高通量测序技术的发展及其在生命科学中的应用

DNA测序技术从以Sanger法为代表的第一代测序技术到如今的高通量测序(HTS)技术,经历了漫长而曲折的发展过程,如今该技术在动植物基因组的研究中获得了很大的成功,它的问世可以使人们以更低廉的价格,更全面、更深入地对全基因组进行分析.作者阐述了几种关于HTS的测序技术平台:Roche/454测序技术、ABI/SOLID测序技术、Illumina/Solexa测序技术、单分子测序技术及Ion Torrent测序技术,并且还归纳了HTS在基因组学、转录组学及表观基因组学等方面的应用.     

高通量测序技术及其在鹿茸生物学领域的应用

随着测序技术的快速发展,各种新方法层出不穷,其测序数据量也在呈几何级数增长.文章对目前最具有代表性的4种高通量测序技术——焦磷酸(GS FLX)测序法、单分子阵列技术(Solexa)测序法、连接酶(SOLiD)测序法和单分子(HeliScope)测序法的测序原理、基本操作流程和测序能力作一综述,并对高通量测序技术在鹿茸...     

高通量测序技术及其在生命科学中的应用

Sanger法第1代测序技术给人类破译遗传密码提供了强有力的工具,经过30多年的不断改善,现已发展到以高通量、速度快、低成本为主要特征的第二代测序技术,给生命科学领域带来了革命性的变化。比较了第2代测序方法与Sanger测序方法的差异,并阐述了其在生命科学中的应用。     

高通量测序技术及其在鹿茸生物学领域的应用

随着测序技术的快速发展,各种新方法层出不穷,其测序数据量也在呈几何级数增长。文章对目前最具有代表性的4种高通量测序技术———焦磷酸(GS FLX)测序法、单分子阵列技术(Solexa)测序法、连接酶(SOLiD)测序法和单分子(HeliScope)测序法的测序原理、基本操作流程和测序能力作一综述,并对高通量测序技术在鹿茸生物学研究方面的应用进行了分析。     

深度测序技术在畜禽疫病诊断中的应用

下一代测序(NGS),也被称为深度、高通量或大规模并行测序,可一次同时测定几十万到几百万条核酸分子序列。在畜禽疫病中应用于复杂诊断和密集监测、病因学、基因组学、进化和流行病学,以及宿主-病原体相互作用和感染生物学等方面。本综述首先简要介绍了深度测序技术,并通过实例对深度测序在畜禽疫病诊断中的应用进展进行阐述,为今后的相关研究提供些许参考。     

通用引物扩增甲型流感病毒基因组及其高通量测序

为探索使用高通量测序方法测定甲型流感病毒的基因组,设计了一对通用引物进行甲型流感病毒全基因组的RT-PCR扩增,并分析了该方法的敏感性。结果显示,该方法能够扩增的甲型流感病毒多种亚型的全部8个节段的基因,其扩增敏感性为100 pg RNA。     

基于高通量测序技术挖掘分子遗传标记及其在蛋鸡生产中的精准应用

高通量测序技术是研究物种复杂生物性状遗传机制的基础,随着高通量测序技术的不断优化提升,一些与生物表型性状密切相关的基因组变异被精准地挖掘出来,其中包括单核苷酸多态位点(SNP)、小片段的插入或缺失(Indel)、拷贝数变异(CNV)以及结构变异(SV)为代表的分子标记。与传统遗传标记相比较,分子遗传标记具有多态性高、遍布整个基因组、检测手段简单快捷以及成本低廉的特点。通过检测覆盖全基因组范围内的分子标记,利用基因组水平的遗传信息对个体或群体遗传资源进行评估,能够缩短世代间隔、提高选种的准确性,进而在短期内取得较大的遗传进展。作者从高通量测序技术挖掘分子遗传标记角度入手,综述了三代测序技术发展历程和应用领域以及三代分子遗传标记检测技术在蛋鸡种业创新中的应用,并详细阐述了高通量测序技术与分子遗传标记相结合在蛋鸡群体遗传多样性及进化分类、群体遗传图谱的构建和功能基因定位、数量性状形成的遗传机制解析和质量性状形成的遗传机制解析等4个方面的精准应用,以期为蛋鸡基因组选择进入实质应用阶段提供科学依据和指导。     

高通量测序技术在猪miRNA功能研究中的研究进展

miRNA的研究是近几年生命科学领域的研究热点,该文对miRNA的形成及作用机制进行了论述。当前研究miRNA最主要的手段是高通量测序技术,文章对该技术的起源、发展、原理、分类及近几年在猪miRNA功能研究中的应用进行了综述。高通量测序技术的出现促进了基因组学研究领域的发展,目前已成为猪转录组研究的重要手段,为猪的基因组学研究提供了一个高效的平台,为当前猪品种遗传改良、辅助育种选择工作提供了数据基础。     

高通量测序技术在兽医临床中的应用

高通量测序技术可一次同时测定几十万到几百万条核酸分子序列,在兽医临床上已被应用到畜禽疾病诊断、疾病监测、致病机理研究、耐药性分析等相关工作中.本综述结合应用实例对高通量测序技术在兽医临床的研究进展进行系统阐述,总结了高通量测序技术在兽医临床应用中的局限性和解决措施,并展望了高通量测序技术在兽医临床的应用前景.     

