绿壳蛋鸡与白来航蛋鸡microRNA变异及其靶基因预测分析

本研究旨在分析绿壳蛋鸡与白来航蛋鸡microRNA变异及其靶基因,将已鉴定的microRNA与预测microRNA组成全基因组的microRNA,并通过与GGRS得到的两种鸡群体SNP位点进行映射,挖掘含SNP的microRNA。利用生物信息学的方法,对含SNP的microRNA进行靶基因预测,并对直接含有SNP的mature-microRNA进行聚焦。将这些靶基因进行富集,一共得到22个GO分类和10条KEGG信号通路与3个主要IPA调控网络,发现其在与生长相关的mTOR信号通路、Wnt信号通路、生长激素受体网络、胰岛素样生长因子Ⅰ受体网络得到了富集,与产蛋性状相关的卵母细胞减数分裂信号通路、黄体酮卵母细胞成熟信号通路得到了富集。此研究方法和结果可以给后期研究提供参考。     

microRNA的功能及家蚕microRNA的研究进展

microRNA(miRNA)是一类长度约22个碱基的内源性非编码小分子RNA,具有广泛的调节基因表达的功能,与生命体的发生、生长、发育和分化过程密切相关。miRNA除了对靶基因mRNA的翻译抑制、降解等起到负调控作用,还有去抑制和miRNA激活作用等正调控作用,以及竞争性内源RNA(ceRNA)调控机制。在家蚕中已经鉴定了许多新的miRNA,通过深度测序技术和利用基因芯片数据等分析了蚕体各个发育时期及不同组织中miRNA的表达特征,关于家蚕miRNA的功能及靶基因研究也成为热点。本文对miRNA的形成、生物学功能、靶基因预测等进行概述,并特别介绍家蚕miRNA的研究进展。     

伪狂犬病毒的microRNAs靶基因预测及功能鉴定

为研究猪伪狂犬病毒(Pseudorabies virus,PRV)编码的微小RNA(micro RNA,mi RNA)的功能,本研究通过生物信息学预测结合双荧光素酶报告系统验证方法,对病毒mi RNA(virus mi RNA,vmi RNA)进行靶基因鉴定。结果表明,PRV编码的prv-mi R-LLT1、prv-mi R-LLT7和prv-mi R-LLT9对病毒转录极早期基因IE180有抑制作用,prv-mi R-LLT7对参与调控病毒复制的UL48基因有抑制作用。初步研究表明这些vmi RNA可能在病毒感染过程中具有基因调控作用,本研究结果为进一步研究PRV vmi RNA在病毒复制、免疫逃避及潜伏感染过程中的功能奠定了基础。     

牛bta-miR-26b靶基因EphA2的鉴定

利用miRNA靶基因预测数据库TargetScan,RNA22对bta-miR-26b的靶基因进行预测,并鉴定bta-miR-26b的靶基因。生物信息学分析结果显示,在EphA2基因3′非编码区域（3′-UTR）有bta-miR-26b的保守结合种子序列。扩增含有bta-miR-26b结合位点的靶基因的3′-UTR区,插入双荧光素酶报告载体pmirGLo Dual-LuciferasemiRNA Target Expression vector,与bta-miR-26bmimics共转染Hela细胞后检测荧光素酶的活性变化。通过荧光素酶活性检测证明在体外bta-miR-26b可以与EphA2基因结合,证明EphA2可能为bta-miR-26b的一个靶基因。     

microRNA在猪中的研究进展

microRNA(miRNA)是一类在真核生物中广泛存在的非编码小RNA,通过与目标基因的3′端非编码序列结合,在转录后水平上调控基因的表达,参与许多生物学过程,包括细胞生长、分化、增殖和凋亡等。miRNA的生物合成始于细胞核,分为3个阶段,即pri-miRNA、pre-miRNA、成熟的miRNA分子。前两个阶段在细胞核中完成,第三阶段转移到细胞质中完成。miRNA具有在真核细胞中广泛存在、长度21~24nt、序列具有高度保守性3个特点。研究表明,miRNA参与调控猪胚胎期肌肉发育、胚后期肌肉生长及肉质性状形成,猪前体脂肪细胞分化和脂质沉积,猪体的免疫应答,以及影响病原与机体的相互作用等过程。因此,了解更多的猪miRNA研究进展,可以加深对猪肌肉发育、脂肪代谢、疾病免疫等分子机制的理解,为生猪的健康养殖提供参考。     

