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利用SSR分子标记建立杂交水稻指纹图谱 总被引:4,自引:0,他引:4
利用微卫星标记对大穗稻1126进行了DNA指纹图谱构建和品种鉴定的研究,77对引物中具有多态性的引物共36对,占所用引物的46.75%。利用这些SSR引物建立了1126的DNA指纹数据库,可以有效解决杂交水稻亲本1126的真伪性及与其他品种的区分问题。三组引物RM21、RM505、RM212共同扩增可以很好地将1126与其亲本Lemont与蜀恢527区分开来,可作为大穗稻1126的特征引物加以鉴定。由此可见利用微卫星分子标记技术进行水稻种子质量鉴定应用前景广阔。 相似文献
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利用SSR标记建立杂交水稻分子指纹图谱数据库 总被引:26,自引:0,他引:26
鉴别优质种子并保护育种者的知识产权是市场经济发展的需要。长期以来,人们主要通过形态特征来鉴定区分水稻种子质量,但这种鉴定方法准确性显然较差。近年来,利用不同水稻种质在DNA水平上的差异(即DNA分子指纹图谱)进行品种鉴定已引起人们的关注。RAPD标记最早被用于鉴定杂交稻的纯度,并取得较好的结果。但由于RAPD标记不够稳定,且为显性标记难以将亲本和F1杂种区分开,因而在水稻纯度鉴定和指纹图谱分析中利用有限。由于SSR是共显性标记且多态性丰富,相比其他标记如RFLP或RAPD,更能揭示生物遗传多样性。 相似文献
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为了分析藜麦种质资源的遗传基础和遗传多样性,为藜麦种质资源的保护与高效利用提供理论依据。本研究以收集到的48份国内外藜麦种质资源为材料,采用简单重复序列(SSR)标记的方法,分析了藜麦种质资源的遗传多样性并构建DNA指纹数据库。结果表明,共筛选出25对多态性SSR分子标记,所有标记共检测到134个等位变异,每对引物检测出3~13个等位变异;Nei’s基因多样性指数(H)为0.107 5~0.368 7,均值为0.242 4;Shannon信息指数(I)为0.204 3~0.551 6,均值为0.383 3;多态性信息含量(PIC)为0.378 8~0.852 2,均值为0.604 2。聚类分析结果表明,48份藜麦种质资源被分为4个组,相近地区或生态环境的种质资源多聚在一组;利用3对SSR引物组合,构建了48份藜麦资源数字指纹图谱。本研究结果表明48份藜麦种质资源遗传多样性丰富;所筛选的SSR标记用于藜麦种质资源遗传多样性分析及品种鉴定是可行的。 相似文献
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【目的】开发球茎甘蓝SSR分子标记,并构建球茎甘蓝的指纹图谱,以期从分子水平了解球茎甘蓝品种间的遗传多样性及亲缘关系,为球茎甘蓝育种材料选择提供参考。【方法】基于转录组数据,利用生物信息学方法开发球茎甘蓝的SSR标记并分析其分布特征,PCR检测SSR引物的有效性和多态性,筛选出多态性引物,用于分析18份球茎甘蓝材料的亲缘关系并构建指纹图谱。【结果】通过球茎甘蓝转录组测序共获得196642条Unigenes,其中85468条含有SSR位点,SSR出现频率43.46%;单一型SSR位点以单核苷酸(44.74%)为主要类型,其次为二核苷酸(26.37%)和三核苷酸(27.35%)类型。SSR位点有112种重复基序,其中单核苷酸重复基序以A/T为主(占44.16%),二核苷酸重复基序以AG/CT为主(占18.11%)。PCR筛选获得29对引物能扩增出86条多态性条带,平均每对引物扩增出3.28条。根据扩增出的多态性条带对18份球茎甘蓝材料进行聚类分析,结果显示在遗传距离为0.61处将其分为五大类,同时还构建了18份球茎甘蓝DNA指纹图谱数据库,建立了相应的识别二维码。【结论】开发获得29个球茎... 相似文献
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玉米SSR与盐溶蛋白指纹图谱分析 总被引:1,自引:0,他引:1
利用SSR标记法与盐溶蛋白法对32份玉米自交系和13个杂交种的指纹图谱进行分析,结果表明,盐溶蛋白图谱中共有35条不同的谱带,多态性信息量占74.29%。筛选了50个SSR引物,其中6个多态性好的SSR引物能区分所有供试材料。在32个自交系中共检测到29个等位基因,平均每个引物4.83个,多态性信息量占93.10%。仅用2个引物就检测到10个位点,把13个杂交种分开,并构建了13个杂交种的数字指纹图谱。 相似文献
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为了建立甜樱桃品种指纹图谱数据库,从而对不同甜樱桃品种进行分子鉴定,以"红灯"、"萨米脱"、"吉塞拉5号"、"吉塞拉6号"等24个甜樱桃主要栽培品种为试材,利用2.5%琼脂糖凝胶电泳进行SSR引物的筛选,选择差异明显且等位基因数目少(2个)的SSR标记,从38对SSR引物中筛选出能够扩增出稳定带型且不同材料之间差异明显的SSR引物,并从中选出10对SSR引物进行甜樱桃分子指纹分析,根据各甜樱桃DNA样品的电泳条带结果进行赋值,利用Visual Basic和Ac-cess软件进行数据库编程,创建一个数据库,入选的10对引物对样品的扩增结果赋值排列起来,即成为甜樱桃的"基因身份证"号码,从而根据分子身份证对不同甜樱桃种质进行鉴别。 相似文献
