动物源肠球菌的耐药表型及Ⅰ类整合子的检测

采用肉汤稀释法、药敏纸片琼脂扩散法(K-B法)和VITEK-AMS全自动药敏实验法相结合的手段检测不同动物源性140株肠球菌分离株的耐药表型(判定标准CLSI 2007);同时采用Ⅰ类整合子整合酶基因PCR方法,检测Ⅰ类整合子的携带率,并对代表株的整合酶基因进行克隆测序.在140株肠球菌中,Ⅰ类整合酶基因阳性菌株73株,总阳性率为52.14%.在肠球菌中,Ⅰ类整合子阳性菌株对多种抗菌药物的耐药率均明显高于阴性菌株.猪、鸡、牛和羊源性肠球菌Ⅰ类整合子的携带率分别为59.52%、52.63%、46.67%和46.67%;临床分离株对阿莫西林、氨苄两林、头孢唑啉、环丙沙星、克林霉素、红霉素、庆大霉素、呋喃坦啶、青霉素、利福平、四环素、万古霉素的耐药率分别为62.14%、60.00%、50.71%、77.86%、17.14%、69.29%、76.43%、20.00%、68.57%、80.71%、51.43%、0.00.研究结果提示畜牧业生产中应加强肠球菌耐药性的监测,以阻断耐药菌株在不同动物和人之间的散播,且Ⅰ类整合子在传播动物源性肠球菌耐药性中的作用不可忽视.     

我国部分地区奶牛乳房炎源大肠杆菌生物学特性及耐药性分析

调查奶牛乳房炎源大肠杆菌的某些生物学特性及其耐药状况,以提高药物疗效,减少牛乳中药物的残留。本研究从国内7个省、市、自治区部分地区患乳房炎奶牛的乳样中分离纯化与鉴定出95株大肠杆菌(Escherichia coli),并对大肠杆菌分离株进行O血清型鉴定、小鼠(Mus musculus)致病性试验以及抗菌药物敏感性分析。研究结果显示,95株大肠杆菌共鉴定出37种血清型,覆盖了54株分离株,另有2株自凝,39株未鉴定出型,较常见血清型为093和09;大肠杆菌分离株接种小白鼠剖检可见明显病变;95株大肠杆菌对16种抗菌药物中的8种药物耐药率超过50%,青霉素的耐药率甚至达到100%,同一菌株最多耐药14种,最少耐药2种,耐药6种以上菌株占到51.58%。表明,奶牛乳房炎源大肠杆菌分离株血清型比较复杂,且对多种药物产生不同程度的耐药性,存在着严重的多重耐药情况。本研究为奶牛乳房炎疫苗的研制和乳房炎的临床治疗提供理论依据。     

白颈长尾雉圈养种群大肠杆菌耐药性及其耐药基因

对白颈长尾雉圈养条件下的38个样品进行大肠杆菌分离及PCR检定,并采用肠杆菌基因间重复共有序列PCR指纹法（ERIC）剔除各个样品的重叠分离株,检测获得的170个大肠杆菌分离株对9种抗生素的耐药性、Ⅰ型整合子携带率及其可变区抗性基因,结果显示：（1）来自白颈长尾雉的分离株对实验用的9种抗生素的抗性比率和多重耐药性远高于环境源和人源者（来自白颈长尾雉的分离株100%耐受3种及以下的抗生素,而环境源者为50.7%,人源者66.7%）;（2）来自白颈长尾雉的分离株的Ⅰ型整合子携带率（92%）高于环境源（87%）和人源（78%）;（3）来自白颈长尾雉和来自人的大肠杆菌分离株的Ⅰ型整合子可变区抗生素抗性基因检出率相同（36%）,但高于环境源（24%）;（4）携带Ⅰ型整合子的分离株对实验用的抗生素的抗性百分率一般高于不携带者,只有个别种类抗生素这种差异为非显著性差异;（5）Ⅰ型整合子可变区基因盒的基因为3类,即aadA、dfrA和未知功能的orfF;aadA、dfrA的频率相同;3类基因均以基因盒形式存在,分别是dfrA17-aadA5、dfrA12-ofrF-aadA2、dfrA12-aadA2。     

