江西地区猪圆环病毒2型的基因型分析

对来自江西各地区的送检的235份临床病料进行检测,结果显示224份为PCV-2阳性,阳性率为95.2%。在224份PCV-2阳性病料中10份为PCV-2a阳性(占4.4%)、138份为PCV-2b阳性(占61.6%)、另外还有80份PCV-2阳性病料(占34%)。对PCV-2、PCV-2a、PCV-2b扩增产物进行测序鉴定,PCR产物测序结果与GenBank中已发表序列作进化树,从系统发育树中也可分出PCV-2a、PCV-2b两种基因型。鉴别PCR和测序结果说明目前江西地区PCV-2的感染是以PCV-2b为主,少数为PCV-2a,也有既不是PCV-2a也不是PCV-2b的未知亚型。     

中国部分地区猪圆环病毒2型的基因型分析

对中国11个省(市)部分猪场收集的812份病料,应用ORF2-PCR进行检测,发现有235份为PCV2阳性病料.利用鉴别PCR方法从235份阳性病料中,检出10份PCV2a基因型和133份PCV2b基因型,检出率分别为4.2%、56.6%.进一步对ORF2-PCR检测阳性的部分模板进行全基因组扩增,构建阳性重组质粒,对插入质粒的片段进行测序鉴定,利用DNAStar进行同源性分析,同GenBank参考毒株绘制系统发育树,从系统发育树中也可分出PCV2a、PCV2b 2种基因型.鉴别PCR和测序结果说明,我国部分地区流行的猪圆环病毒2型以PCV2b基因型为主,少数为PCV2a基因型,也有既非PCV2a又非PCV2b的基因型(PCV2c?).     

上海及周边地区猪圆环病毒2型基因型分析

采集上海及周边地区猪内脏样本,进行猪圆环病毒2型（Porcine circovirus type 2,PCV-2）病原学检测,并对阳性样本的ORF2序列进行分析和比对。结果显示,发病猪群PCV-2阳性率为39.06%（25/64）,健康猪群阳性率为13.51%（5/37）,PCV-2总阳性率为29.70%（30/101）。30份阳性样本中PCV-2a亚型为2株,检出率为1.98%（2/101）,其余28株均为PCV-2b亚型,检出率为27.72%（28/101）。PCV-2的ORF2序列与已登录的ORF2序列的同源性在90.7%~100%。2株PCV-2a株相互间的同源性为99.6%;28株PCV-2b株的同源性在94.4%~100%,PCV-2b株中只有4株与已登录株DQ141322、AY321984和AY484413株同源性关系最近,处于同一分支中,而另外24株与Q151643中国株同源性关系最近且处于同一分支中。研究结果表明上海及周边地区PCV-2感染比较普遍,发病猪场的感染率远高于健康猪场,且感染率比往年有升高,PCV-2在猪场疫病的爆发和传染中起着重要的协同作用;在PCV-2的感染病例中,PCV-2b亚型为感染的优势毒株;绝大多数PCV-2b ORF2片段的同源性与已登录的一株中国株同源性关系密切,在基因进化树上处于同一分支,但是否可以推断其为PCV-2的另一个亚型有待进一步考证。     

猪圆环病毒2型江苏分离株的遗传进化分析

采用PCR方法扩增了15个猪圆环病毒2型（PCV 2）江苏分离株的基因组DNA,以这些毒株的ORF2核苷酸序列进行遗传进化分析。经序列比较发现,所有分离株均属于2b基因群,其中7株为1A/1B亚群、8株为1C亚群;毒株间核苷酸同源性为93.6%~100%,所编码的Cap蛋白氨基酸同源性为92.3%~100%。PCV 2江苏分离株Cap蛋白的主要变异区域为53~90、121~151和190~210位氨基酸;R59、R89、S90、S121、T134、S169、A190、E210为1A/1B亚群分离株的特征氨基酸,而F8、I53、N68、L89、T90、T121、N134、R169、D210、I215、K234则是1C亚群分离株的特征氨基酸。     

