世界不同地理来源粳稻品种的遗传相似性研究

 【目的】探讨不同国家（或地区和组织）间粳稻选育品种的遗传相似性和遗传差异,旨在为世界各地的粳稻品种能够有效利用于水稻育种提供科学依据。【方法】利用34对SSR引物对不同地理来源包括20个国家（或地区和组织）的313份粳稻选育品种进行遗传相似性和聚类分析。【结果】共检测到198个等位基因,平均每对SSR引物检测到的等位基因数为5.8235个。RM320、RM531、RM1、RM21和RM336的等位基因数较多,分别为16、13、12、10和10个;RM320、RM336、RM286、RM531和RM21的遗传多样性指数较高,分别为2.3668、2.0041、1.9684、1.9508和1.7203。各国家（或地区和组织）粳稻选育品种的遗传相似系数变异范围为0.279～0.918,平均值为0.653。纬度和地理位置相近的国家间粳稻品种的遗传相似系数较大,基本聚为同一个类群,而纬度差异较大,地理位置较远的国家间粳稻品种的遗传相似系数较小,聚为不同类群。 【结论】粳稻品种的遗传相似性与纬度和地理位置有着密切的联系。     

中国不同省份粳稻选育品种的遗传相似性

 【目的】探讨中国不同省份间粳稻选育品种的遗传相似性和遗传差异,为粳稻育种提供参考依据。【方法】利用34对SSR引物对12个省139份粳稻选育品种进行遗传相似性和聚类分析。【结果】共检测到198个等位基因,平均每对SSR引物检测到的等位基因数为5.3235个。RM320、RM531、RM1、RM286和RM336的等位基因数较多,分别为15、12、11、9和9个;RM320、RM336、RM286和RM531的遗传多样性指数较高,分别为2.3324、2.0292、1.8996和1.7820。12个省份间粳稻选育品种的遗传相似性系数范围为0.321～0.914,平均0.686。东北三省、宁夏、云南等纬度相近或生态气候环境相似的省份间粳稻选育品种的遗传相似性较高,而贵州、江苏与其它省份间纬度或生态气候差异较大,其粳稻选育品种的遗传相似性较低。【结论】RM320、RM531、RM1、RM286和RM336等标记适合利用于粳稻选育品种的遗传多样性检测。不同省份间粳稻选育品种的遗传相似性与其亲本的遗传基础有密切相关的同时,与品种选育时所处的纬度和生态气候环境也有一定的相关性。     

利用SSR标记揭示中国粳稻地方品种遗传多样性

【目的】通过中国粳稻地方品种的遗传多样性分析,阐明各省份粳稻地方品种的遗传结构及其亲缘关系,为中国粳稻杂交育种的亲本选配提供科学依据。【方法】利用43对SSR多态性标记,对原产于中国17个省（市、自治区）的187份粳稻地方品种进行等位基因多样性、遗传结构和聚类分析。【结果】共检测到等位基因351个,每个位点等位基因变幅为2-21,平均每个位点等位基因数为8.2;基因多样性指数变异范围为0.117-0.908,平均为0.550;多态信息含量（PIC）变异范围为0.114-0.902,平均为0.523。在RM72、RM241、RM219、RM412和RM232等位点所检测到的遗传多样性参数值较大。西南、华南、华中粳稻地方品种的遗传多样性明显高于华北和东北地区;云南省粳稻地方品种遗传多样性最丰富,天津和吉林的粳稻地方品种的遗传多样性相对较低。基于Nei’s遗传距离的系统聚类把供试材料分为8个小类群,南方粳稻地方品种主要聚类于第ⅰ、ⅱ、ⅲ、ⅳ和ⅴ等5个小类群,北方粳稻地方品种主要聚类于第ⅵ、ⅶ和ⅷ等3个小类群。基于模型的群体结构分析,供试材料被分为11个亚群,有144份材料被分到相应的11个亚群,其余43份材料被分到混合亚群。【结论】南方稻区粳稻地方品种的遗传多样性明显高于北方稻区,其中西南稻区的粳稻地方品种遗传多样性最为丰富,而云南是粳稻地方品种遗传多样性最丰富的省份。北方与南方粳稻地方品种间存在较大的遗传差异,粳稻地方品种间亲缘关系与地域性存在一定的相关性,这种相关性在北方粳稻地方品种中更为突出。RM72、RM241、RM219、RM412和RM232适合应用于粳稻地方品种的遗传多样性检测。     

