怀地黄SRAP分子标记优化体系的建立

为了建立适宜怀地黄的SRAP反应体系,以22个不同类型的怀地黄品种为材料,研究了PCR反应体系的主要成分对SRAP扩增结果的影响.对SRAP反应体系中的DNA模板浓度、TaqDNA聚合酶浓度、Mg2+浓度、引物浓度以及dNTP浓度进行了探索,确立的适合怀地黄SRAP反应的体系为:在25 μL的反应体系中,模板DNA20 ng、2.5 mmol·L-1 Mg2+、0.32 μmol·L-1的上下游引物、0.30 mmol·L-1的dNTPs以及2.5U Taq酶.并利用该反应体系对怀地黄22个不同品种进行了SRAP反应,发现不同品种间的DNA谱带多态性丰富,证实该体系稳定可靠,可以用于怀地黄的分子标记研究.     

苔藓植物SRAP反应体系的优化

以黄灰藓总DNA为材料,对影响SRAP-PCR反应的模板DNA、Mg2+、dNTP、引物和TaqDNA聚合酶浓度等因素进行了优化,分析了各因素对SRAP-PCR扩增结果的影响。结果表明,在25μLSRAP-PCR反应体系中,最佳反应条件为:模板DNA40ng;Mg2+浓度2.0mmol/L;dNTP浓度0.2mmol/L;正反引物15pmol;TaqDNA聚合酶2.0U。在此条件下,引物组合Me5/em7对13种苔藓植物扩增的条带清晰、多态性好,表明此反应条件适合于苔藓植物的SRAP-PCR反应体系。     

南瓜SRAP反应体系的建立与优化

以‘密本’南瓜作为筛选体系的材料,通过单因素试验对南瓜20μL SRAP-PCR扩增体系的Mg^2＋、dNTP、 Taq酶、引物及DNA浓度和扩增程序的退火温度与循环次数进行优化,筛选出各组分的最佳浓度、最佳的退火温度和最佳循环次数。试验结果确立南瓜最佳的20μL SRAP体系为：0.2 mmol · L ^-1 dNTP ,1.5 U Taq酶,80 ng DNA ,0.16μmol·L^ -1的单条引物,Mg^2＋1.5 mmol·L^ -1,2μL 10＆#215;Buffer ;最佳扩增程序为：94℃预变性5min;94℃1 min ,35℃1 min ,72℃1 min ,5个循环;94℃1 min ,52℃1 min ,72℃1 min 35个循环;最后72℃延伸10 min。选用17个南瓜品种对确立扩增体系及扩增程序进行验证,检测结果表现为扩增产物条带清晰明亮、多态性丰富、特异性强、重复性好,表明本试验所确定的反应体系及反应程序适用于南瓜的SRAP分子标记。     

不结球白菜SRAP标记体系的建立与作图亲本筛选

SRAP标记是遗传作图和分子辅助育种的重要技术之一,为了建立具有通用性的不结球白菜SRAP标记体系,选用国家种质资源重点实验室的不结球白菜作为试材,利用正交设计方法对、模板DNA、引物、Taq酶和缓冲液6个因素进行了优化,获得了不结球白菜SRAP标记反应体系的最佳组合:10 μL反应体积中包含40 ng的DNA模板、75 ng引物、0.2 mmol·L-1的的、0.15 U的Taq酶和1倍体积的缓冲液.筛选不结球白菜的作图杂交亲本是构建遗传连锁图谱的基础,以12份不结球白菜亲本为试材,利用70对SRAP引物组合共扩增出了382条多态性带,平均每个引物组合扩增出5.46条,由聚类分析图确定了杂交亲本为相似系数最小的2个组合,Q06-2和Q06--4或Q06-2和Q06-6,同时验证了SRAP标记体系的通用性.     

西瓜全雌基因连锁的SRAP分子标记

采用SRAP技术探寻与西瓜全雌基因连锁的分子标记.以全雌母本和弱雌父本为双亲杂交获得F1,自交获得F2群体,用分离群体分组分析法(bulked segregant analysis,BSA)构建全雌和弱雌2个基因池,筛选957对引物.结果发现,只有引物me16～em20能在两池之间扩增得到2条特异带.经F2代单株验证,...     

