AFLP分子标记在玉米优良自交系优势群划分中的应用

本文利用AFLP分子标记技术研究了17个玉米优良自交系的遗传多样性, 4个AFLP引物组合分别扩增出30、 30、 44、 41条多态性带, 平均每个引物组合扩出36.25条带, 4个引物组合共扩增出145条带, 每一个引物组合都可将17个自交系完全分开。 利用AFLP数据、 进行聚类分析, 将17个优良自交系聚为6群, 结果表明, 用AFLP标记进     

RAPD标记对喀斯特高海拔山区地方玉米自交系遗传多样性研究

本文利用RAPD分子标记技术研究了适应我国喀斯特高海拔山区地方玉米种质的自交系的遗传多样性,从23条引物对我国喀斯特高海拔山区玉米种质的地方自交系对其进行杂种优势群划分.从90个随机引物中筛选出23个多态性好的引物扩增材料,产生出152条多态带,多态性位点比率为86.1%,通过UPGMA聚类分析,将我国喀斯特高海拔山区玉米地方自交系划分为 6个类群.     

黄瓜自交系及其F1的RAPD分析

利用RAPD标记方法,从分子水平上探测了黄瓜亲本自交系与其杂种F1的遗传差异。用30个引物对11个黄瓜基因型进行了扩增,共检测出234个位点,其中多态性位点167个,占总位点的71.37%,每条引物可扩增2~17条带,平均每条引物产生7.25条带。根据RAPD遗传距离进行分析,杂种F1偏向母本自交系遗传:由亲本自交系间遗传距离可见,黄瓜亲本自交系间的遗传距离为0.123~0.164,说明黄瓜是一种遗传变异较小的蔬菜。作为父本,津研7号自交系与宁阳大刺自交系相比,子代更加继承了津研7号自交系的遗传特性。以上结果与田间性状表现相符。RAPD标记用于黄瓜遗传差异的研究切实可行,其结果可用于育种过程中的亲本选配和分子标记辅助选择。     

引物组合法在利用DNA指纹鉴定玉米自交系真伪中的应用研究

利用ＲＡＰＤ分子标记方法对我国４６个骨干玉米自交系进行了鉴定研究,结果表明,仅用Ａ６,Ｃ６,Ｄ２,Ｆ１０,Ｈ１９,Ｎ１９等６个引物的指纹组合即可将这４６个自交系相互区分开来,不需要针对每个自交系筛选特异性标记,克服了利用特异性标记鉴定玉米自交系的局限性;研究出基于ＷＩＮＤＯＷＳ９８操作平台的玉米ＤＮＡ指纹数据库和指纹分析软件,并且该数据库和分析软件对自交系的数量和引物数量都是开放性的。如果要区分开ｍ个自交系,最多只用ｎ个引物即可,二者的关系是：２＾ｎ≥ｍ。     

利用SSR标记对126份玉米自交系种质类群划分的初探

利用SSR分子标记分析了126份玉米自交系的遗传多样性,初步进行了种质类群的划分.从230对SSR引物中筛选出70对扩增条带清晰稳定具有多态性的引物.结果表明,70对引物在供试材料中共检测出278个等位基因变异,每对引物检测出2～7个等位基因,平均4个.每对引物的多态性信息量(PIC)变化范围为0.444 ～0.835,平均0.682.126个自交系之间的遗传相似系数变化范围为0.576～0.978.利用UPGMA聚类分析方法将126份供试自交系可以划分为A、B两大类群,共6个亚群.     

黑龙江省部分审定玉米品种亲本自交系的遗传多样性分析

黑龙江省气候条件特殊,血缘关系有些混杂,系谱关系已不太清楚,种质资源匮乏问题尤为突出。利用SSR分子标记技术,分析黑龙江省近年来审定玉米品种亲本自交系的遗传多样性,从79对SSR核心引物目录中,选出43对引物对18份玉米自交系和5个标准测验种进行遗传多样性研究,共检测到174个等位基因位点,每对引物检测到2～8个等位基因,平均每个位点的等位基因变异数4.35个,平均多态性信息量为0.586。UPGMA聚类分析结果表明,23份自交系划分为4个类群。结果表明黑龙江省玉米生产上推广品种的亲本自交系仍然集中在兰卡斯特群和瑞德群两大杂种优势群。     

南瓜抗CMV基因的RAPD分子标记筛选

以抗病自交系K01和感病自交系K02杂交后自交所得的F2群体为材料,采用分离群体分析法筛选与南瓜抗CMV基因连锁的RAPD分子标记。通过520个随机引物和310组双引物的RAPD扩增分析,共找到了2个与南瓜抗CMV亲本K01中的抗病基因相连锁的分子标记S4391400和S19 S345600。这2个标记与K01的抗病基因的重组率分别为7.5%和11.8%,遗传距离分别为7.1和11.7 cM。     

