鸡FSHβ、ESRα基因多态性及其合并基因型与产蛋性能的关联性分析

使用SSCP技术检测FSHβ、ESRα的SNPs位点,分析鸡FSHβ、ESRα基因多态性及其合并基因型与产蛋性能的相关性,为寻找玫瑰冠鸡产蛋性能相关分子标记提供依据。结果表明:在玫瑰冠鸡和海兰褐蛋鸡群体中分别检测到FSHβ(A-173G)和ESRα(G-78416T、A-119854T、C-158689G)4个多态位点,其中A-173G位点、A-119854T位点、C-158689G位点AB型对玫瑰冠鸡300日龄产蛋数有显著影响(P0.05);ESRα基因单倍型GTC个体的开产体质量和300日龄产蛋数高于单倍型GAG,是2种鸡的优势基因型;FSHβ、ESRα合并基因型中玫瑰冠鸡H6型的初生质量显著高于H1基因型(P0.05),海兰褐蛋鸡H1型的开产蛋质量显著高于H9、H10及H12合并基因型(P0.05),开产日龄显著早于H11基因型(P0.05),300日龄产蛋数显著高于其他合并基因型(P0.05)。因此FSHβ(A-173G)、ESRα(A-119854T)、ESRα(C-158689G)AB型与FSHβ、ESRα合并基因H6型有望作为与玫瑰冠鸡产蛋性能相关的分子标记。     

文昌鸡神经肽Y基因多态性与开产性状的关系

[目的]检测文昌鸡神经肽Y基因（NPY）的多态性及其与开产性状的关系,为高产文昌鸡的育种提供资料。[方法]通过PCR-RFLP方法检测文昌鸡NPY基因Dra I位点上的多态性,分析其基因型、群体的遗传稳定性以及该位点多态性与开产日龄、开产体重和开产蛋重的关系。[结果]文昌鸡在NPY基因Dra I位点上有3种基因型（AA、AB、BB）;基因型的分布符合Hardy-Weinberg定律;不同基因型间的开产日龄、开产蛋重差异不显著（P〉0.05）,开产体重差异极显著（P〈0.01）。[结论]文昌鸡NPY,基因Dra I位点处于Hardy-Weinberg平衡状态,其基因多态影响开产体重。     

IGF-1基因多态性对德化黑鸡产蛋性状遗传效应的研究

利用PCR—PstⅠ—RFLP技术对德化黑鸡的胰岛素样生长因子-1（IGF-1）基因的5′端调控区进行多态性分析,并探讨了多态性与产蛋性状的相关性。结果表明,该调控区的扩增产物用PstⅠ酶切检测出3种基因型AA、AB、BB。利用最小二乘分析研究了该多态位点对产蛋性状的影响,结果表明该多态位点对开产日龄没有显著影响,对240日龄产蛋数和300日龄产蛋数有显著影响（P〈0．05）。其中AA基因型的240日龄产蛋数和300日龄产蛋数显著高于AB基因型和BB基因型,表现为差异显著（P〈0．05）,AB基因型的240日龄产蛋数和300日龄产蛋数高于BB基因型,但表现为差异不显著（P〉0．05）。     

雷州黑鸭FSHβ基因多态性与产蛋性能的关联分析

[目的]明确促卵泡激素β亚基(FSHβ)基因在雷州黑鸭群体中的遗传变异情况,为雷州黑鸭群的品种选育提供分子标记.[方法]采用PCR-SSCP对200羽雷州黑鸭FSHβ基因的外显子2(exon2)和内含子1(int1)进行多态性检测,通过测序筛查出多态性位点(SNP位点),同时分析不同基因型与雷州黑鸭产蛋性状间的相关性.[结果]在雷州黑鸭FSHβ基因的g.1103451A>T(int1)处发现一个单核苷酸突变位点(A→T),其存在3种基因型(AA型、AT型和TT型),对应的基因型频率分别为0.538、0.359和0.103.T等位基因频率(0.718)高于A等位基因频率(0.282),且g.1103451A>T位点在雷州黑鸭群体中符合Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05).雷州黑鸭的开产日龄以TT型个体最早,其次是AT型个体,分别比AA型个体提前5.48和4.00d,其差异均达显著水平(P<0.05,下同);在开产体重和300日龄产蛋数方面,也表现为TT和AT型个体显著高于AA型个体,且以TT型个体最高,分别为1299.31g/羽和134.37枚;其他产蛋性状指标在不同基因型个体间的差异均不显著(P>0.05).[结论]雷州黑鸭FSHβ基因int1存在一个SNP位点(g.1103451A>T),其与产蛋性能间存在显著相关性,主要对早期产蛋和生长发育具有促进作用,可作为雷州黑鸭品种选育的辅助选择分子标记.     

