广东省木棉种质资源ISSR遗传多样性分析

利用ISSR分子标记技术对144份木棉（Bombax ceiba）种质资源遗传多样性进行分析。结果表明: 木棉种质资源具有较高的遗传多样性,采用筛选的26个ISSR引物共扩增出179个位点,多态性位点161个,多态性位点百分率为899%,有效等位基因数为16,Nei基因多样性指数为0350 5, Shannon信息多样性指数为0523 3,相似性系数为0238 6～0910 6。UPGMA聚类分析得出,木棉种质之间的亲缘关系与来源没有明显的相关性,对同一产地来说,绝大部分种质聚在一起,亲缘关系较近,同时不同产地之间多数木棉种质亲缘关系也较近。     

基于ISSR的重楼种质资源遗传多样性研究

采用ISSR分子标记方法,对13份重楼属种质资源间的遗传多样性进行了分析。结果显示,12条引物扩增出181条清晰条带,其中174条多态性带,平均多态性比率为96.13%;Nei’s基因多样性指数范围为0.214～0.327,香农指数范围为0.351～0.500,样品间的遗传相似系数范围为0.293～0.624;通过聚类分析将重楼种质分为3类。结果表明,重楼属种质具有丰富的遗传多样性,ISSR是研究重楼种质资源遗传多态性及亲缘关系的重要手段之一。     

基于SRAP分子标记的苦楝种质资源遗传多样性分析

【目的】利用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记对来自17个省(区)的31个苦楝种源进行遗传多样性分析,为苦楝种质资源的保存和育种计划的制订提供依据。【方法】通过SRAP分子标记获得1/0数据矩阵,计算SRAP分子标记各项遗传参数,同时进行分子方差分析(AMOVA)。随后计算遗传距离矩阵并进行主坐标分析(PCo A)、邻接法聚类分析(Neighbour-Joining)以及遗传距离和地理距离Mantel相关性分析。【结果】从783对SRAP引物中筛选出的20对引物可扩增出257条清晰的条带,其中145条具有多态性。引物多态性信息指数(PIC)为0.262~0.478,均值为0.385。PIC值较高的10对引物,可扩增出56条特异多态带,可以作为快速鉴别苦楝种源的工具。AMOVA结果显示,38.96%的遗传变异来源于种源间,61.04%的遗传变异来源于种源内。山区的贵州册亨和黎平,云南勐腊和麻栗坡,湖南东安、炎陵和浏阳,四川达州,河北保定,安徽滁州种源的遗传多样性高于其他种源。邻接聚类法根据Nei’s遗传距离将31个种源分为东西2类,西部云南、四川、贵州和甘肃的8个种源构成类群Ⅰ,其他地区的23个种源构成东部类群Ⅱ。类群Ⅱ中北方的济南、保定、泰安、渭南和许昌5个种源聚为一小类,华南地区的屯昌、五指山、钦州和仁化种源聚为一小类,其他相邻和相近的种源大多聚在一起。PCo A分析的种源间双标图结果与邻接法聚类结果基本一致。种源内双标图显示相同种源内的单株大都聚在一起,且种源间和种源内双标图总体分布大体一致。Mantel检验结果表明,种源间遗传距离和地理距离相关性显著(r=0.256,P=0.003)。【结论】SRAP分子标记可以准确、有效地用于苦楝遗传多样性分析。苦楝遗传变异主要来源于种源内,而种源间基因交流有限。种源遗传多样性整体偏低,而部分山区种源遗传多样性较高。在选择高遗传多样性种源的基础上,苦楝选育应侧重种源内家系和单株选择。苦楝种源特征明显,地理环境差异对其遗传多样性具有一定的影响。31个种源大致可分为东西2类,东部种源从北到南有多个聚类中心,其种质资源应采用多点就地保存方式。我国苦楝遗传多样性起源中心或许存在于2类不同种源的生态过渡区。     

