京海黄鸡IGF-I基因与生长和屠体性状的关联分析

实验将类胰岛素生长因子I(IGF-I)作为研究鸡生长、屠体性状的候选基因,以京海黄鸡为材料,采用PCR-SSCP技术对京海黄鸡的,IGF-I基因5'非编码区和第1外显子进行SNPs检测和基因型分析,探讨IGF-I基因的多态性与鸡生长、屠体性状之间的关系.在IGF-I基因5'端非编码区上发现1个突变,统计结果显示:活重、腿肌重、半净膛重和全净膛重在不同基因型之间均存在显著差异(P<0.05),AA基因型显著高于BB基因型个体.结果表明:该基因可能调控鸡生长、屠体性状或与控制生长、屠体性状的主基因连锁.由此推测,可以将IGF-I基因作为鸡生长、屠体性状的辅助标记.     

京海黄鸡IGF-Ⅰ基因与生长和屠体性状的关联分析

实验将类胰岛素生长因子Ⅰ(IGF-Ⅰ)作为研究鸡生长、屠体性状的候选基因,以京海黄鸡为材料,采用PCR-SSCP技术对京海黄鸡的IGF-Ⅰ基因5′非编码区和第1外显子进行SNPs检测和基因型分析,探讨IGF-Ⅰ基因的多态性与鸡生长、屠体性状之间的关系。在IGF-Ⅰ基因5′端非编码区上发现1个突变,统计结果显示:活重、腿肌重、半净膛重和全净膛重在不同基因型之间均存在显著差异(P<0.05),AA基因型显著高于BB基因型个体。结果表明:该基因可能调控鸡生长、屠体性状或与控制生长、屠体性状的主基因连锁。由此推测,可以将IGF-Ⅰ基因作为鸡生长、屠体性状的辅助标记。     

京海黄鸡GH基因与生长、屠体性状的关联分析

试验将生长激素(GH)基因作为影响鸡生长、屠体性状的候选基因,以京海黄鸡为材料,采用PCR-SSCP技术对京海黄鸡的GH基因的5个外显子进行SNPs检测和基因型分析,探讨GH基因的多态性与鸡生长、屠体性状之间的关系.在GH基因外显子4上发现突变位点,表现为3种基因型,分别为AA、AB和BB基因型.统计结果显示,公鸡的活重、脾重、肝重、头重、脚重、腺胃重、肌胃重、腿肌重和半净膛重在不同基因型间呈现差异显著(P<0.05),AA基因型最高.母鸡的脾重、肝重、脚重在不同基因型间差异显著,其余性状在各基因型间差异均不显著(P>0.05).这表明该基因可能调控鸡生长、屠体性状的主效基因或与控制生长、屠体性状的主基因连锁,可以将该突变位点作为京海黄鸡进行生长、屠体性状筛选的候选分子辅助标记.     

鸡MSTN基因多态性及其与屠体性状的关联分析

为了探明肌肉生长抑制素(Myostatin,MSTN)基因对鸡屠体性状的影响,以优质鸡S3系为研究对象,采用PCR-RFLP及测序技术进行多态性检测.结果发现MSTN基因存在G195C和A234G 2个突变位点,均出现3种基因型.公鸡群体在G195C位点处于非Hardy-Weinberg平衡状态(P＜0.05),各群体在G195C和A234G位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05).最小二乘方差分析显示,MSTN基因A234G位点处GG基因型S3系优质公鸡半净膛率和全净膛率显著高于AG基因型(P＜0.05),而AA型与GG型和AG型在这两项上差异不显著(P＞0.05);G195C位点CC基因型S3系优质母鸡的半净膛率、全净膛率、胸肌重和腿肌重均显著高于GG基因型(P＜0.05),GC型与GG型和CC型均不显著(P＞0.05).因此,MSTN可能是影响鸡骨骼肌生长的一个主效基因或与控制该性状的主效基因连锁,能够作为候选基因用于地方鸡屠体性状的分子标记辅助选择.     

京海黄鸡MC4R基因多态性及其与部分屠体性状的关联分析

以140只京海黄鸡个体为研究对象,采用PCR-SSCP和克隆测序技术分析了鸡MC4R基因的多态性。结果表明:MC4R基因第662位发生G→C突变,第733~734位间插入1个C碱基;χ2检验结果表明,实验中发现的多态位点均处于Hardy-Weinberg不平衡状态;GLM分析结果显示,AB型个体腿肌重极显著高于BB型(P0.01),DD型个体胴体重和半净膛重显著高于CD型(P0.05),AA/DD组合型个体具有高于其他基因型的趋势。因此推测,MC4R基因可以作为影响和控制鸡屠体性状的候选基因。     

