意大利猪圆环病毒3型的检测及遗传特征分析

正荐语:圆环病毒3型(PCV3)是具有猪皮炎肾病综合征和繁殖障碍的临床样品中鉴定出的一种新型圆环病毒,意大利研究者通过qPCR技术对样品中PCV3进行筛选并对其基因序列做出分析,使之成为第一个报告PCV3的欧洲国家。为帮助养猪从业者更好地了解PCV3的相关信息,特对目前仅有的几篇PCV3相关研究文献进行摘译以飨读者,并期待能有越来越多的相关研究来尽快揭示PCV3流行病学信息及遗传特征,为国内对该病毒的研究奠定一定基础。     

猪圆环病毒3型的鉴定与遗传特征分析

正荐语:近两年来,猪圆环病毒3型(PCV3)在国内多个学术活动中被多次提及,然而关于PCV3的文献报道却十分有限。PCV3是在具有猪皮炎肾病综合征和繁殖障碍的临床样品中鉴定出的一种新型圆环病毒。为帮助养猪从业者更好地了解PCV3的相关信息,特对下面这篇PCV3相关研究文献进行摘译以飨读者,并期待能有越来越多的相关研究来尽快揭示PCV3流行病学信息及遗传特征。     

猪圆环病毒3型在韩国猪群中的流行状况调查

<正>猪圆环病毒(Porcine?circovirus,?PCV)是环状病毒科圆环病毒属的无囊膜病毒,基因组为单股环状DNA。众所周知,猪圆环病毒1型(PCV1)和猪圆环病毒2型(PCV2)对均猪具有感染性。但是,最早被鉴定为PK-15细胞污染物的PCV1已知对猪是无致病性的,而PCV2感染则可导致诸如断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS),猪皮炎与肾病综合征(PDNS)及种猪繁殖障碍等多种与猪圆环病毒2型     

河北省猪群中检出猪圆环病毒3型

猪圆环病毒3型(Porcine circovirus type 3,PCV3)为新发传染病病原。2016年美国首次报道了该病的发生与流行。为了解PCV3在我国猪群中的分布与流行状况,本研究建立了PCV3 PCR检测方法。敏感性和特异性试验结果表明,该方法对PCV3的最低核酸检出量为38 pg,可扩增出284 bp的特异性片段。利用建立的PCR方法对从河北省猪场收集的168份疑似样品进行检验,检出阳性样本9份,表明河北猪群存在PCV3感染。     

广西地区猪圆环病毒2型和猪圆环病毒3型基因型监测及遗传进化分析

为了明确猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV-2)和猪圆环病毒3型(Porcine circovirus type 3,PCV-3)在广西地区的分子流行病学情况,试验通过PCR方法对2017年来自广西不同地区的80份猪肺脏样品进行PCV-2和PCV-3核酸检测,并对PCV-2和PCV-3的阳性样品进行ORF2基因的扩增和测序,同时利用生物信息学软件DNAStar和MEGA 6.06对PCV-2和PCV-3的ORF2基因进行同源性分析和构建遗传进化树。结果表明:2017年广西地区PCV-2和PCV-3的总感染率分别为43.8%(35/80)和33.8%(27/80),PCV-2和PCV-3的共感染率为16.3%(13/80)。试验获得的19个PCV-2 ORF2基因序列之间的核苷酸同源性为93.6%～99.9%,对应氨基酸同源性为93.1%～100%;19个PCV-2 ORF2基因序列与国内外参考毒株ORF2基因序列的核苷酸同源性为82.8%～99.9%,对应氨基酸同源性为83.3%～99.6%。试验获得的2个PCV-3 ORF2基因序列之间的核苷酸同源性为99.8%,对应氨基酸同源性为100%;2个PCV-3 ORF2基因序列与国内外参考毒株ORF2基因序列的核苷酸同源性为97.7%～99.8%,对应氨基酸同源性为96.2%～100%。获得的19个PCV-2 ORF-2基因序列中,12个为PCV-2b亚型,7个为PCV-2d亚型;获得的2个PCV-3 ORF2基因序列为PCV-3a亚型,与丹麦和中国湖南分离得到的PCV-3亲缘关系较近。说明PCV-2和PCV-3在广西地区猪群中感染率很高,PCV-2感染主要以PCV-2b亚型为主,PCV-3之间高度保守,分布无地域性规律。     

