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柴松遗传多样性的RAPD分析 总被引:1,自引:0,他引:1
以柴松现存2个居群各50个个体为样本,利用随机扩增多态DNA(RAPD)标记研究了其遗传多样性。50条引物共扩增出349个位点,其中多态位点为321个。用POPGEN32版软件对数据进行了分析,结果表明:(1)柴松的遗传多样性水平很高。在物种水平上,多态位点百分率(PPB)为92.51%,Nei’s基因多样度指数(H)为0.317 3,Shannon多样性信息指数(I)为0.478 2,总基因多样度(Ht)为0.317 4。在居群水平上,平均多态位点百分率为89.92%,H和I平均值分别为0.302 5和0.456 6;(2)居群间的遗传分化较低。居群间遗传分化系数(Gst)为0.046 7,基因流(Nm)为10.201 8,Shannon’s居群分化系数((Isp-Ipop)/Isp)为0.045 2。表明柴松的遗传变异主要存在于居群内,占总变异的95%以上,居群间的遗传变异不足5%。并根据柴松的遗传多样性现状提出了相应的保护策略和措施。 相似文献
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辣椒遗传多样性的RAPD分析 总被引:19,自引:0,他引:19
利用RAPD标记对从国内外收集的灯笼椒、长椒、圆锥椒和簇生椒等1年生辣椒(CapsicumannuumL.)自交系和杂交组合的遗传多样性进行了研究.采用14个随机引物、22个参试材料共扩增出1258条带,其中多态条带比率(PPB)接近50%,表明供试辣椒之间的遗传基础较窄.D=0.69时,聚类分析将供试材料分为3类:灯笼椒,圆锥椒,第三类包括簇生椒(朝天椒)和长辣椒(牛角椒);D=0.75时,供试材料分成4类,将簇生椒和长辣椒区分开来;D=0.77时,进一步区分长椒的杂种一代和自交系.聚类分析结果表明,4个辣椒变种中,簇生椒与长椒亲缘关系较近,与圆锥椒次之,与灯笼椒最远. 相似文献
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芥菜遗传多样性的RAPD分析 总被引:3,自引:1,他引:3
随机扩增多态性DNA(RAPD)是一种新的分子标记技术,利用RAPD标记对芥菜(Brassica juncea Cossa)16个变种的遗传多样性进行了分析,从60个10bp随机引5物中筛选出27个有效的,这27个有效引物共扩增出336条DNA带,其中275条为多态性带,占总数的81.85%,平均每个引物扩增出的DNA带数为12.44,不同引物扩增出各自不同的DNA指纹图谱,大部分图谱均有特征或特 相似文献
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用RAPD技术对南阳牛种质资源的DNA进行检测,采用Popgene软件对扩增结果进行统计分析表明:筛选的16个引物共得到了236条扩增DNA片断,其中89.7%的扩增条带表现出多态性。平均每个位点有1.989 6个等位基因,有效等位基因数为1.233 3。Nei遗传多样性指数为0.159 7,Shannon's遗传多样性指数为0.270 3。种群总的遗传多样性Ht为0.163 7,种群内的遗传多样性Hs为0.130 5,种群的基因分化系数为0.202 8,种群间的基因流为1.965 3。 相似文献
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西葫芦种质资源遗传多样性的RAPD分析 总被引:2,自引:0,他引:2
为了给西葫芦资源合理利用和新品种选育提供参考,利用RAPD标记对21份西葫芦种质资源的遗传多样性进行了分析,从43条随机引物中筛选出25条多态性高、重复性好的引物,共获得285条DNA谱带,其中267条为多态性带,多态率达93.68%,平均每个引物可扩增出11.4条带。利用DPS软件建立了21种西葫芦材料的聚类分析树状图,聚类分析结果显示:在遗传距离为10.86处,21种西葫芦材料可分为三类,而在这其中8号和9号材料的亲缘关系最近,而12号材料与其它材料的亲缘关系最远。 相似文献
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[目的]对采自乌鲁木齐、三坪农场和阜康222团的棉铃虫从分子水平上进行遗传多样性分析.[方法]利用RAPD( Random Amplified Polymorphic DNA)技术.[结果]筛选出11条引物,并利用这些引物对棉铃虫的5个种群进行遗传分化的研究.222团番茄种群棉铃虫遗传多样性水平最高,乌鲁木齐玉米种群其次,昌吉南瓜种群最低.[结论]玉米、苘麻和棉花三种不同寄主间,棉铃虫基因交流更频繁;同阜康相比,昌吉和乌鲁木齐两个地理位置的棉铃虫更易进行基因交流. 相似文献
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芸薹种蔬菜遗传多样性的RAPD初步分析 总被引:1,自引:0,他引:1
本文对芸薹种蔬菜基因组DNA进行了RAPD初步分析,并就RAPD-PCR反应条件的优化进行了探讨。结果表明:各个亚种或变种的品种之间存在着丰富的遗传多样性。 相似文献
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生物遗传多样性和系统学研究中的RAPD分析 总被引:4,自引:0,他引:4
韩雅莉 《内蒙古农牧学院学报》1999,20(2):1-4
论述了物种遗传多样性的概念,并对随机扩增多态性DNA分析方法的原理,特点以及应用范围进行了介绍,并对其优点和缺点进行了评论,总结了国内外这方面的研究进展,认为随机扩增多态性DAN技术是研究生物遗传多样性的重要方法。 相似文献
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[目的]找出一种适合杏鲍菇自身的分子标记方法,为其亲缘关系研究提供借鉴。[方法]利用随机扩增多样性DNA(RAPD)对23种来自我国不同地区的杏鲍菇品种进行遗传多样性分析,寻找一种适合杏鲍菇自身的分子标记方法。[结果]筛选出的12个RAPD引物扩增出谱带121条,多态性谱带95条,多态率为78%,表现出丰富的RAPD多态性;利用NTYS-PC2.1软件进行UPGMA聚类分析,可将该23份材料分为5大类,存在较大的遗传差异性。[结论]RAPD技术用于杏鲍菇遗传多样性的分析是有效的,并且能检测到更高的品种间遗传差异。 相似文献
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DI Hong LIU Zhaojun CHEN Yili 《东北农业大学学报(英文版)》2006,13(1):16-21