木豆随机扩增多态性DNA的反应体系研究

[目的]分析影响木豆RAPD-PCR反应中的主要因素,优化反应条件。[方法]以木豆品种ICPL87091为试材,以木豆基因组DNA为模板,通过对PCR反应体系中各种参数的优化设置,分析比较各种因素对RAPD扩增结果的影响,建立适宜的反应体系。[结果]试验得到了较为理想的适宜木豆的反应体系。优化的木豆RAPD反应条件为:模板DNA浓度30 ng,随机引物1.6μmol/L,dNTPs(dATP,dCTP,dGTP,dTTP)各0.2 mmol/L,Mg2+浓度2.0 mmol/L,Taq酶1.0 U,反应体积为25μl。循环体系为:先94℃1 min,35℃2 min,72℃2 min,5个循环;然后94℃30 s,37℃1 min,72℃1 min,35个循环;最后72℃延伸10 min。[结论]利用这一反应体系可有效地进行木豆随机扩增多态性DNA分析,极大地提高了实验结果的可重复性。     

棉花耐盐相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记筛选

利用相关序列扩增多态性(SRAP)和群体分离分析法(BSA)对棉花耐盐材料×敏盐材料组合的F2群体及26个耐、敏品种(系)进行分析和鉴定,筛选与棉花耐盐相关的分子标记。在88对正反引物组合中,筛选出在2个亲本间具有多态性的引物6对,经F2群体分析,发现1对引物能够在耐盐单株中扩增出350 bp的特异片段,而在敏盐单株中没有。品种鉴定显示,耐盐材料均能扩增出该片段,而敏盐材料没有该片段扩增。推测该片段是与棉花耐盐性紧密连锁的分子标记。     

观赏海棠SRAP-PCR反应体系优化及引物筛选

以观赏海棠叶片DNA为模板,采用正交试验设计,以Mg^2＋、dNTP、引物、模板DNA和Taq DNA聚合酶5种因素4个水平,对观赏海棠的SRAP反应体系进行了研究,建立了观赏海棠的SRAP最佳反应体系,结果表明,观赏海棠SRAP-PCR最佳反应体系为：Mg^2＋ 2.50mmol·L^-1、dNTP0.2mmol·L^-1、引物0.4μmol·L^-1、Taq DNA聚合酶2U、10ng模板DNA,总体积为25μL。各因素对扩增反应结果均有不同影响,其中以dNTP浓度的影响最大,模板浓度的影响最小。运用该体系对观赏海棠4个种进行验证,证明该体系稳定可靠,并从70个SRAP引物组合中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的26个引物组合。这一体系的建立及多态性引物组合的筛选为今后利用SRAP标记技术进行观赏海棠的分子遗传学研究提供了科学的依据。     

旱柳SRAP－PCR体系的建立与优化

为了丰富柳树分子标记的手段,以旱柳Salix matsudana为材料,通过正交实验设计法,获得适于旱柳的相关序列扩增多态性（sequence-related amplified polymorphism,SRAP）-聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR）体系;对SRAP-PCR扩增过程中的2次退火温度进行优化。结果如下：优化反应体系,25.00 μL反应液中,含20.84 nkat的Taq酶,2.00 μL Mg²⁺（25 .00 mmol·L^－1）,2.50 μL 碱基混合物（脱氧核糖核苷酸dNTPs,各2.50 mmol·L^－1）,1.50 μL引物（20.00 μmol·L^－1）,100.00 ng DNA模板,2.50 μL 10 × Taq酶缓冲液。扩增程序,94 ℃ 2.0 min;94 ℃ 1.0 min,38 ℃ 1.0 min,72 ℃ 1.5 min,5个循环;94 ℃ 1.0min,54 ℃ 1.0 min,72 ℃ 1.5 min,30个循环;72 ℃ 10.0 min。经聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）检测,特征性条带清晰,信息量大,完全可以用于旱柳基因组的研究分析。图4表2参12     

