木质素生物合成酶4CL基因的遗传进化分析

【目的】4CL是木质素生物合成途径中的关键合成酶,通过对4CL基因的遗传进化分析,为其研究和利用提供理论依据。【方法】利用生物信息学手段,对4CL基因完整cDNA和编码氨基酸序列进行数据挖掘,利用Mega软件、ExPASy的Prosite数据库、NCBI的Conserved Domains数据库,进行4CL基因核酸和蛋白质水平上的遗传进化分析。【结果】构建了4CL基因的系统发生树,揭示出植物中的4CL基因聚类与植物分类大体一致,主要以基因家族的形式存在,但基因家族中部分基因存在着结构和功能的分化,4CL基因中存在着GC含量偏高和偏低两大类基因。4CL基因编码的氨基酸序列保守区高度相似,但是在单、双子叶两大类植物之间,其氨基酸平均含量存在着较大差异。【结论】在植物的进化过程中,虽然4CL基因较保守,但部分4CL基因发生了分化,体现在基因的结构和功能方面,在4CL基因的研究中必须充分考虑到这种分化。     

绵羊Leptin基因的进化分析

[目的]为绵羊与其他动物的分子系统进化分析奠定基础。[方法]对绵羊Leptin基因的第23、外显子进行PCR扩增和测序,将测序结果与GenBank中绵羊和7个其他物种中相应序列进行比对,并构建绵羊与其他物种的分子系统进化树。[结果]不同物种的Leptin基因的核苷酸序列有较高的保守性。绵羊与山羊、水牛、奶牛、猪、人、家鼠、鸡的同源性分别为99.5%、98.0%、97.3%、93.4%、88.4%、83.9%、82.4%。系统发生树将这些物种总体上分成2支,家鼠与鸡聚为一支;而绵羊与山羊、水牛、猪和人为另一支。绵羊与山羊亲缘关系最近,而与水牛、奶牛、猪、人、家鼠、鸡亲缘关系渐远。[结论]Leptin基因适于进行物种起源、演化、分类以及系统发生关系的研究。     

动物CACNA2D1基因进化遗传研究

[目的]评估该基因在进化遗传中所受到的选择作用,揭示该基因的结构特征和保守性,为进一步研究该基因的功能奠定基础。[方法]参照NCBI数据库上发表的6种动物CACNA2D1基因编码序列,利用常规生物学软件,对动物CACNA2D1基因进行进化遗传分析。[结果]这6个动物的CACNA2D1基因序列核苷酸组成基本相同,其平均GC含量为42%,偏倚不严重,这6条同源序列的ENC值在50.319~53.624,CACNA2D1基因在密码子的使用上存在轻度偏倚,该基因各同源基因间的同义和非同义替换率之比不同,且变化范围较大,该基因在进化过程中极为保守且经历了净化选择。[结论]CACNA2D1基因可能是影响动物生长发育的重要候选基因,具有较高的研究价值。     

犬瘟热病毒甘肃株的分离和N蛋白基因遗传进化分析

采用Vero细胞从甘肃2008-2009年疑似犬瘟热感染病犬体内分离到8株病毒,通过RT-PCR方法扩增M蛋白基因初步鉴定所获得毒株均为犬瘟热病毒(CDV)。进一步通过RT-PCR方法扩增分离株的N蛋白基因,并进行序列分析。结果表明,8株分离株均为CDV,它们之间N蛋白基因的核苷酸同源性和推定的氨基酸同源性分别为98.4%~99.7%、98.3%~99.6%;8株CDV分离株的N蛋白基因和TN、A75/17相应序列的核苷酸同源性分别为98.5%~99.5%、97.0%~98.0%,推定的氨基酸同源性分别为98.3%~99.2%、98.7%~99.8%;8株CDV分离株N蛋白基因和疫苗株(Onderstepoort和Snyder Hill)的相应序列的核苷酸同源性和推定的氨基酸同源性分别为93.0%~94.0%、96.8%~98.3%。根据N蛋白基因所建立的遗传系统发育树可知这8株CDV分离株与TN的亲缘关系较近,而与疫苗株处于不同的分支上。说明从甘肃分离的CDV野毒株和TN由同一毒株演化而来,与疫苗株亲缘关系较远。     

昆虫化学感受蛋白基因的进化分析

从基因库中调取已完成测序的昆虫化学感受蛋白(chemosensory proteins,CSPs)基因序列和氨基酸序列,共涉及昆虫7个目23个种的59个基因.应用MEGA 5.0形成了这59个基因的系统发育关系树,并计算CSPs基因在昆虫中的核苷酸替换速率.对非同义替换速率和同义替换速率进行比较的结果显示,CSPs基因...     

