔山羊产羔性状的关联。结果表明：所研究的8个波尔山羊微卫星基因座均为高度多态性基因座（PIC〉0．5）。与波尔山羊产羔性状有显著效应的等位基因10个。其中与波尔山羊第1胎产羔数有显著正效应的等位基因1个：LSCV22的189bp;与波尔山羊第1胎产羔数有显著负效应的等位基因4个：LSCV22的179和191bp,SRCRSP10的273和303bp;与波尔山羊第2胎产羔数有显著正效应的等位基因6个：LSCV22的189bp、IDVGA64的281、283和245bp、FCB011的143和165bp。     

微卫星标记BM1329在2个山羊品种中的初步研究

依据微卫星标记在相近物种中具有高度保守性这一特点,选择与绵羊高繁殖力主效基因FecB紧密连锁的一个微卫星标记BM1329,分析其在云南黑山羊和努比山羊中的多态性以及与山羊产羔数的关系。结果表明:微卫星标记BM1329在2个山羊品种中均存在AA、AB和BB型3种基因型。统计检验表明,品种与基因型显著相关,云南黑山羊以AA型为主,努比羊以AB型为主。虽然本研究表明微卫星标记BM1329不同基因型最小二乘山羊产羔均数差异不显著,但云南黑山羊与努比羊的产羔数差异极显著,即存在AB型山羊产羔数大于AA型山羊产羔数的趋势,所以微卫星标记BM1329仍可作为探讨山羊高繁殖性能的一个候选标记进行深入研究。     

Booroola羊FecB基因的遗传标记研究进展

从美利奴绵羊中衍生出来的Booroola羊携带增加排卵数和产羔数的一个常染色体突变基因(FecB).基因效应对排卵数是加性的,对产羔数是部分显性的.该位点已被定位到绵羊6号染色体上微卫星标记OarAE101和BM1329之间一个10cM区间内.正在开展限定紧密的侧翼标记的研究工作.     

9个微卫星基因座在太行黑山羊中的遗传多样性研究

通过9个微卫星标记研究太行黑山羊的遗传多样性,为地方山羊品种的选种、选育及保种工作奠定基础。本研究选取位于绵羊第6号染色体上与高繁殖力主效基因FecX和FecB紧密连锁的7个微卫星基因座(TGLA68、OarAE101、BM1329、LSCV043、BM143、OarHH55、GC101)和第4号染色体上的微卫星基因座OarHH35及第8号染色体上的微卫星基因座BM1227,对其进行遗传多样性研究。结果表明:在太行黑山羊中的9个微卫星座位共检测到69个等位基因,平均为7.67个;9个微卫星基因座的平均多态信息含量为0.781,每个微卫星基因座的PIC>0.5,9个微卫星基因座的平均有效等位基因数、平均杂合度分别为5.24、0.81。由此表明,9个微卫星标记均具有高度多态性,可用于太行黑山羊的遗传多样性的分析。     

湖羊产羔性状的微卫星标记与其产羔数的关联性分析

选用位于绵羊第6号染色体上与多胎基因(FecB)紧密连锁的微卫星O arAE101、BM 1329、BM 143和O arH H 55以及位于第4号染色体上的O arH H 35标记对湖羊的产羔性状进行研究。结果发现湖羊的5个微卫星位点都达到了高度多态水平(PIC>0.5),这5个微卫星位点可以用于湖羊产羔性状的遗传多样性的评估。方差分析结果表明:5个位点中O arAE101、BM 143各基因型产羔数之间存在极显著差异(P<0.01),BM 1329、O arH H 35各基因型产羔数之间存在显著差异(P<0.05),O arH H 55、BM 1329各基因型产羔数之间差异不显著(P>0.05),本研究对今后湖羊品种的标记辅助选择和分子育种具有重要的应用价值。     

山羊品种遗传多样性的分析

利用6个微卫星标记对中西部7个山羊品种(陕南白山羊、陕北白绒山羊、西农萨能羊、关中奶山羊、太行山羊、黄淮山羊、伏牛山羊)共计322个个体进行了遗传多样性检测,并根据Nei氏遗传距离进行了聚类分析。结果表明:6个微卫星标记在这7个品种中存在高度多态性;陕北白绒山羊的遗传变异程度最大,平均杂合度和平均多态信息含量分别为:0.8401和0.8244;而关中奶山羊的遗传变异程度相对较小,平均杂合度和平均多态信息含量分别为:0.7990和0.7784。UPGMA聚类分析表明,黄淮山羊和伏牛山羊聚为一类,陕南白山羊,太行山羊,陕北白绒山羊依次加入,西农萨能羊和关中奶山羊作为一类最后加入。     