NCOA1基因多态性与邵伯鸡母系产蛋性状的相关性分析

 以邵伯鸡核心群母系母鸡为试验材料,利用PCR SSCP技术检测核受体辅激活蛋白1（NCOA1）基因的SNPs,并分析基因多态性与开产日龄（AFE）、开产蛋重(WFE)、连产天数(CL)及300日龄产蛋数(EN)之间的关联性。结果显示：在NCOA1基因的第3和第12外显子上分别发现1个SNPs位点,其中第3外显子10155007处发生了T→A突变,检测到 AA,AB,BB 3种基因型;第12外显子108273423处发生了C→T突变,检测到CC,CD,DD 3种基因型。不同基因型与各性状间有显著相关,其中AA基因型个体的连产天数比BB型个体多0.59d,开产蛋重重0.6g,300日龄产蛋量高7.76%,且差异显著（P<0.05）;CC基因型个体比DD型个体的连产天数多0.51d,开产蛋重重1.04g,300日龄产蛋量高9.07%,且差异显著（P<0.05）;组合基因型发现,基因型AACC个体的开产日龄、连产天数和300日龄产蛋量均高于BBDD基因型组合。因而,NCOA1基因可作为鸡产性状的标记基因用于分子标记辅助选择中。     

鹌鹑ESRα基因外显子的SNPs分析及其与产蛋性能相关性研究

旨在明确鹌鹑ESRα基因外显子多态性与其产蛋性能的关联性,为鹌鹑产蛋性能候选基因的确立及分子标记辅助选育提供依据。选取健康蛋用黑羽鹌鹑为研究对象,开产后进行生产性能的持续统计(60d)。PCR-SSCP法对鹌鹑雌激素受体α亚基(ESRα)基因多态性进行检测,结果表明,在ESRα基因Exon 1、3、4、6和8中均存在多态性。Exon 1在开产日龄上,CD基因型与CC和DD基因型差异达到显著性水平;Exon 8在开产蛋质量中,CD与DD和CC基因型差异显著。表明ESRα基因对蛋用黑羽鹌鹑产蛋性状有一定关联性。     

神经肽(NPY)基因多态性与邵伯鸡母系繁殖性状的关联性分析

以神经肽(NPY)基因为候选基因,利用PCR-SSCP技术检测该基因的SNPs,并分析基因多态性与邵伯鸡母系母鸡的开产日龄、开产蛋重、开产体重以及300日龄总产蛋数之间的关联性。结果显示,在NPY基因上发现1个SNP位点,带有1对等位基因A和B,基因频率分别为0.35和0.65;不同基因型仅与开产体重性状间有显著相关,表现为基因型AA个体的平均开产体重比基因型AB个体的平均开产体重重119.03 g,且差异显著(P<0.05),基因型AA个体的平均开产体重比基因型BB个体的平均开产体重重47.6 g,但差异不显著(P>0.05);基因型BB个体的平均开产体重比基因型AB个体的平均开产体重重71.43 g,差异显著(P<0.05)。     

茶花鸡FSHR基因多态性及其与产蛋性能的相关性研究

[目的]旨在探索FSHR基因多态性与茶花鸡产蛋性能的相关性,以期挖掘出影响茶花鸡产蛋的分子遗传标记。[方法]以茶花鸡为研究对象,采用测序技术来筛选FSHR基因SNPs位点,并与茶花鸡产蛋性能进行相关性分析,通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术探究FSHR基因在高、低产组间不同组织中的基因表达情况。[结果]在FSHR基因外显子1中发现了2个SNPs位点(g. 34847A→G和g. 35000C→T),均属于中度多态;关联分析显示:g. 35000C→T位点的TT型个体开产日龄显著高于CT型(P<0.05);CT型个体43周龄产蛋数显著高于CC型和TT型(P<0.05);FSHR基因在高产组卵巢和下丘脑中的表达量显著高于低产组(P<0.05),高产组和低产组中卵巢的表达量都显著高于下丘脑(P<0.05)。[结论]茶花鸡FSHR基因具有一定的多态性和组织表达差异,发现一些影响茶花鸡产蛋性能的潜在分子标记,为地方鸡产蛋性能分子机理及茶花鸡的选育提供了理论基础。     