广西优质黄皮种质资源ISSR分子遗传多样性分析

该文将ISSR技术应用在广西优质黄皮种质资源分子遗传多样性分析研究上,对24份广西黄皮品种种质资源材料进行分析,最终获得172个位点。按照遗传相似性系数构建聚类图。结果显示:黄皮具有比较丰富的遗传多样性,可进一步拓展黄皮种质创新利用新局面。该试验为黄皮形态学的鉴定也提供了一定的技术支持,为新品种的开发提供新的思路和方法。     

基于AFLP标记的薄壳山核桃种质资源遗传多样性分析

利用荧光AFLP分子标记技术,对引种到山东地区的30份薄壳山核桃品种(系)的遗传多样性和亲缘关系进行分析,旨在加深山东地区引进的薄壳山核桃品种资源遗传背景的认识,为以后山东地区薄壳山核桃的品种选育在分子层面提供理论基础.总体上,9对引物组合共扩增出1425个条带,多态性条带1381个,平均多态性比例为96.9％,其中有...     

基于ISSR标记的杉木种源遗传多样性分析

为从分子水平探讨杉木(Cunninghamia lanceolata)种源空间遗传变异模式,采用ISSR分子标记对杉木全分布区内的40个种源进行遗传多样性分析。结果显示:9条ISSR引物共检测出133条带,其中122条多态性条带,多态条带百分率(PPB)为91.73%,各种源PPB和Shannon表型多样性指数(HPOP)分别为37.46%~55.75%和0.201 5~0.344 5,物种水平多态性条带百分率和Shannon信息指数(HSP)分别为89.86%和0.565 5;分子方差分析(AMOVA)揭示,种源间遗传分化系数(ΦST)为0.4651,这表明杉木种源具有较高的遗传多样性,种源间遗传分化较大。UPGMA法聚类表明,参试的40个杉木种源可分为7地理种源区。     

基于ISSR标记的钩栗遗传多样性分析

利用ISSR分子标记对钩栗Castanopsis tibetana Hance 9个野生居群进行了遗传多样性分析。利用100条引物分别对111份钩栗基因组DNA进行PCR扩增,共扩增出158条清晰条带,其中多态性条带141条,多态性条带百分率(P)平均为89.01%。钩栗9个居群的Nei’s基因多样性指数、Shannon’s信息指数分别为0.332 3、0.492 0;总种群基因多样度(Ht)、各种群基因多样度分别为(Hs)0.410 8、0.334 6,表明钩栗的遗传多样性较高。9居群的基因分化系数Gst为0.185 5,占总遗传多样性的81.45%。分子方差分析表明,80.21%的遗传差异存在于群体内,19.79%的遗传差异存在于群体间。基因流为2.196 0。用NTSYS软件计算出9居群111材料的DICE相似系数在0.811 6~0.921 8之间,遗传亲缘关系较近。各居群间的遗传距离差异较大;其中,邵武与建瓯居群的遗传距离最近,仅为0.081 5;浏阳和周宁居群的遗传距离最远,为0.198 4。聚类分析结果表明,采自福建的邵武、建瓯、建阳、屏南和周宁居群聚在一起;恩施和桑植居群聚在一起;永顺和浏阳居群聚为一起,种群遗传变异分布模式基本上与其地理生态格局一致。研究结果表明:供试的钩栗具有较高的遗传多样性,存在着较为频繁的基因交流;基于ISSR标记分析能较准确地揭示出钩栗种间的遗传多样性。     

金银花ISSR分子标记及遗传多样性分析

以湖南、山东、河南的22个金银花主要栽培品种为材料,利用ISSR分子标记对22个金银花品种进行了遗传多样性分析.结果表明:从100条ISSR引物中筛选出10条能够扩增出清晰、稳定条带的引物;这10条引物对22个金银花品种基因组DNA扩增,共扩增出108条带,其中多态性条带96条,多态性条带比率为88.89%;22个金银花品种间的遗传相似性系数范围在0.41~1.00,平均遗传相似性系数为0.68.利用U PGM A进行系统聚类分析,22个供试金银花品种划分为2大类,第1类为忍冬种群,第2类为灰毡毛忍冬种群,每一大类又分为北方种群与南方种群.而且主成分分析结果支持以上的聚类分析结果.可见,利用ISSR标记可有效地分析金银花种质资源的遗传多样性,为金银花品种鉴别、分类、种质资源的有效利用提供理论依据.     

