基于生物信息学与生物技术开发植物分子标记的研究进展

各种序列数据库的迅猛增长与生物信息软件的不断开发使基于序列资源的标记开发更加便捷,各类分子生物学技术的涌现及高通量检测平台的建设为实验室开发分子标记提供了强有力的技术支持.本文从生物信息学角度概述了SNP、SSR等分子标记开发的方法、特点及应用现状,并介绍了利用分子生物技术开发SSR、SRAP、TRAP标记的手段及从RAPD、AFLP等标记向单位点特异性PCR标记(如SCAR、CAPS、dCAPS等)转化的进展.最后,对不同植物标记开发策略的选择及以上各种技术在功能标记开发中的应用前景作了展望.     

番茄分子标记开发进展

分子标记辅助选择为选育由多基因控制的或易受环境影响的性状提供了一条有效的途径.番茄分子标记的开发工作已经进行了三十多年,到目前为止已有2 300多个不同类型的分子标记被开发和定位到12条染色体上.很多文献对这些分子标记的特点及其在番茄遗传育种中的应用进行了综述,但对其开发过程却很少提及.因此本文就主要类型的番茄分子标记的开发进展进行概括并分析其开发前景.     

杂交水稻品种纯度鉴定研究进展

由于杂交水稻在我国粮食生产中占有十分重要的地位,因而种子纯度和品种真实性问题备受关注.随着我国加入WTO和UPOV,传统的形态鉴定方法已不能有效适应当前种业发展和维权需要.特异的品种指纹鉴定应运而生,并显示出广阔的发展前景.本文从蛋白质指纹和DNA指纹两个方面,综述了杂交水稻品种指纹鉴定研究的进展和不足.并对SSR标记在品种指纹鉴定上的应用前景,单一特异标记的筛选和实验室标准检测技术的建立作了探讨和展望,以加快杂交水稻品种指纹鉴定的发展和应用.     

大葱雄性不育分子标记辅助选择的研究

大葱雄性不育在杂种优势利用中具有重要价值,传统方法选育不育系效率低,分子标记辅助育种可提高育种效率。本研究试图建立大葱雄性不育辅助育种的技术体系,加快大葱不育系、保持系的育种进程。利用RAPD技术分析了多态性片段S132800、S38960、S72300、S731100、S2002400与大葱育性的连锁关系,重组率分别为0、7．5％、0、4．2％、0。其中S132800、S2002400能在多数品种中区分N、S胞质,且重组率接近0,用于胞质鉴定具有很高的准确率,因而具有较高的利用价值。以S132800、S2002400为探针对不育系和保持系mtDNA的酶切片段进行了Southern杂交分析,结果表明它们在N、S胞质中存在多态性。预示着它们可能是与大葱CMS相关的片段。鉴于RAPD标记的应用有一定局限性,进一步对特异片段S132800、S2002400进行了克隆、测序和SCAR标记转化,其中S132800成功转化为SCAR标记,而S2002400转化后多态性消失。为进一步降低成本,简化了SCAR扩增产物的检测技术,初步建立了大葱不育系、保持系分子标记辅助选择的技术体系。研究表明,SCAR产物加入EB直接检测存在一定误差,而通过快速电泳可以快速、准确地鉴定单株的胞质类型。RAPD标记和SCAR标记在育种中应用有望提高大葱不育系、保持系的育种效率。     

采用扩增片断长度多态（AFLPs）标记来鉴定桃树品种

分子标记已经用于研究不同桃树品种间的变异性。随着随机扩增多态DNA(RAID)标记和小随体或简单序列重复(SSR)标记的应用，标记代表了主要的改良，使品种的分类更完全。1995年Vos等人提出了扩增片断长度多态(AFIP)标记，由于它在检测多态标记中的有效性，它比RAPDs标记具有更高的重复性且比小随体标记具有更低的构建成本，     

遗传标记在石榴种质资源研究中的应用

石榴属石榴科石榴属植物,具有较高的营养价值、药用价值和观赏价值。笔者从形态、细胞、生化和DNA分子等不同层面对遗传标记在石榴种质资源研究中的应用进行阐述,并对遗传标记方法的优缺点及存在的问题进行分析和探讨,最后提出了一些建议。遗传标记的应用,特别是分子标记的发展,将为石榴遗传多样性研究、亲缘关系分析、分类研究、品种鉴定、遗传图谱构建以及功能基因定位等相关研究开辟新的途径。     

