银白杨×马氏杨杂交子代及亲本的AFLP分析

为了探讨银白杨、马氏杨及银白杨×马氏杨杂交子代间的遗传多样性参数及个体聚类关系,利用8对引物对银白杨、马氏杨及银白杨×马氏杨杂交子代4个样本进行了AFLP分析。结果表明,8对引物共扩增出780条扩增谱带,其中多态性条带数为715条,多态性比例为91.65%,平均有效等位基因数为1.5017,Nei’s平均遗传多样性指数为0.3065,Shannon平均信息指数为0.4679。不同杂交子代在E-AAC/M-CAG引物对上均有特异性位点,这些特异位点可用于品种鉴定。聚类研究发现,在相似系数为0.76时,试验样品分成2个AFLP群,其中马氏杨为1个AFLP群,银白杨及2个杂交子代为1个AFLP群;当相似系数为0.78时,银白杨和2个杂交子代的AFLP群又划分为2个亚群,其中杂交子代1和杂交子代2聚合为亚群1,银白杨为亚群2。本研究的结果多态性比例很高,对样品的区分率达到100%,为杨树AFLP分析检测提供了指导借鉴价值。     

银白杨×N001杨杂交子代及亲本的AFLP分析

本研究在对选择性扩增引物进行筛选的基础上,对银白杨、N001杨及银白杨×N001杨杂交子代共10个样本进行了AFLP试验,并利用Popgene和NTsys软件分别对遗传多样性参数及个体聚类进行分析。结果表明:筛选出的8对选择性扩增引物,共扩增出969条谱带,多态性条带数929条,多态性比例为95.76%,平均有效等位基因数为1.4329,Nei's平均遗传多样性指数为0.2662,Shannon平均信息指数为0.4161。不同杂交子代在E-ACC/M-CAC引物对上均有特异位点,这些特异位点用于申报优良品种保护。在通过NTsys软件聚类后,在遗传相似系数为0.76时,将10个试样分为2个大支,其中N001杨为1个AFLP群,银白杨及8个杂交子代为1个AFLP群;当遗传相似系数为0.79时,银白杨与8个杂交子代的AFLP群又细化为2个亚群,其中杂交子代2和杂交子代6聚合为亚群1,银白杨和其余6个杂交子代为亚群2。本研究的结果多态性比例很高,对样品的区分率达到100%,为杨树AFLP分析检测提供了较好的应用和指导借鉴价值。     

橡胶树优异种质的AFLP初步分析

通过AFLP方法,对15份特异种质及在云南植胶区选择的45份优良单株进行了基于遗传相似性系数的UPGMA聚类分析,得到60份优异种质的聚类图,并初步分析了60份种质间的遗传变异情况及AFLP方法对于分析橡胶树遗传变异的实用性,为橡胶树选育工作及该60份种质的进一步鉴定利用奠定基础。     

柳树种质资源的收集保存及品种对比试验

通过建立种质资源库和对比试验林,在一个生长周期内,对引进的各柳树品种(品系)的生长量、形态、抗性等指标进行记录分析,结果表明,旱×白606,蒙×旱330表现出较强的生长适应性及抗性,可以作为用材树种予以推广,其余品种(品系)经过较长时间栽培,基本能适应本地气候,但生长不是很好。     

楸树优良种质资源的AFLP遗传多样性分析

为研究44份楸树种质资源的遗传多样性及亲缘关系,利用AFLP分子标记技术,对采自鲁豫地区的44份楸树优良种质进行了分析。结果表明:筛选出的8对PstI/MseI引物组合从44份楸树种质中共扩增出1087条清晰条带,其中多态性条带(NPB)1043条,多态性比率(PPB)达到95.60%。平均每对引物可扩增出135.88条带和130.38条多态性带。每个位点的平均有效等位基因数(Ne)、Nei’s平均基因多样性(H)、Shannon平均信息指数(Ⅰ)分别为1.3210、0.2003和0.3204,且8对引物组合共产生261条特异性条带,表明楸树资源间具有丰富的遗传多样性。通过计算种质间遗传相似系数和进行UPGMA聚类分析得出,各种质材料间的遗传相似性系数在0.5022~0.7919间,平均为0.6527。以遗传相似性系数0.65为界44份楸树种质可划分为5组,其中第1组包括15个山东种质和2个河南种质;第2组包括18个山东种质和3个河南种质;第3组包括3河南种质;第4组包括1个河南种质;第5组包括2个河南种质。这表明不同地理生态条件造就了各种质材料间丰富的遗传多样性,其遗传多样性以及亲缘关系与其地理分布并不完全一致。综上,AFLP标记技术能较好的揭示楸树种质资源的遗传多样性和亲缘关系,可为楸树优良种质资源的收集、鉴别及利用提供参考依据。     