鸡PRLR基因多态位点检测及其与产蛋性状的关联分析

以催乳素受体基因(prolactin receptor,PRLR)作为影响鸡产蛋性能的候选基因,采用连接酶检测反应(ligase detection reaction,LDR)对378只四明香鸡B系的PRLR基因进行多态性检测,并利用最小二乘法分析了4个突变位点SNP1(C11390G),SNP2(A14952G),SNP3(A14969C)和SNP4(A14984G)与鸡134日龄体重、65周体重、65周产蛋数和300日龄产蛋数的相关性。单位点分析结果显示SNP2/SNP3/SNP4完全连锁,且其位点多态性对300日龄产蛋数影响显著(P0.05),G/A/G基因型300日龄产蛋数显著高于A/C/A基因型7枚(P0.05);SNP1位点多态性与鸡134日龄体重、65周体重、300日龄产蛋数和65周产蛋数均无显著关联(P0.05)。单倍型分析结果发现存在3种单倍型,即H1(CACA),H2(GACA)和H3(CGAG),不同单倍型对300日龄产蛋数差异显著(P0.05),表现出H3(CGAG)H2(GACA)H1(CACA)的趋势,且H3(CGAG)基因型的300日龄产蛋数比H1(CACA)基因型高7.33枚(P0.05)。结果表明,PRLR基因中H3(CGAG)为有利单倍型,可作为提高鸡群产蛋性能潜在的分子标记。     

核受体辅激活蛋白1基因(NCOA1)作为鸡产蛋性状候选基因的研究

以清远麻鸡、白耳鸡、鹿苑鸡、藏鸡和S2系为试验素材,利用PCR-SSCP技术对核受体辅激活蛋白1(NCAO1)基因编码区进行SNP检测和基因型的判别,探讨NCAO1基因作为影响鸡产蛋性状候选基因的可能性。结果显示:在NCOA1基因的第3和第12外显子上分别发现一个SNP位点,其中第3外显子10155007处发生了T→A突变,检测到AA、AB、BB3种基因型;第12外显子108273423处发生了C→T突变,检测到CC、CD、DD3种基因型。χ2检验表明突变产生的基因型和基因频率在各品种(系)间差异极显著(P<0.01),A、C基因在蛋用型的地方品种白耳鸡中频率较高,B、D基因在肉用型的地方品种清远麻鸡、藏鸡和肉用型培育品系S2系鸡中频率较高。不同基因型与S2系鸡的开产日龄(AFE)、开产蛋重(WFE)、连产天数(CL)及300日龄产蛋数(EN)之间的最小二乘均数分析显示:AA基因型个体的连产天数比BB型个体多0.59 d,开产蛋重重0.6 g,300日龄产蛋量高7.76%,且差异显著(P<0.05);CC基因型个体比DD型个体的连产天数多0.51 d,开产蛋重重1.04 g,300日龄产蛋量高9.07%,且差异显著(P<0.05);组合基因型发现,基因型AACC个体的开产日龄、连产天数和300日龄产蛋量均高于BB、DD基因型组合。因而,初步推断NCOA1基因是影响鸡产蛋性状的主效基因或与主效基因连锁。     

ESR基因与文昌鸡产蛋性状的关联性研究

 以海南文昌鸡为研究素材,运用PCR-SSCP和DNA测序技术检测了ESR基因多态,运用SPSS软件分析ESR基因多态对产蛋性状的关系。结果表明：①ESR基因出现了两个多态位点,并发现了在第580位AATA 4个碱基缺失,②ESR基因多态与产蛋性状中的300日龄产蛋数相关显著（P<0.05）,与平均连产天数(ADCE)相关极显著（P<0.01）,与400日龄产蛋数、双黄蛋数相关不显著（P>0.05）。ESR基因对文昌鸡产蛋性状有作用,但是仅仅关联性分析的结果是不能肯定ESR基因是影响鸡产蛋性状的主效基因或与主效基因紧密连锁的标记基因。     

PRL和POU1F1基因及基因聚合对白耳鸡产蛋数的效应分析

以PRL和POU1F1为影响鸡产蛋数的候选基因,采用PCR-SSCP方法检测白耳鸡PRL基因调控区和POU1F1基因外显子3区域的单核苷酸多态性,并分析PRL、POU1F1基因多态位点和两基因聚合基因型与72周龄产蛋数的关联。结果表明:PRL调控区的插入/缺失基因型AA型和POU1F1基因exon3的突变(A5331T)基因型CC型与72周龄产蛋数显著相关(P0.05),AA、CC型对产蛋数的加性效应分别为3.65和3.57。聚合基因型AACC型个体72周龄产蛋数(除AACD型外)与对照组比较差异显著(P0.05)。两基因间的互作效应并不显著(P0.05)。     

