隆林山羊肌细胞生成素基因的序列分析与结构预测

为了丰富优良地方品种隆林山羊的肌细胞生成素(myogenin,MyoG)基因遗传学基础信息,并探究其序列结构及其对山羊肌肉的发育分化调控机理。本研究设计1对特异性引物,采用PCR和克隆技术成功获得隆林山羊MyoG基因2419 bp长的DNA序列。结果表明,该基因包括3个外显子、2个内含子、部分5'UTR和3'UTR区,编码区DNA序列长675 bp,共编码224个氨基酸,该氨基酸序列无信号肽序列和跨膜结构。经同源性分析可知,隆林山羊MyoG编码区核苷酸序列及其编码的氨基酸序列与其他物种比对结果和氨基酸系统进化树的聚类结果相符,均显示隆林山羊与哺乳动物中的绵羊、牛和野猪的亲缘关系最近,氨基酸同源性达到95%以上。因此隆林山羊MyoG基因在哺乳动物中具有较高的保守性,而MyoG基因的克隆、序列分析和结构预测将为今后该基因的表达与调控、肉质改良、山羊开发利用等研究提供了更充分的分子生物学基础信息和理论依据。     

山羊MyoG基因启动子区序列分析与结构预测

为探明山羊MyoG基因的启动子序列与结构及转录调控机制,本研究设计了1对引物,采用PCR扩增、测序以及序列比对分析,从波尔山羊基因组中扩增出一段长度为969bp的山羊MyoG基因的5′侧翼序列,其GC含量为50.6%。经过生物信息学分析,确定了其转录起始位点及活性区域;发现在转录起始位点上游-24bp处存在1个TATA-box,另外还发现了1个GC-box、2个CAAT-box、2个E-box和1个富含A-T碱基的模体结构;该序列还包含HSF、ADR1和cap等转录因子结合位点。通过比对分析,所得山羊MyoG基因5′侧翼序列与牛、马鹿、人、小鼠和鸡同源序列的相似性在37.22%～96.85%之间,说明不同物种间该序列具有一定的保守性。本研究为进一步探讨山羊MyoG基因的表达和调控机制奠定了理论基础。     

波尔山羊MyoG基因的鉴定和序列分析

为了探明山羊MyoG基因的序列结构及其对肌肉的分化调控机制,用PCR产物直接测序的方法获得了波尔山羊MyoG基因2 363 bp长的DNA序列,并对该序列进行了分析.结果表明,波尔山羊MyoG基凶包括3个外显子、2个内含子及部分5'UTR(74 bp)和3'UTR(260 bp)区,编码序列长675 bp,共编码224个氨基酸.结构分析表明,该序列所编码的肽链没有信号肽,第1～138个氨基睃为波尔山羊MyoG基因的bHLH结构域.通过比对分析波尔山羊与已知的GenBank中的人类及其它物种MyoG基因发现,该基因编码区核苷酸以及推测的氨基酸同源性和物种间的亲缘关系相一致,无根系统进化树的聚类结果与这些物种本身的生理特性以及传统分类学中已知的生物分类结果相一致.波尔山羊MyoG基因的鉴定及序列分析为山羊肌肉发育调控的机理以及肉质改良等的研究提供了很好的生物学基础信息.     

会理黑山羊MyoG基因的鉴定及序列分析

为了研究会理黑山羊肌细胞生成素(MyoG)基因的结构及调控机制,应用PCR技术扩增、克隆该基因,结果:会理黑山羊MyoG基因长度为2 043 bp,包括3个外显子、2个内含子及部分5'-UTR(73 bp)与3'-UTR(9 bp)序列。采用DNA Star、MEGA 5.1、NetPhos 2.0等生物信息学软件分析获得的序列,通过分析会理黑山羊与已知物种的MyoG基因进化关系,结果:进化树结果与传统分类学中已知生物分类的结果一致,会理黑山羊与山羊同处一分支,与山羊、绵羊核苷酸同源性分别为99.5%、97.5%;存在4个主要的疏水区,亲水区占据了大部分区域,表现出的亲水特征;存在23个潜在磷酸化位点、无跨膜区;MyoG具有保守的碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)结构域。     