DNA fingerprints of 37 PVY resistant potato varieties (clones) were generated using PCR-based RAPD analysis. All 37 varieties were differentiated by banding patterns obtained from 17 primers that generated 164 polymorphisms. Similarity matrices were calculated with the simple matching coefficient. The genetic distance value among them was between 0.27 and 0.50, with average value being 0.35. The average link clustering algorithm was used to construct a dendrogram with Statistica. They were classified into three groups according to clustering results, and the results presented some geographic relationship. Dendrogram showed close genetic relationships between a number of varieties (clones) of similar pedigree. This study has shown that RAPD marker is a useful tool for potato variety identification, differentiation, and estimation of genetic relationships. 相似文献
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Total 69 random primers were screened out through RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) markers to analyze the genetic bands of 32 Kentucky bluegrass cultivars. A total of 197 bands were amplified from 46 primers of them, among which 195 bands were polymorphic. Each primer could amplify one to nine polymorphic bands with an average of 4.3 being amplified from an average of primer. Based on the similarity coefficient analysis of RAPD results, NTSYS software and cluster analysis by using average UPGMA method, the result showed that 18 of 32 cultivars were in group 1, three cultivars were in group 2, two cultivars were in group 3, eight cultivars were in group 4, and there was only one cultivar in group 5, which was C2. 相似文献
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华南三地观光木遗传多样性的RAPD分析 总被引:5,自引:0,他引:5
报道了广东南昆山和始兴都亨、广西靖西三地的观光木Tsoongiodendron odorum居群基因多态性研究的初步结果,应用随机扩增多态DNA(RAPD)分子标记方法,从108个10个碱基的随机引物中获得了18个多态性标记,在3个居群共42个样株中,共检测到78个位点,其中多态位点66个,占84.62%,显示该物种的基因多样性较高,聚类分析结果表明,样品可分为3个居群;广东境内的2个居群间相似性较高,相似性系数达0.832,广西与广东都亨和南昆山2个居群间的相似性较低,相似性系数分别为0.772和0.768,南昆山居群内的基因多样性最高,广东始兴都亨居群的基因多样性最低。广西居群居中。 相似文献
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对国内外学术词汇表(AWL)研究进展进行了综述。首先指出研究AWL的理论意义和实践意义,接着回顾了AWL的起源和发展,介绍了最有影响力的Coxhead的AWL及学者们对它的验证与运用,最后指出AWL的研究对我国的科研和教研具有的重要启示作用。 相似文献
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A total of 69 random primers were screened by using random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers to analyze the genetic bands of 32 Kentucky bluegrass cultivars. A total of 197 bands were amplified ... 相似文献
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为了研究韭菜种质资源的多样性和品种间的相似问题,利用RAPD分子标记技术分析了我国11个地区15个韭菜品种间的遗传多样性。结果表明,采用20条RAPD引物,共扩增出136个条带,其中多态性位点98个,平均多态性比率为72%。依据15个韭菜品种间的Nei’s遗传距离进行UPGMA聚类分析,在遗传距离为0.34处将15个韭菜品种分为4个类群:第1类群包含独根红、兰州白根和南京马鞭韭3个品种;第2类群包含汉中冬韭、上海强韭-3和上海强韭-6 3个品种;第3类群包含四季青、桂林小红根、天津大青苗、新疆白根和嘉兴雪莲5个品种;第4类群包含天津大金钩、环韭、平丰苔韭和抗寒薹韭4个品种。韭菜品种间遗传相似性和来源地之间没有必然的联系。 相似文献
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利用RAPD标记技术对19份克新系列马铃薯品种进行了遗传多样性分析,分别提取19份马铃薯品种的DNA,进行随机引物多态性扩增,从1000条随机引物中初步筛选出7条有多态性的引物进行详细研究,每条RAPD引物扩增出4~9条带,共获得52条带,其中多态性条带为43条;19份马铃薯品种的遗传距离介于0.17~0.72之间,平均值为0.39,平均遗传距离介于0.31~0.51之间;聚类分析结果在GS=0.53处可将克新系列马铃薯品种划分为三类,聚类结果与系谱分析基本相符,同时也说明克新系列马铃薯的遗传基础有所拓宽。研究表明:RAPD标记简便、快速、成本低,适用于分析马铃薯遗传多样性,指导马铃薯育种实践中的亲本组配。 相似文献