中国不同省份籼稻地方品种的指纹图谱分析

【目的】通过对中国不同省份籼稻地方品种的SSR标记多样性分析,为中国籼稻地方品种的指纹图谱构建及其有效保护和利用提供理论依据。【方法】利用78对SSR引物,对中国14个省280份籼稻地方品种进行指纹图谱检测,分析不同省份籼稻地方品种间SSR标记遗传多样性差异、等位基因组成及其出现频率等。【结果】共检测到330个等位基因,每对引物等位基因数为2—12个,平均等位基因数为4.141个。RM336、RM334、RM264、RM297、RM204、RM248、RM444的等位基因数和有效等位基因数较多,分别在6和3以上,且遗传多样性指数较高,在1.4以上。78对SSR引物各等位基因的出现频率变异在0.18%—99.56%,RM338的A等位基因出现频率最高,RM131的E等位基因和RM276的F等位基因出现频率最低。RM338、RM308、RM484、RM29等44对SSR引物的某个等位基因在单个或多个省份籼稻地方品种中出现频率为100%。RM336、RM334、RM264、RM204、RM297、RM248、RM263、RM276、RM444、RM21、RM246和RM258等12对引物在多数省份中均表现为较高的遗传多样性。【结论】上述12对SSR引物适用于中国籼稻地方品种的指纹图谱构建。     

中国小麦选育品种与地方品种的遗传多样性

 :对中国作物种质资源信息系统的小麦资料进行了分析。结果表明 ,我国小麦选育品种和地方品种在 4个穗部性状、5种病害性状、6个农艺和品质性状方面都存在较广泛的遗传多样性。选育品种与地方品种相比 ,遗传多样性总体上略有降低。但遗传变异方向有很大的不同。穗部性状、农艺性状和品质性状除粒色和株高外 ,选育品种变异性呈下降的趋势 ,而病害性状多表现出明显的增加。这似乎表明 ,小麦育种与遗传多样性减少没有必然的联系。我国拥有 1 .3万多份小麦地方品种资源 ,应该提高对地方品种的利用 ,努力挖掘其有用基因 ,扩大现代小麦品种的遗传基础     

中国小麦地方品种的SSR遗传多样性分析

【目的】揭示我国主要麦区小麦地方品种的遗传多样性。【方法】选用分布于小麦各染色体臂上的42对SSR引物,对我国10个麦区81个小麦地方品种的遗传变异情况进行分析。【结果】共检测到316个等位变异,单个引物扩增的等位变异为1～17个,平均为7.5个。参试小麦地方品种的多态信息含量PIC值为0～0.90,平均为0.63。平均等位变异数A基因组D基因组B基因组,平均PIC值各基因组间差异不大。遗传多样性最丰富的麦区是黄淮冬麦区和西南冬麦区。聚类分析结果表明,来自同一生态区的全部材料没有完全聚在一起,但冬麦区和春麦区材料间差异较明显。【结论】我国小麦地方品种具有较高的遗传变异,不同麦区间遗传多样性差异较大。     

甘薯地方品种和育成品种的遗传多样性

利用农艺性状、品质性状和RAPD分子标记对中国20份甘薯育成品种和20份地方品种进行遗传多样性分析。结果表明:地方品种与育成品种农艺性状间均有较大的差异,除地上部性状差异较大外,育成品种产量和薯块干物率明显高于地方品种;地方品种的薯块可溶性糖含量、粗蛋白含量均高于育成品种,淀粉含量则低于育成品种。利用农艺性状和品质性状分别获得的育成品种聚类结果与已知品种的系谱吻合度较低,利用RAPD分子标记获得的育成品种聚类结果,与已知甘薯品种系谱图吻合度较高,说明利用RAPD分子标记手段可以更好地反映供试材料的亲缘关系。利用农艺性状和RAPD分子标记结果进行聚类,均表明地方品种中"四季种"和"保亭种"遗传距离最近;地方品种与中国主要育成品种遗传距离较远。在甘薯育种选配亲本时,以分子标记分析为主,辅以农艺性状、品质性状分析较为科学。     

湖北小麦选育品种与地方品种遗传多样性分析

为了解湖北小麦种质资源的农艺和品质性状,探讨育种对各性状的影响及其遗传变异趋势,对湖北省农作物种质资源库中小麦选育品种与地方品种的性状数据进行分类统计分析.结果表明,育种对各性状遗传变异趋势影响各不相同,红粒性状所占比例略有下降,多样性指数升高,长芒、白壳、弱冬性和中熟性状多样性指数均呈下降趋势.在抗病性状中,条锈病、...     