猪圆环病毒2型的免疫学和病毒进化

正猪圆环病毒2型相关性系统疾病(Porcine circovirus 2-systemic disease,PCV2-SD)曾被称为断奶仔猪多系统衰竭综合征(Postweaning multisystemic wasting syndrome,PMWS),这种疾病造成猪只死亡率增加,生长变缓,对猪场造成严重的经济损失。PCV2-SD的临床症状包括消瘦、日增重降低、贫血、腹泻、呼吸困难等。由于感染病毒猪只的B和T淋巴细胞耗竭,淋巴组织内可以观察到广泛的病变。血液和淋巴器官中B和T细胞的数量减     

酒泉市猪圆环病毒2型和3型的流行病学监测和分析

为掌握酒泉市五个农业县猪圆环病毒2型（PCV2）和3型(PCV3)流行情况,在辖区内不同区域、不同养殖规模、不同生长阶段的19个规模化养殖场、38个散养户、4家屠宰场采集血清样品230份、粪便样品250份、猪肺脏、扁桃体、颌下淋巴结等组织样品220份,进行PCV2和PCV3核酸检测,检出阳性样品138份,阳性率为21.23%,PCV2的阳性率为15.54%,PCV3的阳性率为5.69%,表明PCV2的流行比PCV3更普遍、阳性感染率更高,但在不同区域、不同规模猪场的危害程度和流行情况存在一定的差异。规模养殖场的总体阳性感染率明显低于散养户,保育猪的感染率高于其他生长阶段的生猪。本次实验对酒泉市猪场PCV感染综合防控提供技术支撑,为科学养猪产生积极影响。     

猪圆环病毒2型不同地区毒株的分离鉴定及基因型分析

分别对收集于山东、山西、北京和河北的PCV-2核酸阳性的病料进行PCV-2分离鉴定,采用PCR和间接免疫荧光法对各分离毒株进行鉴定,并对各分离毒株的全基因组进行克隆、测序和基因型分析.结果共分离到5株PCV-2毒株,分别命名为DBN-SD02、DBN-SX07 DBN-BJ08、DBN-HB12和DBN-HB13株,...     

一株猪圆环病毒3型的全基因序列测定及遗传进化分析

猪圆环病毒3型(PCV3)是一种与猪皮炎和肾病综合征、生殖功能衰竭和多系统炎症相关的新型猪圆环病毒。为了研究分析PCV3在四川本省的流行情况,本试验通过对实验室送检保存的50份病料进行PCV3阳性筛选、全基因扩增、送检测序,获得一株PCV3/CN/Sichuan/2019毒株,然后与挑选的18株参考毒株进行基因对比分析,得出该新毒株与国内河南毒株He NYS-2(2017)的遗传距离最近,Cap蛋白基因和全基因的同源性最高,分别达99.8%和100%;与国内8株参考毒株的全基因同源性为98.1%～98.8%,与国外9株参考毒株的全基因序列同源性为98.0%～98.6%;Cap蛋白基因序列同源性与国内外基本相同(99.1%～99.3%);进化树分析表明,该毒株与国内毒株进化距离最近,与国外毒株进化距离较远。本次发现的PCV3新毒株遗传进化稳定,没有出现明显变异,这将为四川省当前PCV3的分子流行病学研究提供一定的参考。     

山东省6例猪圆环病毒3型检测及Cap结构遗传进化分析

为了更好地研究PCV3分子进化,对山东省6份阳性样品进行检测,并对PCV3 Cap蛋白基因测序。结果表明:PCV3 Cap蛋白基因与PCV1及PCV2的Cap蛋白基因同源性在34.4%～38.4%;PCV3的Cap蛋白基因与美国标准毒株同源性为97.3%～99.8%;6株PCV3分离株之间的同源性为98.3%～99.8%。Cap基因测序结果表明,山东地区所分离到的6株PCV3毒株既有PCV3a也有PCV3b亚型,与美国毒株仅存在散在变异位点,但与PCV1及PCV2抗原表位差异明显。由此推断:PCV3与PCV1及PCV2交叉保护较差,这也为未来PCV3的有效防控研究提供理论基础。     

