贵州荷斯坦奶牛嗜乳脂蛋白基因多态性及与产奶性状的关联分析

为了解贵州荷斯坦奶牛嗜乳脂蛋白基因的多态性,采用PCR-RFLP法对100头贵州荷斯坦奶牛的嗜乳脂蛋白基因进行了等位基因多态性分析。在此基础上,利用实验奶牛的乳蛋白率、乳脂率及产奶量数据,应用统计学方法对贵州荷斯坦奶牛嗜乳脂蛋白基因多态性与产奶性状的关联进行了分析。结果显示,共获得A、B 2种等位基因,其中A基因频率为0.680 0、B基因频率为0.320 0。共发现3种等位基因型,其中AA基因型频率最高,为0.630 0;其次为BB基因型,频率为0.250 0;AB基因型频率最低,为0.120 0。群体多态信息含量为0.336 3,纯合度为0.572 1,杂合度为0.427 8。BB型个体的305 d产奶量极显著高于AB型和AA型（P〈0.01）。结果提示,嗜乳脂蛋白基因的BB基因型可以作为选择高产奶牛的分子标记。     

荷斯坦牛LF基因5’UTR区多态性分析

本研究采用PCR-SSCP技术对303头奶牛的乳铁蛋白基因5’UTR区进行遗传多态性检测,以确定其等位基因数以及核苷酸变异位点,探讨其遗传特性结果表明,LF基因在扩增区域的64bp处发生G→C的突变,形成AA、AB、BB三种基因型,其基因型频率分别为0.2541、0.4455和0.3004,等位基因A和B的频率分别为0.4796和0.5231。群体遗传学分析发现荷斯坦牛LF基因的有效等位基因数(Ne)、遗传杂合度(He)和多态信息含量(PIC)分别是0.4989、0.4455和0.3745。经卡方适合性检验表明该群体处于Hardy-Weinberg平衡状态(P0.05)。中国荷斯坦牛LF基因5’UTR区的多态性相对较高,遗传变异相对较大,提示该位点有望作为荷斯坦牛乳腺炎抗病育种的标记位点之一。     

荷斯坦牛TLR2基因遗传多态性与乳腺炎抗性关系分析

利用PCR-RFLP方法检测TLR2基因在297头中国荷斯坦牛中的多态性,并分析其多态性与体细胞评分(SCS)的相关性.结果显示,TLR2基因exon2扩增片断的109 bp处产生C→A的突变,并导致天冬氨酸改变为谷氨酸.TLR2基因exon2被EcoRV消化后表现多态性,表现AA、AB、BB 3种基因型,其中B等位基因为优势等住基因,等位基因频率为0.784 5,而A等位基因频率则为0.215 5.经X2适合性检验,中国荷斯坦牛在该位点达到Hardy-Weinberg平衡状态.同时,群体EcoRV基因座不同基因型与SCS相关分析的结果表明,BB、AB型个体的SCS指标显著高于AA型(P<0.05),AA基因型可作为乳腺炎抗性的有利基因型,可将TLR2作为奶牛乳腺炎候选基因,应用于乳腺炎抗性分子标记辅助选择育种.     

宁夏地区荷斯坦牛Nramp1基因多态性分析

天然抗性相关巨噬蛋白(Nramp)和多种细胞内菌体的抗性感染相关联。通过对荷斯坦牛Nramp1基因第11外显子多态性进行PCR-SSCP检测结果显示,该区域存在A、B两种等位基因和AA、BB、AB三种基因型,其中等位基因A的频率为0.2692,等位基因B的频率为0.7308,基因型AA的频率为0.0833,基因型BB的频率为0.5449,B为优势等位基因,基因型BB为优势基因型。经过卡方适合性检验,荷斯坦牛Nramp1基因所测区域处于中度多态,未偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P0.05)。测序结果表明,引物扩增片段在200bp处发生G→C错义突变,从而导致氨基酸由半胱氨酸(Cys)变为丝氨酸(Ser)。     