213份鲜食玉米自交系的遗传多样性分析

本研究从103对SSR引物中筛选出40对稳定扩增的多态性SSR引物,多态性比率为39.1%,并对213份鲜食玉米自交系的亲缘关系进行分子评价。研究表明,40对SSR标记共扩增出169个等位基因,每个标记位点等位基因数变幅从2到9个,平均等位基因数为4.2。多态性信息含量(PIC)值范围从0.72到0.91,平均每对引物0.82。基于非加权组平均法(UPGMA)聚类分析将供试玉米自交系划分为3个大类群,第3类群又划分7个亚群,遗传聚类分析结果基本与自交系谱系及来源相符。     

110份普通玉米自交系的SSR聚类分析

为了明确110份玉米自交系的亲缘关系,更好地利用和改良玉米自交系,以代表国内主要杂种优势群的4个标准测验种(丹340、黄早4、Mo17、K12)与106份普通玉米自交系为材料,利用SSR分子标记进行遗传多样性分析,选用28对SSR引物对供试材料进行了遗传多样性研究。结果表明,在供试材料中共检测到125个等位基因变异,平均每对引物检测到的等位基因变异为4.46个,变异为2~10个,平均多态性信息量PIC值为0.85,变化范围为0.75~0.94。利用UPGMA聚类分析方法可将110份普通玉米自交系划分为6个类群。     

SSR技术及其在植物遗传育种中的应用

利用１７４对ＳＳＲ引物对４个玉米自交系进行鉴定,详细介绍了一种新的分子标记ＳＳＲ的操作技术。鉴定结果表明,ＳＳＲ在玉米染色体上呈随机分布,可以有效地揭示玉米自交系间的遗传差异,追踪亲本遗传物质在后代中的遗传动态。     

Development of a SCAR marker linked with a MYMV resistance gene in mungbean (Vigna radiata L. Wilczek)

Yellow mosaic disease (YMD) caused by mungbean yellow mosaic virus (MYMV) is the most important disease of mungbean, causing great yield loss. The present investigation was carried out to study the inheritance and identify molecular markers linked with MYMV resistance gene by using F₁, F₂ and 167 F_2 : 8 recombinant inbred lines (RILs) developed from the cross ‘TM‐99‐37’ (resistant) × Mulmarada (susceptible). The F₁ was susceptible, F₂ segregated in 3S:1R phenotypic ratio and RILs segregated in 1S:1R ratio in the field screening indicating that the MYMV resistance gene is governed by a single recessive gene. Of the 140 RAPD primers, 45 primers showing polymorphism in parents were screened using bulked segregant analysis. Three primers amplified specific polymorphic fragments viz. OPB‐07_600, OPC‐06₁₇₅₀ and OPB‐12₈₂₀. The marker OPB‐07₆₀₀ was more closely linked (6.8 cM) with a MYMV resistance gene as compared to OPC‐06₁₇₅₀ (22.8 cM) and OPB‐12₈₂₀ (25.2 cM). The resistance‐specific fragment OPB‐07₆₀₀ was cloned, sequenced and converted into a sequence‐characterized amplified region (SCAR) marker and validated in twenty genotypes with different genetic backgrounds.     

四川省常用玉米自交系SSR遗传多样性分析

利用SSR标记研究了33个玉米自交系的遗传变异,初步进行了杂种优势群划分,从85对SSR引物中筛选出72对扩增产物具有稳定多态性的引物。72对引物在供试材料中共检测出289个等位基因变异,每对引物检测等位基因2～7个,平均4．01个,每个位点的多态性信息量(PIC)变化于0．277～0．792之间,平均为0．599。33个自交系之间的遗传相似系数变化范围为0．5866—0．9247,平均为0．7056。UPGMA聚类分析结果表明,33个供试自交系划分为4大类,其中第1类又分为6个亚类,分类结果与系谱来源基本一致,而且类间平均遗传相似系数均小于类内平均遗传相似系数,表明分类是合理的;同时生产上主要推广杂交种的亲本大多来自不同的大类或亚类;研究表明SSR标记可以进行玉米自交系遗传多样性分析,并用于杂种优势群的划分。本研究还筛选出14对不仅带型稳定、重复性好,而且PIC值较高的引物组成核心引物,可以对供试材料进行初步分析,并认为选用大约50对以上扩增产物稳定、多态性高的引物,对供试材料进行分析就可获得较可靠的划类结果。     

利用RAPD技术鉴定大白菜主栽品种及品种间遗传多样性分析

采用随机引物扩增多态ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）技术分析了２１个大白菜主栽品种。用１３个引物共扩增出８７个清晰可重复的ＤＮＡ片段,其中３９条带具有多态性,多态性条带的频率为４４．８％。ＯＰＥ０１是多态性频率最高的引物,它可区分１５个大白菜品种,再与引物ＯＰＨ０３和ＯＰＨ１２配合,即可将２１个大白菜品种区别开。     