猪圆环病毒2型的遗传变异和进化研究进展

猪圆环病毒2型(PCV2)是猪圆环病毒相关疾病的主要病原体,给世界养猪业造成了巨大的经济损失。随着分子生物学的发展,PCV2的研究取得了显著进展。本文综述了PCV2的遗传变异和病毒进化的研究进展,旨在为业界更好地了解PCV2的分子流行病学、控制策略,更能为新型疫苗的设计研发提供参考。     

猪圆环病毒3型全基因克隆及遗传演化分析

辽宁地区某猪场发现疑似断奶仔猪多系统综合征(PMWS),经临床症状、病理变化和PCR检测,确诊为猪圆环病毒3型(PCV3)感染;根据Gen Bank中收录的PCV3基因序列,设计2对特异性引物,从患有PMWS的仔猪内脏组织中扩增PCV3全基因序列,克隆到p MD18-T载体中,经测序、拼接获得PCV3全长c DNA序列,利用DNAStar和DNAman生物软件对全基因组进行遗传变异分析。结果显示:PCV3毒株基因组全长2 000 bp,命名为CN/Liaoning-2017 (简称LN株)(GenBank登录号:MH177453. 1),基因组有3个开放阅读框(ORF),其中2个ORF编码的蛋白与圆环病毒的复制相关蛋白(Rep)和衣壳蛋白(Cap)同源。Cap基因大小为645 bp,编码214个氨基酸。PCV3国内株可分为3大分支(3a簇、3b簇与3c簇),LN株处于3a簇分支中,与湖北株(KY354039. 1)同源性最高,达到99. 7%; LN株与PCV3a簇代表株(PCV3-USMN2016,PCV3-US-MO2015)同源性在98. 8%～99. 2%之间,与PCV3b簇代表株(PCV3-US-SD2016)的同源性为98. 8%,与PCV3c簇代表株(PCV3-China-GD-2016)同源性为98. 7%。Cap蛋白氨基酸位点分析显示,LN株在第68位发生突变,与其他代表株都不相同。以上试验结果表明,成功从患有PMWS的仔猪体内克隆了PCV3全基因,并完成了序列分析。LN株是辽宁省首次发现的PCV3毒株,这些数据将为研究PCV3的遗传变异和流行病学特征提供分子生物学依据。     

湖南省10株猪圆环病毒3型的测序与遗传进化分析

为了解湖南省猪圆环病毒3型(PCV3)的遗传变异情况,以25份PCV3阳性样品DNA为模板,使用PCR方法分两段扩增PCV3全基因序列并进行拼接。结果获得7株PCV3分离株全基因组,3株PCV3 ORF2序列。7株PCV3全基因组的核苷酸序列同源性为98.8%～99.7%,10株ORF2的核苷酸序列同源性为97.8%～99.8%。根据系统发育树,PCV3可分为3个分支,所有分离株的遗传关系均较近。ORF2氨基酸序列突变少,发现2个在其他参考毒株中未出现的突变位点。研究获得的PCV3毒株序列与国内外PCV3毒株序列其遗传关系较近,无特殊突变,较为稳定。     

