芥菜种质资源的RAPD和ISSR分析

利用RAPD和ISSR标记对28份芥菜种质资源进行遗传多样性分析,20个RAPD引物共扩增出162条清晰的谱带,其中140条显示多态性,平均每个引物扩增出7.0条多态性谱带.18个ISSR引物共扩增出143条清晰的谱带,其中多态性谱带124条,平均每个引物扩增出6.9条多态性谱带.基于RAPD和ISSR两种标记,利用UPGMA分别构建了28份芥菜资源的聚类树状图.结果表明,RAPD和ISSR分别聚类以及两种标记混合聚类均将28份芥菜种质分为3类:第Ⅰ类群中包括了15份种质;第Ⅱ类群中包括了9份种质;第Ⅲ类群中包括了4份种质.     

山楂（Crataegus pinnatifida Bge.)遗传多样性的RAPD和ISSR标记分析

 利用RAPD和ISSR标记对35份山楂（Crataegus pinnatifida Bge.）资源进行了DNA多态性分析。12个RAPD引物共扩增出110条清晰的谱带,其中89条显示多态性,平均每个引物扩增出7.4条多态性谱带。13个ISSR引物共扩增出110条清晰的谱带,其中94条显示多态性,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带。基于RAPD和ISSR标记,利用UPGMA分别构建了35份山楂资源的聚类树状图。距离系数分别为0～0.62（RAPD）和0～0.64（ISSR）,表明山楂具有较高的遗传多样性。     

中国茶组植物种质资源遗传多样性的RAPD分析

采用RAPD技术分析了中国茶组植物23个种质资源的遗传多样性。筛选的11个随机引物扩增出135条RAPD谱带, 其中有多态带123条, 平均多态性为91.11%。聚类分析表明, 广南茶与大苞茶之间的遗传距离最小(0.1378) , 汝城白毛茶与厚轴茶之间的遗传距离最大(0.8995) , 应用UPGMA聚类分析法构建了DNA分子系统树图, 并据此讨论了茶组植物的分类。     

美人蕉种质资源的RAPD分析

 利用RAPD技术对美人蕉属4个种和52个品种的亲缘关系进行研究, 从125个随机引物中筛选出27个多态性较高的引物, 扩增出223条DNA带, 其中140条为多态带, 占62.78% , 平均每个引物扩增的DNA带数为8.26条。3个种和7个品种具有特异的位点, 可作为种质鉴定的依据。根据RAPD扩增结果建立美人蕉UPGMA聚类图, 在0.11处将56份种质划分为4类。分子聚类结果与形态分类结果基本一致, 4个种分属4个类群, 52个品种分为大花美人蕉和兰花美人蕉。对美人蕉品种分类和品种演化进行了初步探讨。     

不同产地人参种质资源RAPD和SSR分析

以15个产地人参种质资源为试材,采用RAPD和SSR分子标记技术对其遗传多样性进行分析。结果表明:2种分子标记均能揭示不同地区人参种质间的遗传多样性。共筛选出11条RAPD随机引物,平均每条引物可扩增出3~17条DNA片段,共扩增出104条清晰条带,多态性条带100条,多态性百分率为96.15%,揭示供试材料间遗传相似系数(GS)为0.505 3~0.989 5,平均值为0.760 4。筛选出5对SSR引物,平均每对引物可扩增出1~8条DNA片段,共扩增出38条清晰条带,多态性条带35条,多态性百分率为92.11%,揭示供试材料间遗传相似系数(GS)为0.400 0~0.960 0,平均值为0.742 1。RAPD和SSR标记的聚类分析在分类上稍有差异,但总体趋势一致,RAPD、SSR及RAPD+SSR均将样品聚为三大类,均能揭示它们之间的亲缘关系,为人参种质资源的收集与利用奠定了基础。     

部分栽培葱属植物叶绿体基因组的RAPD分析

  提取我国栽培的几种主要葱属植物的叶绿体DNA , 利用RAPD 技术进行遗传关系分析。从56 个10 bp 随机引物中筛选出18 个多态性引物进行扩增分析, 14 个材料共扩增出270 条带, 其中246 条具多态性。UPGMA 聚类将供试葱属品种分成4 个组。葱属在进化上存在两个方向, 分别形成了管状叶和扁平叶两种类型。     