microRNA在反刍动物中的研究进展

微小RNA(microRNA,miRNA)是一类长度在22个核苷酸左右的小分子非编码RNA,通过与3'端非翻译区的碱基配对靶向调节mRNA的表达从而抑制其翻译或降解。miRNA广泛存在于动物和植物中,可以参与调节多种发育调控和生物学过程,本文在总结miRNA的来源、作用机制、预测方法及其基因表达与功能的基础上,综述了其在反刍动物中的研究进展。     

microRNA调控胆固醇代谢研究进展

microRNA(miRNA)是一种非编码蛋白的短序列RNA,通过与靶基因靶标区的序列互补配对,抑制mRNA翻译或直接降解mRNA,对靶基因表达起负调控作用。胆固醇是合成机体生理活性物质的重要原料,也是构成细胞膜的主要成分。近年来,关于miRNA调控胆固醇代谢相关研究被重视和报导。本文就miRNA对动物胆固醇代谢调控相关研究进行综述。     

microRNA在猪中的研究进展

microRNA（miRNA）是一类在真核生物中广泛存在的非编码小RNA,通过与目标基因的3'端非编码序列结合,在转录后水平上调控基因的表达,参与许多生物学过程,包括细胞生长、分化、增殖和凋亡等。miRNA的生物合成始于细胞核,分为3个阶段,即pri-miRNA、pre-miRNA、成熟的miRNA分子。前两个阶段在细胞核中完成,第三阶段转移到细胞质中完成。miRNA具有在真核细胞中广泛存在、长度21~24 nt、序列具有高度保守性3个特点。研究表明,miRNA参与调控猪胚胎期肌肉发育、胚后期肌肉生长及肉质性状形成,猪前体脂肪细胞分化和脂质沉积,猪体的免疫应答,以及影响病原与机体的相互作用等过程。因此,了解更多的猪miRNA研究进展,可以加深对猪肌肉发育、脂肪代谢、疾病免疫等分子机制的理解,为生猪的健康养殖提供参考。     

鹿茸组织microRNA的研究进展

梅花鹿鹿茸每年的周期性再生是一个多种组织细胞快速增殖分化的过程,其中大量细胞生长因子参与了对鹿茸生长的调控。microRNA是一类物种间广泛存在的高度保守的非编码单链RNA,通过调控靶基因的翻译发挥其功能作用。本文介绍了microRNA的合成过程及结构,综述了近年来鹿茸组织microRNA的研究进展。microRNA通过调控鹿茸组织生长因子基因的表达,参与鹿茸再生发育的过程。梅花鹿microRNA的研究将有助于从分子水平上揭示鹿茸再生调控的分子机理。     

microRNA与病毒关系研究进展

microRNA是一类广泛存在于真核生物细胞内的含20~22个核苷酸的非编码小RNA,它通过与目的mRNA 3'端非编码区的完全或不完全互补使得靶基因降解或翻译受阻。microRNA参与了众多基因的表达,涉及细胞的分化、发育、凋亡,病毒感染,免疫,机体代谢,肿瘤的发生等众多生命过程。microRNA和病毒的关系错综复杂,宿主细胞编码的microRNA可以对自身或病毒基因产生调控从而影响病毒感染,病毒编码的microRNA也可以对自身或宿主基因产生调控从而影响病毒感染,病毒也可以反过来影响宿主microRNA产生和作用。理清这两者之间的关系有助于科研人员发掘新的思路,更好地开展相关科研工作,为科学研究提供理论上的支持。因此,作者综述了microRNA的发现和命名、生成、作用机制,以及当前对于microRNA和病毒相互关系的新观点。     

