如皋黄鸡42日龄体重母体遗传效应评估

随着遗传模型和计算方法的发展,动物遗传育种研究中可以应用复杂模型分析大数据集,文章应用6种模型分析如皋黄鸡42日龄体重方差组分和遗传力。收集2010-2013年如皋黄鸡生产记录,包括8575只鸡的22 935条体重记录,利用WOMBAT软件以平均信息约束最大似然法(AIREML)分析表型方差组分。应用动物模型时考虑了加性效应、母体遗传效应和环境效应,对不同日龄体重进行了标准化。以AIC值、BIC值以及似然比值选择最优模型。结果表明:如皋黄鸡42日龄体重性状遗传模型应考虑加性遗传效应、母体遗传效应和母体环境效应;如皋黄鸡42日龄遗传力为0.33±0.02,母体遗传效应可以解释8%表型方差,加性遗传与母体遗传呈现负相关。遗传分析结果显示42日龄体重属于中低遗传力性状,因此应用动物模型-BLUP方法估计育种值更有效。     

42日龄如皋黄鸡体重间接遗传效应分析

【目的】动物个体遗传物质除了调控自身表型之外,还通过资源分配或行为互动影响同伴性能表现,称之为间接遗传效应。畜禽选育时,遗传模型如果包含了间接遗传效应,不仅有利于改善个体间社会关系,还可以获得更多的遗传进展。研究以饲养于群体笼内如皋黄鸡为试材,以间接遗传模型评估体重数据,旨在为如皋黄鸡选育提供支持。【方法】体重数据采集自如皋黄鸡选育群体,试验鸡于42日龄称重,收集原始数据11 983条。数据清洗包括去除超出三倍标准差的离群值、去除翅号遗失个体、去除性别不明个体以及去除单笼养殖量少于4只的记录。系谱数据包含12 208只鸡：11 735只鸡有体重记录,473只鸡没有体重记录;10 560只鸡没有后代,1 648只鸡有后代,其中种公鸡208只,种母鸡1 440只。以SPSS软件中的单因素方差分析检验环境因素对体重的影响,确定列入固定效应的因子。应用经典动物模型、间接遗传模型分析如皋黄鸡早期体重方差组分及遗传参数,并检验间接遗传方差是否存在稀释效应。遗传模型中包括一般固定效应、固定回归项、加性遗传效应、间接遗传效应、共同环境效应以及残差。研究中,以单笼养殖量作为固定回归项,将加性遗传效应、间接遗传效应、共同环境效应列为随机项。稀释参数起始值设定为0,依次以0.1幅度递增至1.0,经AIC、BIC筛选,稀释参数宜设定为0。由于残差异质化处理没有改变遗传参数和方差组分,因此残差做同质化处理。以WOMBAT软件分析方差组分及遗传参数,计算结果达到收敛标准。【结果】影响如皋黄鸡体重的固定效应包括批次、层级、性别;42日龄如皋黄鸡体重受间接遗传效应影响,加性遗传力为0.54±0.02,总遗传力为0.66±0.06;同笼如皋黄鸡个体间以互助关系为主,加性遗传与间接遗传选择方向一致,遗传相关系数为0.41;育成期如皋黄鸡间接遗传方差不存在稀释效应;如皋黄鸡公鸡与母鸡间接遗传效应表现不同,遗传力、遗传相关系数也存在明显差异。【结论】间接遗传模型可用于蛋鸡早期体重遗传评估及选育。相比于传统动物模型,间接遗传模型可以额外获得遗传进展。     

纯系肉鸽28日龄体重遗传力和近交系数分析

为评估'天山雪'肉鸽纯系经过多世代选育后的群体近交情况,并分析28日龄肉鸽体重遗传力,收集了连续4个世代942只肉鸽个体的系谱资料,以及第4世代231个个体的28日龄体重数据,采用ASReml软件动物模型估计了肉鸽28日龄体重的遗传力,并计算了各世代的群体平均近交系数.结果表明:'天山雪'肉鸽纯系28日龄平均体重为(6...     