分子标记在柳树遗传图谱构建中的应用

综述了分子标记技术在柳树遗传图谱的构建以及QTL定位等方面的研究进展,并讨论了分子标记在我国柳树研究中的应用。     

刺五加AFLP分子标记技术体系的建立

用改良的的试剂盒法提取刺五加叶片的基因组DNA,可以获得高质量的刺五加基因组DNA,DNA降解较少、污染低、电泳条带清晰,可以用于PCR扩增反应,可以被内切酶EcoRⅠ和MseI彻底消化。通过优化酶切反应、引物连接、预扩增、选择扩增,建立了优化的刺五加AFLP分析技术体系,从64对引物中筛选到5对高效扩增引物,并利用这5对引物在6个刺五加种源中获得了89个多态性AFLP分子标记。建立了利用红外荧光检测技术和Li-Cor4300DNA分析系统,进行刺五加AFLP分析的分子标记技术。     

柳树花粉生活力分析

花粉生活力是植物杂交育种成败的现柳树种间、杂种间及亲本与杂种之间的花粉生活力差异较大.用花粉生活力较高的绵毛柳P716做花粉贮藏实验,结果表明花粉生活力与贮藏时间呈负相关,低温干燥对花粉贮藏是有利的.     

顽强的柳树

那天我去一个废弃的工业园区找朋友，因为朋友忙，百无聊赖中，我就在那些倒塌的和没有倒塌的厂房间随意溜达。     

苹果属种、杂交种及品种之间关系的AFLP分析

用AFLP技术,对72个苹果属植物样本(34个种、变种、杂交种及38个品种)进行遗传多样性分析.在64对AFLP引物中选出6对引物进行扩增,得到有效谱带1692条,其中多态谱带1547条,多态谱带比率为91.4%.对72个样品的试验数据进行聚类分析,它们的相似系数为0.54～0.82.在相似系数0.60处参试材料被分为4大类,即佛罗伦萨苹果(Malus florentina)为一类;绿苹果组(Sect.Choromeles)和多胜苹果组(Sect.Docyniopsis)分别各聚一类;花楸组(Sect.Sorbomalus)、脱萼组(Sect.Gymnomeles)和苹果组(Sect.Malus)聚为一类,所有苹果品种和观赏海棠品种全聚在原产亚洲的花楸组、脱萼组及苹果组中.亚洲原产的苹果属植物对于苹果及观赏海棠品种的发展起重要作用.根据试验结果及文献资料,支持将佛罗伦萨苹果组(Sect.Florentinae Cheng M.H.)成立单种组;建议将原属花楸组植物除佛罗伦萨苹果外,全部并入苹果组;取消脱萼组,将其组内的植物全部并入苹果组.     

毛新杨×毛白杨AFLP分子遗传图谱

利用毛新杨×毛白杨的杂交群体构建了毛新杨×毛白杨的AFLP分子遗传图谱,这个群体对杨树溃疡病的抗性是正态分布。本实验使用AFLP分子标记技术对这一构图群体进行了分析,共选用了19对PstI/MseI引物和4对EcoRI/MseI引物,得到标记662个,其中3∶1标记占43 2%,异倍标记占14 5%,偏分离标记(P<0 05)占48 8%。在双亲整合的图谱中,239个标记形成22个含4个以上标记的连锁群,总图距4418cM,标记间的平均图距是18 5cM。图中还有8个重复位点和7个只与连锁群中的某一个标记连锁,但却无法加入这一连锁群的标记,这可能是由染色体的同源性造成的。此外还得到15个属于双亲共有的只有2～3个标记的小连锁群,13个父本独有的连锁群和21个母本独有的连锁群。     

杨树部分种的AFLP遗传多样性分析

利用10对AFLP引物对杨属5个派20个种及杂种的44份杨树材料进行分析.结果表明:在这些材料中,不同引物组合的多态性均为100%,表明杨属种间及无性系间在DNA 水平上存在广泛变异.利用 UPGMA 法对 AFLP 数据进行聚类分析,相似系数在 0.765～0.971 之间,派间聚类与经典形态分类完全一致,派内种间及种内无性系间聚类与形态分类基本相同.构建了 44 份材料的指纹图谱,在该图谱中,每个材料都具有自身独特的条带.最后,探讨根据分子标记结果进行杂交亲本选配及杂种子代早期选择的可行性.     

杨属部分种及杂种的AFLP分析

利用13对AFLP引物对杨属4个派19个种及杂种的47个无性系进行分析,共检测到858个标记,其中多态性标记为771个,多态性位点的百分率为89.9%,每对引物产生的多态性位点的百分率在80.7%～98.1%之间,表明杨属种间及无性系间在DNA水平上存在广泛变异.根据AFLP标记结果计算杨属派间、派内种间、种内无性系间分子遗传距离,对它们的亲缘关系进行定量描述.聚类分析结果表明,派间聚类与经典形态分类完全一致,派内种间及种内无性系间聚类与形态分类基本相同.最后,探讨根据分子标记结果进行杂交亲本选配及杂种子代早期选择的可行性.     