隆林山羊养殖现状及前景解析

从隆林县发展隆林山羊的现状出发,分析了制约隆林山羊发展的主要因素,介绍了隆林县发展隆林山羊的优越条件,并提出了隆林县发展隆林山羊的对策。     

山羊ADD1基因部分序列的克隆与分析

提取湘东黑山羊基因组总DNA，用所设计的3对引物以聚合酶链式反应扩增山羊ADD1（Adipocyte Determination and Differentiation factor-1）基因，并进行克隆测序。序列分析表明所克隆的山羊ADD1基因包含exon 2～8、intron 2～7序列，将序列提交GenBank，获2个登录号：DQ480338、DQ487874；对编码序列（exon 2～8）与牛、人同区域进行Blast对比，同源性分别达到了96．14％和83．82％，所翻译氨基酸序列与牛属同源性更高达97．9％；此外，通过不同引物的测序结果比较，分别在exon6的第42处和intron6的第82处发现了一个碱基突变（C→T）和碱基插入／缺失（G／-），前者属于沉默突变，未引起氨基酸的变化。     

山羊MyoG基因内含子Ⅱ变异及其在体质量上的遗传效应分析

旨在研究M yoG基因内含子Ⅱ多态性与波尔山羊及其级进杂交后代部分生长性状的关系.以纯种波尔山羊及波尔山羊与唐山奶山羊级进杂交一代(F1)、二代(F2)和三代(F3)为研究对象,采用测序和PCR-RFLP方法对山羊MyoG基因遗传多态性进行分析,并研究基因型对初生体质量、1月龄体质量和断奶体质量的影响.结果在MyoG基因内含子Ⅱ的1 823 bp处(依据序列号:FJ607135)发现了1个SNP(C→T),且存在3种基因型(AA、AB和BB),这3种基因型在波尔山羊和波唐级进杂交后代4个群体中的分布基本一致,B等位基因为优势等位基因.通过对有效等位基因数(Ne)、群体杂合度(H)、Shannon's信息指数(Ⅰ)和多态信息含量(PIC)等群体遗传参数的计算,发现此SNP是1个中、低多态位点.最小二乘分析结果表明,AA基因型与其它2种基因型比较有较小的初生体质量且达到显著水平(P＜0.05),而对于1月龄体质量和断奶体质量,3种基因型间虽未达显著水平(P＞0.05),但具AA基因型个体的表型值明显低于具其它2种基因型个体的表型值,AA、AB和BB 3种基因型在这3个生长性状的大小排列顺序均为BB＞ AB＞ AA.推测MyoG基因对山羊生长性状存在一定影响,提示选择带有B等位基因的个体有望提高山羊体质量相关的生长性状.     

鲜香蕉叶对隆林山羊生化指标的影响

通过以鲜香蕉叶替代粗饲料进行饲养试验,研究饲喂鲜香蕉叶对隆林山羊血液生化指标的影响.将试验羊分为6个组,对照组、试验1、2、3、4和5组,每组日粮中鲜香蕉叶占粗料的比例依次为0、20%、40%、60%、80%和100%.结果表明:试验2组的直接胆红素平均为3.3μmol/L,与试验3组(1.1μmol/L)和试验4组(1 μmol/L)差异显著;碱性磷酸酶试验4组与对照组相比差异显著,分别为963.5和98.5 IU/L;试验3组与试验4组的总胆汁酸差异显著,分别为9.9和3.5 mmol/L;其余指标各组问差异均不显著.试验结果表明:直接饲喂鲜香蕉叶对隆林山羊的肝和肾功能部分指标有影响,但并无生理性损害,用鲜香蕉叶替代粗饲料饲喂隆林山羊是可行的.     

隆林山羊与努比亚山羊杂交对后代生产性能和肉品质影响的研究

为了促进广西隆林山羊杂交改良技术的应用,提高隆林山羊的生产效益,本研究以努比亚山羊、隆林山羊及努隆杂交F1代（努比亚山羊♂×隆林山羊♀）为研究对象,所有山羊都在相同水平下进行饲养管理,选取3个群体共205只山羊,分别对1、3、6月龄山羊的生产性能及体尺指标进行测定,选取6只6月龄的父母代及杂交F1代进行屠宰,取其背最长肌进行肉品质分析。结果表明,努隆杂交F1代经产母羊的产羔率、羔羊成活率与父母代差异不显著（P>0.05）,初生重、不同月龄体尺指标与父母代差异极显著（P<0.01）,努隆杂交F1代宰前活重、胴体重、净肉重、屠宰率、净肉率较隆林山羊都有显著提高（P<0.05）,肌肉粗蛋白质含量、肌内脂肪含量、必需氨基酸、风味氨基酸、游离脂肪酸与父母代均有不同程度的提高。因此,努比亚山羊在改善隆林山羊体型、生长速度和肉品质上综合表现良好。     