遮光胁迫对玉米植株性状的影响研究

以8个玉米自交系为供试材料,采用2因素裂区设计,在玉米苗期到成熟期遮阴（遮光率为90%）,研究玉米自交系的耐阴性及其在遮光胁迫条件下的植株性状的变化。结果表明：参试材料耐阴湿的程度从高到低为：06CIn967-11>06CIn892-2>06CIn967-4>06CIn892-11>06CIn891-4>06CIn891-15>06C984-2>06C9 84-8,其中,同一来源的自交系耐阴性差异不显著,不同来源的自交系耐阴性有一定差异;在弱光下,玉米材料的雄穗分化、植株和叶片的生长受到了极显著抑制,不同基因型材料的植株性状对遮光的反应也不同;遮光对不同性状的影响不同,对雄穗分化的影响最大。因此可以根据不同材料性状的变化来筛选耐阴材料。     

利用RAPD标记鉴定大豆种质

本研究以５７个中国大豆祖先吕系及育成品种和１８个美国大豆祖先品系为ＤＮＡ样品来源，通过随机引物ＰＣＲ扩增基因组ＤＮＡ的多态性，探索利用ＲＡＰＤ标记鉴定和相关种质的可能性。研究结果表明，５０个１０摩尔随机引物共扩增可分辩产物２４６个，其中８２．４％的随机引物可产生多态性产物，所扩增产物的５４．４％至少在两个基因毒草境存在差异。上ＰＣＲ扩增产物分别以１和０记录存在与否。扩增产物间的成对比较可产生非相似     

Varietal identification in Cichorium intybus L. and determination of genetic purity of F1 hybrid seed samples, based on RAPD markers

Random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were used to distinguish between several Cichorium intybus genotypes, comprising four white witloof inbred lines, three red witloof experimental inbred lines and a number of F1 hybrids derived from two white parents. Amplification conditions and reproducibility of RAPD patterns were examined. Comparison of polymerase chain reaction (PCR) products obtained by using 100 10-mer arbitrary primers allowed identification of all the lines analysed. With several primers, we defined line-specific RAPD markers, while with others polymorphism was more extensive, revealing several RAPD markers for several lines. All the differences were confirmed both on individual heads and young seedlings for each genotype. Because of the Mendelian segregation of these molecular markers, this method was applied to evaluate the genetic purity of F1 hybrid seed samples.     

两种凝胶电泳系统对SSR标记多态性的影响

利用 35个SSR引物和 14个玉米自交系直接比较了 3%Metaphor琼脂糖凝胶和 12 %聚丙烯酰胺凝胶电泳对SSR位点多态性水平的影响。结果表明 ,两种凝胶系统检测出的等位基因数目和基因多态性水平存在显著差异 ,12 %聚丙烯酰胺凝胶在区分微小差异片段能力上明显高于 3%Metaphor琼脂糖凝胶。另一方面在两种电泳检测系统下 ,14个自交系之间的遗传相似系数相关性 (r =0 516)达到了极显著水平 (P <0 0 1)。在 10个具有最大多态性信息量的SSR引物中 ,8个在两种凝胶系统中保持相同。利用 8个引物可以对供试自交系进行初步鉴定。笔者认为 ,3%Metaphor琼脂糖凝胶电泳比较适合在遗传作图或基因定位研究中应用 ;而在品种指纹图谱分析或遗传多样性研究中 ,应采用 12 %聚丙烯酰胺凝胶电泳作为检测工具     

棉花纤维伸长发育期的基因表达分析

利用cDNA芯片技术分析陆地棉显性单基因突变的李氏超短纤维突变体（Li₁li₁）和其野生型（li₁li₁）纤维发育4 DPA（day post anthesis）的基因差异表达情况。RT-PCR验证4DPA芯片结果，得到15个差异表达的EST（expressed sequence tag），其中9个下调表达，即野     

东北地区主要玉米自交系的SSR遗传多样性分析

利用70对扩增产物具有稳定多态性的SSR标记研究了66份玉米自交系的遗传多态性。70对引物在供试材料中共检测出273个等位基因变异,每对引物检测等位基因2~7个,平均3.9个,每个位点的多态性信息量(PIC)变化于0.121~0.814之间,平均0.584。66份自交系之间的遗传相似系数变化范围0.70~0.93。UPGMA聚类分析结果表明,66份供试自交系划分为5个类群,分类结果与系谱来源基本一致,东北地区生产上主要推广杂交种的亲本大多来自不同的类群。     

黄瓜序列特征性扩增区域标记(SCAR)的开发

黄瓜的分子标记连锁图谱研究已经到了比较和整合的阶段,然而可用于黄瓜作图的锚定标记却并不多.本研究利用华北类型和欧洲温室型黄瓜自交系S94和S06作为PCR模板,通过将二者差异的RAPD和SRAP条带克隆、测序并根据测序结果设计特异引物,成功获得了118个SCAR标记.经4个典型黄瓜种质材料PCR验证,引物多态性比例高达10%以上.本研究获得的SCAR可望用于黄瓜遗传图谱的构建和整合.