水稻微小RNA研究进展

概括了几年来国内外对水稻微小RNA（microRNA）的研究进展,在水稻中至今已经发现了400多种miRNA,大部分miRNA是通过生物信息学预测发现的,只有少数几种miRNA得到了实验验证。经研究表明,水稻miRNA和其他植物miRNA一样,对调控水稻开花、分蘖、抗逆以及结实率等植物生长发育有着至关重要的作用。     

水稻微小RNA研究进展

概括了几年来国内外对水稻微小RNA(microRNA)的研究进展,在水稻中至今已经发现了400多种miRNA,大部分miRNA是通过生物信息学预测发现的,只有少数几种miRNA得到了实验验证。经研究表明,水稻miRNA和其他植物miRNA一样,对调控水稻开花、分蘖、抗逆以及结实率等植物生长发育有着至关重要的作用。     

microRNA与植物花发育调控的研究进展

microRNAs(miRNAs)是约21nt的非编码RNA,主要在转录后水平调节基因的活性。miRNAs通过与靶基因的互补位点结合从而降解靶基因mRNA或抑制其翻译。miRNAs 参与调控植物生长发育的多个方面,包括生长、开花、代谢、激素应答、生物与非生物胁迫。综述了miRNAs在植物花发育中的研究进展,以期为更好地了解miRNA在此过程中的作用机制,并应用于改良植物的农艺性状及培育优良品种奠定基础。     

RNA干扰的研究进展

RNA干扰（RNAi）是一种由双链RNA诱发的转录后水平的基因沉默现象,是近几年发展起来的基因表达调节新机制,广泛地存在于真菌、植物和动物中。主要介绍了RNAi的发现、分子机制、转基因载体构建策略以及RNAi在生命科学中广阔的应用前景。     

植物表观遗传中的RNA介导的DNA甲基化

植物基因组对基因的表达调控不仅表现在转录水平上,也表现在染色质结构的变化上。在植物中存在着特有的RNA 聚合酶Ⅳ (RNA Pol Ⅳ) 和 RNA聚合酶Ⅴ (RNA Pol Ⅴ),它们与RNA 聚合酶Ⅱ(RNA Pol Ⅱ)相似。RNA Pol Ⅳ和RNA Pol Ⅴ的转录产物包括参与表观遗传调控的长链非编码RNA (lncRNAs)和干扰小RNA (siRNAs)。这类非编码RNA广泛地参与了基因组上发生的胞嘧啶甲基化,去甲基化以及甲基化扩散。近年来,研究已经发现RNA介导的染色质水平的基因沉默涉及植物的生长发育、胁迫应答、表观遗传多态性,并对植物的表型多样化、生理适应性以及植物进化具有显著影响。     

利用高通量测序技术发现植物小分子RNA研究进展

 小分子RNA是一类长约20～30个核苷酸的非编码RNA分子,其介导的转录后基因调控是植物中的一种新型基因调控机制。它在植物的生长发育和适应外界各种环境胁迫的过程中起着非常重要的作用。植物中小分子RNA数量巨大、种类繁多,而高通量测序技术的出现大大加快了它们的发现过程。本文在简要介绍目前已知植物小分子RNA的类型及特点的基础上,综合阐述近年来利用高通量测序技术克隆和分析植物小分子RNA的研究成果,以期反映当前植物小分子RNA的基因组分布规律、功能和进化等方面的最新研究进展。     

植物microRNA研究进展

MicmRNAs（miRNAs）是一类内源非编码小RNA（sRNAs）。在植物中,由初级转录本（pri—miRNA）通过Dicer—like酶（DCL）加工,形成的长度约21～24nt RNAs。miRNA组装的沉默复合体（RISC）,对互补mRNA（靶基因）可进行剪切、调控植物生长发育和胁迫应答等过程。文章对miRNAs的生物合成、鉴定和验证、作用机理和功能及在技术应用等方面进行综述。     

植物microRNA研究进展

MicroRNAs(miRNAs)是一类内源非编码小RNA(sRNAs)。在植物中,由初级转录本(pri-miRNA)通过Dicer-like酶(DCL)加工,形成的长度约21~24ntRNAs。miRNA组装的沉默复合体(RISC),对互补mRNA(靶基因)可进行剪切、调控植物生长发育和胁迫应答等过程。文章对miRNAs的生物合成、鉴定和验证、作用机理和功能及在技术应用等方面进行综述。     

RNA干扰在植物中的应用

RNA干扰是一种进化上保守的机制,存在于植物、动物、真菌等生物中,目前已成为研究热点,在近几年得到了巨大的发展。对RNA干扰技术的发现过程、机制以及特点进行了综述,并对RNA干扰技术在植物上的应用进行了介绍,为相关研究提供信息。     

RNAi及其在植物研究中的应用

综述了RNA1的作用机制,生物学意义以及其在植物及其功能基因组、植物发育及生理代谢途径、 植物基因工程研究中的进展,最后对RNA1的研究应用前景进行了展望。     

家蚕细胞cyclinA基因的干涉对家蚕细胞增殖的影响

[目的]研究小干扰RNA (small interfering RNA,siRNA)对家蚕卵巢细胞系(BmN)细胞cyclinA基因表达及细胞周期的影响.[方法]通过脂质体转染试剂将针对cyclinA基因的特异性siRNA片段转入家蚕BmN细胞,采用SYBR荧光定量PCR法检测cyclinA mRNA的表达,流式细胞技术检测细胞周期变化.[结果]转染siRNA-cyclinA可有效下调cyclinA基因的表达,转染48 h后,cyclinA mRNA表达量降低到对照的37.4％;流式细胞仪分析表明:与对照组相比,转染组Go/G1期细胞比例显著增加,细胞周期阻滞于G1期.[结论]靶向cyclinA基因的siRNA片段,通过下调cyclinA基因表达能有效抑制细胞增殖.     