高通量转录组测序技术在猪肉品质研究中的应用进展

猪肉中基因的表达决定了蛋白质的种类、结构和功能,从而决定了肉品质,而肌内脂肪(IMF)和肌纤维(MF)是影响肉品质的关键物质。本文主要综述了高通量转录组测序技术在研究猪肉品质相关的IMF和MF转录组的应用,重点阐述了其研究进展。     

畜禽身份识别技术的研究进展及应用

为防止个人身份信息的泄漏,身份证、密码、签名、生物特征（指纹、虹膜等）及遗传物质DNA等身份识别技术都得到了迅速的发展和应用。如今随着现代畜牧业的发展,这些身份识别技术不仅用于人类,在畜禽中也得到了广泛的研究和应用。笔者阐述了身份识别技术在畜禽的产品流通、疾病防控、育种、生产管理及品种鉴定防伪等方面的研究进展和应用情况。     

畜禽良种繁育技术及其应用的经济学思考

畜禽良种在畜牧产业发展中发挥核心作用,是区域畜牧业发展的物质基础,也是各国畜牧业科技竞争的焦点。现代畜禽良种繁育技术是由一系列技术组成的技术群,在畜牧业生产中的应用有助于提升优质种畜禽使用效率,加快区域畜禽养殖的良种化进程,提高畜禽生产性能。介绍了主要畜禽良种繁育技术及在我国的应用现状,分析了现代畜禽良种繁育技术对畜禽群体饲草料转化效率及良种选育效率的影响,从经济学视角探讨了现代畜禽良种繁育技术与养殖场投入及产出的关系,以期为我国建立现代畜禽良种繁育体系提供参考。     

大麦的营养价值及其在畜禽饲料中的应用

大麦（Hordeum vulgare）属于禾本科植物,是我国用途最为广泛的谷物之一,广泛应用于酿造、食品、医药学等领域。大麦苗、大麦叶、大麦秸秆、大麦芽等均可作为畜禽饲料来源,具有较高的营养价值和饲用价值。将大麦开发为畜禽饲料产品,既可以缓解畜禽饲料来源不足的问题,又能够提高畜禽养殖业经济效益。介绍了大麦的营养价值,综述了其在畜禽饲料中的应用研究进展,以期为大麦在畜禽饲料领域的开发利用提供参考。     

黄粉虫的营养特性及其在畜禽饲粮中的应用效果

蛋白质是动物饲粮的第二大成分,然而中国饲料蛋白质原料资源日益短缺,严重制约了畜牧业的健康可持续发展。黄粉虫（Tenebrio molitor L.）食性广、繁殖快、产出高,属于可再生的生物资源,其干物质中粗蛋白质、甲壳素、不饱和脂肪酸、维生素等含量较丰富,能够提取具有抗菌、抑炎、免疫调节等功能的生物活性物质,如抗菌肽、凝集素,且具有生长快、易规模饲养、占用土地少等优点,有望成为一种新型蛋白质饲料资源,进而缓解当前饲料蛋白质原料不足的现状。有研究表明,黄粉虫可以部分替代饲粮中的常规蛋白质饲料原料,提高畜禽生长或生产性能,改善产品品质,以及提高畜禽机体健康水平。作者阐述了黄粉虫的营养成分、畜禽对黄粉虫营养物质的消化率,在参考国内外最新研究成果的基础上综述了黄粉虫部分替代常规蛋白质饲料原料,改善畜禽生长或生产性能,提高肉禽屠宰性能,改善家禽产品品质,调节畜禽机体物质代谢,增强机体免疫和抗氧化功能以及改善肠道健康的作用,并对其在畜禽生产中的应用前景进行展望,以期为推广黄粉虫在畜牧业中的应用提供参考。     

非编码RNA及其在畜禽中的应用研究进展

在真核生物基因组转录过程中,除了一些蛋白质编码RNA以外,还有一些不同类型的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)也参与了复杂生命活动过程的调节。近年来,全转录组测序技术的出现和生物信息学的快速发展极大地促进了人们对ncRNA的研究,ncRNA在生物领域的多个方面具有重要作用,如在人类肿瘤、非肿瘤等方面的疾病治疗,在动物胚胎发育、肌肉生长、脂肪沉积、免疫应答及皮肤毛囊调控等领域都有了很大的进展。作者主要综述了全转录组测序技术、ncRNA分类、主要作用机制和ncRNA在畜禽中的应用,为探究ncRNA在动物中的调控机制提供理论依据。     

非编码RNA及其在畜禽中的应用研究进展

在真核生物基因组转录过程中,除了一些蛋白质编码RNA以外,还有一些不同类型的非编码RNA（non-coding RNA,ncRNA）也参与了复杂生命活动过程的调节。近年来,全转录组测序技术的出现和生物信息学的快速发展极大地促进了人们对ncRNA的研究,ncRNA在生物领域的多个方面具有重要作用,如在人类肿瘤、非肿瘤等方面的疾病治疗,在动物胚胎发育、肌肉生长、脂肪沉积、免疫应答及皮肤毛囊调控等领域都有了很大的进展。作者主要综述了全转录组测序技术、ncRNA分类、主要作用机制和ncRNA在畜禽中的应用,为探究ncRNA在动物中的调控机制提供理论依据。     

牛磺酸的生产及其在畜禽养殖中的应用

牛磺酸是动物体内一种半必需、游离氨基酸;它具有广泛的生物学功能,可调节神经传导,维持视网膜、内分泌、肝脏、心脏功能,促进脑的发育,抗氧化等。因其具有独特的生理及药理功能,已广泛应用于医药和食品行业。作者侧重介绍了牛磺酸在动物机体中的代谢情况及牛磺酸的生产,概述了牛磺酸对畜禽生长性能、繁殖能力、免疫力、采食等方面的作用,展望了牛磺酸在畜禽养殖业的应用前景。