淮南猪品种遗传特异性的AFLP分析

试验利用25对引物对河南省地方品种淮南猪及引入品种杜洛克猪、长白猪、大约克猪4个品种猪进行AFLP分析。电泳检测结果发现,25对引物共检测到317条扩增片段,其中多态性片段79条,占24.92%。多态性统计分析表明,长白猪与大约克猪之间的遗传距离指数为0.0070,遗传关系最近;淮南猪与杜洛克猪、大约克猪遗传距离指数相近,分别为0.0073、0.0075,遗传关系较近;淮南猪与长白猪遗传距离指数为0.0078,遗传关系最远。结果显示,河南省地方品种淮南猪相对于其他引入品种特异性强,具有很高的育种价值,同时也证明了AFLP技术可以很好地检测猪种群内的遗传变异及猪种鉴别。     

乌羊遗传多态性的AFLP分析

研究了AFLP标记在乌羊遗传多态性方面应用的可行性和该山羊个体基因组DNA的AFLP扩散结果。实验应用10条人工设计的与接头序列相识别的AFLP选择性引物,用PstⅠ酶切,对15只乌羊基因组DNA进行AFLP反应,共获得116个AFLP标记,单引物获得的标记数在2～21之间,乌羊群体相似系数AFLP研究结果为0．897(0．798～0．976),遗传距离为0.024～0．202之间。该研究为评价乌羊的遗传稳定性提供了相关的参数,准确评价尚待和其它品种对比研究后确定。     

利用AFLP标记遗传距离预测猪经济性状杂种优势的研究

利用扩增片段长度多态性(AFLP)标记,测定6个亲本群体间的遗传距离,并对亲本群体间遗传距离与6个经济性状的杂种优势率相关关系进行分析。结果表明:亲本间遗传距离与日增重、饲料转化率、屠宰率和平均背膘厚的杂种优势率呈正相关,与瘦肉率、眼肌面积的杂种优势率呈负相关;亲本群间AFLP标记遗传距离与杂种优势的相关程度因性状不同而异。     

应用分子标记AFLP建立不同猪种间遗传关系

作者首先在实验室建立了猪的AFLP分析体系。经过筛选,利用16对引物组合构建了中国6个常见猪品种中共计20个样本的AFLP分析图谱,通过统计分析,得到了6个猪品种的遗传距离,并由此构建了聚类分析图。在此基础上,得到了一些品种特异性的片段,这些片段为进一步寻找这些品种特异性的分子标记提供了可能。     

攀西黑山羊群体的AFLP遗传多样性研究

 研究采用随机片段长度多态性分析了攀西地区的5个黑山羊品种（类群）的遗传多样性。结果表明：15对引物共扩增出1003条多态条带,多态频率平均为99.01%,5个黑山羊群体的遗传多样性指数变异范围为0.0136~0.2131,其中建昌黑山羊平均遗传多样性指数最高（0.1346）,攀枝花黑山羊次之（0.1329）,乐至黑山羊最低（0.1101）。5个群体遗传距离范围为0.0062~0.0281,攀枝花黑山羊与建昌黑山羊之间的遗传距离最小（DR=0.0062）,云岭黑山羊与攀枝花黑山羊之间的遗传距离次之（DR=0.0128）,乐至黑山羊与金堂黑山羊间遗传距离最大（DR=0.0281）,金堂黑山羊与其它4个类群遗传距离较大（DR=0.0173-0.0281）,说明攀枝花黑山羊与建昌黑山羊的亲缘关系最近,与云岭黑山羊的亲缘关系较近,乐至黑山羊与金堂黑山羊的亲缘关系最远,金堂黑山羊与其它4个类群遗传距离均比较远。聚类结果与群体地理分布、生态条件差异情况基本一致。     

广西地方猪群体遗传结构、选择信号分析和ROH检测

为深入挖掘广西地方猪种的种质特性相关基因,用50K芯片对巴马香猪和隆林猪进行了基因分型,并下载了陆川猪、东山猪、杜洛克、长白猪和大白猪的60K芯片数据,将数据整合后通过多种软件进行群体遗传结构分析、选择信号分析和ROH检测,并对相关位点和区域进行了基因定位与富集分析.结果显示:隆林猪近交程度最低但可能已经受西方商业猪种...     