空肠弯曲菌PCR-RAPD分子亚分型及其毒力相关基因分析

对113株不同来源的空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni)进行RAPD分析,得到15个基因型,其中菌株分布最集中的基因型为V10、V11、V12和V14,所占比例分别为11.50%、12.39%、13.27%和10.62%,不同源分离株呈高度交叉分布.空肠弯曲菌分离株毒力相关基因分析显示,黏附相关基因codF和racR的平均携带率分别为92.45%和38.69%,鞭毛蛋白基因flaA的平均携带率为73.58%;毒素调节基因cdtA、cdtB、cdtC、wlaN和virB11质粒基因的平均携带率分别为71.70%、52.83%、96.23%、12.26%和1.89%;热休克蛋白和转运相关蛋白基因dnaJ和ceuE的平均携带率分别为0.94%和65.09%,CiaB和pldA基因的平均携带率分别为39.62%和9.43%,58.82%的细菌含有6个以上的毒力相关基因.对不同来源的空肠弯曲菌毒力基因的分析结果显示,鸡源各类毒力基因的携带率普遍高于其他来源的检测结果.     

牛粪沼渣中多重耐药细菌的环境风险

为研究牛粪厌氧发酵沼渣中多重耐药细菌的环境污染风险，选用畜禽养殖中常用的5种抗生素(红霉素、氨苄青霉素、金霉素、链霉素、环丙沙星)对牛粪沼渣中可培养抗生素抗性细菌进行筛选。结果表明：多重耐药细菌的比例高达76.5%,其中，抗5种和4种抗生素的细菌分别有11,21株。所有多重耐药细菌均对氨苄青霉素具有抗性，抗红霉素、金霉素和链霉素的细菌分别占总多重耐药细菌数的92.0%,89.3%,61.3%。通过细菌16S rRNA测序鉴定，32株具有4种以上抗性的细菌分别属于福氏志贺氏菌、摩根氏菌和假中间苍白杆菌，均为重要的临床致病菌。使用全基因组测序对7株典型多重耐药细菌携带的抗性基因进行分析，共检测出28种抗生素抗性基因，对应9种抗生素抗性类型。通过分析抗性基因及插入序列所在位点信息发现，多重耐药细菌普遍携带含有抗性基因和插入序列共存的质粒，表明抗性基因具有高度的可移动性和较强的传播风险。综上所述，牛粪沼渣中含有大量的多重耐药细菌，可视作抗生素抗性基因的储存库，应重视沼渣农业资源化利用过程中的环境风险监测与评估。     

sRNA SaaS对沙门氏菌粘附响应规律和胞外代谢物的影响效应

sRNA SaaS(Salmonella adhesion associated sRNA)是近期在肉品源肠炎沙门氏菌(S.Entertidis NCM 61)中筛选出的一种新型调控因子.本研究通过对比野生株与SaaS缺失突变株的粘附响应规律,分析二者胞外代谢物的差异以揭示sRNA SaaS的具体功能及可能的作用机制....     

黄颡鱼源维氏气单胞菌的分离、鉴定及特性分析

为确定导致江西南昌地区黄颡鱼腹水病暴发的病原，进行了病鱼的临床解剖观察、病原菌分离鉴定和回归感染、病原菌株药敏及毒力基因检测等系统性试验和分析。结果显示，患病鱼体鳃、肝脏、肾脏以及肠道等组织均发生不同程度的病变；由病鱼体内分离获得一株优势菌PL1，经过16S rDNA序列比对和系统进化树分析，鉴定为维氏气单胞菌（Aeromonas veronii）。回归感染结果表明，菌株PL1能够引起黄颡鱼与自然患病相同的典型腹水病病症，具有较强的致病性；药敏试验结果显示，菌株PL1对30种抗菌药物中多粘菌素、复方新诺明、呋喃唑酮等12种药物敏感，对氧氟沙星、红霉素和哌拉西林3种药物中度敏感，而对诺氟沙星、环丙沙星、万古霉素等15种抗生素具有耐药性，呈现出多重耐药性。毒力基因检测结果显示，菌株PL1携带有aerA、act、gcaT、ser、fla、ascV等6种毒力基因，表明菌株PL1具有较强的毒力。本研究为黄颡鱼腹水病的防治提供了科学指导，同时为深入研究患病机制提供了基础数据。     