Genetic variation of ten microsatellite loci in Makui sheep of Iran

The native breeds, because of their natural selection against harsh environment and adaptation to regional conditions are important to resource-poor farmers and pastoralists. The molecular characterization of genetic variation is a fundamental step to manage and conserve indigenous breeds. The aim of this study was to determine the genetic variation of Makui sheep. Totally, 100 sheep (60 ewes, 10 ram and 30 lambs) were used in this study. Polymerase Chain Reaction (PCR) was performed using microsatellite primers BM1329, OarAE101, OarFCB11, OarFCB128, OarFCB129, OarFCB20, OarFCB304, OarFCB5, OarHH35 and OarHH55 in a standard 25 μl reaction. All microsatellite loci were amplified and produced minimum 2 and maximum 14 alleles ranging from 90 to 185 bp in size. The mean number of alleles for each locus was 6.8. Loci OarFCB128 and OarAE101 produced the highest (8.5288) and the lowest (1.0304) effective number of alleles, respectively. The mean expected heterozygosity for all loci was 0.6893 (range 0.0295–0.8837). The highest (2.12) and the lowest (0.07) Shanon Index was observed in OarFCB11 and OarAE101, respectively. Only two (OarFCB5 and OarAE101) out of ten loci were in Hardy-Weinberg equilibrium. The present study was able to demonstrate a reasonable genetic variation and polymorphism across all microsatellite loci studied in the Makui sheep.     

辽宁绒山羊7个微卫星位点的遗传多样性分析

试验分析了7个微卫星基因座位OarAE101、OarJMP8、BM143、BM6506、BM1824、BM6438I、LSTS004在辽宁绒山羊4个家系中的遗传多态性。结果表明,7个微卫星标记中仅有4个微卫星位点(OarAE101、OarJMP8、BM143、BM6506)表现出了多态性。OarAE101位点多态信息含量最高,为0.727;BM143位点多态信息含量最低,为0.526。在所标记群体中平均有效等位基因数为3.249个;平均多态信息含量为0.635;遗传杂合度均值为0.638。说明辽宁绒山羊品种内的遗传变异处于一个较高的水平,遗传多样性丰富,选择潜力很大。     

微卫星标记BMS2508在4个山羊品种中的遗传多样性研究

微卫星DNA又称简单序列重复、短串联重复序列和简单序列长度多态性,广泛存在于真核生物基因组中.微卫星多态性是由于减数分裂过程中不等交换造成变异而产生的,具有保守性,其核心序列为2～6 bp,重复约10～20次,属于等显性遗传.自1989年在人类基因组研究发现微卫星多态性后,目前在马、牛、猪、绵羊和鸡等动物基因组中也筛选出了大量的微卫星标记,但山羊等动物中则相对较少.     

湘东黑山羊BM1329微卫星标记的遗传多态性研究

利用经筛选的绵羊微卫星引物BM1329,采用聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳,对湘东黑山羊的BM1329微卫星基因座进行了多态性检测。结果表明:该基因座有8个等位基因,其片段大小在175bp~215bp之间,计算了该基因座各等位基因频率、基因型频率及其平均基因杂合度(0.8305)、多态信息含量(0.8090)和有效等位基因数(5.9001)。说明在湘东黑山羊中微卫星标记BM1329基因座具有丰富的遗传多态性。     

微卫星标记BM1329在湘东黑山羊中的遗传多态性研究

利用经筛选的绵羊微卫星引物BM1329,采用聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳,对湘东黑山羊的BM1329微卫星基因座进行了多态性检测。结果表明:该基因座有8个等位基因,其片段大小在175bp-215bp之间,计算了该基因座各等位基因频率、基因型频率及其平均基因杂合度(0.8305)、多态信息含量(0.8090)和有效等位基因数(5.9001)。说明在湘东黑山羊中微卫星标记BM1329基因座具有丰富的遗传多态性,可用于山羊遗传多态性的评估,也为山羊的选育、保存和利用提供了一定的科学理论依据。