线粒体DNA COX3基因多态性与瓢鸡生长和屠体性状的相关性分析

采用DNA测序和PCR-RFLP方法,分析了瓢鸡线粒体DNA COX3基因(mt DNA COX3)变异,并与生长和屠体性状进行了关联分析。在瓢鸡线粒体DNA COX3基因发现C10669T多态位点,建立了Eco RV PCR-RFLP分子标记,利用该标记对300日龄具有生长和屠体性状记录的82只瓢鸡进行了基因分型。结果表明,线粒体DNA COX3基因C10669T多态位点在瓢鸡群体中C基因为优势基因,基因频率为69.5%,多态信息含量和杂合度分别为0.3341与0.4240。C10669T位点基因型在体重、龙骨长、跖长、屠体重与胸肌率5个性状差异显著,C基因型个体普遍高于T基因型。线粒体DNA COX3基因对瓢鸡生长和屠体性状的作用机理有待进一步深入分析。     

鸡PRR5L基因5'UTR多态性及其与脂肪性状、屠体性状的关联分析

试验旨在研究类富脯氨酸5（proline rich 5 like,PRR5L）基因遗传变异对鸡脂肪性状及屠体性状的影响。以矮脚黄鸡为研究对象,根据GenBank公布的鸡PRR5L基因全序列（登录号：XM_015287209.1）设计扩增引物,利用PCR直接测序技术检测PRR5L基因的5'UTR区域单核苷酸多态性（SNPs）,并用统计学方法分析其与鸡脂肪性状及屠体性状的关联性。结果发现,PRR5L基因5'UTR区域存在C480G、G514A和A579G 3个多态位点,均表现出3种基因型。χ²适合性检验结果发现,群体在G514A位点处于Hardy-Weinberg非平衡状态（P < 0.05）;在C480G和A579G位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P > 0.05）。基因型与性状关联分析结果显示,在脂肪性状方面,PRR5L基因3个多态位点各基因型间腹脂重、腹脂率和肌内脂肪含量差异均不显著（P > 0.05）;在屠体性状方面,在G514A位点处AG与GG基因型的胸肌重差异显著（P < 0.05）,其余指标差异均不显著（P > 0.05）。因此,可推断PRR5L基因5'UTR的G514A位点可能是一个影响鸡胸肌生长发育的位点,但该位点能否作为标识鸡屠体性状的分子标记辅助选择还需要进一步探究。     

籽鹅GH基因内含子3多态性及其与体重和屠体性状的关联分析

根据鸭生长激素基因内含子3的序列设计引物，利用PCR—SSCP方法对籽鹅进行了单核苷酸多态性分析，并检测其多态性。结果表明，籽鹅生长激素基因内含子3长约364bp，共发现了7个突变位点，分别为A160G、C167G、T264C突变，以及AA型个体在176、177位点G、A碱基缺失和BB型个体在231、232位点C、T碱基缺失。产生AA、AB和BB3种基因型，其中BB基因型为优势基因型，且基因型频率表现为BB〉AB〉AA；卡方检验结果表明，基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡（P〉0．05）。不同基因型与体重和屠体性状的关联分析结果表明：BB基因型个体的7周龄体重、9周龄体重、10周龄体重、胸肌重、胸肌率及心脏重显著高于AA型个体（P〈0．05）；BB基因型个体8周龄体重显著高于AB型个体（P〈0O．05）；在所分析的性状中，BB基因型个体的均值最大，AB型次之，AA型最小。     

MC3R基因对京海黄鸡屠体性状的遗传效应分析

本研究以MC3R基因为鸡屠体性状的候选基因,旨在探讨其对京海黄鸡屠体性状的影响。运用PCR-SSCP方法结合测序技术,检测了MC3R基因在京海黄鸡群体中的多态性,并采用一般线性模型(GLM)分析基因型与屠体性状的遗传效应。结果显示,MC3R基因CDS序列检测区内,引物MR2、MR3和MR8扩增的片段具有多态性,其中引物MR2和MR3扩增片段均存在2个SNP位点,分别形成AA、AB、AC 3种基因型和EE、EF、FF、EH 4种基因型,引物MR8扩增片段只存在1个SNP位点,形成了KK、KL和LL 3种基因型;检测到的5个SNPs位点分别为CDS区C160A、G192T、C273T、G310A、G762A突变。关联分析结果显示,MR2位点对京海黄鸡各屠体性状(除腹脂质量)均有极显著影响(P0.01);MR3位点各基因型(排除个体数少于3的基因型)屠体性状间差异均不显著(P0.05),推断MR3位点对京海黄鸡屠体性状影响不显著(P0.05);MR8位点对京海黄鸡屠体质量、胸肌质量、腿肌质量、全净膛质量、半净膛质量有极显著影响(P0.01),对活体质量和腹脂质量有显著影响(P0.05)。对MR2和MR8 2个位点的效应进行联合分析,结果显示,2个位点组合基因型对所有屠体性状均有显著或极显著影响(P0.05或P0.01),其中AB/KK基因型组合为有利基因型组合,AA/LL基因型组合为不利基因型组合。因此,本研究可为京海黄鸡分子标记辅助育种提供依据,有利于加快对京海黄鸡屠体性状选择的育种进程,同时通过本研究可推测MC3R基因对家禽的屠体性状具有很大的遗传效应,为家禽育种工作提供理论依据。     