鸡传染性支气管炎病毒CK/CH/LSD/05 Ⅰ的分离、鉴定及弱毒疫苗对气管的保护

从2005~2006年中国部分地区鸡场疑似鸡传染性支气管炎病毒(Avian infectious bronchitis virus)感染鸡分离到12株鸡传染性支气管炎病毒,并对其部分生物学特性及基因型进行了研究。发现其中11株病毒分属于LX4和CK/CH/LSC/99Ⅰ型。通过S1基因比较、进化树分析、BLAST搜寻和动物试验研究发现,CK/CH/LSD/05Ⅰ是一株新型变异毒株。动物感染试验表明,CK/CH/LSD/05Ⅰ感染鸡的肾脏病变不明显,仅有20%的感染鸡肾脏病毒分离呈阳性,但100%感染鸡呼吸道病毒分离阳性,表明该病毒不是中国普遍流行的肾型毒株,而其对呼吸道具有较强嗜性。同时,实验应用弱毒疫苗H120和本实验室致弱的3株异种毒株进行了动物保护试验,结果显示,用CK/CH/LSD/05Ⅰ攻毒后,这4株异种传染性支气管炎病毒的免疫对气管的保护率很低。初步揭示该毒株可能属新的血清型病毒。     

鸡传染性支气管炎病毒CK/CH/LSD/05I的分离鉴定及弱毒疫苗对其保护研究

本研究从2005到2006年中国部分地区鸡场疑似鸡传染性支气管炎病毒感染鸡分离到12株鸡传染性支气管炎病毒,并对其部分生物学特性及基因型进行了研究。发现其中11株病毒分属于LX4和CK/CH/LSC/99I型。通过S1 基因比较、进化树分析、BLAST搜寻以及动物试验等方面研究发现CK/CH/LSD/05I是一株新型变异毒株。动物感染试验表明CK/CH/LSD/05I感染鸡的肾脏病变不明显,仅有20%的感染鸡肾脏病毒分离呈阳性,但100%感染鸡呼吸道病毒分离阳性,表明该病毒不是中国普遍流行的“肾型”毒株,而其对呼吸道具有强的嗜性。同时,试验应用弱毒疫苗H120和本实验室致弱的3株异种毒株进行了动物保护试验,结果显示用CK/CH/LSD/05I攻毒后,这4株异种传染性支气管炎病毒的免疫对气管的保护率很低。初步提示该毒株可能属新的血清型病毒。     

广东地区副猪嗜血杆菌KRG血清分型及基因分型多态性分析

本研究对保存的2007～2008年广东地区发病猪群中分离的48株副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis)进行了分析.用琼脂扩散进行血清分型,结果表明48株临床分离菌株鉴定出7个血清型,其中以5型为主,占总菌株的23.68%.采用肠杆菌基因间重复序列-PCR(Enterobacterial repetitive intergenic consensus-PCR)法进行基因分型分析,结果显示,48株不同来源副猪嗜血杆菌菌株基因型呈现多态性分布;分析得到31个基因型PHYLIP-3.68软件对31个基因型的电泳图谱进行基因分型及遗传关系的分析,结果得到8个群,其中B为优势群,占总菌株数的66.67%.表明广东地区的副猪嗜血杆菌的基因型和血清型十分丰富,ERIC-PCR技术可成为其分子流行病学研究的有效手段.     

滑板气幕减阻效果的计算及其试验验证

提出了滑板在湿软土壤中滑行时,气幕条件下的阻力和减阻率的数学模型。分析了减阻的机理。并利用该数学模型结合作者曾提出的理论进行充气层面积、滑板阻力及减阻率的计算,同时进行试验验证。结果表明,计算与试验结果基本相符,说明这一方法可用以预测上述各参数。同时又提出了提高减阻率的重要途径。     

应用RAPD技术区别芒果抗炭疽病品种的研究

应用RAPD技术在分子水平上对10个芒果品种的遗传变异程度研究分析结果表明,10个芒果品种被聚为3个RAPD组,RAPD组与品种对炭疽病的抗性有明显相关性。表明RAPD技术在筛选抗病品种时可作为辅助手段之一。     

