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旨在筛选可用于滩羊亲子鉴定的部分SNP标记,对羊群的保种和繁衍具有重要意义。本试验以宁夏盐池地区的159只滩羊为研究对象,利用600K基因芯片进行SNP测定,通过主成分分析了解样本的遗传背景,依据系统进化树划分家系,最后进行亲子鉴定研究。结果显示,大多数滩羊之间遗传背景相近,系统进化树将其划分为5大家系;亲子鉴定筛选到了211个高质量SNPs,单亲累积排除概率超过99.99%,具有很高的准确性和可靠性;父权鉴定结果表明,在95%置信水平下,观测鉴定率为79%,80%置信度下,观测鉴定率达到87%。在有结果的子代中,大部分真实亲本在疑似父本中找到,即非系谱记录的父本,说明场内应加强系谱管理,尽量避免错误的发生。 相似文献
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《中国畜牧杂志》2018,(12)
本研究旨在为猪亲子鉴定提供一种快速、准确的鉴定方法。先用非变性聚酰胺凝胶电泳方法对猪的55个微卫星位点进行筛选,再以高分辨率熔解曲线(HRM)技术对筛选出的微卫星位点进行多态性检测,再对其中一微卫星位点进行克隆测序验证,处理得到的数据,进行猪亲子鉴定研究。结果表明:利用非变性聚酰胺凝胶电泳实验筛选出12个适于HRM检测的微卫星位点,HRM技术对12个微卫星多态性进行检测,共检测出50个等位基因,平均值为4.167个,有效等位基因数平均值为2.675 0,群体遗传杂合度平均值为0.595 0,平均多态信息含量为0.540 0;对SW72位点克隆测序的结果与HRM技术检测结果一致;12个微卫星组合在双亲未知、只知单亲和双亲已知的情况下计算的累积排除率各为0.940 1、0.991 5和0.999 9;利用建立的亲子鉴定体系对样本中8个家系进行检测,结果累积排父率均大于0.999 9。HRM技术对12个微卫星位点组合进行检测,能够快速、准确地对猪进行亲子鉴定。 相似文献
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在牛的育种实践和科学研究中,正确的系谱记录是准确估计育种值、提高遗传进展的基础,是研究各性状分子机理的重要保证。而在生产实践中,由于各种原因,系谱错误在所难免,因此亲子鉴定作为纠正系谱错误的重要方法是育种实践和科研中不可或缺的研究内容。目前用于牛亲子鉴定的标记主要是微卫星标记(SSR)和单核苷酸多态性(SNP)标记。作为第三代分子标记,SNP标记具有数量丰富、遗传稳定、判型错误率低、操作方便、检测自动化的优点,非常适合用于大规模群体的亲子鉴定。随着SNP检测成本的降低,在牛亲子鉴定中有取代微卫星标记之势。 相似文献
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概述了微卫星 DNA用于亲子鉴定的优点及存在的缺陷 ,并对未来的应用前景作了展望 相似文献
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目前国内外已经开展了动物的亲子鉴定工作。在公安、军队等专业部门(如保证工作犬血统纯正,建立警、军犬数据库等)和动物检疫检测(如检测动物疾病、鉴定性别等)等部门都开始得以应用。同时,由于社会经济的发展,不少有条件的百姓家中也养起了价格昂贵的犬种,为了确保犬的血统纯正,也寻求做亲子鉴定工作。让我们来了解一下这项高科技生物技术的基本原理。 相似文献
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为了构建北京奶牛中心荷斯坦种公牛个体及亲子鉴定DNA数据库,本研究从联合国粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)推荐的具有高度多态性的微卫星标记中选取11个常染色体微卫星标记(BM1824、BM2113、ETH3、ETH10、ETH225、INRA023、SPS115、TGLA53、TGLA122、TGLA126和TGLA227),采用荧光引物PCR和ABI3730XL遗传分析仪,对229头荷斯坦种公牛个体基因型进行了检测,并探讨其用于牛个体识别和亲子鉴定的可行性。研究结果表明,11个微卫星标记平均杂合度为0.733,平均多态信息含量为0.695,其中TGLA122标记平均多态信息含量最高为0.866,SPS115标记最低为0.506,均属于高多态性标记。11个标记累积个体识别能力为99.99%,累积非父排除率达到99.99%,随机个体一致性概率为1.59×10-17。研究结果表明上述11个微卫星标记进行个体识别和亲子鉴定的效力与可靠性均很高,同时初步建立了北京奶牛中心荷斯坦种公牛DNA数据库。 相似文献
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《畜牧兽医学报》2017,(4)
旨在利用较少的经过优化的遗传标记组合达到快速高效的亲缘鉴定,最终可有效应用于奶牛群体亲子鉴定与系谱构建。本研究从国际动物遗传学会(ISAG)数据库中初步选择了18个多态性较高的微卫星位点,经PCR优化验证获得可高效扩增的8个位点,并检测其在300头中国荷斯坦牛群体中的多态性分布。这些微卫星位点的亲子鉴定效力检测结果表明,8个标记平均等位基因数为14.63,平均多态性信息含量(PIC)为0.747,群体平均观察杂合度(Ho)为0.718,平均期望杂合度(He)为0.773。3种不同情形下进行亲子鉴定时8个位点的结合排除概率(CPE)均≥0.990。8对父子牛亲权鉴定结果表明,利用该8个标记可以识别并剔除系谱中的错误记录。结合排除概率的分析结果表明,当微卫星位点数增加至4个(TGLA227、TGLA122、BMC1207、BM103)时,3种不同情形下的CPE均≥0.949,可以满足个别案例牛亲子鉴定的要求。群体分子系谱构建的结果表明,当微卫星位点数大于或等于6个时,群体内近交系数和总群体近交系数均明显升高。因此,在生产实践中推荐使用TGLA227、TGLA122、BMC1207、BM103、INRA037、INRA134位点进行小规模群体(200)的分子系谱构建或亲权鉴定。 相似文献