猪圆环病毒3型检测方法研究进展

为了更好地掌握新型猪圆环病毒3型(PCV3)快速、准确而方便的检测方法,现就近两年来国内外相继报道的一种与猪皮炎和肾病综合征、生殖功能衰竭和多系统炎症相关的PCV3主要检测方法包括宏基因组、常规PCR、多重定量实时聚合酶链反应(mqPCR)、TaqMan实时PCR、实时重组酶聚合酶扩增(rt-RPA)、间接ELISA进行了综述,旨在为PCV3流行情况提供可靠的检测方法。     

猪圆环病毒3型检测和致病性的研究进展

猪圆环病毒3型(Porcine circovirus 3,PCV3)是2016年首次在美国报道的一种新的猪圆环病毒。之后,中国、波兰、韩国、丹麦、意大利和西班牙等国家陆续报道PCV3单独或混合感染的检测,引起研究人员的广泛关注。目前认为PCV3与母猪繁殖障碍、发热、呼吸系统疾病以及多系统炎症等有一定的相关性,且检测报道预示PCV3会引起新生仔猪先天性震颤和心肌炎等临床疾病。但PCV3确切致病机理仍需进一步调查研究。文中主要对PCV3基因组序列的特点、感染检测和致病性相关报道进行综述,为PCV3流行病学调查和致病机理研究提供参考。     

猪群感染圆环病毒3型病例的诊断和病毒鉴定

2017年8月,华南某猪场保育猪出现慢性消瘦和呼吸道综合征的病猪。经实验室PCR诊断,排除猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)和猪圆环病毒2型(PCV2)后显示为猪圆环病毒3型(PCV3)阳性。采用特异性CAP段基因引物扩增该片段,使用DNAMAN7.0和MEGA6.06软件进行同源性分析。结果,成功克隆了该病毒的CAP段基因,序列长度为671 bp,并进行基因测序和遗传进化分析。序列同源性分析表明该毒株为PCV3,命名为PCV3/CN/Guangzhou/2017。     

LAMP-LFD技术在检测猪圆环病毒3型中的应用研究

为快速了解猪群中猪圆环病毒Ⅲ型(PCV3)的感染状况,本研究将环介导等温扩增技术(LAMP)与侧向流动试纸条(LFD)相结合,建立了快速检测PCV3 LAMP-LFD方法,并对该方法的特异性、灵敏性以及临床初步应用进行了验证分析.试验结果显示:常规PCR能检测到0.2 pg/μL的病毒,而本研究建立的LAMP-LFD能...     

猪圆环病毒2型GZ-RH1株基因组遗传特征分析

为对猪圆环病毒iDNA新型疫苗、基因组遗传变异以及基因组结构与功能等研究提供科学依据,运用相关生物信息学软件对猪圆环病毒2型(PCV2)贵州仁怀分离株(GZ-RH1)的基因组遗传特征进行了分析。结果表明,PCV2GZ-RH1株基因组结构与pmws(AF027217)株相比存在较大差异,其ORF2基因的第696位因碱基T的缺失而导致移码突变,致使其缺失了ORF8和ORF11,ORF5和ORF10终止密码子提前,其他ORF相对较为保守。PCV2GZRH1株各编码蛋白中除了ORF4和ORF9外,其余都属于亲水性蛋白,且ORF9含有1段信号肽序列。在ORF1和ORF2编码蛋白的磷酸化位点中,ORF1相对较为保守,而ORF2变异较大。ORF1~3所编码的蛋白除均具有各自的蛋白质家族域外,还预测到一些可能具有特殊功能的结构域,如ORF1编码蛋白的NACHT结构域和ORF2编码蛋白的精氨酸富集区。ORF2编码氨基酸位点熵值分析表明,ORF2蛋白氨基酸序列中包含2个高变区,即第53~91位和185~215位。通过构建进化树显示,GZ-RH1分离株系PCV2b亚型。对GZ-RH1株的密码子偏爱性分析表明,相对于大肠杆菌和酵母而言,昆虫细胞更适合于PCV2ORF2基因的体外表达。     

