抗菌肽NK-lysin生物信息学分析及其抑菌作用研究

为分析猪源抗菌肽NK-lysin的理化性质和蛋白结构,并研究猪源抗菌肽在小鼠体内的抑菌效果,以猪小肠组织cDNA为模板进行PCR扩增和测序,通过生物信息学相关软件和工具对其测序结果进行分析。试验选用60只小鼠,随机分为4组(预防组、细菌模型组、治疗组和对照组),设置不同的大肠杆菌和猪源抗菌肽给药方案。结果表明,猪源抗菌肽NK-lysin为稳定的,半衰期在大肠杆菌中(体内)长,与白细胞介素-2(Interleukin-2,IL-2)和颗粒性蛋白B(Granzyme B,GZMB)具有相互作用;预防组和治疗组小鼠存活率分别为80.00%和86.67%。综上所述,猪源抗菌肽在小鼠体内安全且具有一定的抑菌作用。     

昆虫抗菌肽的生物信息学预测及分析

昆虫种类众多,占动物界的90%,其遍布于除深海和极地外的每一个角落。然而,昆虫不具有高等动物 的特异性免疫系统,需要血淋巴细胞产生抗菌肽来抵御外界侵害。昆虫抗菌肽是一类非专一性小分子多肽,是体液 免疫系统的重要组成部分,其来源众多,结构多样,并具有相对分子质量较小、热稳定性良好、抗菌广谱等特点。运用 生物信息学方法,结合生物信息学两大门户网站,对昆虫抗菌肽的分类、平均疏水性、跨膜区域、信号肽、亚细胞定位 等进行预测及分析。     

哺乳动物抗菌肽的生物信息学预测与分析

抗菌肽(Antimicrobial peptides,AMPs)是能够抵抗病源微生物的小分子多肽,广泛分布于动植物、细菌、真菌等各种生物中,其在天然免疫中起着重要的作用。利用生物信息学方法,结合两大生物信息学门户网站ExPASy和NCBI,对截至2013年4月27日NCBI上所有的哺乳动物抗菌肽条目的上述性质进行了详细分类,并对其氨基酸长度、平均疏水性、跨膜结构、信号肽、亚细胞定位等特征进行预测及分析。     

家蚕抗菌肽的诱导及其抑菌作用研究

家蚕抗菌肽是存在于家蚕及蚕蛹的血淋巴内具有抗菌活性的多肽物质,在家蚕的天然免疫中起到至关重要的作用。采用不同剂量的γ-射线照射家蚕、对家蚕进行饥饿、电击和注射大肠杆菌等诱导处理后,提取家蚕抗菌肽,测定其抑菌效果。结果表明：以上的处理均能有效诱导抗菌物质的产生,其中饥饿法处理的家蚕产生抗菌肽的抑菌活性最强。本试验利用家蚕生产抗菌肽为家蚕的综合利用提供了一种新的途径。     

棉花黄萎病抗菌肽25a2的生物信息学分析

25a2是从解淀粉芽孢杆菌（Bacillus amyloliquefaciens）中分离出来的一个棉花黄萎病抗菌肽。利用生物信息学工具分析了抗菌肽25a2的氨基酸序列,预测其信号肽、跨膜区、理化特征、结构域、二级结构、三级结构等性质。结果显示,该蛋白属于分泌蛋白,其序列包含位于N端的一个信号肽和位于C端的一个跨膜区。25a2的二级结构以自由卷曲为主,属于混合型蛋白,三级结构为一个致密的球状。以上特征表明该抗菌肽最可能的作用机制是＂地毯＂模式。     

