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相似文献
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1.
仁用杏SSR反应体系的建立与优化   总被引:1,自引:0,他引:1  
采用正交设计结合单因素分析,建立并优化了仁用杏SSR反应体系。结果表明:20μL反应体系中,Mg2+、Taq DNA聚合酶、dNTPs和引物的浓度分别为1.5 mmol/L1、.5 U、0.2mmol/L、0.25μmol/L,引物退火温度为52℃。应用该体系对24份仁用杏资源进行SSR分析,DNA谱带多态性丰富,将为仁用杏资源的SSR分析提供技术支持。  相似文献   

2.
为探索适宜枇杷的SSR反应体系,利用正交设计对Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶和模板DNA等5种因素4个水平进行筛选和优化。结果表明:20uL反应体系中,Mg2+、dNTPs和引物的最适浓度分别为1.5mmol.L-1、0.15mmol·L-1、0.2umol·L-1,Taq酶最适用量为1U,模板DNA最适用量为20ng;引物的最佳退火温度为51.0~60.0℃。利用该反应体系对17份枇杷种质进行扩增,电泳结果显示,不同品种间DNA谱带多态性丰富,证实该体系稳定可靠。  相似文献   

3.
辣椒SSR反应体系的优化   总被引:1,自引:0,他引:1  
本试验研究了辣椒SSR-PCR反应体系的主要成分对扩增结果的影响,同时进行了退火温度梯度和循环次数试验。优化后的反应体系为:总体积20μL,1.5μL模板DNA(25ng/μL)、1U Taq酶、0.375μmol.L-1引物、1.875mmol.L-1Mg2 、0.2mmol.L-1dNTPs、1XPCR buffer。扩增程序为:94℃预变性4min,94℃变性45s,58℃(以SSR005为例)退火45s,72℃延伸90s,35个循环,最后一个循环延伸增加为8min,4℃保存至电泳。  相似文献   

4.
为摸索适宜甜樱桃的SSR反应体系,利用正交设计对Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶和模板DNA等5种因素4个水平进行筛选和优化,20μL反应体系中,Mg2+、dNTPs和引物的最适浓度为1.5mmol/L、0.2mmol/L、0.4μmol/L,Taq酶宜加入1U,模板DNA应加入10~40ng;引物的最佳退火温度为56.0~62.8℃。用10对引物及建成的反应体系对10个供试品种扩增,6%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,品种间DNA谱带多态性丰富,共有29个等位位点,证实该体系稳定可靠。  相似文献   

5.
6.
核桃SSR反应体系的优化   总被引:14,自引:1,他引:14  
以清香、香铃、爱米格为试材,利用CTAB法提取基因组DNA,将PCR体系的主要成分设定5个梯度,根据每个成分的变化引起的PCR-SSR的效果差异,探讨了核桃SSR技术中PCR体系的主要成分对扩增结果的影响,并对引物WGA321的适宜退火温度进行优化。最终确定了引物WGA321的最适退火温度为48~52℃,PCR反应体系的最佳条件为:15μL体系中,Mg2+1.0mmol/L,dNTPs浓度0.40mmol/L,TaqE用量为0.5U,DNA模板1.0ng/μL,引物浓度为0.4μmol/L。利用此反应体系对部分核桃品种进行PCR扩增并电泳检测,扩增结果清晰且有较高的多态性,表明该体系适合核桃的亲缘关系分析。  相似文献   

7.
苹果SSR反应体系的建立   总被引:15,自引:1,他引:15  
为摸索适宜苹果的SSR反应体系,以金冠苹果为试验材料,研究了苹果SSR技术中PCR反应体系的主要成分对SSR扩增结果的影响。对SSR反应体系中的Mg2+浓度、引物浓度、dNTP浓度、TaqDNA聚合酶浓度、模板浓度以及退火温度进行了探索,确立了适合苹果的SSR反应体系为:在20μL反应体系中,Mg2+、引物和dNTP的最适浓度分别为2.5mmol/L、0.8μmol/L、0.10mmol/L;反应体系中TaqDNA聚合酶宜加入1U,模板DNA应加入15-30ng;引物的最佳退火温度为48.5-52.0℃。并利用该反应体系对10个苹果代表品种进行SSR反应,用8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,不同品种间DNA谱带多态性丰富,证实该体系稳定可靠。  相似文献   