奶牛群体生长激素基因多态性与产奶量关联性

设计7对引物,利用PCR-SSCP技术检测GH基因在130头中国荷斯坦奶牛群体的遗传多态性,研究该基因对产奶量的影响。结果发现在GH基因的第3内含子、第5外显子和3′端存在多态性。GH基因第3内含子等位基因A、B的基因频率为0.775和0.225,3′端等位基C、D在奶牛群体中的基因频率为0.729和0.271,GH基因第5外显子等位基因E、F和G、H在奶牛群体中的基因频率分别为:0.507、0.138和0.259、0.096,GH基因第3内含子座位上不同基因型对305d产奶量有显著效应,AB基因型305d产奶量显著高于AA和BB型(P0.05)。     

智利进口荷斯坦牛β-Lg和β-CN基因多态性及其对泌乳性能的影响

本研究利用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)对江苏某大型奶牛场智利进口荷斯坦牛β-Lg(β-乳球蛋白)和β-CN(β-酪蛋白)基因多态性进行分型,同时收集采样牛只2016～2018年DHI检测结果,利用最小二乘模型分析其多态性及其对泌乳性能的影响。结果表明,在检测群体中β-Lg有A、B两种等位基因,基因频率分别为0.527和0.473,有AA、AB、BB三种基因型,优势基因型为AB型,频率为0.569;β-CN有A、B两种等位基因,其基因频率分别为0.960和0.040,有AA和AB两种基因型,优势基因型为AA型,频率为0.920。方差分析表明,β-Lg对日产奶量、乳蛋白率、体细胞评分(SCS)和尿素氮含量均有极显著影响(P0.01);β-CN对乳蛋白率和脂蛋白比有显著影响(P0.05),对日产奶量影响极显著(P0.01)。该结果为利用乳蛋白基因多态性提高智利进口荷斯坦牛泌乳性能提供了参考资料。     

新疆褐牛,中国荷斯坦POU1F1基因第六外显子多态性与产奶量关联分析

[目的]为了研究POU1F1基因第六外显子多态性与产奶量的关系.[方法]以新疆褐牛,中国荷斯坦为研究对象,利用PCR-RFLP对POU1F1基因第六外显子的多态性及其与产奶量的相关性进行了分析.[结果]表明: 新疆褐牛,中国荷斯坦牛的群体在该位点分别检测到2种等位基因A/B,频率分别为:0.43/0.57,0.33/0.67,B等位基因是优势等位基因 .[结论]在新疆褐牛群体中,BB型个体的产奶量显著高于AA型,在荷斯坦奶牛中BB型比AA,AB型的产奶量高,但差异不显著.     

5个黄牛群体垂体转录因子基因变异研究

 为了阐明云南黄牛垂体转录因子(POU1F1)基因的群体变异特征,采用DNA序列分析和PCR-RFLP技术对云南地区5个黄牛群体（3个本地群体和2个引进品种）的垂体转录因子(POU1F1)基因的第5内含子和第6外显子进行了基因克隆测序和群体变异检测分析。在5个群体中均发现存在A和B两个等位基因,在国外引进的短角牛和安格斯牛中,A等位基因为优势等位基因,其基因频率分别为0.944和0.700;而在云南的昭通黄牛、迪庆黄牛和荷斯坦奶牛中B等位基因占优势,其基因频率分别为0.645,0.727和0.917;在短角牛和安格斯牛中,BB基因型频率为0;而在云南荷斯坦奶牛中,AA基因型频率为0。在所检测的座位中,昭通黄牛、迪庆黄牛和安格斯牛具有较高的杂合度,而其他群体该座位杂合度较低。     

米猪与大白猪、长白猪FSHβ基因多态性分布差异分析

采用PCR方法对FSHβ基因在中国地方猪种米猪和外种猪大白、长白这2种群体共193头母猪中的多态性分布进行分析。结果显示:2群体均有2个等位基因A和B,3个基因型AA、AB和BB。米猪各种基因型数量AA型>AB型>BB型,AA型为其优势基因型,等位基因A、B的频率分别为0.841 5、0.158 5。外种猪BB型>AB型>AA型,BB型为其优势基因型,等位基因A、B的频率分别为0.108 1、0.891 9。由此可见,中国地方猪种米猪与外种猪长白猪和大白猪的FSHβ基因多态性分布上有显著差异。     