小麦抗黄矮病基因遗传特性研究

采用 3× 4不完全双列杂交 ,对 2个遗传背景不同组合 5个世代进行GAV株系接种鉴定结果表明 ,抗大麦黄矮病毒 (BYDV)遗传存在加性、显性和上位性效应 ,以加性效应占绝对优势 ,遗传决定度为 90 %以上 ,狭义遗传力为 75 %～ 83% ;后代表型变异因亲本的遗传背景不同而异 ,其平均抗性和分离程度与父本抗性值及其变异系数密切相关。     

Study of Silicon Effects on Plant Growth and Resistance to Stem Borer in Rice

This research was conducted to evaluate silicon (Si) effects on the morphological characteristics and resistance to rice stem borer under greenhouse conditions at Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University in 2009. The experiment was conducted as factorial in a complete randomized design (two factors) with three replications. The factors included four levels of silicon (Si) (Si₀ = 0, Si₁ = 5, Si₂ = 10, Si₃ = 20 g Si kg^?1 soil) and three rice cultivars (Parto, Line 34, and Neda). The results showed Si fertilizer had a significant effect on percentage of white head, length of leaf, width of leaf, diameter of stem, and percentage of reproductive tiller. Also, increased stem Si increased the resistance to striped stem borer in the rice cultivars studied. The greatest resistance to striped stem borer was observed with the application of 20 g Si kg^?1 soil. The application of Si at the rate of 20 g Si kg^?1 soil significantly reduced the percentage of white head from 18.10% (without Si) to 0.11% (with 20 g Si kg^?1 soil) in Parto cultivar.     

夏玉米农田SPAC系统水分传输势能及其变化规律研究

试验测定华北平原夏玉米农田SPAC系统不同界面的水势,并计算水流传输阻力结果表明,大气水势和叶水势均呈明显日变化,最大值出现在日出前;大气水势日变幅最大,土壤水势主要受土壤含水量的影响而日变化较平缓。夏玉米植株由下部至上部呈逐渐降低的水势梯度,水流在SPAC系统传输过程中不同界面间存在明显的水势梯度和较大的阻力,从叶片至大气的阻力远大于由土壤至叶片的传输阻力,证明从叶片至大气阻力对限制与调节作物水分散失强度和数量具有关键作用。     

优质谷子新品种陇谷029选育报告

为获得优质丰产抗逆优良的谷子品种，甘肃省农业科学院作物研究所用山西省农业科学院选育的谷子品种晋谷29号作母本、皋兰农家地方品种皋兰大凉谷作父本，有性杂交后经过多年多地鉴定，选育出了丰产、抗病谷子新品种陇谷029。2022年通过农业农村部谷子品种登记。该品种白谷黄米，外观品质和蒸煮食味品质俱佳，2017年被中国作物学会粟类作物专业委员会评为“二级优质米”。陇谷029熟性适中，抗旱性强、抗倒伏；抗谷锈病、黑穗病和白发病，中抗谷瘟病和玉米螟。2015 — 2016年参加甘肃省谷子品种多点试验2 a平均折合产量 4 675.36 kg/hm2，2017 — 2018年参加全国谷子区域联合鉴定西北早熟组试验，2 a平均折合产量5 479.50 kg/hm2。陇谷029适宜甘肃中东部及河西走廊地区、山西大同、河北张家口、宁夏固原及内蒙古呼和浩特等西北春谷区种植。     

