柑橘溃疡病菌的普通LAMP及快速LAMP检测方法的建立

建立柑橘溃疡病菌的普通LAMP和快速LAMP检测方法,使其能应用于基层检验检疫部门对病害的快速检测.利用柑橘溃疡病菌基因组特有的保守区域设计LAMP引物,通过优化反应条件,建立柑橘溃疡病菌的普通LAMP检测体系;在普通LAMP引物的基础上设计一对环引物,建立柑橘溃疡病菌的快速LAMP检测体系,并以多种参比菌DNA以及健康柑橘叶片基因组DNA为模板对普通LAMP和快速LAMP检测体系的特异性进行了验证,利用柑橘溃疡病菌菌液和DNA溶液梯度稀释液对普通LAMP和快速LAMP检测体系的灵敏度进行了验证.普通LAMP检测体系菌体和DNA检测灵敏度分别达到了2.25×104 cfu和2.03×10-1 ng,快速LAMP检测体系菌体和DNA检测灵敏度分别达到了2.25 cfu和2.03×10-5ng.在特异性测试中,普通LAMP检测体系与快速LAMP检测体系均仅对柑橘溃疡病菌进行扩增,对非靶标菌和柑橘叶片基因组DNA不产生扩增,普通LAMP与快速LAMP检测体系特异性测试结果一致.快速LAMP检测体系在0.5h内就可以达到普通LAMP检测体系的扩增量,是普通LAMP检测体系反应时间的一半,大大提高了检测的效率;快速LAMP检测体系菌悬液和DNA检测灵敏度均比普通LAMP检测体系提高了10 000倍.成功地建立了柑橘溃疡病菌的普通LAMP及快速LAMP检测方法,为柑橘溃疡病菌的检测提供了一种新的简便、快速的检测手段.     

柑橘溃疡病菌免疫荧光和生物学检测技术研究

本研究通过对7个不同柑橘品种的离体叶片接种及致病性观察筛选出了柑橘溃疡病菌敏感寄主材料，并建立了柑橘溃疡病菌的生物学检测方法；还初次尝试建立了一种简便易行的柑橘溃疡病菌免疫荧光快速鉴定方法。柑橘离体叶片接种实验结果表明：福本、红肉脐橙、纽荷尔和枳壳对柑橘溃疡病菌表现出一定的感病性，而粗柠檬和邓肯葡萄柚未表现出明显感病迹象，反而出现了坏死性应激反应。免疫荧光试验结果显示：浓度为10^3cfu／mL的菌液在30℃下用BSA封闭2h，30℃下抗体结合1h，荧光抗体浓度为4μg,／mL，室温放置40min后镜检，就可以在荧光显微镜下清晰地看到绿色的柑橘溃疡病菌体，而用该方法检测不到水稻白叶枯病菌。用免疫荧光抗体检测柑橘溃疡病菌操作简便，仅需一台荧光显微镜，整个检测过程仅需要4h。     

柑橘溃疡病菌检测方法及其在检疫中的优选

采用常规检测法、免疫斑点法、酶联免疫检测法和PCR检测法对柑橘溃疡病菌纯培养和柑橘叶片提取液进行平行测定。结果表明,对柑橘叶片提取液的检测,4种检测法检出的样品带菌率分别为11.12%、27.22%、18.69%、20.31%;对柑橘溃疡病菌纯培养的检测,4种方法检测结果一致。本实验同时比较了几种方法的灵敏度、特异性和稳定性,以及不同方法在各级检验检疫中的适应性。     

番茄溃疡病菌PCR快速检测技术

番茄溃疡病是一种严重危害番茄生产的细菌性病害，许多国家将其列为检疫性病害。利用ITS通用引物扩增了番茄溃疡病菌（Clavibacter michiganensis subsp．michiganensis）的ITS序列，并进行克隆测序。根据序列比较结果设计了引物BT1和BT2，该引物特异性好，能专一扩增出268bp电泳条带，而马铃薯环腐病菌等不同亚种、不同属的细菌及健康的番茄材料均无扩增条带。从接种但未显症番茄苗叶片及人工模拟染菌种子上提取总DNA，以此为模板均能稳定地扩增出特异性目的条带。该方法直接对种子或植株进行检测，不需进行病原菌分离培养，快速简便，适用于出入境检验检疫及种苗健康检测领域。     

利用EMAqPCR建立快速检测猕猴桃溃疡病菌活菌的方法

利用叠氮溴乙锭(ethidium monoazide bromide,EMA)与实时荧光定量PCR技术相结合(EMA-qPCR),建立了一种有效快速检测猕猴桃溃疡病菌活菌的方法。以猕猴桃溃疡病菌ITS序列为检测靶标,菌体经EMA渗透处理,再进行qPCR特异性扩增。结果显示,qPCR检测灵敏度为2cfu;当EMA的浓度为2.0μg/mL时,能有效抑制1.0×10~7 cfu/mL经高温灭活的死菌的扩增,对活菌的扩增没有影响。当活菌数在1.0×10~1~1.0×10~5 cfu范围内,每个qPCR反应体系中活菌数与Ct值呈线性相关(R~2=0.988)。不同温度处理活菌菌悬液后用EMA-qPCR检测猕猴桃溃疡病菌的存活情况并与平板计数法进行比较,结果表明待检样品可在4℃和20℃短期保存。对疑似带病猕猴桃材料进行EMA-qPCR检测,结果表明能减少猕猴桃溃疡病菌PCR的假阳性结果。本研究建立的EMAqPCR方法是一种有效检测猕猴桃溃疡病菌活菌的方法,能有效避免PCR检测实际样品可能造成的假阳性结果。     