贵州柳源香鸡mtDNA控制区的遗传多样性分析

为研究柳源香鸡与瑶山鸡、黔东南小香鸡的亲缘关系,探讨柳源香鸡的起源和品种遗传多态性,采用mtDNA D-loop序列变异对柳源香鸡、瑶山鸡和黔东南小香鸡进行遗传多态性的研究.结果表明:A、G、C和T等4种核苷酸的平均比例分别为25.22％、13.51％、25.82％、35.45％;共发现29个变异位点(不包含种内变异位点),占分析位点总数的3.71％,其中18个转换,11个颠换;具有29种单倍型,其中有11种共享单倍型.群体遗传多态性与亲缘关系分析表明,柳源香鸡个体具有瑶山鸡、黔东南小香鸡的遗传贡献.     

鸡卵球蛋白G_2、G_3多态性与经济性状关系的研究

以新扬州鸡L和I系为材料,研究了卵球蛋白G_2、G_3基因型和经济性状—开产日龄、不同日龄体重、产蛋量及蛋重间可能存在的关系。结果表明:G_2位点基因型与体重、产蛋量和开产日龄相关,基因G_2~D优于G_2~C;G_2、G_3位点基因型间蛋重无显著差异;G_3位点对产蛋量和体重无影响。     

NPY、IGF-1基因对文昌鸡繁殖性状的遗传效应

采用PCR-RFLP技术检测文昌鸡NPY基因和IGF-1基因的多态性,并分析NPY、IGF-1基因对文昌鸡繁殖性能的影响。结果表明:300日龄NPY AA型个体平均产蛋数(88.95枚)与NPY aa型个体平均产蛋数(81.55枚)相比差异显著,NPY基因以加性方式作用,其中300日龄产蛋数加性效应值为-0.252(P<0.05)。IGF-1基因同样以加性方式作用,其中300日龄产蛋数加性效应值为0.199(P<0.05)。300日龄IGF-1 bb型个体平均产蛋数(89.03枚)与IGF-1 BB型个体平均产蛋数(82.61枚)相比差异显著,400日龄IGF-1 bb型个体平均产蛋数(137.84枚)与IGF-1 BB型个体平均产蛋数(127.82枚)相比差异显著;IGF-1 bb型个体平均连产天数(3.38 d)分别与IGF-1的BB、Bb型个体平均连产天数(2.96、2.78 d)相比差异均显著。     

GH基因多态与生长期高邮鸭主要血浆生化指标及部分生产性状的相关分析

测定了200日龄产蛋早期的42只高邮鸭血浆总蛋白(TP)、白蛋白(ALB)、天门冬氨酸氨基转移酶(AST)、丙氨酸氨基转移酶(ALT)、碱性磷酸酶(ALP)、乳酸脱氢酶(LDH)、α-淀粉酶(α-AMY)、总胆固醇(CHO)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)和无机磷(P)共11项生化指标,并与4项生产性状(102 d产蛋数、最长连产天数、开产体重和30周龄蛋重)进行了相关分析;分析了GH基因的遗传多态性及其与血浆生化指标和部分生产性状的关系.结果显示:①11项生化指标中,仅AST活性与开产体重呈极显著负相关(P＜0.01);CHO、LDL-C与开产体重呈负相关,但没有达到显著水平;HDL-C和CHO与蛋重呈正相关,也未达到显著水平.②GH基因第4外显子检测到AA、AB和BB基因型,等位基因B为高邮鸭的优势等位基因,测序分析表明多态位点位于第3 701处,发生了单碱基突变C→T,该突变为同义突变.③经最小二乘分析,BB型个体LDL-C含量显著高于AB杂合型个体,两者的差异达到显著水平(P＜0.05);各基因型个体的血浆其它生化指标虽有差异但并不显著(P＞0.05);各基因型个体间4项生产性状之间差异不显著(P＞0.05).     

