VIPR-1基因12个多态位点与鸡早期产蛋性状的相关性

以鸡VIPR-1基因作为早期产蛋性状的候选基因,选取了12个多态位点对644只宁都三黄鸡进行基因型检测并分析了其与早期产蛋性状的相关性。研究表明：位于5′调控区的位点A-284G与开产日龄（P〈0.0001）、总畸形蛋数（P〈0.05）呈显著相关,等位基因G有利于产蛋量的提高;位于内含子6的位点C＋42913T与300日龄产蛋数和300日龄的总正常蛋数显著相关（P〈0.05）,CT基因型为优势等位基因型;位于内含子8的位点C＋53327T与开产日龄呈极显著相关（P〈0.01）,等位基因C有利于开产日龄的提前。     

清远麻鸡VIPR-1基因多态性及与生长性状的关联分析

PACAP参与下丘脑-垂体轴的内分泌功能,对生长具有调节作用,是生长激素释放因子,而其生物作用主要由其受体介导。本文以其第2型受体VIPR-1基因作为生长性状的候选基因,选取了已知2个多态位点,对134只清远麻鸡进行基因型检测并分析了其与生长性状的相关性。结果表明：（1）这2个突变位点在该品种中具有丰富的多态性：（2）位点C＋53327T与300日龄体重呈极显著相关（P〈0．01）,CT型个体体重比纯合体CC、TT型大。     

乌蒙凤鸡FGF23基因多态位点筛查与生物信息学分析

研究旨在挖掘成纤维生长因子23（fibroblast growth factors,FGF23）基因的单核苷酸多态（SNP）位点,为进一步研究该基因遗传变异奠定基础。试验以乌蒙凤鸡为研究对象,采用PCR产物直接测序法对FGF23基因进行SNP位点筛查,并进行遗传特性、连锁不平衡、单倍型、双倍型和生物信息学分析。结果显示,仅在乌蒙凤鸡FGF23基因启动子区域检测到3个中度多态的SNPs位点,分别为：g.73424341 C>A、g.73424417 A>G和g.73424701 T>A,每个SNP位点均产生3种基因型。χ²检验结果发现,仅g.73424417 A>G突变位点的基因型分布极显著偏离Hardy-Weinberg平衡（P<0.01）。连锁不平衡、单倍型和双倍型分析结果显示,3个SNPs位点中仅g.73424417 A>G和g.73424701 T>A位点间存在强连锁不平衡,共发现4种单倍型和8种双倍型,双倍型H1H2频率最高,其次为H3H4,频率最低的为H2H2。生物信息学分析发现,FGF23基因的核心启动子区域很可能在-400~-300 bp处,本研究发现的3个SNPs位点不在核心启动子区;突变前g.73423055~g.73425055区域总转录因子数为293个,突变后为300个。g.73424341 C>A位点突变前后转录因子不变,均为ICSBP;g.73424417 A>G位点突变使转录因子由GR转变为C/EBPalp;g.73424701 T>A位点突变前后均没有转录因子。推测SNP位点对调控启动子功能元件可能存在重要影响。     

猪GH基因部分多态特征与早期体重的相关研究

试验采用PCR RFLP技术,BspⅠ、HhaⅠ两种限制性内切酶,检测到猪生长激素基因-119～+486位共605bp片段中的3处碱基突变位点(+193、+330、+379),分析比较了各多态位点对姜曲海猪早期体重的影响。结果发现:姜曲海猪群中,BspⅠ酶切产生的三种基因型个体的早期平均体重间没有差异,但A1A1基因型个体早期的平均体重略高于其它两种基因型个体。HhaⅠ酶切产生的不同基因型中,C1C2型个体在20日龄、70日龄的平均体重均显著地高于C1C4基因型个体的体重(P<0 05)。     