板蓝根多糖对体外培养鸡脾脏淋巴细胞蛋白激酶C活性的影响

采用水提醇沉法提取板蓝根多糖,应用蒽酮-硫酸法进行多糖含量测定。体外培养鸡脾脏淋巴细胞,用固相夹心酶联免疫吸附试验（ELISA）测定蛋白激酶c(PKC)活性,分析板蓝根多糖对鸡脾脏淋巴细胞PKC活性的影响。结果显示,加入板蓝根多糖组（100mg/ml）与空白对照组的PKC的活性有显著差异(P<0.05),表明板蓝根多糖能引起鸡脾脏淋巴细胞蛋白激酶c活性明显升高。     

安全选择标记和无选择标记转基因技术研究进展

转基因植物中选择标记的存在是影响转基因植物安全的重要因素之一。目前主要从两个方面来解决转基因植物中选择标记的安全问题,一是选用安全的选择标记,二是构建无选择标记或标记删除转化系统。对目前几种重要的安全标记和无选择标记转基因技术的最新研究进展进行了综述,并对这些技术在转基因植物研究中的应用前景进行了展望。     

分子标记在花生育种中的应用

简述了RFLP、ARPD、AFLP、SSR分子标记在花生育种中的应用,并提出了存在问题及解决方法。为了尽快将分子标记用于花生育种,应提高分子标记的稳定性,降低所需费用,提高自动化操作程度,积极做好中国花生种质资源的分子标记工作,以及与高产优质高抗有关的新基因鉴定利用及其他相关的标记和定位。     

水稻InDel和SSR标记多态性的比较分析

为评价插入缺失（InDel）标记在水稻分子育种中的应用价值,本研究用日本晴和9311序列筛选得到遍布每条染色体的20对InDel标记和53对SSR标记,分析46份粳稻和47份籼稻的遗传多样性。研究表明这些InDel标记在籼粳亚种间具有很高的多态性,亚种内多态性较低,平均多态性水平显著小于SSR标记,InDel标记具有数量多,扩增产物稳定和易于检测等优点,将InDel标记应用到遗传图谱构建、基因定位分析和标记辅助选择中可以加速研究进程。     

黄颡鱼DNA分子标记的研究进展

为了深入了解黄颡鱼在多种DNA分子标记中的应用研究。详细阐述黄颡鱼多个类型的DNA分子标记的原理,优缺点及其研究进展,对其应用前景和存在的问题进行了综述,并对黄颡鱼的DNA分子标记研究提出了建设性意见,为黄颡鱼种质资源的保护与合理开发提供参考资料。     

Molecular markers: It’s application in crop improvement

Over the past few decades, plant genomics research has been studied extensively bringing about a revolution in the field of plant biotechnology. Molecular markers, useful for plant genome analysis, have now become an important tool in crop improvement. The development and use of molecular markers for the detection and exploitation of DNA polymorphism is one of the most significant developments in the field of molecular genetics. The presence of various types of molecular markers, and differences in their principles, methodologies and applications require careful consideration in choosing one or more of such methods. No molecular markers are available yet that fulfill all requirements needed by researchers. In this article we attempt to review most of the available DNA markers that can be routinely employed in various aspects of plant genome analysis such as characterization of genetic variability, genome fingerprinting, genome mapping, gene localization, analysis of genome evolution, population genetics, taxonomy, plant breeding, and diagnostics. The emerging patterns make up a unique feature of the analyzed individual and are currently considered to be the ultimate tool for biological individualization.     

DNA分子标记及其在甘蔗育种上的应用

DNA分子标记是继形态标记、细胞标记和生化标记之后发展起来的一种新的较为理想的遗传标记，在甘蔗育种方面发挥了重要作用。DNA分子标记包括：限制性片段长度多态性(RFLP)、随机扩增多态性DNA(RAPD)、扩增片段长度多态性(AFLP)、简单重复序列(SSR)、染色体或基因组原位杂交(GISH)、荧光原位杂交(FISH)等。本文对植物DNA分子标记的原理、特点及其在甘蔗种属鉴定、遗传多样性分析、分子图谱构建及病害分子诊断等方面的研究进行简要的概述。     