华东地区猪圆环病毒2型基因型鉴别及ORF2遗传变异分析

利用PCR方法对2014-2015年采集于华东地区部分猪场的病料进行猪圆环病毒2型(PCV2)检测,将所得阳性样品进行2a/2b鉴别分型。同时,选取15份阳性样品扩增ORF2完整序列,并利用DNAStar软件进行同源性分析和系统进化树分析。结果表明,335份病料中PCV2阳性样品146份,其中PCV2a型11份(7.53%)、PCV2b型127份(86.99%),共感染率5.48%,说明华东地区感染的PCV2以2b基因型为主,少数为2a基因型。同源性分析表明,试验所得15株ORF2序列同源性为89.9%~99.9%,与国内外参考毒株同源性为86.2%~99.7%,均存在较高的同源性。系统进化树表明,15株序列中有9株属于PCV2b型,4株属于PCV2d型,2株属于PCV2a型,未出现2c和2e基因型。本试验为进一步研究PCV2遗传变异趋况及新型疫苗的研制积累了有效材料。     

北京市猪场猪圆环病毒3型感染状况调查及其ORF2基因遗传进化分析

为了解猪圆环病毒3型(PCV3)在北京市不同区县猪场中的流行情况,研究建立PCR检测方法,对来自北京市8个区县56个养殖场的1177份临床样品进行检测,并对获得的部分ORF2全基因序列进行遗传进化分析。结果显示,PCV3总体阳性率为1.0%(12/1177),猪场阳性率为8.9%(5/56)。对PCV3阳性样本进行ORF2基因测序及同源性比对,共测得12株PCV3 ORF2全长基因序列,其中包括6株不同的ORF2全长基因序列。结果显示,该6株序列之间的核苷酸相似性为97.7%～99.5%,推导氨基酸序列的相似性为97.2%～100%;与参考毒株之间的核苷酸同源性为96.0%～99.5%,推导氨基酸同源性为92.1%～100.0%;进化树显示北京毒株属于PCV3b基因型。试验表明,PCV3在北京多个猪场呈现一定的流行趋势,流行毒株以PCV3b基因型为主。     

鄂西北地区猪圆环病毒2型抗体水平监测

应用ELISA方法对鄂西北地区35家标准化猪场282份血清进行猪圆环病毒2型抗体水平检测,间接监测猪圆环病毒2型感染情况。试验结果表明：送检血清中阳性者为207份,总体阳性率73.4％,阳性ELISA值正态分布于0.15~0.6,其中0.3~0.4分布最多,占阳性数的25.1％;送检猪场中未感染猪圆环病毒2型者占17.1％,感染猪圆环病毒2型的猪场占82.9％;通过对发病猪进行临床症状观察和病理剖检发现具有典型猪圆环病毒2型特征。      

广西猪圆环病毒2型及3型的流行病学初步调查

为了解广西近年来猪圆环病毒2型(PCV2)、圆环病毒3型(PCV3)的感染现状,本研究采集2020年-2022年来自广西养殖场、生猪屠宰场及无害化处理点的样品,采用实时荧光定量PCR方法进行检测。结果表明,1408份样品中,有731份PCV2阳性样品,阳性率为51.92%,471份PCV3阳性样品,阳性率为33.45%,有353份样品PCV2、PCV3均阳性,混合感染率25.07%。PCV2、PCV3普遍分布在广西14个地市,各地市感染程度存在较大差异。养殖场、屠宰场及无害化处理点PCV2、PCV3风险较高,风险由低到高依次是养殖场、屠宰场及无害化处理点。从不同类型样品携带病毒的情况来看,淋巴结和脾脏最高,脐带次之,精液未检测出阳性。这些结果可为我区PCV2、PCV3的流行情况分析、采样监测及防控提供依据。     