DRD2基因14个多态位点与鸡产蛋性状的相关性

本研究旨在分析DRD2基因与鸡产蛋性状的相关性,寻找可作为鸡产蛋性状的重要标记。在该基因上选取了14个多态位点,采用PCR-RFLP及PCR测序等方法在宁都三黄鸡母系644个个体中进行了鸡产蛋性状的关联分析。结果表明:位于该基因5′调控区的4个突变位点G-38560C、T-38326G、T-32751C和A-16105G与鸡的开产日龄显著或极显著(P0.05或P0.01)相关,位点A-16105G还与300日龄总产蛋数显著相关(P0.05);由G-38560C、G-38544A、I-38463D与T-38326G这4个位点组成的单倍型块与开产日龄呈极显著相关(P=0.006 50.01)。研究结果提示:G-38560C、T-38326G、T-32751C和A-16105G这4个突变位点以及由G-38560C、G-38544A、I-38463D与T-38326G组成的单倍型块可作为产蛋性状标记辅助选择的有效分子标记。     

清远麻鸡羽速基因的分子检测及其与体重和冠高相关性分析

本研究旨在探讨清远麻鸡的羽速分子检测技术鉴别的准确性以及在生产中的应用,以加快配套系的组建。基于内源性病毒21基因(ev21)结合位点与慢羽基因K紧密连锁,对清远麻鸡中249个个体进行ev21基因插入位点的PCR检测,并进一步对慢羽系80只公鸡进行PCR-RFLP分型,分析羽速与体重、冠高的相关性。结果表明:ev21基因插入位点的分子检测与表型鉴定一致率达到98.8%;分型发现32个为杂合子,19个为纯合子,29个为缺失体;在清远麻鸡的快羽系和慢羽系中,110日龄的体重和冠高呈高强度正相关,相关系数(r)分别为0.886和0.694(P<0.01);但快慢羽品系间体重和冠高差异不显著(P>0.05)。结果显示,清远麻鸡中应用快慢羽分子检测技术有利于选育计划的实施。     

鸡apoB基因T123G多态位点与生长和体组成性状的相关性研究

载脂蛋白B（apoliprotein B，apoB）在能量的转运和代谢过程中具有重要作用，是研究生长和体组成性状的重要候选基因。以东北农业大学高、低腹脂双向选择品系第8世代仔鸡为试验材料，对鸡apoB基因进行SNP检测，探讨npoB基因与生长和体组成性状（尤其是体脂）的关系。本研究通过测序的方法在apoB基因26外显子上发现SNP（T→G），相关性研究结果表明该突变位点对1周龄体重、3周龄体重、7周龄腹脂重和腹脂率有显著影响（P〈0．05）。对于1周龄体重，基因型为GT的个体显著高于GG个体；而3周龄体重，基因型为TT和GT的个体显著高于GG个体；对于腹脂重和腹脂率，TT基因型个体显著高于GT和GG基因型个体（P〈0．05）。群体遗传学分析表明该位点的基因型在两系间差异显著（P〈0．05）。因此初步推断apoB基因可能是控制生长发育、腹脂沉积的主基因或与主基因紧密连锁。     

ACVR1基因对京海黄鸡生长和繁殖性状的遗传效应研究

以京海黄鸡为材料,采用PCR-SSCP和DNA测序技术对ACVR1基因外显子多态性进行研究。结果表明,ACVR1基因20190 bp处发生G→A突变,检测到AA、AB和BB 3种基因型。A等位基因频率为0.9075,B等位基因频率为0.0925。基因型与生长和繁殖性状的关联性分析发现,BB基因型鸡的开产体重极显著高于AA基因型鸡(P<0.01),AA基因型鸡300日龄体重显著高于BB基因型鸡(P<0.05)。由此初步推断,ACVR1基因可能对京海黄鸡的产蛋和发育有一定的影响,A为体重的优势基因,B为产蛋的优势基因。     

河田鸡VIPR-1基因外显子2HpaⅡ位点多态性与产蛋性状的关联分析

为研究VIPR-1基因位点多态性与产蛋性状的相关性,寻找影响产蛋性状的分子标记。本研究以河田鸡为试验材料,利用PCR-HpaⅡ-RFLP技术,对VIPR-1基因外显子2进行了多态性检测和基因型分析,并对该多态位点与产蛋性状进行关联分析。结果表明:扩增产物用HpaⅡ酶切检测出AA,AG和GG 3种基因型。不同基因型对开产日龄和300日龄蛋重没有显著相关(P0.05),对240日龄产蛋数、300日龄产蛋数有显著影响(P0.05)。其中GG基因型的240日龄产蛋数和300日龄产蛋数显著高于AG基因型和AA基因型,表现为差异显著(P0.05),AG基因型的240日龄产蛋数和300日龄产蛋数高于AA基因型,但表现为差异不显著(P0.05)。3种基因型240日龄产蛋数、300日龄产蛋数呈现GG基因型AG基因型AA基因型的趋势。G等位基因为优势等位基因。     