珙桐天然种群遗传多样性的ISSR标记分析

利用ISSR分子标记分析来自11个天然珙桐种群的遗传多样性。从100条引物中筛选出5条引物能扩增出稳定、清晰且具多态性的条带,共扩增出77个条带。其中74个为多态,多态条带百分率(PPB)为96.10%;各种群PPB值为37.66%～63.64%,平均为54.07%。种内Shannon多样性指数(HSP)为0.4849,种群内Shannon多样性指数(HPOP)为0.1886～0.3274,平均为0.2774。这表明珙桐在物种和种群水平上均维持较高的遗传多样性。分子方差分析显示,种群间与种群内遗传变异分别占总遗传变异的46.22%,53.78%,种群间呈高度遗传分化。种群间遗传距离与对应的地理距离呈显著正相关(r=0.546,P<0.01)。UPGMA法聚类分析将11个珙桐种群分为3组。研究结果为珙桐遗传资源保护策略制定提供有价值的种群遗传学信息。     

油茶种质资源遗传多样性分析

利用RAPD标记技术分析90份油茶种质的遗传多样性,探讨无性系间的亲缘关系,以及抗病性、果油率和产油量3个数量性状与谱带的相关性.结果表明:RAPD扩增得到593条谱带,多态性谱带564条,多态比率达95.11%,特异性及特异性缺失谱带32条,占5.32%,无性系间存在丰富的遗传多样性;广西软枝油茶和广东阳春油茶均聚在同一亚类,从分子水平说明了阳春油茶和软枝油茶的亲缘关系比较近,可能是同一个农家品种;与抗病性、果油率和产油量3个数量性状显著相关谱带分别为13.1%、25.2%和34.5%,这些与抗病性、果油率和产油量数量性状相关谱带的确定,可为选育丰产、抗病、优质的油茶品种提供参考.     

42份乌榄种质资源SCoT分子标记遗传多样性分析

为了解和掌握广西乌榄的资源类型及其遗传变化规律,利用SCoT分子标记技术,对桂西南地区收集到的42份乌榄种质资源进行遗传多样性分析。筛选出14条引物对供试材料进行PCR扩增,共获得124条带(DNA位点),其中具有多态性条带74条,平均多态性比例(PPB)59.68%;经Ntedit软件计算,其遗传相似系数(GS)的范围值在0.726~0.903,平均为0.817,表明SCoT能够揭示乌榄种质间的遗传变异。UPGMA法聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.812时,可将乌榄种质资源分为A、B 2个大组,每大组又各分2个亚组,亚组内种质资源按照采样地聚集,说明乌榄的亲缘关系与地理起源有一定的相关性。总体上,橄榄种质资源遗传多样性水平相对较低。     

古银杏种质亲缘关系及遗传多样性的ISSR分析

为了探明山东古银杏种质及其群体的亲缘关系和遗传多样性水平,从20对ISSR中筛选出7对扩增产物重复性好、谱带清晰的引物,对29个山东古银杏种质的亲缘关系及遗传多样性进行了研究。结果表明:7对引物共产生34条谱带,其中多态带28条,多态带的比例为82.4%;29个古银杏种质之间的相似系数为0.53～0.95;当相似系数为0.78时,供试种质可分为5类,种质的聚类与种质是否在同一地理区域并非完全相关;泰安与临沂群体之间的遗传一致度比较高,非半岛地区古银杏种质的遗传多样性高于半岛地区的。     

利用ISSR标记分析兴安落叶松种源的遗传多样性

利用ISSR标记对17个兴安落叶松种源170个个体遗传多样性进行了分析。通过10个ISSR引物扩增,共检测到95个位点,各种源多态位点百分率在25.26%~44.21%之间,多态位点百分率最高的为鹤北种源,最低的为绰尔种源。根据种源间的遗传距离,构建了兴安落叶松17个种源的遗传聚类图。同时,结合遗传距离和地理距离对兴安落叶松进行了种源区划。     