新疆褐牛，中国荷斯坦POUIF1基因第六外显子多态性与产奶量关联分析

[目的]为了研究POUIF1基因第六外显子多态性与产奶量的关系。[方法]以新疆褐牛,中国荷斯坦为研究对象,利用PCR—RFLP对POU1F1基因第六外显子的多态性及其与产奶量的相关性进行了分析。[结果]表明：新疆褐牛,中国荷斯坦牛的群体在该位点分别检测到2种等位基因A／B,频率分别为：0．4a／0．57,0．aa／0．67,B等位基因是优势等位基因。[结论]在新疆褐牛群体中,BB型个体的产奶量显著高于AA型,在荷斯坦奶牛中BB型比AA,AB型的产奶量高,但差异不显著。     

奶牛催乳素基因多态性与产奶量的关系

通过PCR-RFLP的方法,对201头武汉荷斯坦奶牛中催乳素基因Exon3的多态性进行了分析,得到3种基因型:AA、AB和BB,基因型频率分别为81.59%、16.42%、1.99%,并时不同基因型间产奶量进行了分析。结果表明:AA、AB和BB基因型奶牛的产奶量之间没有显著差异(P>0.05);但AA基因型奶牛的产奶量最高,AB基因型奶牛的产奶量次之,BB基因型最低。     

贵州黑白花奶牛Leptin基因启动子区多态性与产奶性状关联分析

为了探讨贵州黑白花奶牛的产奶性状与Leptin基因的关联性,试验采用PCR-SSCP和DNA测序技术,对190头贵州荷斯坦奶牛Leptin基因进行单核苷酸多态性分析,分析不同基因型与产奶性状的相关关系。结果表明:Leptin基因启动子区在617 bp碱基处发生A→G的转换,表现出AA、AB、BB 3种基因型,AA基因型频率最高为0.468,A为优势等位基因,基因频率为0.65;基因型与产奶性状的关联性分析显示,AA基因型的产奶量及乳脂率均优于AB和BB基因型,但3种基因型对乳脂率的影响差异均不显著(P>0.05)。说明Leptin基因可以作为贵州黑白花奶牛产奶性状的标记辅助基因。     

中国荷斯坦奶牛催乳素基因多态性与泌乳性能关联性分析

【目的】为了了解中国荷斯坦奶牛催乳基因多态性与泌乳性能的关联性,【方法】采用PCR-RFLP技术对新疆地区357头中国荷斯坦奶牛催乳素(PRL)基因多态性进行了分析。【结果】表明,检测到三种基因型(AA、AB、BB)的基因型频率分别为0.6466、0.2461、0.1073。【结论】催乳素基因在此中国荷斯坦奶牛群体中处于Hardy-Weinberg不平衡状态。催乳素基因的杂合度为0.1008,有效等位基因数为0.8943,多态信息含量为0.1001,属于低度多态。同时对所发现的多态位点与奶牛产奶性状的关系进行了分析,探讨了催乳素基因作为影响中国荷斯坦牛产奶性状候选基因的可能性。     

中国荷斯坦牛FASN基因单核苷酸多态性对脂肪酸含量的影响

奶牛脂肪酸合成酶（FASN）在乳脂肪酸合成中起至关重要的作用。本研究利用PCR—SSCP方法检测了318头中国荷斯坦牛FASN基因第2、4、26、34外显子的单核苷酸多态性（SNP），并对FASN基因SNP对脂肪酸含量的影响进行分析。结果表明仅第34外显子（g．16009）存在A／G多态性，基因频率分别为0．4481和0．5519．其基因型分布符合Hardy—Weinberg平衡。方差分析表明，FASN基因SNP对短链脂肪酸相对含量有显著影响（P〈0．05）。AA和AB基因型短链脂肪酸相对含量显著高于BB型。该结果为奶牛脂肪酸合成的调控和选种、选育提供了理论基础。     

成都地区中国荷斯坦牛乳蛋白多态性的研究

用聚丙烯酰胺凝胶电泳对成都地区40头荷斯坦牛乳蛋白多态性进行检测。结果表明：αs1-CN和α-La均分别只表现为BB一种基因型：β-CN有AA和AB两种基因型，AA型和A基因频率分别为0.9500和0.9750；β-La表现出AA、AB和BB三种基因型，B基因频率高于A基因。     