奶牛中性粒细胞抗菌肽的提取及其对大肠杆菌的抑菌效果

[目的]从奶牛血液中性粒细胞中提取、分离抗菌肽,并对大肠杆菌进行初步抑菌试验。[方法]用5%乙酸提取奶牛血液中性粒细胞可溶性成分,经聚丙烯酰胺凝胶电泳分离奶牛血液中性粒细胞抗菌肽成分,回收抗菌肽各组分并对大肠杆菌进行抑菌试验。[结论]奶牛中性粒细胞可分离出2种抗菌肽蛋白,抗菌肽成分对大肠杆菌存在抑菌效果,其抑菌圈直径为:抗菌肽A为(16±2.6)mm,抗菌肽B为(12±2.8)mm。[结论]该研究为控制奶牛乳房炎的感染开辟了一条新途径。     

黄粉虫幼虫中抗菌肽的诱导及其抗菌活性的初步研究

本文前次以鞘翅目拟步甲科昆虫黄粉虫幼虫为实验材料，分别用超声波和饥饿后饲喂大肠杆菌的方式进行诱导，对诱导前后０￣４ｄ内获得的抗菌肽进行了平板测活。实验表明抗菌肽含量在诱导后第４ｄ最高，且在４ｄ内随时间的增加而增加。两种诱导方式诱导出的抗菌肽具有相似的抗菌活性，都能较好地抑制大肠杆菌０７９和沙门氏菌５０１５，且收集的抗菌物质经１００℃处理２０ｍｍ后抗菌活性基本不变。本文前次采用了饥饿后饲喂含菌食物的     

泥鳅抗菌肽的制备及其抑菌效果的研究

采用Tris-HCl法提取泥鳅抗菌肽,SephadexG-50凝胶过滤层析分离泥鳅抗菌肽,并通过微量反映法测定泥鳅抗菌肽对株嗜水气单胞菌、大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的最低抑菌浓度（MIC）。结果表明：泥鳅抗菌肽对株嗜水气单胞菌、大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的MIC分别为0.195、3.125、12.50μg/μL,具有较好的抗菌活性。     

大肠杆菌刺激蝇蛆产生抗菌肽浓度和抑菌活性的测定

[目的]确定大肠杆菌菌液刺激蝇蛆产生浓度高、活性强的抗菌肽时间和蝇蛆饲喂家禽的安全性。[方法]采用不同浓度的大肠杆菌菌液分别与麸皮混合饲喂蝇蛆,于10、24、48 h分别收集存活蝇蛆并对其粗提取抗菌肽,通过考马斯亮蓝法和抑菌试验分别测定各试验组抗菌肽粗提液的浓度和抑菌力,同时用CFU计数法测定细菌培养的家蝇幼虫的细菌含量以确定其作为绿色抗生素的安全性。[结果]浓度为3.0×107cfu/ml的大肠杆菌作用24 h的蝇蛆组产生的抗菌肽浓度最高、活性最强,且蝇蛆体内细菌含量为1.6×105cfu/g,低于国家规定的饲料细菌标准含量最低值(2×106cfu/g)。[结论]为进一步利用动物死尸、畜禽粪便生物转化蝇蛆产生大量安全、浓度高且活性强的蝇蛆抗菌肽作为绿色抗生素运用于禽类养殖业奠定了基础。     

柞蚕抗菌肽Moricin的抑菌活性研究

本研究在对柞蚕抗菌肽Moricin基因成功进行克隆及毕赤酵母表达的基础上,对其生物活性进行了研究。结果表明,抗菌肽Moricin对大肠杆菌、肠炎沙门氏菌、副猪嗜血杆菌、猪链球菌和金黄色葡萄球菌临床分离菌株的抑菌圈直径为12~21 mm,表明Moricin对这些菌株均具有较强的抑菌活性,对临床耐药菌株的抑菌作用尤其明显。Moricin对上述菌株的最低抑菌浓度为3.9~15.6μg/m L。Moricin对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的广谱抑菌活性使其在畜禽疫病防治和生产中具有潜在的重要价值。     