猪流产胎儿中猪圆环病毒3型的检测及其遗传演化分析

旨在分析猪流产胎儿中猪圆环病毒3型(porcine circovirus type 3,PCV3)的感染及其遗传进化情况。对2015—2017年采集的湖南省680份猪流产胎儿病料样品进行PCV3检测、扩增和测序,并利用生物信息学软件对获得的序列进行遗传进化分析。结果显示,猪流产胎儿样品中PCV3阳性率为24.4%(166/680),其中,2015—2017年阳性率分别为18.2%(26/143)、22.7%(54/238)和28.8%(86/299)。从PCV3阳性样本中获得了1株PCV3基因组全长序列,命名为PCV3/CN/Hunan-57(GenBank序列登录号为MZ934695),与国内外毒株基因组序列相比,相似性为97.8%~99.2%;获得了5株PCV3 ORF2基因序列,它们的核苷酸和氨基酸相似性为97.5%~98.3%和96.7%~99.7%,与国内外参考毒株ORF2基因序列相比,其核苷酸和氨基酸相似性为96.3%~99.2%和96.8%~100%。基于ORF2基因序列构建遗传进化树和进行多重序列比对,发现获得的PCV3阳性序列分别属于PCV3a(1株)和PCV3c(4株),并鉴定出T100A、G113S和A184S突变位点。综上表明,猪流产胎儿中PCV3感染率较高,且存在不同类型的PCV3毒株感染,为后续深入研究PCV3遗传变异及其相关致病性提供了重要参考信息。     

猪圆环病毒3型研究进展

猪圆环病毒3型(Porcine Circovirus Type 3,PCV3)是在发病猪临床病理样品中新发现的病毒,已经严重威胁养猪业。PCV3首先在美国被发现,目前在波兰、意大利、韩国以及中国等国家或地区的猪群中流行。本文主要从PCV3的国内外流行情况、诊断和防控措施等方面进行综述,以期对PCV3的防控以及净化提供科学指导。     

猪圆环病毒3型快速检测方法研究进展

猪圆环病毒3型可引起猪的皮疹、呼吸系统和泌尿系统功能障碍等。快速、准确地检测PCV3对于保障猪的健康和生产具有重要意义。本文综述了当前国内外已报道的PCV3快速检测方法,主要包括免疫学检测方法 (酶联免疫吸附试验、免疫层析技术)、基于PCR的方法 (常规PCR、套式PCR、多重PCR、荧光定量PCR、数字PCR及其他基于PCR的技术)、等温扩增技术(环介导等温扩增、重组酶介导等温核酸扩增、重组酶聚合酶扩增、酶促重组等温扩增以及聚合酶螺旋反应)、原位杂交技术以及宏基因组测序技术。本文还初步探讨了不同方法的原理、特性及优缺点,展望了未来PCV3快速检测方法的发展方向,以期为快速、精准地检测及科学防控PCV3提供参考。     

猪圆环病毒3型分子生物学检测方法研究进展

猪圆环病毒3型感染猪后能引起猪厌食、皮炎和肾病综合征、母猪繁殖障碍、仔猪先天性震颤、多系统衰竭综合征等多种疾病,是一种新发的猪传染病,未来可能会给养猪业造成巨大的经济损失。文章综述了6种猪圆环病毒3型分子生物学检测方法,主要包括核酸探针、常规PCR法、套式PCR法、多重PCR法、荧光PCR方法和环介导等温扩增技术,对猪圆环病毒3型的诊断和防控有一定的参考价值。     

一种新的猪圆环病毒—猪圆环病毒3型

正猪圆环病毒相关性疾病(Porcine Circovirus Associated Diseases,PCVAD)是全球养猪业重要的一种疾病。这种疾病造成猪只死亡率增加,生长变缓,对猪场造成严重的经济损失。临床上主要表现为断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)、猪呼吸道病综合征、繁殖障碍和猪皮炎肾病综合征(PDNS)等。猪圆环病毒属于圆环病毒科(Circoviridae)圆环病毒属(Circovirus),是一种无囊膜、单链、环状DNA     

非洲猪瘟病毒、猪圆环病毒2型和猪圆环病毒3型三重PCR检测方法的建立

为建立可同时鉴别检测非洲猪瘟病毒(ASFV)以及猪圆环病毒2型(PCV2)、3型(PCV3)的三重PCR方法,根据GenBank中登录的ASFV、PCV2、PCV3相关基因保守序列,分别设计合成特异性引物,通过对引物浓度、退火温度、循环数等反应条件进行优化,建立了针对3种病原的三重PCR检测方法,并开展了敏感性、特异性及重复性试验。结果显示:引物最佳终浓度为0.375 pmol/μL,最佳退火温度为61℃,最佳循环数为35;该方法对ASFV、PCV2、PCV3的扩增目的条带分别为873、530和217 bp,对猪细小病毒和伪狂犬病病毒的扩增结果均为阴性;对ASFV、PCV2、PCV3重组质粒标准品的检出下限均为1×10⁴ copies/μL;相同条件下重复性试验获得均匀一致的结果。结果表明,本研究建立的三重PCR检测方法具有特异性强,敏感性及重复性好等优点,可用于ASFV、PCV2和PCV3感染的快速鉴别诊断及流行病学调查。     