我国的文昌鱼与其渔业

文昌鱼（BranchiostomabelcheriGray）隶属于脊索动物门（Chordata），头索动物亚门（Cephalochordata）、文昌鱼纲（Amphioxi）、文昌鱼目（Amphiocxiformes）、文昌鱼科（Amphioxidae）、文昌鱼属（Branchiostoms）的鱼形动物，俗称给摘鱼、双尖鱼、海矛等。1文昌鱼研究的历史十九世纪俄国胚胎学家B.O．柯瓦列夫斯基研究了文昌鱼的胚胎发育，著有《文昌鱼发育史》，这一发现填补了无脊椎动物和脊椎动物进化之间的空白讲揭穿了神创论者法国的居维叶（G．Curier，1769－1832）关于动物界各门孤立无关的学说，为达尔文的进化论提供了物…     

猪嵴病毒福建株3D基因的克隆及遗传进化分析

根据GenBank中登录的猪嵴病毒(porcine kobuvirus,PKV)3D基因序列特征设计特异性引物,采用RT-PCR方法从福建省某猪场采集腹泻粪便样品和小肠组织混合物中扩增猪嵴病毒3D基因,将扩增后的目的片段克隆后进行序列测定。结果表明,所扩增的目的片段编码有完整的3D开放阅读框,全长为1 407bp,编码有468个氨基酸。运用生物信息学软件,将获得3D基因序列和GenBank的猪嵴病毒株3D基因序列进行分析比较,该毒株的3D基因序列和SH-W-CHN/2010/China毒株的核苷酸同源性最高,为93.6%,与WH1株核苷酸同源性最低,为92%。从遗传进化上看,猪嵴病毒和其他中国株在遗传进化上处在一个同一分支,匈牙利分离株处在另一分支,表明猪嵴病毒可能在欧亚大陆上各自独立进化。     

一株新城疫病毒F基因的克隆及其遗传进化分析

从新乡市某养鸡场的疑似新城疫病鸡群中分离到1株新城疫病毒,并对该病毒分离株进行F基因的扩增、序列测定和遗传进化分析。结果表明,该新城疫病毒分离株的F基因全长为1 662 bp,F蛋白裂解位点区的氨基酸序列为112R-R-Q-K-R-F117,具备强毒株的特征;同源性分析表明,该新城疫病毒分离株与国内外流行的基因Ⅶ型强毒株之间的同源性较高,为87.5%～97.7%,其中与国内流行的基因Ⅶd型的参考毒株同源性最高,为95.4%～97.7%,而与现用疫苗株La Sota、Clone-30、B1、Mukteswar等同源性较低,84.2%～86.6%;系统进化树分析表明,该新城疫病毒分离株与基因Ⅶd型参考毒株FJ882014、FJ608335和GU227738处在同一个进化分支上,亲缘关系最近。     

我国的文昌鱼与其渔业

文昌鱼（BranchiostomabelcheriGray）隶属于脊索动物门（Chordata），头索动物亚门（Cephalochordata）、文昌鱼纲（Amphioxi）、文昌鱼目（Amphiocxiformes）、文昌鱼科（Amphioxidae）、文昌鱼属（Branchiostoms）的鱼形动物，俗称给摘鱼、双尖鱼、海矛等。1文昌鱼研究的历史十九世纪俄国胚胎学家B.O．柯瓦列夫斯基研究了文昌鱼的胚胎发育，著有《文昌鱼发育史》，这一发现填补了无脊椎动物和脊椎动物进化之间的空白讲揭穿了神创论者法国的居维叶（G．Curier，1769－1832）关于动物界各门孤立无关的学说，为达尔文的进化论提供了物…     

海洋珍稀物种文昌鱼及其影响因素和保护措施研究

对文昌鱼的分布、形态特征、生活习性及其研究意义等进行叙述,进而阐明文昌鱼生长的影响因素及保护措施。     

杆状病毒与抗凋亡基因的进化关系研究

截至2010年2月,已有50种杆状病毒完成了全基因组测序,为研究这些杆状病毒所包含的抗凋亡基因之间的关系,以及抗凋亡基因与其来源的宿主之间的进化关系,对抗凋亡基因进行了分类,并利用Clustal X软件对其进行序列比对,构建单基因进化树.分析结果显示,在已测序的杆状病毒中都包含抗凋亡基因,且绝大部分含有2个或2个以上的...     

