四种短体线虫的形态和分子生物学鉴定

 采用形态学和分子生物学方法对来自荷兰的藏橐吾和铃兰、泰国的高山榕、缅甸的香蕉等种苗(球)分别鉴定出玻利维亚短体线虫Pratylenchus bolivianus、铃兰短体线虫P. convallariae、咖啡短体线虫P. coffeae和斯佩奇短体线虫 P. speijeri。对这4种线虫的形态特征进行较为详细的描述后,认为头环、口针、侧区、生殖系统和尾形等形态特征是种类鉴定的重要依据;进一步利用引物28S-D2A/28S-D3Br扩增测序得到上述4种线虫的28S rRNA基因D2/D3区序列,序列分析发现玻利维亚短体线虫从欧洲到美洲的不同种群之间的遗传距离变异较小,仅为0~0.007;铃兰短体线虫同一种群不同个体之间的遗传变异较大,为0.006~0.029;咖啡短体线虫不同种群之间的平均遗传距离为0.013;斯佩奇短体线虫不同种群之间的平均遗传距离为0.010;咖啡短体线虫P. coffeae和斯佩奇短体线虫P. speijeri亲缘关系很近,二者种间平均遗传距离仅为0.026。本研究再次证明线虫28S rRNA基因D2/D3区基因序列可作为短体线虫种间鉴定的依据。     

四种短体线虫的形态和分子生物学鉴定

采用形态学和分子生物学方法对来自荷兰的藏橐吾和铃兰、泰国的高山榕、缅甸的香蕉等种苗(球)分别鉴定出玻利维亚短体线虫Pratylenchus bolivianus、铃兰短体线虫P.convallariae、咖啡短体线虫P.coffeae和斯佩奇短体线虫P.speijeri。对这4种线虫的形态特征进行较为详细的描述后,认为头环、口针、侧区、生殖系统和尾形等形态特征是种类鉴定的重要依据;进一步利用引物28S-D2A/28S-D3Br扩增测序得到上述4种线虫的28S rRNA基因D2/D3区序列,序列分析发现玻利维亚短体线虫从欧洲到美洲的不同种群之间的遗传距离变异较小,仅为0～0.007;铃兰短体线虫同一种群不同个体之间的遗传变异较大,为0.006～0.029;咖啡短体线虫不同种群之间的平均遗传距离为0.013;斯佩奇短体线虫不同种群之间的平均遗传距离为0.010;咖啡短体线虫P.coffeae和斯佩奇短体线虫P.speijeri亲缘关系很近,二者种间平均遗传距离仅为0.026。本研究再次证明线虫28S rRNA基因D2/D3区基因序列可作为短体线虫种间鉴定的依据。     

咖啡短体线虫分子鉴定

本实验采用单条线虫法提取DNA,rDNA-ITS-PCR技术扩增目的片段(ITS1、5.8S、ITS2和部分的18S和28S),将此片段纯化回收,克隆测序分析,与GenBank比对,结果为:该种群的基因序列与AY561436(基因库编号)的相似度为92.3%,与AB053485的相似度为91.3%.分子鉴定结果与形态鉴定该线虫为咖啡短体线虫.     

进境新西兰麻中玻利维亚短体线虫的鉴定

2013年,北京口岸入境的新西兰麻中分离到一种短体线虫,通过形态学特征以及基于核糖体r RNA-ITS区及28S r RNA-D2/D3区序列比较,证实其为玻利维亚短体线虫(Pratylenchus bolivianus Corbett,1983)。该线虫的主要形态鉴别特征为:唇区有3个唇环;平均V=80%~82%;尾末端圆而光滑。该线虫至今未在我国发现,这是国际上首次从新西兰种苗中截获。     

拟短体线虫属一新种

 甘薯拟短体线虫新种(Pratylenchoides batatae n. sp.)根据采自河北省卢龙县前双庙的甘薯根部及根际土壤中的一个拟短体线虫种群进行描述和作图。新种的主要鉴别特征是:唇区有5个唇环,侧区4条侧线并有网格纹,尾呈圆柱形、有24~26个体环,尾端圆、具粗纵纹。食道腺末端覆盖于肠背面,2个亚腹食道腺核均在背食道腺核之后,一个亚腹食道腺核位于食道-肠瓣门前的腹面、另一个位于食道-肠瓣门稍后。近似种为齿尾拟短体线虫(P. crenicauda),该种与新种的主要区别是:唇区3~4个唇环,侧区有6条侧线、无网纹,亚腹食道腺核一个在背食道腺核前、另一个在背食道腺核后。新种为两性种。模式标本保存于福建农林大学植物保护学院植物线虫学实验室。     