杏品种的RAPD分析

实验从S系列(Sangon公司)100个引物中筛选出能稳定扩增的18个引物,用这些引物首次对新世纪与红丰等20个杏品种进行了扩增,均具有多态性。共扩增出218条带,106条具有多态性,多态性比例为48.6%;建立了红丰及新世纪等优新品种的DNA指纹图谱,找到了它们的特异谱带。利用特异谱带结合DNA指纹,可将参试品种鉴别出来。同时利用STATISTIC软件,根据RAPD标记相似系数采用UPGAM聚类策略,对20个杏品种进行了聚类分析。在LD=0.4时划等值线,将参试品种分为7类。     

灵芝菌株的DNA指纹分析

CTAB法提取灵芝菌丝体总DNA,再以核糖体DNA转录间隔区（ITSⅡ、IGR IPCR RFLP）结合随机引物扩增多态性（RAPD）标记分析30个灵芝菌株间的亲缘关系.结果表明,ITSⅡ、IGR I-PCR RFLP产生了47条带,其中42条显示出多态性,通过聚类分析将30个菌株分成七大类,包括紫芝、黑灵芝、树舌灵芝、薄树灵芝四大类,以及另外三个无法确定具体归属的类群,但没能将赤芝与松杉灵芝区分开.RAPD从247个随机引物中筛选出8个随机引物,共检测到69个多态性位点并全部显示出多态性,通过聚类分析将供试的30个灵芝菌株全部区分开.     

辽宁地区五种野生软枣猕猴桃RAPD遗传多样性分析

以CTAB法提取的5种野生软枣猕猴桃基因组DNA为模板,应用RAPD方法随机扩增多态性DNA,分析其亲缘关系。结果表明:5种软枣猕猴桃均表现出各自不同的多态性RAPD标记,5条单个引物分别扩增出一般为4～6条RAPD条带,其分子量约在250～2000bp之间。依据这些多态性标记计算其种间遗传相似性,建立了亲缘关系树形图。     

RAPD和SRAP分子标记在真姬菇菌种鉴定中的应用

利用RAPD及SRAP分子标记技术对从国内外收集到的12个真姬菇菌株进行遗传多样性分析.结果表明,20条RAPD引物共扩增出多态性条带285条,18对SRAP引物共扩增出多态性条带176条.在相似系数0.800水平时,RAPD和SRAP分子标记分别将12个真姬菇菌株分为5个和6个类群.两种方法均适用于真姬菇种内鉴定,而SRAP标记较RAPD标记稳定性好,更适于真姬菇的种内鉴定.     

运用RAPD对核桃属种间亲缘关系的研究

用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）技术对核桃属内９个种及近缘属的２个种进行基因组ＤＮＡ多态性分析,共选用２０个１０ｂｐ随机引物扩增出３１１个ＤＮＡ片段,其中铁核桃Ｊ．ｓｉｇｉｌｌａｔａ,甘肃枫杨Ｐ．ｍａｃｒｏｐｔｅｒａ显示出自身特征性标记,利用这些片段进行遗传关系分析,根据ＵＰＧＭＡ方法构建聚类树状图。研究结果表明：铁核桃为核桃属中一个独立种;核桃属内组间和种间亲缘关系与经典分类学的结果完全一致;     

Clone identification and genetic relationship among vine cacti from the genera Hylocereus and Selenicereus based on RAPD analysis

Clones of Hylocereus and of Selenicereus species were distinguished from each other by the banding pattern generated by one to nine 10-mer oligonucleotide primers in the random amplified polymorphic DNA (RAPD) reaction. RAPD analysis was also applied to estimate the genetic relationship among five Hylocereus and nine Selenicereus species. A dendrogram was constructed based on a data matrix of 173 polymorphic bands originated by nine primers. Two groups were identified, one consisting of Hylocereus species and the other consisting of Selenicereus species. These results are consistent with the accepted taxonomic classification of the genera studied. The principal coordinate analysis (PCO), i.e. the plot drawn on the basis of the RAPD data, clearly distinguished between three groups, namely, Hylocereus species, S. megalanthus and the rest of the Selenicereus species studied. PCO thus strongly support the notion that the tetraploid S. megalanthus is an exception among the Selenicereus group. The RAPD results support our hypothesis regarding the allopolyploid (rather than autopolyploid) origin of this species.     