鸡IGF-Ⅰ基因SNPs及其对屠体性状的遗传效应分析

以180只3个品系的温岭草鸡为材料,采用PCR-RFLP方法测定了IGF-Ⅰ基因的3个SNPs座位,同时分析了它们对屠体性状的遗传效应.结果显示PstⅠ、HinfⅠ和TaqⅠ识别座位分别发生T→C、C→A和C→T突变,每个SNPs座位各出现了3种基因型,其中A系在3个座位上均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05).方差分析显示每个座位基因型对部分屠体性状都有极显著或显著的差异(P≤0.01或0.01＜P≤0.05).多重比较显示在其中6个屠体性状上,每个座位3种基因型的最小二乘均值之间均有突变型＞杂合型＞野生型的关系,联合基因型QF/QF和QE/QF的最小二乘均值在4个屠体性状上显著高于(0.01＜P≤0.05)联合基因型PE/QE,每个座位突变等位基因都对部分屠体性状具有增效作用.A系和B系之间的遗传距离为0.005 3,聚类分析表明两系同为1枝.     

温岭草鸡GH基因多态性及其与生长和屠体性状的相关性研究

以温岭草鸡优质、中速和快大3个品系为试验材料,采用PCR-RFLP方法,研究其生长激素(GH)基因的多态性及其对生长和屠体性状的影响。结果表明:(1)PCR产物酶切得到AA、AB、BB、CC、AC和BC共6种基因型。优质系(Ⅰ)中,C基因频率最高,A基因频率最低;中速系(Ⅱ)中,各等位基因频率接近;快大系(Ⅲ)中,B基因频率最低,A、C基因频率接近。(2)3个品系PIC值均大于0.5,χ2检验显示3个品系中,6种基因型分布差异极显著(P<0.01);Hardy-Weinberg平衡检验表明,品系Ⅰ和Ⅱ符合平衡定律,品系Ⅲ不符合。(3)GLM分析表明,基因型对全净膛重、腿肌重和腹脂重影响显著(P值分别为0.039、0.047、0.016),对活重、屠体重、半净膛重及胸肌重影响不显著(P>0.05)。多重比较显示,BC基因型的活重、屠体重、半净膛重、全净膛重、胸肌重和腿肌重的平均值最大,AA基因型最小;BB基因型的腹脂重平均值最大,AA基因型最小,二者差异极显著(P<0.01)。     

鸡PRR5L基因5′UTR多态性及其与脂肪性状、屠体性状的关联分析

试验旨在研究类富脯氨酸5(proline rich 5like,PRR5L)基因遗传变异对鸡脂肪性状及屠体性状的影响。以矮脚黄鸡为研究对象,根据GenBank公布的鸡PRR5L基因全序列(登录号:XM_015287209.1)设计扩增引物,利用PCR直接测序技术检测PRR5L基因的5′UTR区域单核苷酸多态性(SNPs),并用统计学方法分析其与鸡脂肪性状及屠体性状的关联性。结果发现,PRR5L基因5′UTR区域存在C480G、G514A和A579G3个多态位点,均表现出3种基因型。χ2适合性检验结果发现,群体在G514A位点处于Hardy-Weinberg非平衡状态(P0.05);在C480G和A579G位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P0.05)。基因型与性状关联分析结果显示,在脂肪性状方面,PRR5L基因3个多态位点各基因型间腹脂重、腹脂率和肌内脂肪含量差异均不显著(P0.05);在屠体性状方面,在G514A位点处AG与GG基因型的胸肌重差异显著(P0.05),其余指标差异均不显著(P0.05)。因此,可推断PRR5L基因5′UTR的G514A位点可能是一个影响鸡胸肌生长发育的位点,但该位点能否作为标识鸡屠体性状的分子标记辅助选择还需要进一步探究。     

