菊花品种表型性状与SSR和SCoT分子标记的关联分析

利用16对SSR和10对SCoT引物对99个菊花品种的基因组变异进行扫描,分析其群体结构,并采用一般线性模型GLM和混合线性模型MLM方法对10个表型性状进行关联分析。供试群体Shannon’s指数为1.46~2.52。群体遗传结构分析将99个菊品种划分为5个亚群。GLM分析发现有8个SSR位点与7个表型性状相关联(P0.01),其中与3个花部性状(花序直径、花序高度、舌花宽度)相关位点5个,与4个营养性状(叶柄长度、叶片长度、托叶大小及叶一级刻度)相关位点4个,各位点对表型变异的解释率在0.06~0.40之间;3个SCoT位点与花序直径相关联。MLM分析发现3个SSR位点与4个表型性状相关联。MLM中检测到的标记JH42、JH81和JH86在GLM中同样被检测到,但解释率稍低。     

生菜资源表型性状变异及其与SSR标记的关联分析

从世界范围内搜集的300多份生菜资源中筛选30份优质资源作为研究对象,调查12个表型性状变异,并进行SSR分子标记分析,探究表型性状与SSR标记之间的相关关系,以期为生菜分子标记辅助育种提供参考依据。结果表明:调查的30份资源表型性状均存在极显著差异,平均变异系数最大的为株幅(40.256%)。12个表型性状将30份生菜资源分成两大类,30份资源的遗传距离变化范围为0.083~0.667。14个多态性EST-SSR标记在30份生菜资源中扩增的条带数为3~8,HO和HE的平均值分别为0.156和0.680,PIC值变化范围为0.466~0.771。同样,14个标记将30份资源分成两大类,30份资源间的遗传距离为0.032~2.629,表型性状聚类结果与SSR标记聚类结果不相关。以单一性状聚类结果与SSR标记聚类结果进行相关性分析,大部分标记均与表型性状有相关性,且大部分引物组合表现为累积效应。     

菜心重要农艺性状与SSR分子标记的关联分析

菜心是华南地区的主要蔬菜,利用分子标记辅助育种发掘出与重要农艺性状相关的分子,不仅可以加速优良品种的选育进程,还可以定向地优化目标性状,培育出高产优质的菜心品种.本研究选用148 份来自宁夏银川和广东南沙田间种植的菜心种质材料,采集株高、株质量、薹高、薹质量和薹粗5 个重要农艺性状的数据;利用SSR 标记对其进行基因分...     

卡特兰DUS测试性状与SSR标记的关联分析

为挖掘与卡特兰（Cattleya）表型性状显著相关的分子标记,对160份卡特兰品种的63个DUS（特异性、一致性和稳定性）测试性状进行鉴定描述,用筛选得到的22对核心SSR引物对这些品种进行遗传多样性分析,并利用TASSEL2.1软件的一般线性模型（generallinearmodel,GLM）和混合模型（mixed linear model,MLM）依次对供试品种8个主要观赏性状进行关联分析。研究结果显示,22对核心SSR引物共得到293个等位变异位点,变异幅度在3～28之间,PIC值平均为0.8531,平均Shannon’s信息指数（I）为2.3280。基于Nei’s遗传距离进行聚类分析,可将160份卡特兰品种分为两大种群。GLM模型分析共检测到17个标记分别与4个性状相关联;MLM共检测到15个标记分别与6个性状相关联;共有15个标记被两种模型同时检测到与表型性状相关联。SSR42和SSR9这两个标记在两种模型中多次出现,与花长度、花颜色和中萼片性状等多个性状相关联,体现了“一因多效”现象。     