几种主要短体线虫的鉴别

1988年6月1日,我所截获了昆明植物所某教授从英国引进的一批花卉苗木,共有10个属52个种100株。作者就其是否带有寄生线虫作了严格的检查,结果发现在 Myrtus lechlerana、Oleariacheegmanii、O.floribunda、O.gunniana、O.macrodanta、Rohdodendronpachysanthum和R.razorbiu的根中有多种寄生线虫,包括滑刃属 (Aphelenchoides)、茎属(Ditylenchus)、螺旋属(Helicotylenchus)、狭尾垫刃属     

山西省窖藏薯类块茎中2种短体线虫的种类鉴定

本文采用传统形态学与分子生物学相结合的方法,对采自山西省窖藏马铃薯和薯蓣块茎中的短体线虫进行了种类鉴定.结果 表明,从马铃薯块茎中分离出的短体线虫形态学特征与斯克里布纳短体线虫Pratylenchus scrib-neri一致,其SSU序列与P.scribneri美国群体相似性达99.8％.从薯蓣块茎中分离出的短体线虫...     

日本盆景中截获的短体线虫与根结线虫的鉴定

2014年,天津口岸从日本进境盆景中截获3种短体线虫和1种根结线虫。通过形态学和DNA条形码方法将截获的短体线虫鉴定为朱顶红短体线虫(Pratylenchus hippeastri)、伤残短体线虫(P.vulnus)和穿刺短体线虫(P.penetrans)。根据形态学并结合特异PCR和DNA条形码方法,将截获的根结线虫2龄幼虫鉴定为南方根结线虫(Meloidogyne incognita)。朱顶红短体线虫是短体线虫属非中国种,为我国进境植物检疫性有害生物,在挪威槭和榉树盆景中截获该线虫为国内外首次报道。     

松材线虫rDNA-ITS1区分子检测与鉴定

利用两对松材线虫特异性引物,分别对来自日本、美国和葡萄牙的松材线虫虫样进行PCR检测,成功扩增出330 bp和220 bp rDNA-ITS1区基因片段,该方法对松材线虫成虫或幼虫均能作出准确鉴定.     

美国报道线虫新种达科他短体线虫

《Plant》 2021年1月17日在线刊文,Zafar Handoo研究团队在来自美国北达科他州的大豆土样中分离到短体线虫,经培养后发现其可侵染大豆并以其为寄主繁殖。该线虫群体为两性繁殖的短体线虫类群,进一步通过形态学研究并结合分子生物鉴定,确认该类群为不同于目前所有短体线虫的新种,以其发现地命名为达科他短体线虫(Pratylenchus dakotaensis n.sp)。     

Assessment of the pest status of Pratylenchus curvicauda and ultrastructural changes in roots of infected wheat and barley

Pratylenchus curvicauda, which was first described in metropolitan Perth in 1991, was recently identified in grain-growing areas in Western Australia. The biology of this root-lesion nematode, and especially its pest status, is unknown. We investigated its life cycle and interaction with host plants, because such information is essential for its management. The life cycle took 45 days to complete in a wheat cultivar maintained at 23°C. Over 10 weeks, the nematode multiplied in 26 of 61 genotypes; these host plants were all cereals and included widely grown cultivars of wheat and barley. Eighteen other cereal genotypes and 13 cultivars including canola, chickpea, ryegrass, lupin, soybean, and tomato, sustained the nematodes to different degrees without multiplication. Four cover crops were not suitable hosts. The patterns of attraction of the nematodes and penetration into roots of the host and tolerant plants were similar. The nonhosts attracted fewer nematodes, none of which penetrated the roots. Browning of infected roots was atypical—it occurred late in some roots, 55 days after inoculation, and in the presence of a fungus. The nematodes were confined to, and fed from, cortical cells. The ultrastructure of infected wheat and barley cells showed typical signs of damage caused by Pratylenchus spp. and included cell disorganization and lack of membrane integrity, disintegration of cytoplasm, hypertrophy of some nuclei, and deposition of tannin-like granules. This detailed characterization of P. curvicauda–host interaction indicates the nematode is likely to be a pest of major crops, and attention should be given to its management.     

山羊草属检疫性杂草PCR-RFLP鉴定方法的研究

禾本科山羊草属具有多种农田杂草,其中具节山羊草和节节麦是我国禁止进境的检疫性杂草,我国检验检疫部门在进口粮谷检疫中经常会截获具节山羊草和节节麦。由于检疫性山羊草属杂草在植株及种子形态上与其近似种不容易区分,给检疫鉴定带来了很大困难。本文研究了一种PCR-RFLP分子鉴定方法,能够快速、准确地将检疫性山羊草属杂草与非检疫性种类区分开来,解决了该类杂草鉴定难题。     