安徽省小麦品种演变分析

摘要：安徽在我国小麦主产省份中位列第四。通过对从1950-2008近60年来安徽省小麦主要推广品种种植面积和使用情况的分析,将主推品种划分为六个阶段,约10年一个阶段。对各个阶段的主要推广品种特征特性、主要优缺点和轮替情况进行了分析,归纳出各个阶段生产的基本要求、品种的综合表现和育种的进展。并对小麦品种演变的特点进行了总结,揭示了品种冬春性变化、生产布局的调整、主导品种与搭配品种的更替频率以及日益提高的对抗病抗逆性要求。     

植物品种权价值链演化模式与案例分析

植物品种权价值链模式并非一成不变,而是随着外部环境的变化和企业的成长,从一种模式演化为另一种更高级、更适应环境的模式。文章阐述了植物品种权价值链演化的概念与特征,总结了植物品种权价值链演化的3种模式,并对每种演化模式的优缺点、适用条件及典型案例进行了分析,期望不断提升我国种子企业的国际竞争力。     

浅析中国耕作制度的演变

运用系统归纳和类比的分析方法,概述了中国农业耕作制度发展经历的3个阶段,即原始耕作、传统耕作和现代耕作;同时从整地、耕地、中耕、水利灌溉以及科技发展等方面对耕作制度发展的不同阶段进行了较为详细的论述,指出了农业耕作制度发展对农业科技的促进作用．而农业科技的发展对农业耕作制度的变革又起到了积极的推动作用。     

棉属GhPEPC1同源基因的克隆与进化分析

根据GenBank中的GhPEPC1(登陆号:AF008939)的开放阅读框设计引物,运用PCR技术分别得到棉属16个种的PEPC同源基因全长序列.序列比对结果表明,核苷酸和氨基酸的序列差异除长萼棉外分别是0.3％～9.8％和0.2％～18.8％.利用核苷酸序列构建的NJ和ME系统进化树对它们的亲缘进化关系进行了分析,...     

欧盟动物源性产品中药物残留限量沿革分析

欧盟经过多年的发展,制订了《食品卫生法》等多部食品安全领域的制度法规,这些制度法规是欧盟保障食品安全的法律基础。将我国与欧盟的动物源性产品中药物残留限量进行对比分析,结合我国国情及进出口大宗动物源性产品情况,学习并借鉴欧盟的药物残留限值设置方式方法,促进我国药物残留标准体系的健全完善。     

基于CAS理论的土地系统脆弱性演化机制分析

基于土地系统的复杂适应特征,从CAS理论的角度对土地系统脆弱性的演化机制进行分析,从系统层、子系统层、主体层多个层次分析了各个主体在影响土地系统脆弱性的产生及演化中的地位与作用。结果表明,在土地系统脆弱性的演化过程中,政府的宏观调控行为起到一定程度的决定性作用,其会使土地系统脆弱性呈现出2个演化方向;而政府通过积极管理,采取合适的调控措施,将有利于促进土地系统脆弱性向良性方向发展。     

论莴苣的起源和进化

本文根据有关历史文献和莴苣的分布及生理生态特点,提出:地中海沿岸为莴苣的初生原产中心。欧洲南部为直立莴苣、结球莴苣、皱叶莴苣的次生原产中心,中国北方为茎用莴苣的次生原产中心。     

北京市昌平区农村居民点用地演变机理研究

我国农村居民点扩张形势十分严峻,研究其演变机制并进而对农村居民点用地进行调控显得至关重要,但是目前相关研究较少。在全面总结国内外关于农村居民点扩展研究的基础上,采用统计分析和空间分析的方法对北京市昌平区2001~2006年期间的农村居民点用地扩展演变进行了定量分析。研究结果表明:研究期内,研究区农村居民点用地的动态演变过程揭示出农村居民点用地利用的程度甚为粗放,并且农村居民点用地区域分异特征明显。研究认为:应该对农村居民点进行适度挖潜使其集约利用,但在集约化利用过程中应分别采取不同的集约化措施,同时要统筹兼顾区域整体和各城镇农村居民点用地之间的协调。