广西北部湾地区猪圆环病毒2型检测及其ORF2遗传变异分析

为了解猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)在广西北部湾地区的流行情况和其ORF2基因的遗传变异规律,本研究采用PCR方法对2016年采自广西北部湾地区规模猪场和农村散养户的306份疑似PCV2感染猪的血液和组织样品进行了PCV2的病原学检测,同时对分离的4株PCV2 ORF2基因进行PCR扩增、克隆和测序,并与Gen Bank中登录的34株国内外PCV2参考株ORF2序列进行比对和遗传进化分析。结果表明:PCV2检测阳性样品为129份,阳性率为42.16%。随机选取的4份阳性病料PCV2 ORF2基因测序结果显示,4个毒株遗传关系上均属于Group 1(PCV2b),其中BBW-1和BBW-2分离株属于1A分支且分别与Fd3株(AY321984)和NL_PMWS_3株(AY484415)同源性较高,BBW-3和BBW-4分离株属于1B分支且BBW-4分离株与Hu Zhou0301株(AY536756)和NL_Control_1株(AY484407)同源性较高,其ORF2基因核苷酸和氨基酸同源性分别为98.9%~99.5%和93.9%~95.4%,说明该地区PCV2的优势基因型是PCV2b。研究结果不仅有利于掌握广西北部湾地区PCV2流行毒株同源性情况,而且将为该地区(porcine circovirus associated disease,PCVAD)的防治和新型疫苗的研制提供依据。     

山西省猪圆环病毒3型感染调查及其Cap基因的遗传进化分析

为了解山西省各地市养猪场中猪圆环3型病毒(PCV3)的感染及其Cap基因的遗传变异情况,本研究通过PCR方法对2019年6月～7月采集的山西省11地市共521份猪肺脏组织样品进行PCV3检测,结果显示,山西省PCV3的总体感染率高达85.22%(444/521),大同市、长治市、吕梁市、临汾市的阳性检测率高达90%以上,朔州市、太原市的阳性检出率较低为65.38%、64.00%,说明山西省PCV3的感染率总体较高。随机抽取山西省各地市11份PCV3阳性肺脏样品进行Cap基因的PCR扩增并测序,利用DNAStar软件将其与30株PCV3参考株、3株PCV2疫苗株进行同源性及遗传进化分析。Cap基因同源性分析结果显示,11株PCV3间Cap基因的同源性为97.8%～99.5%,与PCV3参考株Cap基因的同源性为97.7%～99.7%;11株PCV3 Cap基因编码氨基酸比对分析结果显示,其与PCV2 Cap蛋白氨基酸序列的同源性为27.1%～29.0%,与PCV3参考株Cap基因编码的氨基酸同源性为97.7%～100%;11株PCV3 Cap基因进化树结果显示,4株PCV3属于PCV3b型,7株PCV3属于PCV3a型;选取的11株病毒与PCV3参考株仅于aa24、aa27、aa77、aa150有散在变异位点,且与3株PCV2疫苗株抗原表位有明显差异,据此分析可知山西省各地市流行的PCV3株同源性及整体保守性均较高。对所有病料样品进行PCV2、PRV等病毒的检测,结果发现PCV3与PCV2的混合感染率为44.53%(232/521),与其他病毒的混合感染率较低。本研究首次对山西省11地市PCV3的感染情况进行了调查,结果表明PCV3感染率较高,该地区流行的PCV3株相对保守,且与PCV2混合感染率较高,上述结果为山西省PCV感染的防控提供了参考依据。     

广西某市屠宰猪淋巴结猪圆环病毒3型的病原检测及遗传演化分析

为了解猪圆环病毒3型(PCV3)在广西地区健康猪群中的遗传变异情况,对广西某市屠宰场健康猪的181份淋巴结进行PCV3的病原检测,结果 PCV3阳性率为24.31%。这说明在健康屠宰猪群中PCV3的感染率较高,带毒情况较为严重。对其中的阳性样品进行全序列扩增,最终得到6条PCV3全基因组序列。将试验所得PCV3全基因组序列与GenBank上已发表的国内外毒株全基因组序列相比较,结果发现PCV3全基因组相似性为98.6%~99.9%,变异程度低,较为保守;对PCV3ORF2基因进行遗传演化分析,发现PCV3毒株可分为两大型。通过对PCVs(PCV1、PCV2和PCV3)Cap蛋白相似性进行比对分析,推测PCV2与PCV3不具有交叉保护性。