朝那鸡MC1R基因G274A和A427G多态位点与羽色性状的关联分析

为了研究宁夏地方品种鸡朝那鸡的黑色素皮质激素1受体(melanocortin 1 receptor, MC1R)基因G274A和A427G多态位点与羽色性状的关联性,试验选择120日龄健康的朝那鸡150只(红羽、黑羽和白羽各50只)为试验对象,采用高分辨熔解曲线(high resolution melting, HRM)分析技术对朝那鸡MC1R基因G274A和A427G位点进行基因型分型检测,并且对基因型和羽色性状进行了关联分析。结果表明：试验朝那鸡群体MC1R基因G274A位点有GG、GA、AA三种基因型,其中AA基因型个体数量最多,等位基因A为优势等位基因,多态信息含量(PIC)为0.286 7,表现为中度多态(0.25≤PIC≤0.50),说明MC1R基因位点为G274A的朝那鸡群体选育潜力较高;A427G位点有AA、AG两种基因型,其中AA基因型个体数量最多,等位基因A为优势等位基因,PIC为0.062 3,表现为低度多态(PIC<0.25),说明MC1R基因位点为A427G的朝那鸡群体选育潜力较低;这两个位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05...     

Association of Polymorphisms in the 5'Regulator Region of the VIPR-1 Gene with Chicken Broodiness

本研究旨在探索血管活性肠肽Ⅰ型受体(Vasoacitve intestinal peptide type Ⅰ receptor,VIPR-1)基因5'调控区(-496～-1 bp)多态性及其单倍型效应对鸡就巢性的影响,寻找影响肉鸡就巢性的分子标记,为降低或者剔除肉鸡就巢行为的育种研究提供相应依据.采用测序技术对498只清远麻鸡VIPR-1基因5'调控区进行多态性检测及基因型分析,利用最小二乘均数对VIPR-1基因5'调控区的多态位点与就巢性状进行相关分析,利用PHASE软件对多态位点进行单倍型分析.结果,VIPR-1基因5'调控区存在12个多态性位点,G-359T、G-266T、A-134G、A-94G、C-72G对18～43周龄的就巢持续天数影响达到显著水平(P＜0.05),A-94G位点对18～54周龄的就巢率的影响达到显著水平(P＜0.05);构建的单倍型对18～54周龄的就巢持续天数的影响达到极显著水平(P＜0.01).最小二乘分析结果表明,CCTGGGAAC,CAG/TTGGGGAAGCAC型个体的就巢持续天数比其它单倍型个体极显著的延长(P＜0.01).结果表明,VIPR-1基因5'调控区(-496～-1 bp)可能存在影响鸡就巢行为的分子标记,CCTGGGAAGCAG/TTGGGGAAGCAC型个体对鸡就巢性具有较大的遗传效应,可作为分子标记应用于家鸡就巢行为的筛选.     

VIPR-1基因SNP位点与如皋黄鸡产蛋性能和蛋品质的关联分析

本研究旨在分析VIPR-1基因的SNP位点与产蛋性能和蛋品质之间的关联性。实验以如皋黄鸡为素材,采用飞行时间质谱技术对VIPR-1基因内含子2第+1063位碱基(PA位点)的G-T突变和第+3522位碱基(PB位点)的T-C突变进行单位点和多位点组合效应分析。结果表明:PA位点的多态性与产蛋性状中的开产日龄(AFE)和40周龄总产蛋数(EN40)呈显著相关(P<0.05);与蛋品质性状中的蛋壳强度(ESS)、蛋黄比率(YR)和蛋黄蛋白比(YAR)呈显著相关(P<0.05);等位基因T有利于产蛋量和蛋品质的改善。PB位点与本次实验所测的5个产蛋性状相关均不显著(P>0.05),与蛋品质性状中的蛋重(EW)、蛋形指数(ESI)、蛋壳厚度(EST)和蛋比重(ESG)相关显著(P<0.05)。组合效应分析结果表明,对于产蛋性能,GTTT和TTTC组合基因型个体的组合效应显著。     