松树脂溃疡病菌及其近缘种AFLP分析

利用AFLP分子标记技术对松树脂溃疡病菌及其近缘种进行DNA指纹分析,筛选出10对多态性较高的引物.上述引物在供试的9种17个菌株中共扩增出298条带,其中有多态性带283条,多态性位点百分率为94.97%.每对引物产生的多态性位点百分率在89.29%-100%之间,表明松树脂溃疡病菌及其近缘种间在DNA水平上存在广泛变异.根据AFLP标记结果计算松树脂溃疡病菌及其近缘种间的相似系数,对它们的亲缘关系进行定量描述.聚类分析结果表明,菌株间的聚类与生物学种分类的结果一致.分析引物E-AT/M-CAA绘制的镰刀菌AFLP指纹图谱遗传多样性,确定李瑟组镰刀菌各交配群的特异带、差异带,区分供试的7个交配群.     

AFLP标记及其在植物中的应用

对AFLP基本原理、技术流程及特点做了简要介绍;从遗传多样性和亲缘关系分析、遗传连锁图谱构建、种质资源鉴定、基因定位与克隆、基因表达与调控、分子标记辅助选择育种等方面概述了AFLP标记在植物中的应用,并对其应用前景进行了展望。     

人心果品种资源亲缘关系的AFLP分析

利用荧光AFLP分子标记技术对27个人心果品种(类型)及4个蔓妹人心果品种资源的亲缘关系进行研究.9对引物(Pst Ⅰ-Mse Ⅰ)共扩增得到1131条带(75～500 bp),其中多态性带1096条(96.90%).28个品种(类型)具特征性条带,特征带大小为350～500 bp.品种间多态性比例在22.19%～45.89%之间,遗传相似性系数为0.40～0.87.UPGMA聚类结果将31个品种聚为蔓妹人心果类群(MAM)和2个人心果类群(SAP1和SAP2).在遗传相似性系数0.52处,4个蔓妹人心果品种首先被区分开,单独聚为一类(MAM).人心果类群中,11个美国品种和10个国内地方类型在相似性系数0.66处聚为一大组(C、D组),相互之间表现出较近的亲缘关系.大部分栽培品种聚于D-2亚组,与地方类型有一定的遗传距离,说明栽培种的亲缘关系较为相近.人心果表型标记与分子标记结果间存在一定差异,二者的相关性不高.     

部分箬竹属植物的荧光AFLP分析

利用AFLP技术,选择EcoR I/Mse I这一酶切组合,应用9对(EcoR I+3)/(Mse I+3)引物组合进行选择性扩增,检测16种箬竹和5个形态相似的外源竹种的基因组DNA多态性.在21个样品基因组中共获得1 367条清晰的谱带,其中共有条带115条,特异性带273条,特异性缺失条带72条.在16个箬竹样品基因组中共获得1 193条清晰的谱带,其中共有条带190条,特异性带177条,特异性缺失条带98条.这些特异性带或特异性缺失条带可作为识别不同竹种的分子标记.聚类结果表明:所有的箬竹属植物聚成一类,其他5种外源植物聚成一类.此外,AFLP分析提供的分子证据,支持耿氏分类系统(1996),将天目箬竹归入阔叶箬竹中.     

木瓜属优良品种亲缘关系的AFLP分析

用AFLP技术对29个木瓜属品种的亲缘关系进行分析.用8对引物(EcoRⅠ+3/Mse Ⅰ+3)对基因组DNA进行选择性扩增,共获得1095条扩增带,其中1035条具有多态性,多态带百分率达94.52%,揭示木瓜品种具有丰富的遗传多样性.采用NTSYS-PC软件的DICE法计算样本间的相似系数,UPGMA法进行聚类分析.结果表明:品种间的相似系数在0.4650～0.8339之间,具有相似形态特征的品种优先相聚,29个品种可以划分为4类,且基本对应着贴梗海棠、日本木瓜、木瓜海棠和傲大贴梗海棠,但品种'猩红与金黄'宜归人贴梗海棠内,而'碧雪'的分类地位值得进一步探讨.说明AFLP标记技术能较好地揭示木瓜属种质资源的亲缘关系及演化规律.     

银杏雌株种质遗传关系的AFLP分析

从64对Eco RI/MseI引物(其中MseI引物为荧光标记物)中筛选出7对扩增产物多态性高、谱带清晰的引物.对来自日本、法国和中国的49个银杏雌株种质的遗传关系进行研究.结果表明:7对引物共产生1 219条谱带,132个特异位点(其中缺失带11条、单态带121条),多态带1 200条,多态带的比例为98.44%;每对引物鉴别效率为100%.49个雌株种质之间相似系数为0.39～0.83,来自不同国家的雌株遗传变异程度不同.当相似系数为0.51时,供试种质可分为2类,来源地相同的种质并不单独聚成一类,山东大部分雌株种质聚为一类,它们与其他的雌株种质有显著的遗传差异,亲缘关系较远.叶籽银杏不是很原始的种质,而'海阳'则比较原始.对雌株种质的特异位点、相似系数、聚类结果等的综合分析表明,法国的'垂枝银杏'、日本的'黄金丸'、中国的'盘县1'、'灵川'、'安陆'、'东安1'、'西山大佛手'、'荣城'、'煜?、'郯城2'、'泰安1'、'泰安2'、'泰安3'、'崂山'、'海阳'、'灵岩'16个种质是银杏雌株中的重要特异种质.