不同薄荷品种遗传关系的ISSR分析

本研究利用ISSR分子标记技术对上海地区适应性种植良好的11个薄荷品种的遗传关系进行了分析,从分子水平阐明其遗传多样性和相似性,以期完善薄荷品种资源的评价方法。结果显示,12个引物共检测到176个位点,其中多态位点170个,多态位点百分率为96．59％。Nei遗传多样性指数平均为0．2280,平均遗传相似系数为0．50,分布在0．19到0．67之间。聚类分析结果显示,圆叶留兰香（Mentha rotundifolia）与留兰香（Mentha spicata L．）成一组,巧克力薄荷（Mentha piperita L．cv．chocolate）、黑胡椒薄荷（Mentha piperita f.rubfscens）、胡椒薄荷（Mentha piperita L．）、薰衣草薄荷（Menthapi perita cv．lavandula）和柠檬辣薄荷（Mentha piperita var．citrata）成一组,苹果薄荷（Mentha suaveolens）、菠萝薄荷（Metha suaveolens cv．variegata）与葡萄柚薄荷（Mentha suaveolens×piperita）成一组,唇萼薄荷（Mentha pulegium L．）单独成一组。该分析结果与以前根据形态进行的分类结果一致。     

Analysis on Genetic Similarity of Japonica Rice Variety from Different Origins of Geography in the World

The genetic similarity and genetic difference among improved japonica rice varieties from different countries （or regions and organizations） were detected. The aim is to provide genetic basis to the breeding of japonica rice varieties. The genetic similarity and cluster of 313 improved japonica varieties from 20 countries （or regions and organizations） were analyzed using the SSR marker. With 34 SSR primers which were polymorphic and uniformly distributed in rice genome, totally 198 alleles were detected among these improved varieties with the average number of alleles per pair of primers of 5.8235. RM320, RM531, RM1, RM21, and RM336 located more alleles, which were 16, 13, 12, 10, and 10 respectively. RM320, RM336, RM286, RM531, and RM21 showed higher genetic diversity indexes, which were 2.3668, 2.0041, 1.9684, 1.9508, and 1.7203, respectively. The genetic similarity for improved japonica varieties among different countries （or regions and organizations） were ranged from 0.279 to 0.918, and the mean value was 0.653. The rice varieties from countries whose latitude and geography position were all nearer were clustered together with higher genetic similarity indexes. The rice varieties from countries who had more different latitude and far geography position were clustered separately with lower genetic similarity indexes. The results indicated the genetic similarity indexes among improved japonica varieties had a close relationship with the geographical position, especially with the latitude.     

Analysis of Genetic Similarity for Improved Japonica Rice Varieties from Different Provinces and Cities in China

To provide a genetic basis for japonica rice breeding, the genetic similarity and cluster of 139 accessions of improved japonica rice varieties from 12 provinces and cities of China were analyzed using 34 SSR markers. Totally 198 alleles were detected among these improved japonica rice varieties with the average number of alleles per pair of primers was 5.3235. RM320, RM531, RM1, RM286, and RM336 showed more alleles, which were 15, 12, 11, 9, and 9, respectively. RM320, RM336, RM286 and RM531 showed higher genetic diversity indexes; which were 2.3324, 2.0292, 1.8996, and 1.7820, respectively. The range of genetic similar index among improved japonica rice varieties from different provinces was from 0.321 to 0.914, with the average of 0.686. There was a high genetic similarity among improved japonica rice varieties from Heilongjiang, Jilin, Liaoning, Ningxia, and Yunnan, which were located in similar latitude or similar ecological environment, while there was a low genetic similarity between improved japonica rice varieties from Guizhou and Jiangsu, and other provinces which were located in more different latitudes and ecological environments. The markers of RM320, RM531, RM1, RM286, and RM336 fit to be used in analysis of genetic diversity for improved japonica rice variety. The genetic similarity among improved japonica rice varieties from different provinces was closely associated with genetic basis of parents, and was also correlated with latitude and ecological environment where the varieties were bred.     

山西省地方花生品种农艺性状的遗传多样性分析

以84份来自山西不同地方的品种为材料,对其农艺性状进行遗传多样性分析。结果表明,在考察的8个性状中,变异系数最大的是抗旱性,为0.32,最小的是出米率,为0.05;多样性比较丰富的是主茎高、单株饱果数和出米率,分别为2.03,2.02,2.02,多样性最低的为抗旱性,为0.96。采用Ward法对地方品种进行了聚类,在平均欧式距离D2为5时将其分为了三大类群,其中,同一地理来源地方品种的亲缘关系并不是最近的,大粒品种与小粒品种在三大类群中交叉出现,表明山西省地方品种间亲缘关系与地理来源和籽粒大小关系不大;也不是同一类型的所有地方品种都能聚到一起,有个别品种聚到了不同类群中,说明并不是所有同一类型的品种的亲缘关系最近,表明山西省花生地方品种具有丰富的遗传多样性。     