淮南麻黄鸡CRBP2基因第3外显子PCR-SSCP多态性及其与蛋品质的相关分析

利用PCR-SSCP和DNA测序技术对淮南麻黄鸡CRBP2基因第3外显子的多态性进行了检测,并分析其与蛋品质的相关性。结果表明:在淮南麻黄鸡样本群中CRBP2基因第3外显子存在C/T的突变位点,共检测到3种基因型(CC、CT和TT),C和T等位基因的频率分别为0.45和0.55,多态信息含量和杂合度分别为0.37和0.47,表明该位点处于中度多态。χ2适合性检验表明淮南麻黄鸡样本群在该位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P0.01)。淮南麻黄鸡CRBP2基因第3外显子各基因型间开产日龄、蛋形指数、蛋壳厚度、蛋壳强度、蛋黄色泽和蛋黄比率差异不显著(P0.05),CC基因型的开产蛋重和30周龄蛋重分别比TT基因型高1.66%和2.60%(P0.05),TT基因型的哈氏单位显著高于CC和CT基因型(P0.05)。     

茶花鸡GDF9基因多态性与产蛋性状的相关性分析

【目的】研究GDF9基因单核苷酸多态性与茶花鸡产蛋性状之间的关系,为进一步阐明该基因的遗传变异提供基础,也为提高茶花鸡产蛋性能的育种工作提供指导。【方法】采用直接测序法筛选SNPs位点,并将不同基因型的开产日龄、体质量及300日龄产蛋数进行差异性分析。采用qPCR检测GDF9基因在茶花鸡高、低产蛋组不同组织中的表达情况。【结果】共检测到5个SNPs位点,分别是g.1642AT、g.1652AG、g.1804AG、g.2008CT和g.2281TC,其中g.1652AG导致异亮氨酸(Ile)突变为缬氨酸(Val)。g.1642AT、g.1652AG、g.1804AG、g.2008CT和g.2281TC位点的优势等位基因分别为A、G、G、T和T;除g.1642AT外,其他位点均符合哈温平衡定律。g.1652AG和g.2281TC属于中度多态位点。关联分析表明:g.1652AG位点AA型开产体质量最高,AG型300日龄产蛋数最高;g.2281TC位点TT型开产日龄最早。GDF9基因在高、低产蛋组的3个组织中表达一致,由高到低依次为卵巢、垂体和下丘脑。【结论】本研究揭示了GDF9基因多态性对云南茶花鸡的产蛋性状存在一定的影响,推测g.1652AG和g.2281TC可能是影响茶花鸡产蛋性状的重要SNPs位点。     

济宁百日鸡FSHβ基因的SNP分析及其与早期产蛋性能的相关性研究

采用PCR-SSCP技术,对70羽济宁百日鸡进行了促卵泡激素β亚基(FSHβ)基因的多态性检测,并对多态性位点进行了克隆测序,统计分析了不同基因型与早期产蛋性能的关系。研究结果表明:在济宁百日鸡FSHβ基因的exon2未发现多态性位点;在exon3区域的2540处发现一个A→C的单核苷酸突变位点。与早期产蛋性能的相关性分析结果表明:FSHβ基因exon3区域的BB型鸡的开产日龄早于AB型和AA型鸡;AB型鸡的43周产蛋量多于AA型和BB型鸡,AA型鸡的畸形蛋数少于AB型和BB型鸡,但三者的差异均不显著(P>0.05)。     

生长分化因子 9 基因的研究进展

目的研究GDF9基因单核苷酸多态性与茶花鸡产蛋性状之间的关系,为进一步阐明该基因的遗传变异提供基础,也为提高茶花鸡产蛋性能的育种工作提供指导。方法采用直接测序法筛选SNPs位点,并将不同基因型的开产日龄、体质量及300日龄产蛋数进行差异性分析。采用qPCR检测GDF9基因在茶花鸡高、低产蛋组不同组织中的表达情况。结果共检测到5个SNPs位点,分别是g.1642A>T、g.1652A>G、g.1804A>G、g.2008C>T和g.2281T>C,其中g.1652A>G导致异亮氨酸(Ile)突变为缬氨酸(Val)。 g.1642A>T、g.1652A>G、g.1804A>G、g.2008C>T和g.2281T>C位点的优势等位基因分别为A、G、G、T和T;除g.1642A>T外,其他位点均符合哈温平衡定律。g.1652A>G和g.2281T>C属于中度多态位点。关联分析表明：g.1652A>G位点AA型开产体质量最高,AG型300日龄产蛋数最高;g.2281T>C位点TT型开产日龄最早。GDF9基因在高、低产蛋组的3个组织中表达一致,由高到低依次为卵巢、垂体和下丘脑。结论本研究揭示了GDF9基因多态性对云南茶花鸡的产蛋性状存在一定的影响,推测g.1652A>G和g.2281T>C可能是影响茶花鸡产蛋性状的重要SNPs位点。