京海黄鸡LYZ基因外显子的遗传多态性及其与体重的关联分析

试验旨在研究鸡溶菌酶基因(LYZ)对鸡体重的影响。以200只京海黄鸡为研究群体,采用PCR-SSCP和DNA测序的方法检测LYZ基因单核苷酸多态性,并将所发现的SNPs与体重进行关联分析。结果发现,共3个突变位点,且均为沉默突变,未引起氨基酸序列的改变;经χ2适合性检验,除1411位点外,其他2个突变位点均显著偏离Hardy-Weinberg平衡;111位点AA基因型个体12和16周龄体重显著高于GG基因型个体(P0.05),1411位点AA和GA基因型个体各周龄体重均高于GG基因型个体,且4周龄体重差异达到了显著水平(P0.05),1426位点各基因型对体重没有显著影响(P0.05)。单倍型分析结果显示,除4周龄外,ANC个体各周龄体重均较大,GAC个体4周龄体重较大,这与上述各位点基因型对体重影响的分析结果相一致,暗示在选种、育种过程中,可将鸡LYZ基因作为京海黄鸡体重候选基因应用于遗传标记辅助选择。     

鸡胰岛素样生长因子-1基因的遗传多态性与其体重的关系

对宁都三黄鸡、万载康乐黄鸡两个鸡种共295个样本,采用PCR RFLP技术对胰岛素样生长因子—1(cIGF 1)基因的5'端调控区进行遗传变异研究,发现该调控区的扩增产物经PstⅠ酶切后出现3种基因型(AA、AB、BB)。结果表明:性别对宁都三黄鸡这3种基因型的分布呈现显著差异(P<0 05)。分析这3种基因型与其体重的关系发现,这3种基因型对初生重、30日龄体重、60日龄体重、90日龄体重及120日龄体重影响差异均不显著(P>0 05),但体现出AA型有较高体重的趋势,公母表现出一致的规律。在万载康乐黄鸡中,均呈现出杂合优势,在8周龄及18周龄时差异不显著(P>0 05),而在12周龄表现为差异显著(P<0 05)。宁都三黄鸡公母基因型分布均符合哈代 温格伯定律,而万载康乐黄鸡基因型分布不符合哈代 温格伯定律。     

桂香鸡冠高及体重的相关性分析

以2个批次的桂香鸡为研究对象,分析不同生长时期桂香鸡冠高及体重的相关性。结果表明,批次对桂香鸡的冠高和体重具有显著的影响(P<0.05)。相关性分析结果表明,2个批次桂香鸡的49、70日龄的冠高和体重间存在极显著的相关性(P<0.01);在120日龄时,第2批次的冠高和体重间存在极显著的相关性(P<0.01)。对冠高间的相关性而言,2个批次桂香鸡的49日龄冠高与70和120日龄冠高的相关性均达到极显著水平(P<0.01);第2批次的70日龄冠高与120日龄冠高间的相关性达到极显著水平(P<0.01)。对体重间的相关性而言,2个批次桂香鸡的49日龄体重与70和120日龄体重间的相关性均达到极显著水平(P<0.01);2个批次70日龄与120日龄体重间的相关性均达到极显著水平(P<0.01)。研究结果为桂香鸡冠高和体重性状的选择,尤其是早期选择提供了一定的理论基础。     

鸡VLDLR基因多态性与蛋黄性状的关联分析

本研究采用PCR-RFLP方法,检测VLDLR基因在山东地方鸡种汶上芦花鸡、济宁百日鸡和莱芜黑鸡中的多态性,并分析各多态位点不同基因型与4个蛋黄性状的相关性。结果表明,在3个供试群体中共检测到2个具有生物学意义的SNPs位点,即第6外显子8 467nt处的G→A突变(V8467)和第17内含子13 876nt处的A→G突变(V13876)。最小二乘分析结果表明,V8467对蛋黄质量有极显著影响(P<0.01),对蛋黄高度有显著影响(P<0.05);V13876对蛋黄质量有极显著影响(P<0.01),对蛋黄比率和蛋黄高度有显著影响(P<0.05);而双倍型对蛋黄质量、蛋黄比率的影响均达到极显著水平(P<0.01),对蛋黄高度的影响达到显著水平(P<0.05)。结果提示:本研究检测到的VLDLR基因的V8467和V13876多态性位点可以作为蛋黄性状的候选分子标记。     

