双重抑制PCR技术分离鹅微卫星标记

用双重抑制PCR技术分离11对鹅的特异微卫星引物,应用于浙东白鹅和太湖鹅的基因组PCR扩增.结果表明:11对引物在浙东白鹅和太湖鹅中分别扩增出37和36个清晰条带,20个等位基因为两品种所共有,11对引物中有5对呈中等多态、6对呈高度多态.各位点产生2～6个等位基因,各位点的平均杂合度为0.456～0.772,以G07位点为最高,G06位点为最低;平均多态信息为0.375～0.737,以G07位点为最高,G01、G03和G11位点为最低.浙东白鹅和太湖鹅有效等位基因数分别为2.655和2.558,与实际测得的两品种平均值3.364和3.273较接近.研究结果表明,两品种的等位基因分布较为均匀,与鹅的实际品种特征一致,因此,双重抑制PCR技术适合于鹅的基因组结构研究.     

利用双重抑制PCR技术分离鸭微卫星标记

用双重抑制PCR技术分离10对鸭的特异微卫星引物,应用于北京鸭、樱桃谷鸭、高邮鸭3个品种的基因组PCR扩增。结果表明:10对引物中有7对引物具有多态,3对呈高度多态,4对呈中度多态。7对引物在上述3个鸭品种中分别扩增出23、22、23个等位基因,其中15个等位基因为3个品种所共有;各位点产生4~7个等位基因,平均杂合度为0.494~0.650,平均多态信息含量为0.414~0.586,平均有效等位基因数为2.001~2.870。3个鸭品种的平均杂合度分别为0.578、0.566、0.594,平均多态信息含量分别为0.496、0.480、0.524;平均有效等位基因数分别为2.441、2.340、2.615,与实测平均等位基因数3.286、3.142、3.286较接近。     

利用5'锚定PCR技术分离枇杷微卫星标记

用5'锚定PCR技术分离出32个枇杷特异SSR位点,对其中适合设计引物的28个位点设计了相应的引物,并分别与对应的5'锚定的简并SSR引物配对,应用于5个枇杷品种的基因组PCR扩增.结果表明,27条引物在5个受试枇杷品种中有扩增产物,其中24条为可用引物,另外3条引物因为扩增产物不符合SSR标记的特征不能用作SSR标记的引物.     

利用5′锚定PCR技术分离枇杷微卫星标记

用5′锚定PCR技术分离出32个枇杷特异SSR位点,对其中适合设计引物的28个位点设计了相应的引物,并分别与对应的5′锚定的简并SSR引物配对,应用于5个枇杷品种的基因组PCR扩增。结果表明,27条引物在5个受试枇杷品种中有扩增产物,其中24条为可用引物,另外3条引物因为扩增产物不符合SSR标记的特征不能用作SSR标记的引物。     

多重PCR法在微卫星标记中的效果观察

通过建立一种同时检测3个位点（MCW0083、MCW0037、LEI0166）的多重PCR方法,在同一样品中同时扩增这3个微卫星位点。混合扩增产物与各位点单引物PCR法扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,用BandScan软件分析各微卫星位点的等位基因大小。多重PCR方法扩增出的DNA片段与单PCR扩增的结果表明,每个个体标记等位基因的片段大小差异不大,初步认为该方法是可行的。     

丽佳鹅、五龙鹅和长白Ⅰ型鹅遗传多样性的微卫星标记分析

丽佳鹅、五龙鹅、长白Ⅰ型鹅是南京市近年从外地引进的优良鹅品种.为深入了解这些品种的种群遗传状况,为其进一步选育利用提供理论依据,选用25个微卫星标记对其遗传结构及系统发生关系进行了分析.结果表明,25个微卫星位点中有8个位点在3个鹅品种中表现为多态性,平均杂合度和多态信息含量分别为0.569和0.500,可作为有效的遗传标记用于分析,其中,WD206的多态性最好,其有效等位基因数、多态信息含量分别达7.860和0.859,AaLu1的多态性最差,其有效等位基因数、多态信息含量分别为1.270和0.202;3个鹅品种在8个微卫星位点上的多态性表现出了明显的差异,长白Ⅰ型鹅最高(0.528),五龙鹅次之(0.444),丽佳鹅最低(0.344);Ds标准遗传距离显示,五龙鹅和长白Ⅰ型鹅的遗传距离较近(0.037 1),与丽佳鹅较远(0.292 6),在UPGMA聚类结果图上,五龙鹅与长白Ⅰ型率先聚为一类,它们与丽佳鹅要在更大距离上才能聚为一类,这与3个鹅品种的源地和选育历史情况十分吻合.     