中国樱桃地方种质资源表型性状遗传多样性分析

以源自中国樱桃主产区7个群体,80份地方种质资源为试材,采用巢式方差及聚类分析法对其叶片、果实及果核26个表型性状进行多样性分析。结果表明:(1)质量性状之间存在较大的多样性差异,Shannon-Wiener多样性指数范围在0.61~1.64之间,其中果实形状、果皮颜色、叶片及果核剖面形状等表现出较高的遗传多样性。(2)数量性状无论是在群体间还是群体内均表现出极显著差异,14个数量性状的平均变异系数为9.93%,其中果柄长度的变异系数最高(24.80%),果核顶面观指数最低(6.61%)。在7个群体中,云南的种质材料变异系数最大,为12.92%;安徽的最小,为7.42%。(3)对14个数量性状的主成分分析表明,前5个主成分的累积贡献率达80.9434%,能反应数量性状的基本特征。(4)基于Nei’s遗传距离的聚类分析以及主坐标分析将80份材料分为2个大类,分布于山东、河南和安徽群体的种质资源聚为一类,为华北类群,分布于四川、云南、贵州和重庆群体的聚为另一类,为西南类群。研究结果表明不同地理分布群体的中国樱桃表型多样性存在差异,而这种遗传差异可能是由于来自不同的驯化位点而造成的。     

基于SCoT 标记的芥菜种质遗传多样性与指纹图谱

利用SCoT 标记对46 份芥菜种质资源进行遗传多样性分析。从70 条引物中筛选出21 条用于PCR 扩增,共扩增出200 条条带,其中多态性条带140 条,多态性比率为70%。供试材料相似系数介于0.77～0.95 之间,平均Nei’s 基因多样性为0.198,平均Shannon 信息指数为0.301,平均多态信息含量为0.822 7。利用UPGMA 构建46 份芥菜种质资源的聚类树状图,在相似系数D1=0.780 处,可以将46 份芥菜种质分为两大类;而在D2=0.807 处,第Ⅱ类可进一步细分为5 个亚类。选出清晰的16 个多态性位点,构建46 份芥菜种质的SCoT 指纹图谱,结果由引物SP4、SP19、SP20、SP23、SP30 所构建的DNA 指纹图谱可将供试材料完全区分开。     

基于SCoT标记的山西五角枫遗传多样性分析

以同一生境的40份自然分布的五角枫为试材,采用SCoT分子标记技术,对霍山兴唐寺的五角枫群体进行遗传多样性分析,为五角枫种质资源的评价和保护提供分子生物学依据。结果表明:筛选的15条SCoT共扩增出113条条带,其中多态性条带41条,多态性比例为36.28%;等位基因数平均为1.362,有效等位基因数平均为1.23,Nei′s基因多样性平均为0.134 1,香农信息指数平均为0.199 4;平均相似系数为0.945。试验结果说明供试材料种群的遗传多样性不高,遗传基础较为狭窄。五角枫的遗传多样性评价应该结合形态学表型与更多的分子标记技术。     

马铃薯表型性状与SRAP标记的相关分析

应用表型标记和SRAP分子标记研究方法,以变异系数、系统聚类和关联度分析为统计手段,研究了44份马铃薯种质资源的遗传多样性、亲缘关系和遗传基础,进而对种质资源的育种利用价值进行评价。结果表明:表型性状与SRAP标记聚类结果的关联度在块茎品质性状上最大,在植株性状上和块茎外观性状上次之,在植株抗病性状上和块茎产量性状上最小。说明在对马铃薯种质资源进行评价时,块茎品质性状是一种理想的指标。     

