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玉米粗缩病抗性基因SSR标记初步研究 总被引:8,自引:1,他引:8
以高抗粗缩病玉米自交系齐319和高感粗缩病玉米白交系掖478的189个F<,2>群体单株作为标记群体材料,结合BSA法,用88对SSR引物进行筛选研究,结果表明:引物Bnlg125和Bnlg1064在抗、感DNA池呈多态性,其中Bnlg125在抗、感池之间扩增出1条约410 bp的多态性片段(记Bnlg125-410);通过Mapmaker/Exp(Version3.0)软件分析F<,2>单株,结果Bnlg125-410标记与玉米粗缩病抗性位点连锁,遗传距离为5.8 cM. 相似文献
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通过矮花叶病抗性鉴定筛选出玉米高抗自交系黄野四-3和高感自交系8112.遗传分析显示矮花叶病抗性表现为显性遗传.利用SSR分子标记,结合群体分离分析方法(BSA),对抗矮花叶病基因进行定位,筛选获得了与玉米抗矮花叶病基因位点连锁的SSR标记,并将该基因定位于第3连锁群,与两侧的Bnlg1035和Umc2266分子标记遗传距离分别为8.02 cM和3.04 cM.这一研究结果为快速筛选抗矮花叶病玉米新种质,培育抗性新品种提供了理论依据,为抗矮花叶病基因的分子标记辅助育种和抗病基因克隆奠定了基础. 相似文献
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梨果实形状的SSR分子标记 总被引:2,自引:0,他引:2
本研究以‘矮化梨’(Pyrus communis Linn.)×(‘茌梨’(Pyrus bretschneideri Rehd.)+‘新高梨’(Pyruspyrifolia Rehd.))F1代分离群体为试材,用分离群体分组分析法(Bulked Segregant Analysis,BSA)对梨果实形状(圆形/非圆形)进行了SSR标记分析。通过对源自梨和苹果基因组的281对SSR引物的筛选,获得了与梨果实形状相关的SSR标记CH02b10和CH02f06,其圆形/非圆形性状判断的符合率分别为91.67%和96.67%,并将所获得的标记在品种上进行分析。 相似文献
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利用SRAP-BSA法筛选棉花抗病基因的分子标记 总被引:1,自引:0,他引:1
[目的]以高抗黄萎病品种辽棉18号和高感黄萎病品种军棉1号及其杂交后代F2为材料,筛选棉花抗病基因.[方法]采用分离群体分组分析(Bulked Segregate Analysis,BSA)法,对棉花抗病基因进行SRAP分析.[结果]在88对SRAP引物中筛选出3对引物在两亲本及抗、感基因池中均能扩增出稳定的差异条带,命名为S_(6-6)、S_(6-10)、S_(8-8).[结论]通过F2代个体验证,抗病个体均能扩增出此差异条带,而感病个体中不能扩增出此差异条带,证明这三对引物是与棉花抗病基因紧密连锁的SRAP分子标记. 相似文献
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桃果实非酸/酸性状分子标记的筛选 总被引:6,自引:0,他引:6
以桃品种‘京玉’、‘美味’的正反交F1代群体69株为试材,采用RAPD、AFLP技术与BSA相结合的方法筛选与桃果实非酸/酸性状连锁的分子标记。在筛选的301个RAPD引物中,只有引物S332在两基因池间产生的多态性片段与非酸性状连锁,但重组率高达28.9%。通过128对AFLP引物组合在两基因池间的分析结果表明,18对引物组合产生多态性。单株验证结果表明,只有3对引物组合E-ACT/M-CAT、E-TA/M-CTC和E-AT/M-CTA产生的多态性片段与果实非酸/酸性状连锁,连锁距离分别为16.2、1.47和2.99 cM。利用获得的连锁标记,构建D/d基因连锁群,连锁距离最近的2个标记AFTA-CTC、AFAT-CTA分别位于D/d基因位点两侧。 相似文献
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【目的】无核是鲜食葡萄的重要农艺性状,无核基因分子标记的准确性将影响无核葡萄早期选择的效果。本研究对前人开发的5个葡萄无核基因分子标记在183份葡萄材料中进行通用性鉴定,旨在明确各个分子标记的适用范围,为利用分子标记辅助无核葡萄育种提供参考依据。【方法】以96个葡萄品种(其中无核63个,有核33个)及‘红地球’ב黎明无核’87个F1单株(其中无核61株,有核26株)的叶片DNA为模板,利用已报道的5个葡萄无核基因分子标记(SCF27-2000、GSLP1-569、VMC7f2、p3_VvAGL11和5U_VviAGL11)的引物进行PCR扩增,采用1.5%琼脂糖凝胶电泳、毛细管电泳和8%聚丙烯酰胺凝胶电泳技术检测PCR产物,分析各个样品的无核特异条带,鉴定5个分子标记的准确率。【结果】SCAR标记GSLP1-569对96个葡萄品种的检测准确率为40.6%,无核检测率为63.6%。SCAR标记SCF27-2000对96个葡萄品种及87个F1杂交单株的检测准确率分别为71.9%和76.54%,无核检测率分别为70.5%和78.5%。SSR标记VMC7f2在96个葡萄品种中鉴定出8个等位基因,经卡方检验,189-bp等位基因与葡萄无核性状显著关联,其检测准确率为85.4%,无核检测率为85.5%。SSR标记p3_VvAGL11在96个葡萄品种中鉴定出7个等位基因,经卡方检验,187-bp等位基因与葡萄无核性状显著关联,其检测准确率为89.6%,无核检测率为90.7%,在F1杂交单株中其鉴定准确率为87.65%,无核检测率为91.1%,假阳性率为6.17%,假阴性率为6.17%。SSR标记5U_VviAGL11在96个葡萄品种中鉴定出17个等位基因,经卡方检验,306-bp等位基因与葡萄无核性状显著关联,其鉴定准确率为88.5%,无核检测率为90.6%,在F1杂交单株中检测准确率为88.89%,无核检测率为92.7%,假阳性率为4.94%,假阴性率为6.17%。【结论】SSR标记p3_VvAGL11和5U_VviAGL11在葡萄种质及遗传群体中无核分型的准确性及无核检测的效率较高,适用范围较广,在无核基因分子标记辅助选择中可以考虑优先使用。 相似文献