绵羊微卫星标记多重PCR体系的建立与应用

微卫星标记由于具有在基因组中分布广、多态性高及共显性等特点,因而在群体遗传多样性分析中广泛应用。本实验针对绵羊19个微卫星标记位点构建了8个多重PCR扩增体系,其中包括3个三重,5个两重PCR扩增体系。采用建立的多重PCR扩增体系对32只小尾寒羊的多态性进行了检测,结果表明19个微卫星标记的等位基因数在5～17之间,期望杂合度、观测杂合度和多态信息含量分别位于0.423～0.885、0.344～0.875和0.392～0.859之间。本实验所建立的多重PCR扩增体系将为绵羊遗传多样性、亲子鉴定和个别识别提供技术基础。     

丽佳鹅、五龙鹅和长白Ι型鹅遗传多样性的微卫星标记分析

丽佳鹅、五龙鹅、长白Ι型鹅是南京市近年从外地引进的优良鹅品种。为深入了解这些品种的种群遗传状况,为其进一步选育利用提供理论依据,选用25个微卫星标记对其遗传结构及系统发生关系进行了分析。结果表明,25个微卫星位点中有8个位点在3个鹅品种中表现为多态性,平均杂合度和多态信息含量分别为0.569和0.500,可作为有效的遗传标记用于分析,其中,WD206的多态性最好,其有效等位基因数、多态信息含量分别达7.860和0.859,AaLu1的多态性最差,其有效等位基因数、多态信息含量分别为1.270和0.202;3个鹅品种在8个微卫星位点上的多态性表现出了明显的差异,长白Ι型鹅最高(0.528),五龙鹅次之(0.444),丽佳鹅最低(0.344);D s标准遗传距离显示,五龙鹅和长白Ι型鹅的遗传距离较近(0.037 1),与丽佳鹅较远(0.292 6),在UPGMA聚类结果图上,五龙鹅与长白Ι型率先聚为一类,它们与丽佳鹅要在更大距离上才能聚为一类,这与3个鹅品种的源地和选育历史情况十分吻合。     

太湖鹅微卫星标记与体重的相关性

为了解太湖鹅群体的遗传特性,寻找其生长性状的辅助标记。该研究采用微卫星标记技术对太湖鹅群体进行了遗传多样性研究,初步探讨了微卫星标记与10周龄体重的相关性。结果显示：太湖鹅在10个微卫星标记座位上共检测到52个等位基因,群体平均杂合度为0.653 0,平均多态信息含量为0.611 2。与生长性状的关联分析发现,CKW1...     

江西4个地方鹅品种遗传多样性的微卫星标记分析

通过选用31个多态性较好的微卫星标记,检测江西4个地方鹅品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(P IC)和群体间的遗传距离(DA)。结果表明:31个微卫星位点中有25个微卫星位点在4个鹅群体中的多态信息含量均为中度多态,可作为有效的遗传标记用于各鹅品种的遗传多样性和系统发生关系的分析;4个鹅品种的杂合度都较高,平均杂合度为0.584 6~0.643 4,其中最高的是广丰白翎鹅(0.643 4),最低的是莲花白鹅,而且杂合度的高低与P IC值的大小表现出较高的一致性。用DA的U PGM A法进行聚类分析,结果4个鹅品种被聚为3类,莲花白鹅与丰城灰鹅聚为第1类,广丰白翎鹅自聚为第2类,兴国灰鹅自聚为第3类。     

固始白鹅体尺性状微卫星DNA标记的筛选

【目的】筛选固始白鹅体尺性状的微卫星DNA标记。【方法】测定固始白鹅的体尺性状。选用11对微卫星引物(WD136、WD206、G06、G07、CKW21、CKW23、TTUCG5、TTUCG4、TTUCG2、Aalu1、TTUCG1),对固始白鹅进行遗传检测,计算各微卫星位点的等位基因频率、多态信息含量、杂合度和有效等位基因数。利用最小二乘法拟合线性模型,探索11个微卫星位点与固始白鹅体尺性状的关系。【结果】11个微卫星位点中的8个位点(WD136、WD206、G07、TTUCG4、CKW21、TTUCG2、TTUCG1和TTUCG5)在固始白鹅上有较好的多态性,其平均等位基因数为4.25(3~6)、平均杂合度为0.598(0.273~0.695)、平均多态信息含量为0.635(0.530~0.769)、平均有效等位基因数为3.345(2.383~4.984)。通过最小二乘分析,检测到WD136、WD206、CKW21、TTUCG1等4个位点与9项体尺性状间存在显著相关性。【结论】WD136位点有望作为体质量、体斜长、骨盆宽的早期选择辅助标记;WD206位点有望作为体质量、胸宽、龙骨长、骨盆宽、胫长、半潜水长和颈长的早期选择辅助标记;CKW21位点有望作为体质量、龙骨长、胫长、半潜水长、颈长的早期选择辅助标记;TTUCG1位点有望作为体质量、体斜长、胫长、龙骨长的早期选择辅助标记。     

利用微卫星标记分析湖南4个地方鹅品种遗传多样性

通过选用31个多态性较好的微卫星标记,检测了湖南4个地方鹅品种的遗传多样性.利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和群体间的DA遗传距离.结果表明,31个微卫星位点中有25个微卫星位点在4个鹅群体中的多态信息含量均为中度多态,可作为有效的遗传标记用于各鹅品种的遗传多样性和系统发生关系的分析.4个鹅品种中,平均杂合度范围是0.5010 ～ 0.6705,各鹅种的杂合度都较高,最高的是酃县白鹅(0.6705),最低的是武冈铜鹅,而且杂合度的高低与PIC值的大小体现了较高的一致性.对DA遗传距离的计算表明,用UPGMA法进行聚类分析,结果4个鹅品种被聚为3类:道州黑鹅与酃县白鹅聚为第1类;武冈铜鹅自聚为第2类;溆浦鹅自聚为第3类.     