燕山板栗种质资源叶片表型性状多样性研究

为了给燕山板栗资源保护、开发和科学利用提供数据基础和依据,对燕山地区11个群体的149份板栗资源的28个叶片表型性状进行了多样性研究。结果表明：（1）在群体间23个数量表型性状中仅有4个性状存在显著或极显著差异（P <0.05或P <0.01）,5个质量性状均无显著差异,但在群体内所有数量性状均存在极显著差异（P <0.01）,说明燕山板栗叶片表型在群体间变异处于较低水平,在群体内存在丰富变异。（2）群体间叶片表型分化系数VST为7.80%,远小于群体内变异在总变异中的占比（92.20%）,认为燕山板栗叶片表型变异主要来源于群体内。（3）燕山板栗28个叶片表型性状的平均变异系数（CV）和多样性指数（H’）分别为15.91%和1.24,5个质量性状中以叶片形状的CV和H’最高（34.44%,0.82）、叶缘特征最低（只有具锯齿表型）;23个数量性状的CV在4.52%（气孔宽）～28.32%（锯齿深度）之间,H’在1.97（叶片长/宽）～2.09（叶柄长）之间。生理指标、外观形态和解剖结构这3类性状的平均H’分别为2.05、2.04和2.04,CV为外观形态（12.61%...     

农家板栗品种叶片表型性状分析

以13个农家板栗品种为试材,利用统计分析方法对各品种5个叶片表型指标进行了分析,以揭示不同农家板栗品种间叶片表型性状的变异程度。结果表明:13份农家板栗品种叶片性状存在显著或极显著差异,各性状在品种间均有较大程度的变异,按变异程度大小依次为叶柄长(CV=21.61%)单侧锯齿数(CV=12.44%)叶长(CV=9.95%)叶宽(CV=9.46%)叶形指数(CV=7.11%);各种质不同叶片表型性状变异程度大小不尽相同,叶柄长、单侧锯齿数变异程度较大(CV10%),表型多样性丰富;该研究为板栗种质收集、分类及核心种质构建奠定了基础。     

胡萝卜种质资源的农艺性状及黑斑病抗性研究

在安徽萧县多年连作基地对160份国内外胡萝卜种质资源进行主要农艺性状及3个时期(T1、T2、T3,分别为播种后70、90、110 d)的黑斑病病级指数调查。结果表明:黑斑病病级指数随着胡萝卜生长而逐渐增加,3个时期的平均病级指数之间存在显著差异,分别为0.9、1.8、2.1。基于T3时期的病级指数,160份材料共分为5类,其中第Ⅰ类材料抗性最强,病级指数为0.25～0.75,共21份,其地上部的主要农艺性状指标显著优于其他类群。     

青萝卜种质资源主要农艺性状的表型评价

主要农艺性状的表型评价是青萝卜育种的重要依据。对48 份青萝卜种质资源的33 个主要农艺性状进行变异分析、相关性分析、主成分分析和聚类分析，结果表明：9 个数量性状均有不同程度的变异，单株质量变异系数最大，为32.46%，叶宽变异系数最小，为14.67%；以肉质根为主的典型农艺性状间存在复杂的相关性，相关性极显著的有29 对，相关性显著的有8 对；从33 个农艺性状提取出9 个主成分，累计贡献率为78.937%，基本反映了青萝卜地上部和地下部重要农艺性状信息；在平方欧式距离系数为8.5 时，可将48 份供试青萝卜种质资源分为3 个组群，第Ⅰ组群包括33 份材料，主要特征是株高、开展度、叶长、叶宽和叶片数在3 组中最小，第Ⅱ组群包括14 份材料，主要特征为株型、叶片大小中等，第Ⅲ组群只有1份材料，其株高、开展度、单株质量和单根质量在3 组中最大。     

慈姑种质资源的品质性状分析

对保存于国家种质武汉水生蔬菜资源圃内的100份慈姑种质资源品质性状进行了测定,并对其进行了正态分布检验、相关性分析和聚类分析。结果表明：干物质含量平均为30.87%,变幅23.55%～38.82%|淀粉含量平均为16.36%,变幅11.44%～22.58%|粗蛋白含量平均为4.67%,变幅2.89%～6.98%|可溶性糖含量平均为2.67%,变幅1.55%～3.94%。干物质含量、可溶性糖含量和淀粉含量服从正态分布,粗蛋白含量不服从正态分布|高干物质含量和高淀粉含量的慈姑种质资源的总体水平相对较高。干物质含量与粗蛋白含量、可溶性糖含量、淀粉含量间呈极显著正相关,粗蛋白含量、可溶性糖含量和淀粉含量间呈极显著负相关。依品质性状将100份慈姑种质资源聚为5类,第1类为各品质性状含量均低类型|第2类为仅粗蛋白含量稍高类型|第3类为可溶性糖含量极高类型|第4类为粗蛋白含量极高类型|第5类为干物质含量和淀粉含量极高类型。     