四川省引进外种猪群体的ESR基因Pvu Ⅱ位点多态性分析

采用PCR-RFLPs方法,对四川引进外种猪(杜洛克、长白猪和约克夏)ESR基因的多态性进行研究。并对ESR基因的基因频率和基因型频率进行分析,结果表明:杜洛克出现了AA、AB、BB3种基因型,基因型频率分别为76.32%、18.42%和5.26%,A、B基因频率分别为85.53%和14.47%;长白猪中仅出现AA和AB2种基因型,且基因型频率分别为67.74%和32.26%,其中,等位基因A、B频率分别为83.87%和16.13%;在约克夏中存在AA、AB、BB3种基因型,频率分别为22.22%、61.90%和15.87%,等位基因A与等位基因B频率相当,分别为53.18%和46.82%。     

荷斯坦牛TLR6基因多态性分析

为研究中国荷斯坦牛TLR6基因的多态性,确定其等位基因数以及核苷酸变异位点,探讨其遗传特性,采用PCR-SSCP技术对303头荷斯坦牛的TLR6基因进行了遗传多态性检测。结果表明:TLR6基因在扩增区域的209 bp处发生G→A的错义突变,导致TLR6蛋白中第70位天冬氨酸(Asp)变为天冬酰胺(Asn),并产生AA、BB、AB三种基因型,基因型频率分别为0.214 5、0.122 1和0.663 4,经χ~2适合性检验,荷斯坦牛在该位点偏离了Hardy-Weinberg平衡状态(P0.05)。说明中国荷斯坦牛TLR6基因多态性丰富,该位点可以作为荷斯坦牛抗病育种的分子标记位点。     

申农I号猪ESR基因的多态性及其与繁殖性能相关性分析

本研究采用PCR-RFLP的方法,对申农I号144头母猪进行ESR基因的多态性进行检测,分析ESR基因型对头胎总产仔数与产活仔数的遗传效应。结果表明,在申农I号母猪群中,ESR基因存在遗传多态性,可分为AA、AB和BB三个基因型,A、B等位基因频率分别为0.5069和0.4931。AA型、AB型和BB型的频率分别为0.2639、0.4861和0.2500,但AA、AB和BB三种基因型与产仔数之间差异均不显著。     

贵州荷斯坦奶牛甘油二酯酰基转移酶基因多态性及其与产奶性状的关联分析

甘油二酯酰基转移酶（diacylglycerol acyl-transferase 1,DGAT1）是控制甘油三脂合成的关键酶。近年来DGAT1基因被鉴定出来,被认为是奶牛乳脂率的一个重要功能候选基因。该研究以贵州荷斯坦奶牛为试验动物,利用奶牛DGAT1基因序列设计引物,以RCR-单链构象多态性（PCR-SSCP）方法检测了奶牛DGAT1基因第8外显子的碱基突变。结果共检测到AA、AB和BB 3种基因型,基因型频率分别为0.5588、0.3824和0.0588,等位基因A和B的频率分别为0.7549和0.2451;该碱基突变对305 d校正产奶量和乳脂率的影响均达到显著水平（P<0.05）,乳蛋白率影响不显著（P>0.05）;多重比较结果表明,AA和AB型对305 d校正产奶量和乳脂率均显著高于BB型（P<0.05）。结果显示,DGAT1基因突变对贵州荷斯坦奶牛泌乳性状有较大的遗传效应,可用于其泌乳性状的分子标记辅助选择。     

申农1号猪ESR基因的多态性及其与繁殖性能相关性分析

本研究采用PCR—RFLP的方法,对申农1号144头母猪进行ESR基因的多态性进行检测,分析ESR基因型对头胎总产仔数与产活仔数的遗传效应。结果表明,在申农1号母猪群中,ESR基因存在遗传多态性,可分为AA、AB和BB三个基因型,A、B等位基因频率分别为0．5069和0．4931。AA型、AB型和BB型的频率分别为0．2639、04861和0．2500,但AA、AB和BB三种基因型与产仔数之间差异均不显著。