RAPD markers reveal polymorphism among some Iranian pomegranate (Punica granatum L.) genotypes

In this study RAPD markers were used to determine the diversity level among 24 Iranian pomegranate genotypes. One hundred decamer random primers were used for PCR reactions, among which 16 showed reliable polymorphic patterns. These primers produced 178 bands, of which 102 were polymorphic. Cluster analysis of the genotypes was performed based on data from polymorphic RAPD bands, using Jaccard's similarity coefficient and UPGMA clustering method. The highest and lowest similarities detected between genotypes were 0.89 and 0.29, respectively. At a similarity of 60%, the genotypes were divided into four sub-clusters. Cophenetic correlation coefficient between similarity matrix and cophenetic matrix of dendrogram was relatively high (r = 0.9) showing the goodness of fit of the dendrogram. RAPD markers showed to be a useful tool for studying the genetic diversity of pomegranate.     

加工型辣椒资源RAPD聚类分析

利用RAPD技术对不同来源、不同类型的34份加工型辣椒种质资源进行聚类分析。20对随机引物共扩增出179条带，各引物的扩增带数在4—15条之间，其中多态性条带数139条，占总条带数的74．32％。聚类分析结果表明，34份材料首先分成3大类，与传统的辣椒属中种的划分一致，其中32份一年生辣椒（Caspsicum annuum L.）又可分为5个类群，果形性状在聚类图中呈随机分布，与种质资源的亲缘关系无相关性。     

从DNA水平上分析香菇不同菌株的遗传差异

本文选取了10个中国香菇野生种和2个栽培种.采用RAPD技术进行遗传差异测定.16个随机引物共扩增出118条DNA带,在此基础上分析并构建了遗传相关聚类图.结果表明,我国的香菇野生资源存在着较大的遗传差异,10个野生种菌株之间的遗传相似性在50%～80 %之间.     

Inter- and intra-specific genetic diversity among cyclamen accessions investigated by RAPD markers

Random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis was used to characterize genetic diversity of 26 Cyclamen persicum and Cyclamen com accessions. Eighty-four arbitrary primers tested, among which nine primers showed reliable polymorphic banding patterns and yielded 104 polymorphic markers. Jaccard's similarity coefficient among accessions ranged from 0.99 to 0.08. At a similarity of 68%, accessions were divided into three clusters. The cophenetic correlation coefficient between the similarity matrix and the dendrogram was relatively high (r = 0.9) showing the goodness of fit of the dendrogram. The RAPD analysis offered a rapid and reliable tool for the estimation of inter- and intra-specific variability in cyclamens. The wide genetic variation observed for cyclamens within Iran guarantees a promising future of breeding.     

中国兰属植物种间及品种间亲缘关系的RAPD分析

 利用RAPD分子标记分析中国兰属(Cymbidium ) 的28个原生种和部分种的不同品种及3个杂交种共50个材料间的亲缘关系。获得250条可明显区分的DNA扩增片段, 除S143-850 bp 1条带为全部材料共有外, 其余带均为多态性位点。这些带最大的为2 100 bp, 最小的为200 bp, 以集中在1 031～300 bp的带居多。UPGMA进行聚类分析显示: RAPD的聚类树状图所呈现出的亲缘关系大体与ITS系统发育树一致。建兰亚属可能为一自然类群。大花亚属并非自然类群, 其成员之一文山红柱兰(C. Wenshanense Y.S. Wu et. ) 偏离出去而与兰亚属聚在一起。兰亚属则为一高度异质性的类群, 分散成互不关联的3支。本结果和ITS系统发育分析表明, 有必要对经典分类的兰属属下分类, 特别是兰亚属进行修订。对3个亚属中各组的划分基本与传统分类的一致。春兰品种间的多样性高于其它测试品种。     

中国北方引种的部分越橘品种的RAPD分析

利用RAPD技术对我国北方引种的15份越橘(Vaccinium spp.)栽培品种进行了遗传多样性分析。从70条随机引物中筛选出15条引物,共扩增出94个位点,其中多态性位点83个(88.3%)。材料间遗传相似系数变化为0.5426～0.8936,表明各品种间具有一定的遗传差异。UPGMA聚类分析结果可将供试材料分为2大类、5个亚类。聚类结果与各品种的杂交系谱相对应,从分子水平揭示了品种间的亲缘关系。