蚕豆种质资源种子表型性状精准评价

为深入了解蚕豆种质资源种子表型性状特征及相关性,以防虫网隔离纯化1代的554份国内外蚕豆种质资源为试材,利用相关分析、主成分分析、聚类分析等方法,对采用数码考种仪获得的种子表型性状进行了综合分析。结果表明:供试蚕豆种质资源种子表型变异范围广,遗传多样性丰富,以百粒重的变异最大;百粒重、种子投影面积、周长、粒长、粒宽和直径这6个表型性状之间具有较高的相关性,相关系数均大于0.80且达到了极显著水平;对8个数量性状进行主成分分析,前3个主成分的贡献率分别为74.60%、23.09%和1.70%,累计贡献率达到99.39%,几乎覆盖参试种子数量性状的全部信息,上述6个表型性状的变异对第1主成分贡献较大,均为籽粒大小性状;聚类分析将所有参试材料聚为3类,与播期和地理来源有一定相关性。基于种子表型性状的综合分析,筛选出11份具有近圆形种子、适宜全程机械化种植和8份具有高产潜力的优异蚕豆资源。     

野生毛花猕猴桃叶片和果实AsA 含量的SSR 标记关联分析

 以抗坏血酸（AsA）含量变异丰富的野生毛花猕猴桃（Actinidia eriantha Benth.）种群为试 验材料,对其叶片和果实中的AsA 含量与SSR 标记进行关联分析。结果表明：通过SSR 分子标记技术和 群体结构分析,可将70 份野生毛花猕猴桃种质材料分为4 个亚群;GLM 模型分析结果显示,在P < 0.01 水平上检测有7 个SSR 标记与叶片和果实AsA 含量紧密相关,各标记对叶片和果实AsA 含量变异的解释 率在0.082 5 ~ 0.175 5;MLM 模型分析结果显示,在P < 0.01 的水平上共检测到有6 个SSR 标记分别与 叶片和果实AsA 含量紧密相关,各个标记的解释率在0.073 6 ~ 0.154 6 之间。发现了与叶片及果实中的 AsA 含量关联的优异SSR 标记位点（UDK96-040、UDK96-053、UDK97-408、UDK97-414 和Ke227）。     

番茄数量性状与番茄红素相关性分析

运用DPS软件对50份番茄种质资源的14个数量性状与番茄红素之间的相关性进行分析。结果表明:单花序花数、单花序果数和可溶性固形物含量与番茄红素含量呈极显著正相关;果梗洼大小、果柄长度和单果质量与番茄红素含量呈极显著负相关;果形指数与番茄红素呈显著正相关;果实硬度、果肉厚、商品果纵径与番茄红素呈显著负相关。     

茄子种质资源表型性状筛选与确定

以10份茄子种质资源为试验材料,采用方差分析、因子分析等统计方法,对茄子17个形态指标进行分析评价和筛选。结果表明,10份茄子种质在株型、主茎色、叶形、果色、果形、单果质量等16个性状方面存在显著差异;采用因子分析可将16个表型性状集约于4个主因子上,其中第1个主因子为果实质量、第2个主因子为株型、第3个主因子为果形、第4个主因子为果籽,这4个主因子对变异的累计贡献率为93.727%以上,基本保持了16个表型性状的绝大部分信息。这些研究对简化种质资源评价和提高育种选择效率有着重要的现实意义。