基于SRAP分子标记的广宁红花油茶种质资源遗传多样性研究

利用SRAP分子标记建立广东省4个种群153个单株的广宁红花油茶种质资源遗传多样性评价体系,从594对引物组合中最终选出13对引物,结果表明:13对引物组合共扩增出206条带,平均每对引物组合获得15.85条,多态性条带为187条,多态性条带比率(PPB)为90.78%。种群Nei's基因多样度(h)、Shannon多样性指数(I)、多态性位点百分比(PPL)变化范围分别为0.217 9~0.356 3,0.321 7~0.524 8及58.25%~92.72%,平均值分别为0.307 8,0.456 3及83.62%,表明广宁红花油茶具有丰富的遗传多样性。聚类分析表明,当阈值为0.93时,可将广宁红花油茶4个种群分为2大类,广东清远单独成为一类,第二类包括广东广宁县,广东增城,广东云浮。广东云浮与广东增城遗传距离为0.019 3,遗传距离最小,说明二者的亲缘关系最近。AMOVA分子变异方差分析显示,在广宁红花油茶总的遗传变异中,种群内占95%,而种群间仅占5%。     

北美泡泡树ISSR标记开发及遗传多样性分析

以泡泡树[Asimina triloba (L.)Dunal]品种‘Mango’为实验材料,从100个ISSR(Inter-simple sequence repeat)引物中筛选出6个多态性高、重复性好的引物。利用这6条引物,对13个泡泡树品种及其半同胞家系和6个种源的48个样品进行遗传多样性分析。通过DNA检测,扩增出2 337条谱带,其中多态性条带为1 930,多态性比率为82.6%。聚类分析结果表明,供试材料相似系数介于0.59～0.99之间。供试材料在相似系数0.91处的DNA水平上的类群划分和形态特征一致。该研究为泡泡树新品种培育的亲本选择及杂种鉴定提供理论依据。     

福建柏遗传多样性ISSR分析

采用ISSR分子标记技术,对我国濒危植物福建柏的7个种群进行遗传多样性分析。结果显示:17个引物共扩增出202个位点,多态性位点167个,占总位点的82.67%;引物UBC849可以将24份福建柏样本完全鉴别出来;7个福建柏种群的多态位点百分率在17.82%~54.95%之间;群体总观测等位基因数Na为1.821 8,有效等位基因数Ne为1.431 3,Nei指数为0.258 2,Shannon指数为0.394 0;种群内平均Na指数为1.372 0,平均Ne指数为1.289 2,平均Nei指数为0.160 0,平均Shannon指数为0.203 5;基因分化系数Gst为32.41%,种群间基因流Nm为0.878 0;7个种群遗传相似度在0.668 3~0.806 9之间,遗传距离在0.214 5~0.404 3之间;利用UPGMA法进行聚类,将泉州市、福州市和龙岩市种群分为第一类,将南平市、三明市和漳州市种群分为第二类,将宁德市种群分为第三类。     

蜡梅种质资源遗传多样性研究进展

综述了蜡梅的分布情况、群落生态学、表型多样性以及分子标记手段研究蜡梅遗传多样性的研究成果及进展情况。并对蜡梅种质资源研究中存在的问题提出建议与展望。     

漆树种质资源遗传多样性研究进展

遗传多样性是生物多样性的重要组成部分,也是生态系统多样性和物种多样性的基础。本文从分子水平对原产我国的重要经济树种——漆树种质资源的遗传多样性研究概况进行了综述,同时,对漆树遗传多样性研究发展趋势进行了展望,以期为该植物的资源保护与利用提供科学借鉴。     

荷花种质资源遗传多样性研究进展

遗传多样性作为生物多样性的重要组成部分,是物种多样性、生态系统多样性和景观多样性的基础.本文就荷花种质资源分类,分布以及其遗传多样性进行了总结和探讨,以期为荷花资源进一步研究提供借鉴与参考.