8.
辣椒AFLP反应体系的优化与建立   总被引:3,自引:0,他引:3  
以5个辣椒(Clapsjcum annuum L.)材料为研究对象,对AFIJP反应体系中的DNA用量、酶切连接时间、预扩增产物的稀释倍数等关键因素进行优化分析,建立了适宜辣椒作物的AFLP反应体系。研究结果:酶切连接反应中,基因组DNA适宜用量为100ng,反应时间是6h最为合适,预扩增产物适宜稀释倍数在30-50倍时较为理想。  相似文献   

9.
SSR标记遗传距离与结球甘蓝杂种优势的关系分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
利用SSR标记对23份春甘蓝自交系和29份秋甘蓝自交系进行遗传多样性分析,结果表明:春甘蓝自交系在遗传相似系数0.61处可以划分为极早熟和早熟2个类群。秋甘蓝自交系在遗传相似系数0.58处可以分为中晚熟群、中早熟群和中熟群3个类群。从上述材料中挑选15份代表性材料作为亲本,采用完全双列杂交法组配105个杂交组合,对其进行杂种优势分析,同时探究SSR分子标记遗传距离与杂种优势之间的关系。结果发现,不同类群间杂交或同一类群不同亚群间杂交产生的后代杂种优势较强,遗传距离与全株质量中亲优势的相关性达显著正相关,表明基于SSR分子标记划分的类群对于杂种优势的预测具有一定的价值。此外还发现,在105个杂交组合中,全株质量中亲优势最强的10个组合的组配方式均为春甘蓝×秋甘蓝,表明春甘蓝×秋甘蓝可能是一种潜在的杂种优势利用模式。  相似文献   

10.
菊花SSR-PCR反应体系的建立和优化   总被引:1,自引:0,他引:1  
李亚慧  黄丛林  董然 《北方园艺》2012,(13):127-131
为快速确定菊花SSR反应体系,利用正交实验设计L16(45)对菊花基因组SSR-PCR反应体系的5个因素(模板DNA、Mg2+、dNTP、引物和Taq酶)在4个水平上进行正交设计,筛选出适合菊花的最佳SSR-PCR反应体系,进一步利用单因素完全随机试验筛选各反应因素的最佳水平。结果表明:建立菊花基因组DNA SSR-PCR反应体系为25μL:60ng模板DNA、2.0mmol/L Mg2+、0.1mmol/L dNTP、0.3μmol/L引物、1UTaq酶。并对菊花引物进行梯度退火试验,其最佳退火温度在53.1℃;扩增程序是:95℃预变性5min;32个循环的94℃变性50s、53.1℃退火50s、72℃延伸50s;72℃延伸8min,4℃保存。该体系的建立为今后菊花SSR分析奠定了基础。  相似文献   

11.
以2个耐抽薹的甘蓝高代自交系和2个易抽薹的甘蓝高代自交系为亲本,按照Griffing完全双列杂交方法Ⅰ配制杂交组合,对其抽薹期性状进行配合力和遗传力分析。结果表明:耐抽薹自交系LN-0901和LN-0913的一般配合力和特殊配合力都较高,宜用于杂种优势育种。抽薹期性状主要由基因的加性效应控制,广义遗传力为96.42 %,狭义遗传力为67.68 %,在育种实践中适宜进行早期世代选择。  相似文献   

12.
结球甘蓝耐裂球性状的配合力及遗传力研究   总被引:6,自引:3,他引:3  
按照Griffing双列杂交方法Ⅳ,选用6个结球甘蓝骨干自交系,配制15个杂交组合,进行耐裂球性状的配合力及其遗传力分析。结果表明:基因加性效应和非加性效应对耐裂球性状均起重要作用,且以加性效应为主,随着田间持续生长时间的延长其加性效应所占比例增加,GCA方差在总遗传方差中所占比例大,GCA/SCA值大于1,且差异达显著水平。选择耐裂球材料时,应着重一般配合力的选择,且应重视在早期世代进行选择。  相似文献   

13.
根据甘蓝SRK基因序列保守区设计特异性引物,通过PCR扩增和克隆测序,结合生物信息学分析方法对两个甘蓝自交系材料的S单元型进行初步鉴定。BLAST分析表明:甘蓝自交系96-100与Brassica oleracea的SRK29基因核苷酸序列相似性最高(91 %),但蛋白序列与S14相似性最高(在84 %的序列覆盖度下相似性达100 %)。自交系俄引165与Brassica oleracea的BoSRK28基因核苷酸序列相似性达100 %,推测其S单元型为S28。  相似文献   