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HOU Cheng-xiang LI Mu-wang ZHANG Yue-hua QIAN He-ying SUN Ping-jiang XU An-ying MIAO Xue-xia GUO Qiu-hong XIANG Hui HUANG Yong-ping 《中国农业科学(英文版)》2007,6(5):620-627
Thirty-five SSR markers were used to construct 96 silkworm races fingerprint. All the SSR markers were polymorphic and unambiguously separated silkworm strains from each other. A total of 467 alleles were detected with a mean value of 13.34 alleles/locus (range 3-28). The mean polymorphism index content (PIC) was 0.71 (range 0.299-0.919). UPGMA cluster analysis of Nei's genetic distance grouped silkworm strains on the basis of their origin. The results indicated that SSR markers are efficient tools for fingerprinting cultivars and conducting genetic diversity studies in the silkworm. 相似文献
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【目的】从分子水平研究不同家蚕品种间淀粉酶基因多态性差异,为家蚕的育种选择和遗传进化研究提供有力的证据。【方法】根据网上基因数据库中的家蚕α淀粉酶基因序列(序列号:U07847),在第4和第5外显子区设计了一对特异性引物,在1个镇江野蚕和6个不同的家蚕品种基因组内进行PCR扩增,发现了该基因区域在不同品种间的多态现象。【结果】根据所得基因测序结果信息,用Clustalx软件进行分析并构建了分子系统树。其聚类结果在一定程度上也比较符合家蚕地理和化性的分布,而且镇江野蚕和家蚕品种距离较远。【结论】家蚕淀粉酶是一个为家蚕的起源和进化密切相关的分子标记基因,值得更深入的研究和探讨。 相似文献
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家蚕五龄幼虫中部丝腺细胞的蛋白质组成比较 总被引:16,自引:2,他引:16
对家蚕5龄期中部丝腺细胞不同区段的蛋白质组成研究,有利于发现与丝胶蛋白合成和分泌有关的功能蛋白质。本研究采用蛋白质双向电泳和图像分析技术,发现家蚕中部丝腺前、中、后3个不同区段的细胞的蛋白质组成具有显著差异;仅在前段表达的20个特异性蛋白质,可能与Ser2A、Ser2B、S4和S5这4种丝胶蛋白的合成与分泌有关;仅在中段表达的22个特异性蛋白质,可能与Ser1B、Ser1C、Ser1D和S3这4种丝胶蛋白的合成与分泌有关;仅在后段表达的27个特异性蛋白质,可能与Ser1A和S3这2种丝胶蛋白的合成与分泌有关。另外,在中段和后段表达、前段不表达的51个差异性蛋白质、表达量在中段和后段比在前段高的20个差异性蛋白质,可能参与了中、后段相应的丝胶蛋白的合成。 相似文献
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介绍SSR分子标记在玉米遗传图谱构建、亲缘关系及杂种优势群划分、孤雌生殖单倍体鉴定等方面的应用,并对SSR标记技术在玉米研究中的应用进行展望。 相似文献
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张彦广 《华南农业大学学报》1994,15(2):151-155
本文介绍了高温导致桑蚕雄性不育的发现及其品种间差异,高温敏感期和发生原因等研究进展,并就高温对雄性生殖系统的影响进行了讨论。作者认为对高温雄性不育的深入研究,在蚕业生产乃至农林业害虫防治上具有重要意义。 相似文献
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詹永乐 《安徽农业大学学报》1996,23(4):521-524
以蛹油为原料,在强酸性阳离子交换树脂催化剂作用下,通过与双氧水和冰乙酸发生环氧化反应,制取环氧蛹油;并探讨了最佳反应条件,结果显示:催化剂用量为3%、冰乙酸用量为25%、双氧水用量为50%,反应时间为7h。 相似文献