根结线虫种群的线粒体DNA分析

 在同工酶和形态学鉴定的基础上,利用引物#C2F3和#1108对42个根结线虫种群线粒体DNA (mtDNA)中的COⅡ和LrRNA间区域进行特异性PCR扩增,35个种群的扩增产物约为1.7kb,其中29个是南方根结线虫,6个是爪哇根结线虫;3个花生根结线虫种群的扩增产物约为1.1kb;1个种群的扩增产物约为0.7kb,为根结线虫属在中国的新记录种;3个北方根结线虫种群的扩增产物约为0.5kb。用单条2龄幼虫提取物作模板得到的结果与大量提取DNA作模板的结果相同。为了区分产生相同大小片段的南方根结线虫和爪哇根结线虫,用限制性内切酶HinfⅠ对扩增产物进行酶切,结果表明:所有供试的南方根结线虫都可以被HinfⅠ酶切,且产生约1.3和0.4kb的2个限制性片段;但供试的爪哇根结线虫种群不能被酶切。由此表明,利用mtDNA PCR及酶切实验可以作为快速而准确地鉴定常见根结线虫的方法。     

不同杀线剂对穿刺短体线虫的杀灭效果研究

为寻找杀灭短体属线虫有害生物的有效药剂,以穿刺短体线虫为供试线虫,测定了5种不同杀线剂对该线虫的杀灭效果。结果表明,5种供试杀线剂分别处理该线虫0.5h、1h和24h后,对该线虫均有一定的杀灭效果,顺序依次为:阿维菌素﹥噻唑磷﹥灭线磷﹥丁硫克百威﹥棉隆,其中阿维菌素和噻唑磷对穿刺短体线虫的杀灭效果较好,可作为备选药剂进一步研究。     

华北土石山区四种常见乔木根系的形态研究

以华北土石山区四种常见乔木的根系为研究对象,采用全挖法,从根长、根径、土层深度和生物量等方面进行比较,并计算了四个树种随土壤深度变化的累积根系长度百分比,利用Sketchup Pro 8软件建立了各根系的形态模型。结果表明:四个树种根系长度差别较大,总长度大小顺序依次为白桦>落叶松>蒙古栎>油松;不同树种不同径级根的差别较大;各树种根系垂直分布范围集中在0～60cm的土层中,在60cm以下的土层中分布很少。研究中四个树种拟合的β值都在0.960-0.970之间,根系垂直分布方式都显示出深根型根系轮廓。用软件模拟出的根系形态较接近实际。     

9种检疫性实蝇PCR-RFLP快速鉴定研究

应用PCR-RFLP技术,对我国口岸截获频率较高的9种检疫性实蝇开展了快速鉴定方法的研究,结果表明,设计的2对引物对9种供试实蝇线粒体DNA(mtDNA)的PCR扩增片断大小分别约为350bp和450bp.用限制性内切酶MSE1和DRAI对PCR扩增产物进行酶切,得到的酶切位点可将供试的9种实蝇区分开来.该方法不受供试实蝇地理来源及食物源的影响,对各种虫态(卵、幼虫、蛹)和不同性别的成虫均适用,可用于口岸截获实蝇的快速检疫鉴定.     

智利苹果中牛眼果腐病菌的分离鉴定研究

天津检验检疫局从智利进口的腐病苹果中分离了一株真菌,通过菌落、分生孢子形态特征比较,ITS序列比对分析,并通过科赫氏法则验证,确定该菌株为牛眼果腐病菌(Neofabraea alba),该病菌是导致苹果牛眼果腐病的4种病原真菌之一,该有害生物为我国首次截获。     

热水处理对薯蓣红斑病病原——咖啡短体线虫的影响

采用水浴法,对离体咖啡短体线虫、薯蓣块根内咖啡短体线虫以及薯蓣块根在不同温度条件下的敏感性进行测定。结果表明,在47、50、52、55 ℃处理条件下,杀死100%离体咖啡短体线虫的处理时间分别为6、2.5、1.5、1.5 min,而杀死100%薯蓣块根内线虫的处理时间分别为19、15、11、10 min;同时在上述温度下,分别处理35、30、25 min和25 min对薯蓣发芽没有影响。在同一温度处理中,随着处理时间延长,线虫的死亡率增加;而在不同温度处理中,随着温度升高,杀死线虫的时间逐渐缩短。综合上述试验结果,建议生产上防治薯蓣种薯内咖啡短体线虫的处理方法以52～55 ℃处理15～20 min为宜。     

假高粱及其近似种rDNA ITS序列同源性分析

根据高粱属核糖体基因转录间隔区(ITS)序列设计通用引物S9/S3,分别扩增了假高粱及其几个近似种的ITS区段,并对PCR产物进行了序列测定和分析.扩增的序列长度为559～564bp.序列分析的结果表明S. halepense、 S. silk、 S. vulgare×S. sudanense、 S. vulgare、高粱S. bicolor等属于同一聚类组,亲缘关系比较近,同源性为97.9%～100%.S. nitidum和S. versicolor属于另一个聚类组,亲缘关系比较近,同源性为97.7%.S. halepense和S. nitidum、S. versicolor ITS区序列差异大,亲缘关系较远,同源性仅为90.3%.序列分析结果支持S. nitidum属于Parasorghum区组.