朱鹮全基因组序列图谱绘制完成

4月15日,西安交通大学和华大基因在西安交通大学科学馆召开新闻发布会,宣布朱鹮全基因组序列图谱绘制完成。这是继家鸡基因组、珍珠鸟基因组、火鸡基因组之后,世界上完成的第四个鸟类基因组测序项目和全基因组序列图谱,其对于挽救和保护朱鹮和注释生命现象具有重要科学价值和战略意义。     

我国科学家成功破译飞蝗基因组图谱

正1月16日记者从中科院获悉,由该院动物研究所康乐院士领衔,深圳华大基因研究院和中科院北京生命科学研究院等单位参与的一项研究,成功破译了飞蝗的全基因组序列图谱,这是迄今人类破译的最大动物基因组。基于基因组信息,科学家们还揭示了飞蝗食性、迁飞和群聚的奥秘。飞蝗是世界性的重要农业害虫,在过去近百     

中外科学家成功绘制达尔文雀基因组图谱

万种脊椎动物基因组计划(G10K)联盟和华大基因近日联合宣布,勇地雀基因组图谱绘制完成。这是双方合作完成的首个可在UCSC基因组数据库中获取的脊椎动物基因组。专家表示,达尔文雀的表型多样性是达尔文进化论的典型例子。本研究将有助于对生活在同一岛屿上的具有丰富遗传多样性的近缘物种基因组进行研究,了解这些物种的遗传学和性状进化机制。勇地雀是最早由达尔文记载的生活在加拉帕戈斯群岛上的13种达尔文雀之一,是研     

全基因组SNP分析证实火鸡遗传多样性低于鸡

火鸡的遗传多样性对相关选育品种的遗传改良具有非常重要的作用,也是先决条件之一。为此,荷兰瓦赫宁根大学联合美国农业部贝茨维尔农业研究中心和史密森生物保护研究所采用新一代测序技术对32只     

首个绵羊“虚拟基因组图谱”问世

新华网堪培拉 11月13日电澳大利亚联邦科学与工业研究组织13日发表公报称。一个跨国科学家小组用电脑绘制出了世界上首个绵羊“虚拟基因组图谱”。并称这将为生产更优质的羊毛和羊肉提供帮助。     

基于简化基因组测序的永登七山羊遗传多样性分析

旨在通过简化基因组测序(specific-locus amplified fragment sequencing, SLAF-seq)技术分析永登七山羊群体遗传多样性和群体结构,为永登七山羊作为新发现资源申报提供支撑。本研究以甘肃省4个地方绵羊群体(每个群体随机选取10只成年健康母羊)作为研究对象,利用SLAF技术检测全基因组范围内的单核苷酸多态性位点(SNPs)。通过perl编程计算观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、香浓维纳指数(SHI)和基因多样性指数(Nei)等5个遗传多样性指标;PopLDdecay软件分析每个品种连锁不平衡情况;elgensoft软件进行主成分分析(PCA);mega x软件构建4个绵羊品种的系统发育树;structure软件进行群体遗传结构分析;gcta软件进行亲缘关系分析。结果表明,40只绵羊个体共检测到1 658 596个SNPs位点,其中大部分SNPs位点位于基因间区域。永登七山羊群体Ho、He、PIC、SHI、Nei指标值分别为0.082、0.277、0.221、0.411和0.305,且永登七山羊的连锁不平衡系数较高,...     

我科学家破译飞蝗基因组图谱并揭示其奥秘

<正>记者日前从中科院动物所获悉,我国科学家成功破译了飞蝗的全基因组序图谱,并揭示了它为什么偏爱吃粮食、能长途迁飞、喜好群聚而行等奥秘。相关论文1月14日在线发表于《自然·通讯》杂志。飞蝗是世界性的重要农业害虫,取食水稻、小麦、玉米、高粱、谷子等多种禾本科植物。当蝗灾暴发时,蝗虫可形成高密度蝗群并可以长距离迁飞。近百年来,科学家们一直致力于揭示蝗灾暴发的机制。     