应用贝叶斯算法评估如皋黄鸡40周龄体重母体遗传、显性遗传效应

文章旨在评估亲本印记及显性遗传效应对如皋黄鸡40周龄体重表型方差的影响。收集2009~2011年如皋黄鸡生产记录,包括3 890只鸡的产蛋高峰期体重记录,以贝叶斯算法分析表型方差组分。应用动物模型时考虑加性遗传、母体遗传以及显性遗传效应,对不同日龄体重进行标准化,以DIC值选择最优模型。结果表明,如皋黄鸡40周龄体重性状遗传模型应考虑加性遗传效应和母体遗传效应;如皋黄鸡40周龄遗传力为0.45,母体遗传效应可解释6%表型方差;如皋黄鸡40周龄体重基本不受显性遗传效应影响。遗传分析结果显示40周龄体重属于中等遗传力性状,可以利用母体遗传效应估计育种值进行专门化选育。     

如皋黄鸡开产性状加性遗传及母体遗传效应分析

【目的】以动物模型分析加性遗传、母体遗传对如皋黄鸡开产性状的影响,并计算开产性状遗传参数。【方法】收集如皋黄鸡2009—2012年生产数据,包括10 454个动物个体、31 362条生产记录。依据是否考量母体效应,设计4种统计模型。利用WOMBAT软件以平均信息约束最大似然法(AIREML)剖分表型方差,以似然比统计值检验模型适用性。以单性状模型分析遗传力,以多性状模型分析遗传相关系数和表型相关系数。【结果】母体环境对开产日龄有显著的影响,模型II为开产日龄最适模型,开产日龄遗传力为0.28±0.02;母体遗传对平均开产蛋质量影响显著,模型III适合计算开产蛋质量遗传力,开产蛋质量加性遗传力为0.23±0.02、母体遗传力为0.03±0.01;母体遗传和母体环境对开产体质量有显著影响,开产体质量加性遗传力为0.34±0.03、母体遗传力为0.04±0.01,模型IV为开产体质量最适模型。如皋黄鸡开产蛋质量、开产体质量加性遗传与母体遗传存在负相关。开产体质量、开产蛋质量与开产日龄之间的遗传相关系数分别为0.36±0.07、0.33±0.07,开产蛋质量与开产体质量之间的遗传相关系数为0.65±0.05。【结论】如皋黄鸡开产日龄、开产体质量、开产蛋质量等开产性状均受母体效应影响,且遗传力较低。     

如皋黄鸡

一、品种来源 如皋黄鸡属蛋肉兼用型地方品种鸡．主要分布于江苏省如皋、如东、通州及泰兴、姜堰等地，由江苏省如皋市畜牧兽医站、如皋市万生黄鸡原种场选育而成。2005年通过省级品种审定。     

基于随机回归模型的如皋黄鸡产蛋数遗传参数分析

【目的】应用随机回归模型分析如皋黄鸡产蛋数的方差组分和遗传参数。【方法】收集2009-2012年如皋黄鸡的生产记录,包括9 298只蛋鸡的46 327条月产蛋记录。应用随机回归模型分析时将Legendre多项式嵌入加性遗传效应、永久环境效应以及固定效应,各产蛋月以不同的残差效应处理。加性遗传与永久环境效应分别以1~4阶Legendre多项式评估,以AIC、BIC以及残差值选择最优模型。利用WOMBAT软件以平均信息约束最大似然法(AIREML)分析表型方差组分。【结果】如皋黄鸡月产蛋数遗传力为0.05~0.32;开产第2月产蛋数遗传力最低,第1~2月的产蛋数遗传力在0.1以下,第3~7月产蛋数遗传力为0.20~0.32;如皋黄鸡第1个月产蛋数与其他月份产蛋数遗传相关系数较低,相邻产蛋月遗传相关系数较高。【结论】如皋黄鸡产蛋数遗传力较低;随机回归模型适用于地方鸡产蛋数遗传参数估算。     