用RAPD标记分析6个品种猪的群体遗传结构

用140个10碱基随机引物对引入品种杜洛克猪、长白猪、大白猪、斯格猪及广东地方猪种蓝塘猪、大花白猪的基因组池DNA进行了RAPD分析，并从扩增产物表现为多态的引物中筛选出9个特异性强的引物进行个体DNA的RAPD分析。结果表明：（1）斯格猪与长白猪、蓝塘猪与大花白猪的相似系数较高，聚类关系较近；而个地方猪种与4个引入猪种之间则相应地较低、较远。在4个引入猪种中，除杜洛克猪外，另3个表现出与华南地方猪种相对较近的亲缘关系。（2）引物L－15、J－13可作为地方猪种与引入猪种区别的标记，I－09可作为猪性别区别的标记。（3）4个引入品种的群体内遗传变异程度普遍低于广东两地方猪种，尤以杜洛克猪群体内遗传变异最小；两地方猪种中，蓝塘猪的群体内遗传变异要小于大花白猪。     

野生狗牙根种质资源的AFLP遗传多样性分析

利用AFLP标记对采自非洲以及中国四川、重庆、云南、贵州和西藏五省区的共44份野生狗牙根材料进行遗传多样性分析。10对引物共扩增出462个条带,其中多态性条带有452条,多态性条带比率为97.64%,材料间的遗传相似系数(GS)范围为0.64~0.95,平均GS值为0.76。根据研究结果进行聚类分析和主成分分析,可将供试材料分成五大类,分类结果与材料的地理分布大致相符,呈一定的地域性分布规律。由此可见,丰富的地理生态条件造就了狗牙根资源丰富的遗传多样性和明显的地域性分布规律。     

巴马小型猪和贵州小型猪封闭群的遗传结构分析

巴马小型猪(Bama,BM)和贵州小型猪(Guizhou,GZ)是我国自行培育的2个重要的小型猪封闭群,但长期以来对其群体遗传结构状况并不十分清楚。本试验应用本实验室筛选的32个微卫星位点组合对这2个小型猪封闭群进行了遗传结构分析。结果显示:BM封闭群的平均观察等位基因数和有效等位基因数分别是5.750 0和2.572 7,GZ封闭群的相应参数为6.187 5和3.783 7;2个猪群的平均杂合度分别是0.542 8(BM)和0.697 8(GZ),多态信息含量分别是0.546 9(BM)和0.729 6(GZ)。结果表明:GZ猪群的遗传变异程度略高于BM猪群,但它们都是比较好的封闭群群体,符合封闭群小型猪的遗传要求。     

新疆6个地方绵羊品种遗传多样性的AFLP分析

本试验旨在从分子水平研究绵羊品种之间的遗传多样性,为科学评价新疆地方绵羊种质资源提供依据。利用筛选出的8对E+3/M+3引物,对6个地方绵羊品种基因组DNA进行AFLP扩增。根据AFLP分析结果,统计了每个引物组合在各品种中检测到的多态性条带和特异性条带,计算了6个绵羊品种的遗传相似系数和遗传距离,并构建了UPGMA聚类关系图。结果表明,8对引物组合共得到334条清晰可辨条带,平均每个引物组合产生41.75条多态性标记,多态性条带为103条,多态位点百分率为30.838%,同时各品种中还检测出特异性条带。通过UPGMA聚类分析,将6个地方绵羊品种种群划分为2类。因此,6个地方绵羊品种均得到较丰富的遗传多样性,其遗传相似系数和聚类结果与各绵羊品种的地理分布及现实状况相吻合。     