应用微卫星标记研究中国15个地方白羽鹅品种遗传多样性

利用22个微卫星DNA标记对中国15个地方白羽鹅种进行遗传分析。结果表明：22个微卫星标记中3个为高度多态座位，1个低度多态座位，其余均为中度多态座位。平均杂合度最高的是太湖鹅（0．7105），最低的是皖西白鹅（0．5838）。织金白鹅与溆浦鹅遗传距离最近，为0．0417，而太湖鹅与四川白鹅最远，为0．7259。通过UPGMA法15个地方白羽鹅聚为3大类：织金白鹅、溆浦鹅、闽北白鹅、右江鹅、莲花白鹅、武冈铜鹅、同始鹅、浙东白鹅、籽鹅聚为第一类，广丰白翎鹅、皖西白鹅聚为第二类；酃县白鹅、百籽鹅、太湖鹅、四川白鹅聚为第三类。本研究证明中国地方鹅群体的遗传多性样比较丰富，具有较高的选择潜力。     

5个鹅品种微卫星遗传多样分析

选用10个微卫星引物对四川白鹅、豁眼鹅、莱茵鹅、朗德鹅、扬州鹅5个鹅品种进行遗传多样性分析。结果表明:5个鹅品种的10个微卫星座位共检测到272个等位基因,平均基因数为5.4个,5个鹅品种在10个微卫星座位上的基因频率存在一定差异,其平均基因杂合度为0.708 1,平均多态信息含量为0.661 8。其中,扬州鹅平均基因杂合度最高,为0.756 8,遗传多样性最丰富;朗德鹅平均遗传杂合度最低,为0.670 7。     

广东4个地方鹅品种的遗传多样性分析

用磁珠富集法筛选的19对微卫星引物和从GenBank搜索12个微卫星引物检测广东4个地方鹅品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和群体间的遗传距离(DA),分析其遗传多样性。结果表明,31个微卫星引物中有25个微卫星引物在4个鹅群体中的多态信息含量均为中度多态,可作为有效的遗传标记用于各鹅品种的遗传多样性和系统发生关系的分析。4个广东地方鹅品种的平均杂合为0.611 9-0.672 7,均较高,最高的是乌棕鹅(0.672 7),最低的是阳江鹅(0.611 9),且杂合度的高低与PIC的大小体现了较高的一致性,表明广东4个地方鹅品种均具有丰富的遗传多样性;4个鹅品种被聚为2类:狮头鹅和乌棕鹅聚为第1类,阳江鹅和马冈鹅聚为第2类。     

微卫星标记OarFCB304和MCM53在3个绵羊品种中的遗传多态性

利用两个微卫星标记OarFCB304和MCM53对陶赛特、德克赛尔和萨福克3个绵羊品种的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数和杂合度进行了检测。结果表明,微卫星位点OarFCB304和MCM53在3个绵羊品种中均具有高度多态性,可以用于绵羊遗传多样性的评估;位点OarFCB304比MCM53变异大;从不同品种来看,陶赛特绵羊的遗传变异程度较大,而德克赛尔羊的遗传变异程度相对较小。     

微卫星标记在杂交稻种子纯度鉴定上的应用

当前杂交稻种子纯度鉴定以大田种植为主,鉴定时间长,受环境因素影响大,当鉴定结果出来后不合格种子已上市下地,影响到农业生产用种安全.微卫星标记具有共显性、稳定性、多态性高、数量丰富等特点,在快速鉴定杂交稻种子纯度上正显示出越来越重要的作用.利用微卫星标记和田间小区种植鉴定同时对杂交稻品种进行纯度鉴定,鉴定结果分别为93.0％和93.5％,结果很接近,说明利用微卫星标记进行杂交稻种子纯度鉴定是可行的.     

中国中型鹅种的遗传多样性分析

通过微卫星标记技术对我国12个中型家鹅群体(丰城灰鹅、广丰白翎鹅、兴国灰鹅、浙东白鹅、钢鹅、四川白鹅、马岗鹅、织金白鹅、溆浦鹅、雁鹅、武冈铜鹅、皖西白鹅)的遗传多样性进行了分析。结果表明:12个品种的平均杂合度都较高,最高的为浙东白鹅,最低的为雁鹅,杂合度范围为0.4958~0.6547,12个鹅种资源群体平的均杂合度为0.5999,反映了各鹅种的杂合度都较高,遗传多样性丰富;通过计算DS遗传距离发现各群体的遗传距离较远,分化时间较长;NJ聚类结果将12个中型鹅种聚为3类,NJ的聚类结果分析与几个鹅品种的地域分布关系并不密切。