文蛤蛋白抗菌肽制备工艺优化与抗菌活性研究

[目的]为文蛤的深加工提供科学依据。[方法]以鲜活文蛤为供斌材料,采用胰蛋白酶水解文蛤肉,选取大肠杆菌作为供试菌检测酶解物的抗菌活性,并采用响应面回归分析法优化酶解工艺。[结果]胰蛋白酶酶解文蛤蛋白的最优条件为：酶用量0．5％,酶解时间8h,酶解温度40℃;酶解液经蛋白质层析系统层析分离得到7个洗脱峰;抗菌性检测结果显示第2个洗脱峰的抗菌性最强,其分子质量为1650u。[结论]胰蛋白酶水解文蛤肉的酶解产物具有明显的抗菌性。     

不同浓度抗菌肽对辣椒青枯病菌抑菌活性的研究

实验室条件下研究不同浓度抗菌肽对辣椒青枯病菌的抑菌活性及药效结果表明:不同浓度抗菌肽均有抑菌作用且效果稳定。以浓度为2.5 mg/L时增效作用最明显,EC50为69.533 0 mg/L;其次是1.4 mg/L,EC50为226.376 1 mg/L;1.0 mg/L对辣椒青枯病菌的抑制活性较低。     

抗凝血多肽的筛选和生物信息学分析

对小分子多肽类抗凝血药物进行了筛选,对得到的多肽进行了生物信息学分析,蛋白同源建模及分子对接,旨在寻找新型抗凝血多肽,并为其今后的临床应用提供理论依据。     

对虾抗菌肽的研究进展及其在水产养殖业的应用前景

论述了对虾抗菌肽的结构特性、作用机理、研究进展及其在水产养殖业的应用前景和存在问题。     

蚯蚓抗菌肽的研究进展

抗菌肽是一类广泛存在于自然界生物体中的小肽类物质,是机体先天性免疫系统的重要组成部分。由于其具有分子质量小和抗菌谱广等特点以及不同于抗生素的全新的抗菌机制,在药物开发领域和畜禽饲料添加剂等领域具有广阔的应用前景。蚯蚓抗菌肽种类多,具有良好的抑菌效果。对蚯蚓抗菌肽的分类、功能及其在生产中的应用研究进展进行了综述。     

东北林蛙皮肤抗菌肽dybowskin-1ST的表达、纯化及抑菌活性分析

  【目的】利用毕赤酵母菌真核表达系统重组表达东北林蛙皮肤抗菌肽dybowskin-1ST,分析评价dybowskin-1ST的抑菌活性。【方法】采用TRIzol法提取蛙皮总RNA,经RT-PCR扩增获得抗菌肽dybowskin-1ST基因,将目的基因克隆到毕赤酵母菌分泌型表达质粒pPIC9K中,得到重组质粒pPIC9K-1ST。经电转化将pPIC9K-1ST转入到毕赤酵母菌GS115中,获得高效表达dybowskin-1ST的重组菌株。以甲醇诱导重组菌株,上清液经SDS-PAGE检测表明有目的蛋白dybowskin-1ST分泌表达。目的蛋白经Ni-agarose色谱柱分离纯化后,对大肠埃希氏菌、肺炎克雷伯氏杆菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌、肠炎沙门氏菌和蜡状芽孢杆菌进行抑菌活性分析。【结果】成功构建了东北林蛙皮肤抗菌肽dybowskin-1ST的毕赤酵母真核表达系统,且dybowskin-1ST对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌均有良好的抑菌效果。【结论】东北林蛙皮肤抗菌肽dybowskin-1ST具有良好的广谱抗菌活性和潜在的研发价值。     

动物抗菌肽的研究进展

综述了动物抗菌肽的来源和种类,探讨了其在药品、食品以及转基因动植物中的应用前景。     

现代生物信息学及其主要研究领域

综合分析了生物信息学这一现代新兴学科的定义和内涵,据此提出现代生物信息学是采用计算机技术和信息论方法研究生命科学中各种生物信息的表述、采集、储存、传递、检索、分析和解读的科学,是现代生命科学与信息科学、计算机科学、数学、统计学、物理学、化学等学科相互渗透和高度交叉形成的学科,介绍了近年来国内外对于现代生物信息学的认识及其主要研究领域。