进境柠檬样品上柑桔溃疡病菌的检测

从进境柠檬样品上分离到一株疑似柑桔溃疡病菌的分离物X206,对分离物进行了菌落形态学特征观察、16S r RNA序列测定、PCR检测、Biolog测定及致病性测试。试验结果表明分离物X206在NA培养基上形成黄色,有光泽,圆形,全缘,微隆起,粘稠状的菌落。特异引物Xac01/Xac02扩增分离物X206的DNA得到582bp的预期产物,产物序列与柑桔溃疡病菌序列的相似性为100%。其16S r RNA序列与柑桔溃疡病菌的序列完全一致。Biolog测定将分离物X206和柑桔溃疡病菌阳性菌株FZ01均鉴定为Xanthomonas campestris pv.dieffenbachiae。致病性测试显示分离物X206能导致柑桔叶片产生明显的溃疡病斑。根据试验结果将分离物X206鉴定为柑桔溃疡病菌(Xanthomonas axonopodis pv.citri)。     

番茄溃疡病菌的PCR-DHPLC快速检测

根据番茄溃疡病菌ITS序列,设计并合成了PCR-DHPLC检测引物,对番茄溃疡病菌及其他病菌共10个标准菌株进行了PCR-DHPLC检测。结果表明,番茄溃疡病菌的PCR-DHPLC检测图谱出现了特异性吸收峰,而其他病菌均未在相同洗脱时间出现吸收峰,说明这种方法具有检测番茄溃疡病菌的特异性。灵敏度实验结果表明,PCR-DHPLC体系与PCR-琼脂糖凝胶电泳体系的检测灵敏度一致。研究表明,PCR-DHPLC方法是一种特异、灵敏、快速的番茄溃疡病菌检测方法。     

柑橘溃疡病检疫与防治

细菌性溃疡病是严重危害世界柑橘产业的重大检疫性病害之一,柑橘溃疡病引起落叶、枯枝和落果,溃疡病斑导致果品质量降低,影响外贸出口。世界各国长期以来对病害采取严格苗木检疫、疫区病树铲除、零星病害药剂防控的综合治理措施;新近美国农业部推出"柑橘健康种植行动计划";2007年7月中国农业部正式启动"柑橘非疫区建设和维护"项目,总体目标在于防控柑橘溃疡病的发生和传播,确保柑橘产业的安全。     

柑橘溃疡病菌在湖北省越冬期适存性的研究

采用栽种易感病的脐橙苗实测法和以供检材料的浸提液或高速离心浓缩浸提液针刺接种脐橙叶片的致病性检测方法,对柑橘溃疡病菌在湖北省越冬期的适存性进行了研究。结果表明:柑橘溃疡病菌在湖北省主要在病株的病斑内越冬,也有少量能以潜伏侵染的方式在病株的未显症叶片内越冬,成为翌年的初次侵染来源;病原菌不能在田间的病落叶、土壤和杂草上越冬。     

柑桔溃疡病菌的分子生物学研究进展

柑桔溃疡病菌 (Xanthomonasax onopodispv .citri)属重要的国内外检疫性有害生物 ,由其引起的柑桔溃疡病对柑橘产量和苗木及果品进出口影响极大。随着分子生物技术的研究进展 ,对柑桔溃疡病菌的菌系鉴别与系统分类 ,全基因组测序以及检测研究等方面都进入了分子水平。本文从柑桔溃疡病菌的分类地位演变、全基因组测序的完成及其在病害的分子快速鉴定技术上的应用作了详细的评述。1　柑桔溃疡病菌的分类研究随着黄单胞杆菌属 (XanthomonasDow son 1 939)属下分种或分型的演变 ,柑桔溃疡病菌的种名也发生了较大的变化 ,尤其是分子生物学的发…     

Development of a simplified NASBA protocol for detecting viable cells of the citrus pathogen Xanthomonas citri subsp. citri under different treatments

Nucleic acid sequence based amplification (NASBA) is a method of amplifying RNA, for the detection of RNA viruses and human pathogenic bacteria. Recently, NASBA has also been employed for the detection of plant diseases caused by viruses and quarantine bacteria. A major citrus pathogen, Xanthomonas citri subsp. citri (Xcc), causal agent of citrus bacterial canker, is being studied in depth due to its economic importance, with recent focus concentrating on its viability and survival under different stress conditions and control treatments. In this work, a NASBA protocol using primers for gumD mRNA has been developed to assess the viability of this pathogen under different bacteriocidal treatments. This method is rapid, specific and sensitive, and is able to detect viable bacterial cells, using a hybridization device which allows the visualization of the results in only 30 min. The usefulness of the method has been confirmed with bacterial suspensions subjected to different heat treatments and to sodium orthophenylphenate.     