14.
结球甘蓝抗寒性配合力分析及优良抗寒组合选育   总被引:1,自引:1,他引:0  
通过自交分离和抗寒性鉴定,选育出经济性状优良的结球甘蓝抗寒自交系逾30份,以其中6份抗寒性有一定差异的自交系为试材,按照Griffing双列杂交方法Ⅳ进行甘蓝抗寒性配合力及遗传力分析。结果表明:甘蓝抗寒性遗传符合加性-显性模型,以加性效应为主,随着寒害程度的增加其加性效应所占比重增加|一般配合力方差在总遗传方差中所占比重较大,一般配合力/特殊配合力的均方比大于7,且差异达极显著水平,因此在甘蓝抗寒育种中应重视早期世代的选择。结合配合力测定结果及田间经济性状调查结果,初步明确两个优良抗寒越冬甘蓝新组合。  相似文献   

15.
蛋白质提取方法和电泳条件是蛋白质组学研究中双向电泳的关键。为建立适合甘蓝柱头总蛋白质的双向电泳体系,本试验以甘蓝柱头为材料,采用改良TCA/丙酮沉淀法提取柱头总蛋白质,通过对IPG胶条、上样量、聚焦程序、SDS-PAGE胶浓度等的优化,建立了甘蓝柱头总蛋白质双向电泳体系,即选用长17 cm、pH 3~10 NL的IPG胶条,上样量150 μg,按照聚焦程序Ⅰ进行等电聚焦,第二向SDS-PAGE胶浓度选用12%,得到了分辨率高、重复性好的双向电泳图片。  相似文献   

16.
以结球甘蓝自交系02-12及其回交转育多代育成的显性核基因雄性不育系(DGMS)和细胞质雄性不育系(CMS)为试材,对其制种产量及种子产量构成因素进行分析。结果表明:显性核基因雄性不育系材料DGMS02-12与细胞质雄性不育系材料CMSR302-12在单株产量和小区产量方面存在显著差异,并且全株有效荚数和每荚种子粒数是两种类型甘蓝雄性不育系间制种产量存在差异的主要构成因素。其中,一级分枝种子产量占单株产量的80%以上,一级分枝有效荚数、每荚种子粒数与制种产量有显著的相关性和较高的通径系数。  相似文献   

17.
拟南芥叶绿体SSR引物在甘蓝上的应用   总被引:1,自引:0,他引:1  
 根据拟南芥的叶绿体全基因组序列,搜索获得89个叶绿体基因组SSRs(cpSSRs),平均每1.736 kb出现1个SSR。针对这些SSR设计cpSSR引物58对,其中32对能在甘蓝上应用。5对引物在甘蓝C300、C322和波里马油菜N478、N479间有多态性,这些片段均位于基因内含子区或基因间隔区。测序结果显示单核苷酸A/T重复数从8个到13个不等。同源性比较表明C300、N479之间的同源性大于两者与拟南芥之间的同源性。  相似文献   

18.
以结球甘蓝无蜡粉亮绿材料10Q-961(P1)与普通有蜡粉材料10Q-206(P2)为亲本进行杂交、自交和回交,配制六世代材料,对结球甘蓝10Q-961无蜡粉亮绿性状遗传规律进行研究。对分离比例进行χ2检测,初步结果显示,结球甘蓝10Q-961无蜡粉亮绿性状为隐性单基因遗传。  相似文献   

19.
通过对16个平头型结球甘蓝进行品种比较试验,观察记录各品种的生育期、植物学性状和产量,分析各品种的表现情况,为四川省绵阳地区结球甘蓝种植户品种选择提供一定依据.结果表明:春福来、西园056、京丰1号(C K2)、乐匠2号、绿崎、优秀4号、夏御所、中甘101、乐匠等9个品种熟性较早,均为中熟品种;冬武者、寒将军(C K1...  相似文献   

20.
以甘蓝ZQ启动抽薹的茎尖为材料,分别提取DNA和RNA,以两对引物扩增并序列拼接得到甘蓝LFYZQ基因DNA序列和cDNA完整编码区,长度分别为2 560、1 239 bp,与花椰菜、拟南芥、芥菜和萝卜同源性分别达到91 %、87 %、86 %、87 %。该基因含有3个外显子(452、394、393 bp)和2个内含子(514、807 bp),共编码412个氨基酸,内含子剪接位点均符合经典GT-AG法则。将LFYZQ与网上公布的12种十字花科植物LFY氨基酸序列按分子进化分成两类:甘蓝LFYZQ与花椰菜以及Jonopsidium属植物Jonopsidium acaule这3个分为一类;其余10种植物分为第二大类。LFYZQ蛋白分子量为46 kD,是一个不稳定的疏水蛋白,存在N-十四(烷)酰化位点、蛋白激酶C磷酸化位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、酰胺化位点共4种活性位点。  相似文献   

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