200份陆地棉种质资源农艺性状遗传多样性分析

【目的】 研究本地棉花种质基因库,筛选出适于作杂交亲本的种质资源。【方法】 以200份棉花种质资源为材料,研究其形态指标的变异情况和遗传多样性,并以形态指标对 200 份种质进行聚类分析。【结果】 21个形态指标遗传多样性指数(H′)变幅范围在0~1.02。所有材料可划分成6大类,其中第1大类30份材料,茎色紫红色,种子短绒颜色灰褐色材料为主,可以作为彩色棉花育种资源;以170177为主的20份材料种子短绒着生稀毛,种子短绒颜色绿褐色可以作为早熟、无酚、耐高温的育种材料;第6大类50份,所占比例较大。【结论】 200份种质资源的遗传多样性丰富,第6大类50份,可以作为目前新疆育种材料亲本,主要特征为株型塔型,无茎毛,叶色深绿色,叶片大小中,无叶基斑,有限果枝类型,黄色花冠,黄色花药,种子短绒着生情况多毛,种子短绒颜色灰绿色,有种仁色素腺体,吐絮颜色白色。     

陆地棉棉铃性状的遗传效应分析

根据加性 显性 母体效应遗传模型,分析了 6个陆地棉亲本及其按完全双列杂交法配制的 30个F1 的铃重、单株铃数、铃体积、铃容重、单铃种子数、子指、衣指、衣分、铃纵经、铃横经、铃形指数和铃室数共 12个棉铃性状的遗传方差分量以及铃重与其它棉铃性状之间的各项遗传相关。结果表明,铃重和铃容重的加性方差和显性方差均达显著水平;但显性方差明显大于加性方差;铃体积、铃纵径、铃横径和铃形指数的加性方差和显性方差均达显著水平,且两者差异不大;子指、衣指、单铃种子数及衣分等性状均存在显著的母体效应。此外,衣分和衣指的加性方差亦达极显著水平;单铃种子数显性方差达极显著水平;子指的加性和显性方差均不显著;单株铃数的加性和显性效应均达显著水平;衣指、子指、铃体积等性状与铃重间都存在显著的加性相关;而单株铃数与铃重则呈极显著加性负相关;单株铃数、单铃种子数、铃容重、铃体积、铃横径等性状与铃重之间都存在极显著的显性正相关。     

288份陆地棉种质资源主要性状遗传多样性分析

【目的】 研究新疆本地棉花种质基因库,筛选适于作优异亲本的种质资源。【方法】 以288份种质资源为材料,对4个农艺性状和5个品质性状进行变异、相关性、主成分及聚类分析。【结果】 变异系数分别为单铃重(9.14%)、衣分(8.34%)、单株铃数(14.03%)、果枝数(6.26%)、上半部平均长度(4.50%),整齐度指数(1.56%)、马克隆值(6.43%)、伸长率(1.99%)、断裂比强度(7.26%);单铃重与上半部平均长度、整齐度指数、伸长率及断裂比强度呈极显著正相关,衣分与单株铃数、上半部平均长度呈显著正相关,与整齐度指数、马克隆值呈极显著正相关,上半部平均长度与伸长率、整齐度指数及断裂比强度呈极显著正相关,与马克隆值呈极显著负相关;前3个成分特征值累计贡献率达到61.68,第1主成分主要跟单株铃数有关,第2主成分主要与纤维品质有关,第3主成分主要跟衣分有关;聚类分析将288份陆地棉种质资源在遗传距离为11.5时划分为4类,第Ⅰ类群包含88份材料,马克隆值最好的材料。第Ⅱ类群包含75份,类群材料衣分平均数为43.2,4个类群衣分平均里是最高的;第3类群包含124份材料,材料农艺性状和品质性状都相对较好;第Ⅳ类群材料稀絮H10属于特异种质资源,被单独分为一类。【结论】 288份种质资源变异系数幅度较大(1.56~14.03)。单株铃数变异系数最大为14.03,样本间差异较大;其它性状变异系数均小于10,材料纤维品质性状间差异不大。     

中国部分杂交稻和常规早籼、晚粳品种(系)的抗瘟性

 选用来自中国18个省、市,12个小种分属于9个不同谱系的30个具有广谱毒性的稻瘟病菌株,人工接种于已知抗瘟基因型的品种(系)及中国20世纪90年代新育成的部分杂交稻和常规早籼、晚粳品种上进行水稻抗病性鉴定。通过具有广谱毒性并能识别抗病基因的30个菌株,与具有不同抗性类型并携带有不同或与之相连锁的抗性基因的品种及已知抗性基因的国际鉴别品种进行比较,以期推测某些中国品种的抗性基因。结果表明,部分优异抗瘟材料及新育成的杂交稻组合和常规早籼、晚粳稻品种(系)能抗多数近年采集分离的田间致病菌株,是育种和大面积推广种植