伊维菌素注射剂防治隆林山羊疥螨病的临床效果分析

目的:分析伊维菌素注射剂防治隆林山羊疥螨病的临床医疗效果。方法:选取某养殖场2018年1~12月饲养的隆林山羊120只,根据数字随机表法分组,对照组60只不给予用药,干预组60只给予伊维菌素注射剂防治,对比分析2组山羊疥螨病的阳性情况。结果:实验1周、2周、3周及4周时,干预组山羊疥螨病的阳性率均明显低于对照组(P<0.05)。结论:伊维菌素注射剂防治隆林山羊疥螨病的临床效果比较显著,能够有效预防和治疗疥螨病,积极促进患病部位康复,抑制新病灶产生。     

山羊KIFI基因分子克隆及序列分析

利用Primer 3.0设计出1对特异性引物F和R,以成年山羊基因组DNA为模板,扩增山羊的KIFI基因,将其克隆至pGEM-T载体,转化后挑取阳性菌落进行酶切及测序鉴定。结果表明,克隆所得的472 bp序列(GenBank登录号:GQ988385),包括山羊KIFI基因的Exon 1全长、部分5′UTR和部分Intron 1序列。山羊KIFI基因的Exon 1序列编码116个氨基酸,与绵羊、牛、马、人和家鼠的同源性分别为98%、90%、90%、88%和84%。KIFI基因部分序列的克隆,为进一步研究KIFI基因多态性与绵、山羊绒用性能间的相关性奠定基础。     

山羊催乳素受体基因部分片段的克隆与序列分析

采用PCR技术扩增出济宁青山羊催乳素受体基因长892 bp的片段，该片段含有97 bp的部分外显子8序列（外显子8全长为100 bp）、683 bp的内含子8、70 bp的外显子9及42 bp的部分内含子9。将该片段克隆到pGEM-T Easy质粒中，重组质粒用PCR进行阳性克隆鉴定，然后测定核苷酸序列，并推导其氨基酸序列。该序列与绵羊、母牛、人、大鼠、小鼠的催乳素受体基因mRNA的对应序列的核苷酸同源性分别为99.4 %、97.01%、89.22%、89.22%、88.02%，氨基酸同源性分别为100%、94.55%、81.88%、81.82%、83.64%。     

山羊KIFI基因分子克隆及序列分析

利用Primer 3.0设计出1对特异性引物F和R,以成年山羊基因组DNA为模板,扩增山羊的KIFI基因,将其克隆至pGEM-T载体,转化后挑取阳性菌落进行酶切及测序鉴定。结果表明,克隆所得的472 bp序列(GenBank登录号：GQ988385),包括山羊KIFI基因的Exon 1全长、部分5′UTR和部分Intron 1序列。山羊KIFI基因的Exon 1序列编码116个氨基酸,与绵羊、牛、马、人和家鼠的同源性分别为98%、90%、90%、88%和84%。KIFI基因部分序列的克隆,为进一步研究KIFI基因多态性与绵、山羊绒用性能间的相关性奠定基础。     

隆林山羊SMPX基因克隆及其组织表达谱分析

为了探究小肌肉蛋白(Small Muscle Protein X-link,SMPX)在隆林山羊中的蛋白结构和组织表达水平,本研究克隆隆林山羊SMPX,并进行生物信息和组织表达谱分析.从NCBI查找山羊SMPX基因序列设计引物,根据TRlzol法提取1月龄隆林山羊心、肝、脾、肺、肾、背肌的总RNA,反转录成cDNA,并...     