豁眼鹅GH基因外显子2多态性与体重和体尺性状的关联分析

实验旨在探究对豁眼鹅体重和体尺性状进行选育的有效分子标记,根据GenBank鹅GH基因的cDNA序列以及前人的研究设计引物,以饲养于辽宁省和江苏省同批出雏的豁眼鹅,共计552只为实验材料,利用PCR-SSCP方法对GH基因外显子2进行SNPs检测,并将纯合基因型进行克隆测序。结果表明:豁眼鹅GH基因外显子2共有2个SNPs突变位点,得到10种基因型AA、BB、CC、DD、AB、AC、AD、BC、BD和CD,等位基因D的频率较高;经χ2检验,公、母鹅群体以及整个群体均处于Hardy-Weinberg平衡状态;将氨基酸序列突变和未突变的基因型分别合并后得到的3种基因型与10周龄体重和体尺性状进行关联分析发现,基因型对体重和部分体尺性状均有极显著(P<0.01)或显著(P<0.05)影响;在公鹅和母鹅群体中,合并后的AB型与BB型分别为高生产性能基因型,可以作为对豁眼鹅体重和体尺性状进行选育的分子标记。     

Apo-AI基因多态性与鸡生长和体组成性状的相关研究

以明星肉鸡和丝毛乌骨鸡杂交产生的F2资源群体为试验材料，根据鸡载脂蛋白AI（Apo-AI）基因的5’端序列设计引物，采用测序和PCR—SSCP方法进行SNP检测和基因型分析，探讨Apo-AI基因多态性与鸡生长和体组成性状之间的关系。研究发现在Apo-AI基因序列起始密码子ATG上游163bp处存在一个A／T突变。该突变产生的不同基因型与鸡生长和体组成性状进行的统计分析结果表明，BB基因型个体的1、2周龄体质量显著高于AA和AB基因型个体的相应体质量（P〈0．05）；BB基因型个体腹脂质量显著高于AA基因型个体的腹脂质量（P〈0．05）；BB和AB基因型个体的腹脂率显著高：于AA基因型个体的腹脂率（P〈0．05）。可以尝试将Apo-AI基因应用于鸡生长和腹脂性状的分子标记辅助选择育种方案中。     

思州鸡BMP15基因第1外显子多态性及其与蛋品质的关联分析

研究旨在探讨思州鸡骨形态发生蛋白15（BMP15）第1外显子多态性及其与蛋品质的相关性。采用PCR产物直接测序法检测思州鸡BMP15基因第1外显子测序,将测序结果用DNAStar软件校正;利用Excel 2007统计基因型频率数据,并进行卡方适合性检验;通过SPSS 18.0软件对BMP15基因不同基因型与思州鸡蛋品质间的关联性进行分析。结果显示,思州鸡BMP15基因第1外显子存在4个SNPs位点：397C/T、473A/G、603C/T和612C/T,均处于Hardy-Weinberg非平衡状态（P<0.05）;397C/T和603C/T位点的多态信息含量（PIC）分别为0.3488和0.3299,属于中度多态（0.25 < PIC < 0.5）,473A/G与612C/T位点的PIC分别为0.1527和0.2075,属于低度多态（PIC<0.25）。关联性分析结果表明,397C/T位点对思州鸡蛋白高度、哈氏单位、蛋黄重均有显著影响（P<0.05）;473A/G、603C/T位点对思州鸡蛋品质指标均无显著影响（P>0.05）;612C/T位点对思州鸡蛋长径有显著影响（P<0.05）,提示BMP15基因第1外显子对鸡蛋品质中蛋白高度、蛋长径具有较大的遗传效应。结果表明,BMP15基因可能是影响思州鸡蛋品质的基因之一,可作为思州鸡蛋白高度、蛋长径等蛋品质性状的分子标记。