4个微卫星标记分析6个鸭群体之间的遗传关系

利用4对微卫星引物（AJ272577、AJ272578、AJ272579和AJ272580）对6个鸭群体（绍鸭、番鸭、樱桃谷鸭、北京鸭（Z4、Z1）和奥白星鸭）300只鸭的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数、杂合度和遗传距离进行了检测。结果表明：4个微卫星基因座在6个鸭群体中均存在多态性，可以用于鸭的遗传多样性评估；且基因座AJ272578变异最大，基因座AJ272579变异最小，从不同群体来看，北京鸭Z1的遗传变异最大，奥白星鸭的遗传变异最小。基于Nei氏标准遗传距离，采用UPGMA方法构建了系统发生树，将绍鸭和樱桃谷鸭归为一类，北京鸭Z1、奥白星鸭和北京鸭Z4归为一类，番鸭归为一类。鸭的微卫星基因分型技术为检测品种（群体）之间的遗传关系提供了一个有用的工具。     

AFLP标记检测大足黑山羊地方类群遗传多样性的研究

利用AFLP标记技术,从15对引物中选取11对扩增效果较好的引物,对17只大足黑山羊个体DNA进行扩增。结果共扩增出766个条带,其中59条为多态条带,平均每对引物扩增出69．6个条带,平均多态率为5．36％.     

桑天牛不同地理种群遗传分化的AFLP分析

研究桑天牛不同地理种群的遗传分化,为探讨桑天牛在不同区域暴发危害的规律提供理论依据。采用AFLP技术,对6个桑天牛地理种群的DNA进行扩增,5对引物组合得到扩增条带共241条,有多态性条带196条,平均多态性位点比率为81.33%,其中杭州种群具有13条特异条带。遗传距离分析结果:来自河北省的4个桑天牛地理种群间的平均遗传距离为0.270 3;来自浙江杭州的桑天牛种群与来自河南济源的桑天牛种群之间的遗传距离为0.397 2,二者与河北省的4个桑天牛地理种群间的平均遗传距离分别为0.418 2、0.333 4。聚类分析也显示,地理上相距越远,桑天牛种群间的遗传分化越大。     

运用微卫星标记分析11个鸭种(群)的亲缘关系

利用9个微卫星标记对11个鸭种（群）的平均基因杂合度、多态信息含量以及群体间的亲缘关系进行分析.结果11个鸭种的平均基因杂合度为0.659 9;平均多态信息含量为0.596 6.其中,黑羽番鸭（白头）平均基因杂合度最高,为0.694 8,荆江麻鸭平均遗传杂合度最低,为0.575 7.平均多态信息含量也出现了类似的结果,说明黑羽番鸭（白头）遗传多样性最丰富.根据遗传距离构建NJ系统发生树,系统发生树分析结果表明：黑羽番鸭（纯黑）、黑羽番鸭（白头）、白羽番鸭聚为第1类群;山麻鸭、金定鸭、高邮鸭聚为第2类群;苏牧白羽鸭、苏牧黑羽鸭、龙白鸭、苏牧麻鸭、荆江麻鸭聚为第3类群.     

猪的遗传标记和系统地位

从猪品种的体型外貌、染色体带型、血型和蛋白质以及DNA分子水平等几个方面的遗传标记及遗传多样性进行了论述，并对其系统地位作了分析。     

AFLP分子标记对9份狗牙根材料的鉴定分析

狗牙根(Cynodon dactylon)是全球最重要、品种最丰富的暖季型草坪草种之一,种或品种间形态相近,采用传统形态学和田间小区试验等方法难以作出鉴定,本试验利用AFLP分子标记技术,对9份常用狗牙根材料的遗传多样性进行了分析.结果表明:13对引物共扩增出1326个条带,平均每对引物扩增出93.2条带,其中多态性条带有1212条,多态性条带比率为91.71％,材料间遗传相似系数(GS)为0.469～0.797,变幅为0.328.聚类分析表明,在GS值为0.648处,可将9份常用狗牙根材料分为5类:T-419、小矮人和老鹰草为一类,摄政王单独为一类,瑞拉和黑杰克为一类,南京狗牙根和普通狗牙根