分子标记及其在云南稻种核心种质中的应用

本文总结了分子生物学发展的各类分子标记及其在核心种质中的应用。     

小麦条锈病抗性基因研究进展及在育种中的应用

概述了已知小麦条锈病抗性基因的来源、染色体定位和分子标记研究现状,回顾了抗性品种与生理小种的演变,评价了小麦抗条锈基因,并浅谈了小麦抗条锈基因的分子标记在育种中的应用     

Application of Molecular Markers in Studying on Crop Heterosis

概述了分子标记的种类，分析了杂种优势研究中常用的几种分子标记的原理、特点。综述了分子标记在作物杂种优势群划分和杂种优势利用模式构建、杂种优势预测以及杂种优势遗传基础研究中的利用现状。并对分子标记在杂种优势研究中的进一步利用进行了展望。     

Validation of simple sequence repeats associated with quality traits in durum wheat

Over recent years, quality has become an important commercial issue for durum wheat breeders. Modern breeding methods are most efficient for producing and supplying the best quality raw materials to the pasta industry. Here we assessed the effectiveness of molecular marker-assisted selection of quality traits in durum wheat. To this end, DNA and quality trait markers were jointly used to analyze quality-related traits in a durum wheat collection. A total of 132 durum wheat (Triticum turgidum ssp. durum) Mediterranean landraces, international lines, and Moroccan cultivars were analyzed for seven important qualityrelated traits including thousand-kernel weight (TKW), test weight (TW), gluten strength, yellow pigment (YP), and grain protein content (GPC). Additionally, 18 simple sequence repeat (SSR) markers previously reported to be associated with different quality traits were analyzed. Of these, 14 (78%) were polymorphic and four were monomorphic. There were between two and seven alleles per locus, with an average of four alleles per locus. The average phenotypic variation value (R²) ranged from 2.81 to 20.43%. Association analysis identified nine markers significantly associated with TKW, TW, and YP, followed by eight markers associated with GPC, six markers associated with yellow index b, four markers associated with brightness L, and three markers associated with SDS-sedimentation volume. This study highlights the efficiency of SSR technology, which holds promise for a wide range of applications in marker-assisted wheat breeding programs.     

Potential of marker-assisted selection in hemp genetic improvement

Summary The development and applications of molecular markers to hemp breeding are recent, dating back only to the mid-1990s. The main achievements in this field are reviewed. The analysis of Cannabis germplasm by RAPD, AFLP and microsatellites is discussed, with its consequence for the still debated species concept in Cannabis. DNA-based markers have also been exploited in the field of forensic science, in an attempt to discriminate licit from illicit crop. The main applications of the molecular markers to the breeding, however, have been achieved with the development of markers closely linked to the male sex and to some of the most relevant chemotypes. Active research is carried out by several groups in the field of identification and characterization of the genes involved in fiber quality and quantity, and in the determination of monoecy, another very important target of hemp breeding. Besides, markers associated to new, potentially useful chemotypes are being developed, for the marker-assisted breeding of pharmaceutical Cannabis.     

杨树SSR标记在柳树中的通用性分析

简单重复序列（simple sequence repeat,SSR）分子标记因其具有稳定性好、多等位基因、共显性遗传、数量丰富、基因组覆盖性好等优点,现己广泛应用于多种植物的遗传育种研究中。本研究利用杨树的48对基因组SSR引物及48对EST—SSR引物对6个苏柳品种进行了通用性分析。结果表明,杨树EST-SSR引物在柳树中的通用性达54．2％,而基因组SSR的通用性仅10．4％;但EST-SSR引物在有效引物中的多态性比例为80％,基因组SSR引物在有效引物中的多态性比例为100％。同时研究结果也表明,杨树SSR标记完全可以用于柳树群体或品种间的群传多样性分析。     

油菜种子油脂分子标记及QTL定位的研究进展

阐述了油脂的合成途径,重点归纳了油菜种子含油量及重要脂肪酸（包括油酸、亚油酸、亚麻酸和芥酸）的分子标记及QTL定位。总结了分子标记技术在油菜遗传图谱构建、重要性状的基因定位、油菜遗传多样性与种质资源评价及油菜分子标记辅助选择中的应用。最后提出需要进一步研究和解决的问题,并做了展望。