基于低深度全基因组测序分析内江猪群体结构和遗传多样性

旨在更好的了解内江猪群体结构和遗传多样性,更好的保护和利用内江猪遗传资源。本研究基于低深度全基因组测序,检测了133头(12头公猪,121头母猪)内江猪的SNP,按照SNP检出率大于90%和95%获得两组SNP数据,分别编号为NJ90和NJ95。针对两组数据,通过群体分层、遗传距离、亲缘关系、家系划分等方法分析了内江猪群体结构,通过等位基因频率、有效等位基因数、多态性标记比、杂合度等指标估计了群体遗传多样性,最后利用不同方法评估了群体近交系数。结果显示：1)NJ90共包含135 760个SNPs位点,其等位基因频率为0.87,有效等位基因数为1.27,多态性标记比为0.76,观测杂合度为0.15,期望杂合度为0.21;NJ95包含32 266个SNPs位点,其等位基因频率为0.79,有效等位基因数为1.44,多态性标记比为0.74,观测杂合度为0.30,期望杂合度为0.31。2)NJ90结果显示群体平均遗传距离为0.20,平均亲缘系数为0.9%;NJ95结果显示群体平均遗传距离为0.25,平均亲缘系数为0.7%。3)根据NJ90公猪和群体聚类以及亲缘关系,可将群体分为6个家系。4)根据...     

40个蚕基因组测序揭开了其选育史

中国古代通过处死那些将蚕或蚕卵走私出国的人来保护蚕丝生产的秘密。在蚕丝生产技术传播到日本、韩国、中东和欧洲之前,这种处罚措施一直持续了几千年。但是现在,中国无私地提供家蚕的秘密：在这个星期SCIENCE杂志在线网络上（http：／／www．sciencemag．org／cgi／content／abstract／1176620）,     

我国圈养和野生东北虎种群线粒体基因组遗传多样性的比较研究

东北虎（Panthera tigris altaica）是体型最大的猫科（Felidae）动物之一,是极具代表性的珍稀野生动物。现有研究表明,我国野生东北虎种群遗传多样性较低、近交水平较高。尽管目前我国野生东北虎的数量在逐步增长,但通过人工干预来提高野生东北虎的遗传多样性会更利于其数量的恢复,通过野化放归进行遗传拯救是一种关键策略,但实施遗传拯救之前,必须确定圈养个体与现存野生个体间的遗传关系。采用粪便DNA的高通量测序数据组装了51只横道河子圈养东北虎和13只完达山、老爷岭等地的野生东北虎的线粒体基因组,分析两者之间的关系,评估线粒体基因组的遗传多样性。结果表明：圈养东北虎的遗传多样性高于野生种群,所有遗传变异均为无害。部分圈养个体与野生种群同属一个进化支,且具有野生种群所不包含的遗传变异,可用于实施遗传拯救。此外,圈养种群存在显著的遗传分化,一个与当前野生种群关系很远的分支可能代表未知的地理种群,因此,建议对该远缘分支开展野外来源的追溯,确定其谱系地理学地位和保护价值,使其成为恢复野外历史遗传多样性的后备资源。     

华大基因研究院“解密”水牛基因组

近日,孟加拉LalTeer畜牧科技公司和深圳华大基因研究院正式签署合作协议,宣布联合开展水牛基因组测序和生物信息学分析等相关研究。该项目将为深入了解水牛这一物种的起源驯化过程及其品种选育等奠定重要的分子基础。     

从测序到编辑：家蚕基因组研究再获突破

家蚕是一种重要的经济昆虫、文化载体和模式生物,其不但在蚕丝产业的发展和丝绸之路的文化传播中做出了卓越的贡献,在蚕丝纤维新材料、生物反应器和模式生物中也逐渐凸显出广阔的应用前景。为了对家蚕进行更深入的研究和利用,西南大学夏庆友教授领衔的家蚕基因组研究团队率先开展了家蚕基因组研究,并于2004年和2009年先后在《science》杂志上公布家蚕基因组图谱和家蚕遗传变异图谱。在该研究的推动下,团队在功能基因组研究、家蚕转基因和家蚕生物反应器方面取得了显著的进展,家蚕的研究也受到越来越广泛的关注。但是,家蚕要成为全世界公认的生物反应器和模式生物,依然有很长的路要走,其中最重要的一步就是定点敲除和敲入等基因组编辑技术的建立。     

生物饲料国家开发工程研究中心专家技术委员第二次扩大会议专家发言摘登

<正>刘建新教授:生物饲料范畴划分有待进一步确认生物饲料的发展首先要解决生物饲料安全与环境污染的防护问题。我个人觉得,抗菌肽作为当今备受关注的安全无副作用饲料添加剂,理应包含在生物饲料的定义范畴内。另一方面,饲料和饲料添加剂是两种不同的概念,应区别对待。现在存在一种说法称,污染关注料的种不