植物基因沉默机制研究进展

综述了植物体中转录水平、转录后水平基因沉默及RNA干扰（RNAi）导致基因沉默的机制,并阐述了RNAi技术在植物基因工程中的广泛应用。     

微小RNA及其介导的竞争性内源RNA调控网络在意大利蜜蜂工蜂中肠发育过程中的潜在作用

【目的】微小RNA(micro RNA,miRNA)能够通过靶向结合导致m RNA的抑制或降解,从而对基因表达进行负调控。Mi RNA在昆虫的生长、发育、免疫和细胞生命活动调控方面扮演关键角色。本研究旨在对意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)工蜂中肠的差异表达miRNA(differentially expressed miRNA,DEmiRNA)及其调控网络进行深入分析,并结合前期在m RNA、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和环状RNA(circular RNA,circ RNA)组学层面的相关研究结果,系统解析中肠发育过程的miRNA差异表达谱及竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络介导的中肠发育机理。【方法】利用small RNA-seq技术对正常的意蜂7日龄和10日龄工蜂中肠(Am7和Am10)进行测序。将质控后的测序数据比对西方蜜蜂基因组,再将比对上的序列标签(tags)比对到miRBase数据库以鉴定已知miRNA。利用每百万标签序列(tags p...     

RNAi 3种分子加工机制研究进展

RNAi(RNA interference,RNA干扰)是一种高度保守的由小分子RNA介导的基因沉默过程。根据介导RNAi的小RNA长度以及结合Argonaute(AGO)蛋白家族成员的不同,将小RNA分为miRNA(microRNA)、siRNA(small interfering RNA)和piRNA(Piwi-interacting RNA)3类。根据近年来取得的研究进展,系统地阐述了这3类小RNA的基因组来源及其加工产生机制,归纳总结了这3类小RNA之间的区别和联系,并结合当前RNAi应用于疾病治疗存在的问题提出了自己的看法。RNAi机制的完善对于生物进化、生长发育及癌症等重大疑难疾病治疗具有重要的应用价值。     

植物转基因抗性策略研究进展

通过转基因技术使植物获得抗病性是控制植物病毒感染的一种重要技术途径。RNA干扰技术的出现为植物转基因抗性策略的研究提供了新思路。植物转基因抗性产生方法主要是通过表达不同的病毒蛋白(外壳蛋白、复制蛋白、运动蛋白及其他病毒蛋白)、RNAs(反义RNA、卫星RNA、缺陷干扰RNA、发夹RNA及人工微小RNA)、非病毒基因(核酸酶、抗病毒蛋白抑制子及植物体)、宿主来源的抗性基因(显性抗性基因和隐性抗性基因)及各种宿主防御反应因子等。介绍了以上几种抗性策略并分析了目前尚存在的问题,以期为植物转基因抗性策略研究的学者提供参考。     

小鼠早期胚胎发育过程中母源基因降解相关内源性小干扰RNA筛选与鉴定

为探究endo-siRNA在小鼠胚胎母源基因降解过程中的功能,通过生物信息学分析对小鼠母源基因和对应小RNA作筛选与鉴定,研究发现近三分之二母源基因为小RNA靶标。母源基因在早期胚胎发育过程中表达模式分析表明endo-siRNA与母源基因表达呈较强负相关,预示endo-siRNA在母源基因降解过程中具有重要功能。验证表明, endo-siRNA可在转录后水平调控母源mRNA水平,调控母源基因降解。研究结果为哺乳动物母胚转换的相关研究提供理论基础。     

Characterization of MicroRNA* Species in Peking Duck Skin

A substantial fraction of miRNA* species are conserved in animals and can repress activities of target genes. This study aims to investigate the miRNA* species in duck skin by using Solexa sequencing. We obtained a total of 96 miRNA* species in two skin small RNA libraries and identified 56 miRNA/miRNA* (miR/miR*) pairs. Nucleotide bias of miRNA* indicated that the priority was C>A>U>G for the first nucleotide and U>C>A>G for the last nucleotide. Comparison analyses showed that 3′-U accounted for a higher proportion in the 56 miR/miR* pairs. Among the top 20 expressed miRNA* species, 17 were shared by two libraries and most of the miRNA* species were highly conservative, especially in the “seed region”. miR-199a* were expressed highly in our samples, which was also previously shown abundant in mouse hair follicle. Furthermore, four miRNA* species were predicted to target their genes in signal pathways of feather follicle development and feather morphogenesis despite very low levels.