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依据Henderson计算加性遗传相关矩阵的递归过程法,导出亲属间的亲缘系数的通式。结果与Wright.S法相同。对于复杂的混合亲属而言,此法简捷、准确、全面。 相似文献
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张志武 《东北农业大学学报》1991,(3)
本文提出了适于任何无世代交叉系谱的近交系数与亲缘系数迭代算法。迭代过程是先利用亲代的近交系数和亲代间的亲缘系数计算出子代的近交系数,然后利用亲代的近交系数、亲代间的亲缘系数和子代的近交系数计算出子代间的亲缘系数。这种迭代算法不仅以统一的形式描述了连续全同胞、半同胞等有规律系谱近交系数迭代公式,而且突破了有规律系谱的限制,使迭代算法的适用范围拓宽到了任何无世代交叉的不规则系谱。 相似文献
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为了对多仔动物所构成的“全同胞半同胞”混合家系,在不能获得详细系谱资料的情况下,快速、有效的计算抽样群体期望亲缘系数,使用递归和迭代设计特定算法,实现对后代随机抽样情况下样本个体在家系内各雌亲间分布情况的计算,并对各种符合参数要求的样本后代分布进行同胞对数和频数的统计,最终实现抽样群体期望亲缘系数的计算机自动求解和输出。对采用本算法和近似公式计算得到的亲缘系数进行对比分析,结果表明:当雌亲数d≥5时,2种方法计算的亲缘系数差值〈0.01;当d≥50时,两者差值〈0.001。本算法适用于多种参数组合混合家系期望亲缘系数的计算;依照本算法编制程序计算亲缘系数,计算结果精确,运行速度快。本算法可为动物遗传育种工作提供比较可靠的参数估计。 相似文献
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华南地区常规籼稻主栽品种间亲缘系数分析 总被引:1,自引:0,他引:1
品种间亲缘系数是研究作物品种间遗传关系和遗传多样性的重要方法.对华南地区不同年代育成的常规籼稻主栽品种的亲缘系数进行了分析.结果显示,近50年来华南地区基于亲缘系数的水稻品种遗传多样性呈"W"型变化,3个高点分别出现在1957年前、1970—1979年和2000—2008年,3个低点分别出现在1957—1969年和1980—1989年.基于亲缘系数的品种聚类结果较直观地反映了近50年来华南地区籼稻品种的遗传关系及其品种演变特点,与该地区不同时期主要围绕着少数几个骨干亲本进行品种改良的特点相吻合.本研究获得的华南地区近50年来水稻品种遗传多样性呈"W"型变化这一结果说明,基于品种间亲缘系数的华南地区品种遗传多样性未经历持续的下降或上升,而是在一定范围内波动. 相似文献
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采用ASP编程,实现从Excel文件中读取数据,开发了运行在Internet网络平台的群体亲缘系数的计算程序,提高了工作效率。 相似文献
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建国以来山东省小麦品种及其亲本的亲缘系数分析 总被引:17,自引:3,他引:17
【目的】探讨山东省小麦品种的遗传多样性。【方法】对山东省建国以来历经9次更换的66个小麦品种的2145个组合进行了亲缘系数(coefficient of parentage, COP)分析。【结果】67.44%品种组合间存在亲缘关系,所有品种COP值变异范围为0.00~0.8203,平均为 0.06249,系谱亲缘系数高于平均值的占21.53%。随着时间的推移,各个年代之内品种间亲缘系数有逐渐增大的趋势,到90年代有所降低,然后又再增大。各年代内品种的亲缘系数普遍高于年代间品种的亲缘系数。早期的品种与以后年代的品种间的亲缘系数较小,中期和近期品种与以后年代的品种间的亲缘系数较大。同一个年代的品种,对后代的遗传贡献率,则随着年代的推移而逐渐减小。对品种间COP值按WAP法进行了聚类分析,除徐州438、齐大195、烟农78在COP为0处单独聚在一起外,其余63个品种可以聚为6个大类群,大多是同一年代的品种聚在一起,体现了不同年代的特点。山东省历史上年种植面积较大或推广时间较长的17个小麦品种,大都是较早利用引进亲本进行组配选育而成,亲本的亲缘系数较小,遗传差异较大。从系谱上看,山东省小麦的种质资源可基本上追溯到碧玉麦、Villa Glori(中农28)、洛夫林系、蚰子麦等四大骨干亲本体系。【结论】自50年代以来,品种间的遗传差异日趋狭窄,遗传多样性逐渐降低。 相似文献