八仙花SRAP反应体系的建立与优化

为建立适合八仙花SRAP-PCR分子标记技术体系,以八仙花栽培品种H.macrophylla‘Lavbla’为材料,通过单因子实验分别研究了模板DNA、dNTPs、Mg2 、Taq酶浓度和引物用量对八仙花SRAP扩增反应的影响,确立了八仙花SRAP分析的最佳反应体系为25μl:模板DNA60ng、Mg2 2.0mmol/L、dNTPs0.7mmol/L、Taq酶0.5U、引物0.7μmol/L×2、10×PCRBuffer2.5μl,该反应条件下八仙花SRAP扩增条带清晰,多态性丰富。     

山梨叶片再生体系的研究

以无菌条件下培养的山梨组培苗叶片为外植体建立叶片再生体系.结果表明:取继代培养约30 d的无菌苗叶片为材料,接种在MS BA 5.0 mg/L NAA 0.4 mg/L培养基上,20～30 d后产生不定芽,再生频率48.6%,再生芽数3.83;暗培养20 d叶片再生频率最高;远轴面接触培养基的叶片再生频率和再生芽数高于近轴面接触培养基的叶片;叶片基部的再生频率68.1%,显著高于叶片中部和尖部.     

观赏山梨叶片总RNA的提取及质量分析

为了从富含多糖和多酚等物质的观赏山梨幼叶中提取和分离出高质量的RNA,利用Trizol法、改良的Trizol法、异硫氰酸胍法、硼砂-CTAB法和硼砂-SDS法提取观赏山梨叶片总RNA。通过RNA产率、纯度、电泳图谱和RT-PCR结果等分析来确立适用于观赏山梨RNA分离的方法。结果表明,硼砂-SDS法提取的RNA呈现出28S rRNA,18S rRNA和5S rRNA三条较清晰的条带,RNA的得率和纯度均较高、很少有降解。RT-PCR结果进一步证实了硼砂-SDS法提取的观赏山梨叶片总RNA可用于分子生物学的下游试验。此方法简便易行,成本也较低,适合于富含多糖、多酚植物材料RNA的提取。另外4种方法获得的RNA得率、纯度较低,降解严重,有较多小分子和盐存在,因此不适合用于观赏山梨总RNA的提取。     

长果种黄麻DNA的提取及SRAP分子标记体系的建立

以宽叶长果和甜麻杂交产生的F2代为材料,研究长果种黄麻DNA的提取方法和SRAP分子标记技术中的主要影响因素(包括模板DNA浓度、Mg2+浓度、Taq DNA聚合酶浓度、dNTPs浓度及上下游引物浓度).最终建立了适于长果种黄麻DNA提取的CTAB法与SRAP-PCR反应体系(25 μL):模板DNA 100 ng,引...     

Cloning and Analysis of Full-Length cDNA of PumNPR1 Gene from Pyrus ussuriensis Maxim

The purpose of this study is to find a new gene resource for the researches of molecular breeding of Rosaceae plants disease-resistance. Pyrus ussuriensis Maxim is used as a starting material to clone the full-length cDNA of NPR1（nonexpressor of pathogenesis- related genes 1） which is a key regulator in SA （salicylic acid）-mediated systemic acquired resistance （SAR） by homologous cloning and RACE techniques. The length of the cDNA sequence was 1 767 bp, the ORF was 1 761 bp, it coded 586 amino acids, pi=5.58, the relative molecular weight was 65.009 ku, contained 19 kinds of amino acids, and had full BTB/POZ and ANK domains. Compared the homology of NPR1 gene in GenBank database, the homology with Pyrus pyrifolia, Arabidopsis thaliana, Nicotiana tabacum, Lycopersicon esculentum, Oryza sativa, Helianthus annuus were 98%, 62%, 68%, 65%, 57%, 63%. The homology offunctional area were 99%, 78%, 82%, 79%, 74%, 77%. This NPR1 gene was considered as homologic gene of Pyrus ussuriensis Maxim and named PumNPR1.     