新扬州鸡早期体重的遗传力估计

在新扬州鸡随机交配大群中,按家系随机选择不同年份的新扬州鸡2批,采用约束极大似然法对新扬州鸡早期体重遗传力进行估计。结果表明:初生和2、4、6、8周龄5个不同时期体重遗传力中等,遗传力为0.3096～0.5684,达到或接近显著水平(P<0.05);2、4、6及8周龄4个不同时期体重遗传力为0.30～0.44;初生重遗传力较高,接近0.60。     

大黄鱼40日龄体长和体重遗传力估计

应用数量遗传学原理和全同胞组内相关法估计了40日龄大黄鱼的体长和体重遗传力,通过巢式平衡设计和人工授精技术,构建了5个半同胞家系和15个全同胞家系,利用SAS9．0软件的一般线性模型（GLM）计算表型变量的方差组分,估计体长和体重性状的遗传力．结果表明：大黄鱼鱼种阶段体重和体长遗传力分别为0．29和0．31．t检验显示两个性状遗传力的估计值均不显著,且雄性遗传方差组分大于雌性遗传方差组分,说明雄性遗传方差组分存在非加性效应或受环境影响较大．     

国家级畜禽遗传资源——如皋黄鸡

1如皋黄鸡的起源如皋黄鸡,俗称＂三黄鸡＂,＂草三黄＂。中心产区以江苏省如皋市为主,分布于毗邻的如东、海安、泰兴、通州等地。产区如皋市位于长江下游北岸,北纬32°～32.3°,东经120.2°～120.5°,滨江临海,地势平坦,属江海冲积平原区,海拔2~6米,气候属北亚热带湿润气候区,气候温和,雨水充沛,     

宁都黄鸡卵巢中卵泡生长速度的研究

试验以我省名地方鸡种－宁都黄鸡成年母鸡为研究对象，每天间隔饲喂脂类染色剂ＳｕｄａｎⅢＳｕｄａｎＢｌａｃｋ，其卵泡因其脂质被染色而形成红墨相间的染色环，根据染色环圈数判断卵泡成熟前迅速生长的天然，根据染色环半径计算出卵泡第天沉积量。     

宁都黄鸡体尺选育及肉质性状比较的研究

自 1997年始 ,宁都黄鸡每世代均作体尺和屠宰测定 ,并于 1998年和 2 0 0 2年作了肉质测定。结果表明 ,在体尺方面 ,变化最小的是体态结构指数 ,母鸡变化最大的是耻骨间距离加大 ,公鸡变化最大的是胸骨长和胸宽加大 :国内 18个地方品种鸡作肉质性状比较后表明 ,宁都黄鸡在肌肉氨基酸总含量、鲜味和甜鲜味氨基酸含量、亚麻酸含量 ,肌肉系水力、芥子酸含量、肌纤维直径、肌肉失水率等 7个方面处于优势地位 ,而肌肉蛋白质含量、不饱和脂肪酸含量、肌纤维密度、熟肉率、胸肌率和腿肌率等 6个方面亦表现出很高水平。     