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【目的】分析青藏高原青稞育成品种的遗传多样性,评估其遗传基础,探索拓宽其遗传基础的对策,推动青稞新品种选育工作。【方法】以1950s后,影响力高、推广面积大的105个藏区青稞育成品种和3个引进品种为研究对象,采用亲缘系数分析法分析参试品种的遗传基础,进而以亲缘系数为基础,采用兰氏距离、类平均法对参试品种进行聚类分析;采用累积直系亲缘系数,筛选藏区主要骨干亲本。【结果】18.01%的品种组合间存在亲缘关系,各组合亲缘系数的变异范围为0.000—0.750,组合平均亲缘系数为0.053,显著高于中国大麦主栽品种以及北美大麦品种。根据参试品种的育成时间,以十年为期,将参试品种划分为7个时期,1970s和1980s 2个时期,参试育成品种的组合平均亲缘系数较高,分别达到0.115和0.107;1990s和最近十年,参试育成品种的组合平均亲缘系数较低,分别为0.040和0.032。西藏自治区、青海省、四川省、甘肃省的参试育成品种数分别为48、27、17和12个;甘肃省的参试育成品种组合平均亲缘系数最高,达到0.220,西藏自治区、青海省、四川省的参试育成品种组合平均亲缘系数较为接近,分别为0.094、0.122和0.138。聚类分析的结果显示,参试品种聚为7类,Ⅱ、Ⅲ类群共包含25个参试品种,各类群的组合平均亲缘系数较低;其他5个类群共包含83个参试品种,各类群的组合平均亲缘系数较高。40个参试品种的累积直系亲缘系数大于0,其中9个育成品种是藏区青稞的重要骨干亲本,其衍生了67个参试品种。9个骨干亲本及其67个衍生种占参试育成品种总量的72.38%。1960s,骨干亲本及其衍生种的数量占该时期参试品种总量的41.76%,之后的4个时期,骨干亲本及其衍生种的数量占各时期参试育成品种总量的比例分别达到80.00%、80.77%、76.47%和72.22%;最近十年,该指标虽有所下降,但仍然高达68.75%。对于西藏自治区、青海省、四川省和甘肃省,骨干亲本及其衍生品种数占各地区参试育成品种总量的比例分别达到79.17%、62.96%、70.59%和75.00%。参试育成品种所使用的亲本合计118个,其中本地亲本97个,占比82.20%,外引亲本15个,占比12.71%;剩余6个亲本的来源信息缺失。【结论】藏区青稞的9个骨干亲本及其67个衍生品种构成了育成品种的主体,外引大麦种质利用率低,从而导致青藏高原青稞育成品种的遗传多样性较低,遗传基础相对狭窄、脆弱。 相似文献
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改进畜禽近交系数计算方法的研究 总被引:1,自引:0,他引:1
本项研究是对Wright的计算近交系数的方法做了改进,同时,借助计算机实现了计算过程的程序化,从而明显地提高了计算工作的效率,很有实用价值。 相似文献
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肉羊计算机辅助育种工作需建立在系统、规范化的羊场生产管理模式下,大量累积数据基础上。本文在肉羊生产管理实现信息化的前期工作基础上,进一步开展育种分析,从近交系数和亲缘系数入手,采用亲缘协方差法,设计程序,按照获取简明系谱、对系谱排序、计算亲缘协方差矩阵三步骤计算。该方法的特点在于无需人工做系谱图,查找共同祖先,绘制通径线,易于计算机编程求解,且与生产管理系统结合可实现全程自动批量运算,简捷、快速,把育种工作者从繁琐的劳动中解放出来,可有效提高育种工作效率。 相似文献
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本文利用线性空间理论讨论了常系数齐次线性递归数列线性空间,并由常系数齐次线性递归数列的系数及其初始值求出其通项公式。 相似文献
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为了对多仔动物所构成的"全同胞-半同胞"混合家系,在不能获得详细系谱资料的情况下,快速、有效的计算抽样群体期望亲缘系数,使用递归和迭代设计特定算法,实现对后代随机抽样情况下样本个体在家系内各雌亲间分布情况的计算,并对各种符合参数要求的样本后代分布进行同胞对数和频数的统计,最终实现抽样群体期望亲缘系数的计算机自动求解和输出.对采用本算法和近似公式计算得到的亲缘系数进行对比分析,结果表明:当雌亲数d≥5时,2种方法计算的亲缘系数差值<0.01;当d≥50时,两者差值相似文献
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递归算法具有简单自然、结构清晰、易于设计、可读性强等优点,但执行效率不高。为了节省存储空间并提高执行效率,人们更希望用非递归的方式求解问题。在分析了递归算法和非递归算法执行原理的基础上,通过实例介绍了几种常用的消除递归的方法。 相似文献