壳聚糖和2株芽孢杆菌对柑橘溃疡病菌的杀菌效果评价

柑橘溃疡病是重要的柑橘细菌性病害,为探明壳聚糖和枯草芽孢杆菌对柑橘溃疡病的防治潜力,本文用平板菌落计数法评价了3种粘度壳聚糖对柑橘溃疡病菌的杀菌效果,以改良的纸碟法测定2株枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)发酵液对柑橘溃疡病菌的抑菌效果。综合处理0.5 h、3 h和6 h的结果显示,3种粘度壳聚糖对柑橘溃疡病的杀菌强弱依次为:粘度12粘度100粘度20。枯草芽孢杆菌菌株BS 101和54-6在YPG培养基中有氧发酵3 d产生发酵液原液的抑菌圈直径分别为3.45 cm和3.21 cm,比0.1 g/mL氨苄青霉素的抑菌圈分别大45%和35%。可见,发酵液中存在对溃疡病菌高度有效的成分。因此,认为粘度12的壳聚糖和芽孢杆菌菌株BS 101和54-6具有防治柑橘溃疡病的潜力。     

柑橘溃疡病菌抗铜相关基因copA和 copB的克隆及原核表达

 以柑橘溃疡病菌DNA为模板,对抗铜相关基因copA和copB进行了PCR扩增和克隆,获得了大小分别为1 782 bp 和1 095 bp的目标片段。构建了这2个基因的原核表达载体 (pET-copA和pET-copB),并在大肠杆菌 [Escherichia coli BL21(DE3)] 中成功诱导表达。利用原核表达的融合蛋白免疫大耳白兔,制备了抗copA和copB原核表达蛋白的多克隆抗体。用间接ELISA法测定了所制备的多克隆抗体的效价均为1∶6 400。用所制备的抗体分别对copA和copB的原核表达产物进行Western blot分析的结果显示,在相应位置产生了较强的免疫反应条带,表明所制备抗体能特异性地与相应的抗原发生免疫反应。     

柑桔溃疡病菌PCR快速检验检疫技术研究

 柑桔溃疡病是严重影响全世界柑桔生产的重大检疫性病害,根据柑桔溃疡病菌(Xanthomonas axonopodis pv. citri)新近公布的全基因组中独有的保守蛋白基因序列,设计筛选出一对种特异性引物(JYF5/JYR5),能专一地扩增检出柑桔组织表面所带溃疡病菌的DNA靶带(413 bp)。而柑桔叶面附生的非致病性黄单胞菌、野油菜黄单胞菌近缘种以及健康柑桔样品都不能扩增;靶细菌DNA检测下限1.56 pg/μL,靶细菌悬浮液检测下限10 cfu/μL;在不同PCR仪及各种控温方式下都能稳定地扩增出特征性靶带。这一特异、准确的柑桔溃疡病菌PCR检验技术和研制的预包被固相化PCR检测试剂盒已开始用于我国非疫生产区建设中柑桔苗木、果实的病害检疫检验。     

柑桔溃疡病菌对杀菌剂拌种灵抗逆性生理研究

在离体条件下对柑桔溃疡病菌 Xanthomonas citri胞外产物的分泌量、胞外蛋白酶活性、拌种灵的作用动态进行了测定 ,并对病原菌细胞的超微结构进行了电镜观察。结果表明 ,在一定浓度拌种灵的选择压力下 ,柑桔溃疡病菌胞外产物及胞外多糖的分泌量增多 ,胞外蛋白酶的活性在拌种灵浓度低于 10 μg/m L时亦增高 ,但胞外蛋白的产量受到抑制。接触药剂的菌体细胞原生质浓缩。胞外产物对拌种灵具有拮抗作用 ,从而对菌体细胞产生保护功效。     

柑桔溃疡病菌抗药突变体的生理特性研究

 经药剂驯化和紫外光诱导双重作用可获得柑桔溃疡病菌抗拌种灵突变体(XcR),病原菌抗药突变频率低于10-6。Xc R的生长速率与敏感菌株基本一致,对萎锈灵和叶枯唑具有潜在的正交互抗性,与浸种灵没有交互抗性。XcR胞外产物和胞外水解酶活性一般多于或高于敏感菌株,其中以淀粉酶活性变化最为明显。Xc R琥珀酸脱氢酶活性显著降低,并对拌种灵的敏感性亦降低。XcR能够引起烟草的过敏性反应,但失去对寄主的致病性。Xc R的性质表明,柑桔溃疡病菌对拌种灵产生抗药性的风险较低,病原菌获得抗药性状的同时可能导致其在田间的适合度下降。琥珀酸脱氢酶的活性可作为柑桔溃疡病菌抗药性的标记。