土壤反硝化对磺胺嘧啶及抗性基因消减的影响

农田土壤中抗生素及抗性基因的复合污染已给生态环境安全和人体健康带来了全新隐患。针对厌氧条件下,反硝化作用过程对土壤抗生素乃至抗性基因消减影响的研究一直相对较少。因而,本研究采集牛粪堆积池塘周边底层农田土壤作为目标污染土壤,重点研究反硝化作用过程对土壤磺胺嘧啶及抗性基因消减动态的影响。结果表明:相较于原始污染土壤处理(T1),添加了NO_3~–-N的处理(T2)可以显著强化土壤和水相中反硝化速率,提升N_2O的产气速率,促进土壤中磺胺嘧啶浓度和抗性基因丰度的快速降低;同时发现土壤反硝化基因(nir K、nir S和nos Z)与磺胺类抗性基因(sul Ⅰ和sul Ⅱ)呈显著负相关(P0.05),说明当NO_3~–-N底物越充足,土壤反硝化细菌活性往往被激活,其反硝化功能基因表达就越活跃,土壤反硝化作用过程就越强烈,从而反馈作用促进磺胺嘧啶抗生素的厌氧消减,进而有助于sul系列抗性基因丰度的显著衰减;同时通过高通量测序技术及对反硝化细菌的分离筛选后,发现变形菌门(Proteobacteria)赖氨酸芽胞杆菌属(Lysinibacillus)的细菌是土壤厌氧反应前后的主导优势菌群,对于强化反硝化过程和促进磺胺嘧啶及sul抗性基因的消减发挥了潜在的积极作用。本研究结果可为探明土壤中抗生素的厌氧消减过程和缓解抗性基因的扩散传播提供新颖的认知基础。     

三七及屏边三七病程相关基因克隆的新策略

三七[Panax notoginseng（Burk）F.H.Chen]是我国传统名贵中药材之一。近年来,三七的病虫害问题变得越来越严峻,现已成为限制三七产业可持续发展的一个重要因素。观察发现,作为三七的近缘物种屏边三七[Panax stipuleanatus H.T.Tsai et K.M.Feng]在其相同的生长环境下抗病性状表现优异。如何从分子角度挖掘利用植物本身所具备的抗病基因必将成为三七未来研究当中的一个热点问题。本研究利用人参、西洋参的EST数据库,通过基因注释、KEGG作图找到病原与植物识别代谢途径上有关植物病程相关的基因。然后经RT-PCR和TA克隆分别获得了若干个三七和屏边三七病程相关基因,该技术的应用为三七抗病基因的研究和克隆开辟了新的技术途径,同时也对其他药用植物的抗病研究具有参考意义。     

小飞蓬的铜毒害和抗性机制研究

对高铜污染区的小飞蓬进行盆栽实验,在不同Cu浓度处理下,对小飞蓬的电导率、叶绿素以及蛋白质含量进行测定。结果表明:电导率随着Cu浓度的提高而增大,而叶绿素和蛋白质含量先微增后持续减少,这说明Cu损害了小飞蓬的细胞膜,并影响了小飞蓬的光合作用和蛋白质的合成。对小飞蓬的抗性机制研究表明,当土壤Cu浓度升高时,小飞蓬根部Cu含量随着增加,相关系数为0.974**;而地上部分Cu含量的上升并不明显;转移到地上部分的Cu随着土壤铜含量的提高,亚细胞组分铜的总量增加;其中组分F1(细胞壁以及未破碎残渣)、F3(线粒体部分)、F4(核蛋白和可溶性组分)中Cu含量也呈现增加趋势,相关系数为0.992**、0.973**、0.995**,呈现极显著的正相关性;以F1所占比例最高,约为34.7%～40.9%,F4次之,约为26.8%～32.3%。随着土壤Cu浓度的提高,Cu在根部的存在形态中以醋酸提取态为主,其次为盐酸提取态;地上部分的Cu提取态中活性较低的醋酸提取态和盐酸提取态所占比例提高,活性较高的氯化钠提取态和乙醇提取态下降,水提取态变化幅度不是很明显,但总体上以氯化钠提取态和乙醇提取态为主;抗氧化酶系统SOD、POD、CAT在Cu浓度增加时,活性增强,其中CAT、POD与Cu浓度之间的相关系数为0.940*、0.924*,呈现显著的正相关性,这3种酶组成的清除自由基系统对小飞蓬的耐Cu性有很大的影响。     

New indices for quantifying the resistance and resilience of soil biota to exogenous disturbances

The stability (resistance and resilience to disturbance) of a soil system is a key factor influencing ecosystem properties and processes. To compare the stability of different systems, it is necessary to have indices that provide a relative quantitative measure of both the resistance and resilience of a response variable in all possible scenarios. However, the indices currently in use are frequently unable to do this, or are difficult to interpret. Here, we present new indices that avoid these problems. We compare our indices with previously published indices of stability, and also test their performance by using a real data set. We show that our indices accurately represent the response of soil properties (e.g. soil microbial biomass) to a disturbance, and that they are capable of determining differences in stability between contrasting soils.