饲喂香蕉茎叶对隆林山羊生长性能的影响

本试验通过以鲜香蕉叶、青贮香蕉茎叶部分或全部替代粗饲料进行饲养试验,研究饲喂香蕉茎叶饲料对隆林山羊生长性能的影响.试验分两期进行,一期饲喂鲜香蕉叶,二期饲喂青贮香蕉茎叶,每期将试验羊随机分为6个组,对照组和试验1、2、3、4、5组,每组饲粮中鲜香蕉叶、青贮香蕉茎叶占粗料的比例依次为0、20%、40%、60%、80%、1...     

羊肌细胞生成素基因内含子的克隆及序列分析

以羊MyoG基因的内含子为研究对象,参考羊和猪MyoG基因的mRNA序列信息,选取保守基因序列设计上下游引物,采用PCR方法,首次成功克隆出羊MyoG基因内含子Ⅰ和内含子Ⅱ,并进行序列测定（GenBank登录号：DQ453548）.序列分析比较发现内含子Ⅰ的片段与猪的同源性为71.9%,与人的同源性为65.7%;内含子Ⅱ的片段与猪的同源性为77.9%,与人的同源性为62.7%.说明该基因的内含子在不同物种间具有较高的同源性.     

不同月龄阉割对隆林公山羊体重增长的效果观察

试验目的在于观察不同月龄阉割对隆林公山羊体重增长的效果。选取同等饲养条件、体重接近、品种相同的隆林母羊所产的40只体重相同的双胞胎公羔进行试验,试验随机分成8组,分别在不同月龄阉割,称取各组三月龄重、六月龄重、八月龄重。结果表明八月龄内的隆林公山羊阉割月龄越大,其体重就越大。     

20个山羊品种FSHβ基因部分序列测定及与其它8个物种的序列比较分析

利用牛、绵羊等动物FSHβ亚基基因序列设计引物，采用PCR法扩增并测定出20个山羊品种（16个本地品种和4个引进品种）FSHβ亚基基因部分序列（GenBank登录号：AY838283和AY853276）。在测定出的FSHβ亚基基因731bp序列中，包括第1外显子全序列（1～61bp），第1内含子全序列（62～702bp）以及第2外显子部分序列（703-731bp），序列的A＋T含量（66．07％）高于G＋C（33．93％），编码7个氨基酸。在所有测定的序列中共检出3个突变位点，分别是78（-／A）、132（G／A）和343（G／A），这些突变都位于内含子1序列中，它们与产羔率之间的联系需进一步研究。利用山羊以及GenBank中其他8个物种的FSHβ基因内含子1序列进行系统发育分析，部分结果与传统生物分类不一致，可能是由于大部分物种的序列长度不足700bp以及物种之间的关系超过了属阶元的限制。     

山羊HABP4基因的克隆、序列分析及功能预测

旨在克隆简州山羊HABP4基因,鉴定与HABP4互作蛋白的mRNA表达水平并分析其相关性,为进一步探讨HABP4基因在调控山羊细胞凋亡中的作用奠定基础。于四川省简阳大哥大牧业有限公司随机选取10月龄左右,体重为55 kg左右的健康简州大耳羊公羊（16只）,清晨空腹屠宰后迅速采集各山羊心、肝、脾、肺、肾、小肠、大肠、瘤胃和胰腺9个组织样本,TRIzol法提取组织总RNA,并反转录cDNA。RT-PCR技术克隆山羊HABP4基因cDNA序列,利用在线软件进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR （RT-qPCR）技术检测HABP4基因在不同组织中的表达量（n=16）以及分析在胰腺（n=16）组织中与该HABP4蛋白可能存在相互作用的10个蛋白的mRNA表达特性及其相关性。结果,成功扩增山羊HABP4基因1 496 bp,包含5'UTR 61 bp,CDS区1 254 bp,3'UTR 181 bp,编码417个氨基酸残基。HABP4 mRNA在山羊各组织中均有表达,在胰腺中表达水平最高,且与UAB52呈极显著正相关,和RPL32、RPS9呈显著正相关,推测其在细胞定位、新陈代谢、多生物过程及生物过程负调节以及翻译起始、核糖体转录、细胞质代谢等方面发挥着重要作用。本研究成功克隆山羊HABP4基因cDNA全长1 496 bp,其可能与UAB52、RPL32和RPS9呈显著正相关。这些结果也为进一步探讨HABP4在调控细胞凋亡过程中的作用提供了参考数据。