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A total of 144 F2 individuals were obtained from the crossing between 1047 (susceptible) and A21 (resistant). Two RAPD markers were screened out in 200 random primers using:BSA(Bulked Segregant Analysis). Two RAPD markers, designated as AG13/2000 and U16/660, were 7.7 cM and 8.38 cM apart from the TuMVresistant gene, respectively. The two RAPD fragments were converted to SCAR markers. SCAR markers were confined in germplasm. 相似文献
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用SSR标记进行野生大豆耐碱基因定位及QTL分析 总被引:1,自引:0,他引:1
以抗碱野生大豆Gs0001(♀)和碱敏感栽培大豆吉科豆1号(♂)的F2群体作为基因定位群体,通过BSA法(Bulked-segegant analysis,群分法),对大豆耐碱基因进行SSR分子标记定位。在分布于大豆20个连锁群的488对SSR引物中,筛选出7对与耐碱基因紧密连锁的标记,这7对标记位于G连锁群相近的区域。利用Mapmaker/EXP3.0分析,在最小似函数值LOD=14.0时,将耐碱基因定位于Satt298与Satt269之间,距离两个标记的遗传距离分别为1.3 cm和6.9 cm。此耐碱基因的贡献率是40.31%。 相似文献
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葡萄无核基因的RAPD遗传标记 总被引:7,自引:0,他引:7
报道了用随机引物和混合分离分析(BSA)方法检测葡萄无核基因连锁的遗传标记。DNA混合样来自B72-216×B45-187的杂交后代。两个混合样分别由9个表现型为无核和有核杂种组成,除有核与无核性状外,其他性状是随机的。用10碱基随机序列的100个引物筛选混合样以期获得多态型DNA片段。结果在引物UBC-269扩增后,500对碱基的DNA多态型片段出现在无核样,而有核样不出现该多态型片段。进一步用杂种、父本及其无核基因的供给者无核白(ThompsonSeedless)和百乐葡萄(Perlete)作模板,用引物UBC-269扩增,一些杂种、亲本及无核基因的供给者也拥有500对碱基的多态型片段。据此分析,葡萄的无核性是由多基因控制的,这些基因有主效和微效之分;本研究获得的分子标记UBC-269500与葡萄无核基因之一有连锁关系,而且与主效基因之一有连锁 相似文献
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Inheritance Analysis and Identification of SSR Markers Linked to Late Blight Resistant Gene in Tomato 总被引:4,自引:0,他引:4
ZHU Hai-shan WU Tao ZHANG Zhen-xian 《中国农业科学(英文版)》2006,5(7):517-521
Late blight caused by Phytophthora infestans is the most serious disease of tomato production in China. Studies on the genetics of resistance and identification of molecular markers are very useful for breeding late blight resistant varieties. The objective of this paper was to study the inheritance of late blight resistance and identify simple sequence repeat (SSR) markers associated with resistance allele in tomato (Lycopersicon esculentum Mill). The results came from an F2 progeny of 241 plants derived from a cross between 5~ inbred line that is susceptible to late blight and a resistant accession CLN2037E. The late blight responses of F2 plants were tested by artificially inoculation of detached-leaflets in plate and natural infection assayed under greenhouse conditions. Both methods showed that the resistance is dominant and inherited as monogenic trait. Genetic mapping and linkage analysis showed that the late blight resistance gene Ph-ROL was located on chromosome 9 with a genetic distance of 5.7 cM to the SSR marker TOM236. 相似文献