猪圆环病毒3型与猪圆环病毒2型二重PCR检测方法的建立

为建立同时检测PCV3和PCV2的二重PCR方法,分别以PCV3和PCV2基因组的保守区域设计2对特异性引物,片段大小分别为649,295 bp。将反应条件进行优化,构建PCV3和PCV2的二重PCR检测方法。检测结果表明该方法能特异性扩增PCV3和PCV2,且无法扩增其他猪常见病毒;PCV3和PCV2的最低检出限分别为508,412 copies/μL。临床样品检测结果显示,PCV3和PCV2阳性率分别为2.1%(3/145),62.1%(90/145),PCR产物经测序证实为PCV3。本研究建立的二重PCR方法具有速度快、特异性强和灵敏度等优点,可以用于PCV3和PCV2的检测和流行病学调查。     

猪圆环病毒3型全基因克隆及遗传演化分析

辽宁地区某猪场发现疑似断奶仔猪多系统综合征(PMWS),经临床症状、病理变化和PCR检测,确诊为猪圆环病毒3型(PCV3)感染;根据Gen Bank中收录的PCV3基因序列,设计2对特异性引物,从患有PMWS的仔猪内脏组织中扩增PCV3全基因序列,克隆到p MD18-T载体中,经测序、拼接获得PCV3全长c DNA序列,利用DNAStar和DNAman生物软件对全基因组进行遗传变异分析。结果显示:PCV3毒株基因组全长2 000 bp,命名为CN/Liaoning-2017 (简称LN株)(GenBank登录号:MH177453. 1),基因组有3个开放阅读框(ORF),其中2个ORF编码的蛋白与圆环病毒的复制相关蛋白(Rep)和衣壳蛋白(Cap)同源。Cap基因大小为645 bp,编码214个氨基酸。PCV3国内株可分为3大分支(3a簇、3b簇与3c簇),LN株处于3a簇分支中,与湖北株(KY354039. 1)同源性最高,达到99. 7%; LN株与PCV3a簇代表株(PCV3-USMN2016,PCV3-US-MO2015)同源性在98. 8%～99. 2%之间,与PCV3b簇代表株(PCV3-US-SD2016)的同源性为98. 8%,与PCV3c簇代表株(PCV3-China-GD-2016)同源性为98. 7%。Cap蛋白氨基酸位点分析显示,LN株在第68位发生突变,与其他代表株都不相同。以上试验结果表明,成功从患有PMWS的仔猪体内克隆了PCV3全基因,并完成了序列分析。LN株是辽宁省首次发现的PCV3毒株,这些数据将为研究PCV3的遗传变异和流行病学特征提供分子生物学依据。     

河南地区猪圆环病毒3型的PCR检测

为调查河南地区猪圆环病毒3型(PCV3)的感染情况及流行特点,对2015—2017年河南不同地区猪场采集的152份临床样品进行PCR检测PCV3。结果显示,152份临床样品中检测到46份PCV3,阳性率为30.26%(46/152),在开封、新乡、鹤壁等7个地市均检测出PCV3,说明PCV3在河南省部分地区存在并且已呈现流行趋势;152份临床样品中有105份样品PCV2为阳性,阳性率为69.08%,且所有PCV3阳性样品均可检测出PCV2,推测PCV3与PCV2的共感染可能广泛存在。本研究对河南省猪圆环病毒病的防控提供基础信息。     

猪圆环病毒3型流行病学研究进展

正猪圆环病毒(Porcine circovirus,PCV)是迄今为止能够感染哺乳动物的最小病毒,目前已发现有PCV1、PCV2和PCV3 3种血清型。PCV1于1974年首次在猪肾细胞(PK-15)中发现,可感染猪但对其无致病性;PCV2于1998年首次被分离和鉴定,是引发猪群出现断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)、猪皮炎肾病综合征(PDNS)、猪呼吸道疾病综合征(PRDC)等猪圆环病毒相关疾病(Porcine circovirus-associated disease,PCVAD)的主要病原体;PCV3于2016年首次在患有PDNS的母猪和流产胎儿中检测出,随后在亚洲、欧洲、美洲等地区的猪群中被陆续发现,