山梨组织培养及快繁技术研究

通过对由山梨种子长出的茎尖进行组织培养的研究,筛选出了适宜诱导及增殖的培养基是ZS(改良的MS培养基)+BA 2 mg/L+NAA0.1 mg/L,适宜生根的培养基是ZS(改良的MS培养基)+IBA3 mg/L。     

秋子梨品种及野生类型花粉特性和育性的研究

对42个秋子梨品种及野生类型的花粉特性和育性进行研究。结果表明,花粉粒形态多为椭圆形或长圆形;雄性不育现象明显,有23个品种表现出雄性不育,为花药败育类型,占调查群体的54.8%I;-KI染色法和培养基培养法测定花粉活力差异较大,培养基培养法测定更为准确;温室催花可以得到可育性花粉,育性偏低。     

野生秋子梨（Pyrus ussuriensis Maxim）果实性状的遗传多样性

【目的】探讨野生秋子梨果实形态、香气物质及糖酸组分的遗传变异及遗传多样性,为野生秋子梨种质资源的保护与利用提供基本资料。【方法】以迁地保存圃的35个野生秋子梨实生株系的果实为试材,以‘小香水’梨、‘京白’梨和‘南果’梨3个秋子梨栽培品种为对照,测量果实的纵径、横径、果形指数（纵径/横径）及单果重,采用静态顶空和气相色谱-质谱联用、高效液相色谱技术,定性、定量分析果实的糖酸组分和香气物质。【结果】 野生秋子梨各实生株系果实大小、香气成分总含量、各类香气成分种类数及其含量、主要香气成分分离比率与具体含量、各糖酸组分的含量、总糖以及总酸含量等均存在广泛的遗传变异,变异系数均在17%以上,各株系间差异明显,表现出丰富的遗传多样性;进一步与3个栽培品种比较发现,野生秋子梨的果实纵径、横径及单果重均小于3个栽培品种,但果形指数比较接近;野生秋子梨平均每个株系检测出41种香气成分,明显高于栽培品种的平均香气种类（25种）;野生秋子梨平均香气成分含量为9.44 μg•g-1,显著高于3个栽培品种的平均含量（5.71 μg•g-1）;野生秋子梨与栽培品种相比,含有酸类和烃衍生物类2类特有化合物,含有酯类等9类111种特有成分;野生秋子梨与3个栽培品种共检测出16种特征香气,其中1-己醇和己醛等8种化合物为野生秋子梨与3个栽培品种共有的特征香气,乙酸己酯和乙酸戊酯等8种特征香气为野生秋子梨特有;35个野生秋子梨实生株系和栽培品种中几乎均能检测出果糖、葡萄糖和蔗糖等3种糖组分以及苹果酸、酒石酸和柠檬酸等6种酸组分,且均以果糖和苹果酸含量最高;野生秋子梨中酒石酸及蔗糖含量明显高于栽培品种,其他糖酸组分、总糖及总酸含量最大值均高于3个栽培品种。【结论】野生秋子梨在果实形态、糖酸组分及香气成分上存在广泛的遗传变异,参试的35个实生株系间差异明显,遗传多样性极为丰富,并且含有酸类和烃衍生物类2类特有化合物和111种特有成分,进一步挖掘利用的潜力巨大。     

芝麻SRAP反应体系的建立与优化

通过对芝麻SRAP反应体系主要影响因素进行优化,建立最佳反应体系.以芝麻幼叶提取的DNA为实验材料,对影响SRAP扩增结果的重要反应因素dNTPs、Mg2 、Taq酶、随机引物及模板DNA设置不同梯度实验.得到了芝麻扩增多态性高、稳定性强、带型清晰的SRAP最佳反应体系为:dNTPs(10mmol/L)0.30μl,Mg2 (25mmol/L)1.20μl,Taq酶1.00U,正反引物各50ng,DNA模板80ng,10×Buffer1.5μl,总体积15μl,为SRAP标记技术在芝麻分子生物学研究方面的应用奠定了基础.