慢病毒与microRNA研究进展

正MicroRNA (miRNA)作为一类重要的调控分子广泛存在于动植物体内并且对调控基因表达有着重要的作用。mi RNA是一类高度保守且长度为18～25个核苷酸(nt)的小分子,它不编码蛋白质但却可以通过与蛋白编码基因的m RNA互补结合调控基因的表达。在植物中,通过完全配对结合靶基因而裂解靶m RNA;动物中,通过与靶基因不完全配对结合而抑制蛋白质的翻译。1993年首次在线虫体内发现mi RNA编码基因-lin-4基因,其编码的22 nt     

microRNA研究方法进展

microRNAs是一类21～23核苷酸小非编码RNAs,其通过与靶基因的3’非翻译区间结合抑制靶基因表达,或者使靶基因转录本降解。miRNAs起着一种新调节子的作用,控制大多数蛋白质表达量。在动物中通过实验鉴定的miRNAs编码基因有几百个,大多数都是通过计算机方法预测出来。利用实验的方法预测靶标困难十分大,因此开发了运用计算机靶标预测法。本文就miRNA基因鉴定、靶标预测的方法做一概述。     

猪链球菌鉴定方法的研究进展

猪链球菌是一种重要的人畜共患病病原,现已对我国部分省市的养殖业产生了巨大的影响。该菌血清型众多,生化特征变化较大,鉴定困难。本文就其中几种鉴定方法,如生化鉴定、血清学鉴定、分子水平鉴定等方面进行了综述。     

发情鉴定方法的研究进展

发情鉴定的效率与准确性影响着繁殖性能的高低,决定着以人工授精为主的养殖业的经济效益。文章主要针对目前国内外的发情鉴定方法、灵敏度与准确率进行比较,传统的发情检测是通过观察确定的,检测率的高低取决于母畜发情表现的强度与观察者的经验与频率。检测设备主要是结合数字软件与生物传感设备,因设备与数字处理模型不同准确率存在差异。     

精子获能鉴定方法研究进展

精子获能是哺乳动物受精过程和体外受精技术中的关键环节。本文主要对获能精子的超激活运动、顶体反应、去能因子及呼吸能变化等鉴定方法进行了综述。     

深度测序鉴定绵羊microRNA转录组

本研究采集的Texel绵羊胎儿的背最长肌样品包括5个发育阶段:70、85、100、120和135 d。通过采用Solexa测序技术对混池样品进行了microRNA(miRNA)深度测序,获得了16532850条原始序列读数。使用ACGT101-miR v4.2分析软件对miRNA测序数据进行了深度发掘;通过与最新的哺乳动物成熟miRNA序列(miRNA数据库:miRBase v17.0)、miRNA前体序列、绵羊基因组序列(绵羊基因组数据库,2010年2月)的比对分析,对绵羊microRNA转录组数据库进行了大幅更新,pre-miRNA(miRNA前体)序列增至1529条,编码的miRNA成熟体序列增至1999条。通过实时荧光定量PCR技术对深度测序获得的5个miRNA在混池样品中进行了验证。绵羊miRNA的研究起步较晚,而miRNA的发现与鉴定将促进基因调控机制及miRNA功能的研究。     

常用肉制品鉴定方法研究进展

随着人们生活水平的提高,人们对肉的需求越来越大,这就使一些不法商贩用低价劣质的肉冒充高价优质的肉,所以如何鉴别肉类及其制品是否掺假成为食品安全监管和检测机构迫待解决的问题,所以本文就肉制品鉴定方法的研究进展进行介绍.     

植物miR156及靶基因SPL家族的研究进展

SPL(SQUAMOSA promoter binding protein-like)是绿色植物所特有的一类转录因子,其部分家族成员含有miR156结合位点,在转录水平上受miR156负调控.在拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)等模式植物中,miR156-SPL不仅参与植物的开花调控,同时具有介导植物生育阶段转变、调节植物次生代谢、参与植物光信号转导和胁迫响应等作用.随着生物技术的发展,关于植物中miR156-SPL的研究越来越多,本研究重点阐述miR156-SPL模块在调控植物开花、株型结构、果实发育、胁迫响应等方面的作用及其机制,为进一步探索miR156-SPL模块在草类植物中的功能奠定基础.     

植物miR156及靶基因SPL家族的研究进展

SPL(SQUAMOSA promoter binding protein-like)是绿色植物所特有的一类转录因子,其部分家族成员含有miR156结合位点,在转录水平上受miR156负调控.在拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)等模式植物中,miR156-SPL不仅参与...