泥鳅养成品形态性状与体质量和净体质量的相互关系

[目的]探索泥鳅形态性状与体质量、净体质量的相互关系,为泥鳅的苗种选育工作提供科学依据.[方法]随机选取120尾放养于池塘生境的12月龄泥鳅同生群体为研究对象,逐一测量其体质量(BW)、净体质量(NW)、全长(X1)、体长(X2)、肛长(X3)、肛后长(X4)、肛围(X5)、肛部体高(X6)、肛部体宽(X7)、头长(X8)、头高(X9)、头宽(X10)、眼间距(X11)、鼻间距(X12)、躯干长(X13)、体高(X14)、体宽(X15)、尾柄长(X16)、尾柄高(X17)、背鳍周长(X18)、背鳍部体高(X19)、吻长(X20)和背前区长(X21)共23项性状,采用相关分析、通径分析和多元回归分析方法研究泥鳅形态性状对体质量、净体质量的影响效应.[结果]各项形态性状与体质量和净体质量的相关系数均达极显著水平(P<0.01);经通径分析发现,被保留的形态性状为全长(X1)、背鳍部体高(X19)和吻长(X20)3项,其对体质量、净体质量的决定系数总和分别为0.863和0.866,其中以背鳍部体高(X19)对体质量和净体质量直接作用最大,通径系数分别为0.490和0.487,全长(X1)对体质量和净体质量间接作用最大,通径系数分别为0.361和0.357;被保留形态性状与体质量和净体质量的多元回归方程分别为BW=0.103X+0.745X9+0.279X20-10.092和NW=0.104X1+0.783X19+0.269X200-17.115.[结论]背鳍部体高可作为泥鳅苗种选育的核心性状,而全长可作为泥鳅苗种选育的相对重要性状.     

Quantitative and Qualitative Body Traits of Longling Yellow Goats in China

Quantitative, qualitative and phenotypic body measurements were determined on Longling Yellow goats in Longling of Yunnan Province in China. Body weight was determined at birth and then at 3, 6, 9, 12, 18, 24, 36, and 48 mon of age. Body measurements traits including height at wither （HW）, body length （BL）, heart girth （HG）, chest depth （CD）, and circumference of cannon bone （CCB） were determined at 3, 6, 9, 12, 18, 24, 36, and 48 mon of age. Phenotypic traits including coat colour, horns type, tip horn torsion, nose type, hair on forehead, wattles, ear lobes, black back line, hair on legs, and black hair on belly were determined at 12, 18, 24, 36, and 48 mon of age. Males were heavier （P〈0.01 or P〈0.05） than females; and except for chest depth at 24 mon of age （P 〉 0.05）, all other body measurements were also higher （P 〈 0.01 or P 〈 0.05） in males. HW, BL, CD, HG, and BW increased （P 〈 0.01） with age, except for 48 mon of females （P 〉 0.05）; while CCB did not always increase with age. HG had the highest correlation （P〈0.01） with body weights of both sexes. No differences were observed between the two sexes in the colour of the coat, horn type, tip horn torsion, nose type, ear lobes, black back line, and black hair on belly. However, differences exist between the two sexes in the presence of hair on forehead, wattles and long hair on legs. The female goats absence of tip horn torsion had positive effect on all variables measured at 36 and 48 mort of age （P〈0.01 or P〈0.05）. The presence of wattles was associated with heavier body weights from 18 mort （P〈0.01） of age onward, and also with longer HW, BL and CD （P〈0.01 or P〈0.05） in female goats. Female goats with ear lobes had heavier body weights at 12, 36 and 48 mon （P〈0.01） and longer CCB at 12 and 24 mon of ages （P〈0.05）. Hair on legs and black hair on belly only had partly effect body measurements on 12 mon of Longling Yellow female goats. Results of this study provide valuable information that will assist breeders and genetic improvement specialists when conducting selection and preservation programs in Longling Yellow goats in China.     

四明香鸡体重和体尺性状指标的主成分分析

以四明香鸡为研究对象,分别测定了公鸡91日龄、母鸡119日龄的体重与体尺性状指标,并进行了体重与体尺性状的主成分分析。结果表明：四明香鸡公鸡平均体斜长、龙骨长、胸宽、胸深、骨盆宽、胫长、胫围和体重分别为1884,1057,753,909,606,851,435 cm和1 59113 g,母鸡各项指标平均值分别为1818,1072,730,824,632,720,396 cm和1 64833 g;公鸡体重与体斜长、龙骨长、胸宽、骨盆宽均极显著相关（P<001）;母鸡体重与体斜长、胫长、胫围均极显著相关（P<001）,与胸宽、胸深显著相关（P<005）。从主要成分的特征根和贡献率来看,体重、龙骨长、胸宽和胫长对主成分的贡献率最大,提示今后对四明香鸡的体型性状进行选育时至少应包括以上4个指标。