鸡PIK3C2A基因第6内含子多态性及其与体尺和屠体性状的关联分析

本研究采用直接测序法检测了无量山乌骨鸡磷脂酰肌醇-4-磷酸3-激酶催化亚基2型α(PIK3C2A)基因内含子的单核苷酸多态性(SNPs),并分析其与体尺和屠体性状的关联性。研究发现,在鸡PIK3C2A基因内含子上共检测到5个SNPs。关联分析表明,g.38511TA位点与龙骨长和胫围相关(P0.05),g.38573CT位点与盆骨宽和胫围相关(P0.05),g.38632TC和g.38662AG位点与胸角和胫围相关(P0.05),g.38729CT位点与胸角和盆骨宽相关(P0.05或P0.01);g.38511TA位点与屠体率相关(P0.05),g.38632TC位点与活重、屠体重、半净膛重、全净膛重、腹脂重和腹脂率相关(P0.05或P0.01),g.38662AG和g.38729CT位点与活重、屠体重、半净膛重、全净膛重和胸肌率相关(P0.05或P0.01)。本研究结果表明,PIK3C2A基因的5个SNPs位点与无量山乌骨鸡的体尺和屠体性状相关(P0.01),可作为鸡体尺和屠体性状的分子标记辅助选种。     

荆江麻鸭A-FABP基因内含子2多态性及其与屠体性状的关联研究

采用PCR-SSCP法检测了96只荆江麻鸭A-FABP基因内含子2的多态性,并对基因多态性与屠体性状进行关联分析。结果发现,本试验群体中检测到AA、AB和BB 3种基因型,其中AA、BB基因型频率相同,均为0.2083,A、B等位基因频率均为0.5000,群体该多态位点处于Hardy-Weinberg遗传平衡状态。最小二乘分析结果显示,荆江麻鸭A-FABP基因内含子2多态位点AA基因型个体活重、腿肌率和瘦肉率显著高于BB基因型(P0.05),皮脂率显著低于BB基因型(P0.05)。初步推断,A-FABP基因可作为影响荆江麻鸭皮脂性状的候选基因(标记),其中基因型AA为有利基因型。     

鸡CACNA1S基因SNPs及其与部分屠体性状的关联性研究

为了研究L型钙离子通道α1亚单位(CACNA1S)编码基因与动物肌肉收缩和发育的关系,试验采用PCR-SSCP技术,首次对萧山鸡、仙居鸡、灵昆鸡、萧山鸡×仙居鸡杂交F1代、爱拔益加鸡(AA鸡)CACNA1S基因5’-调控区(5’-UTR)和外显子1进行多态性检测,同时结合屠体性状进行关联分析。结果表明:试验群体CACNA1S基因5’-UTR和外显子1存在2个单核苷酸多态性(SNPs)位点与屠体性状关联;SNPs716位点JJ基因型的胸肌率极显著大于KK基因型(P<0.01),SNPs1711位点YY基因型的胸肌率极显著大于XY和XX基因型(P<0.01),YY基因型的半净膛率极显著大于XX基因型(P<0.01)。初步推断CACNA1S基因可能是影响鸡部分屠体性状(全净膛率、半净膛率、胸肌率、腿肌率)的主效基因或与主效基因连锁,并且这些突变位点可能作为分子遗传标记用来选择鸡的屠体性状。     

PIK3C2A基因多态性及其与宁海黄鸡和广西黄鸡屠体性状的相关分析

磷脂酰肌醇-4-磷酸3-激酶催化亚基2型α(phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase,catalytic subunit type 2 alpha,PIK3C2A)基因在生物体中主要参与细胞代谢、细胞增殖以及细胞内蛋白质的转移,并与蛋白质合成以及肌肉质量有关。本研究分析宁海黄鸡和广西黄鸡2个国内优质地方鸡种PIK3C2A基因多态性及其与屠体性状之间的相关性,以期为标记辅助选择提供理论依据。应用鸡高密度(600 K)SNP芯片对PIK3C2A基因中的单核苷酸多态性(SNP)进行分析,在总共被检测出的42个SNPs中,有4个SNPs(rs312835349、rs13757033、rs16466818和rs317679804)位于PIK3C2A基因的外显子区域,且这4个SNPs共显示出3种基因型(AA、AB和BB),并呈现出中度多态性;在PIK3C2A基因内含子区域的38个SNPs中,发现宁海黄鸡的7个SNPs和广西黄鸡的6个SNPs分别与部分屠体性状显著相关(P0.05或P0.01),其中有3个SNPs为2个鸡品种共有(C939A、T6477C和A38680G),推测这3个SNPs可能是鸡标记辅助选种的潜在候选遗传标记。研究结果表明,PIK3C2A基因可能是影响鸡屠体性状的关键基因之一,可作为分子标记辅助选择的候选基因。     

GHRL及其受体GHSR基因多态性与鸭生长及屠体性状的关联性

本研究旨在分析GHRL和GHSR基因部分SNP和单倍型与鸭生长和屠体性状的关联性.试验以三水白鸭为材料,利用PCR-RFLP方法检测GHRL基因C-729T、T+985C和GHSR基因T404C、G3427A共4个SNPs位点的多态性,构建单倍型,进行方差分析.结果表明,C-792T与21、28、35和49日龄体质量、全净膛质量、胸腺质量显著相关(P<0.05),CT基因型杂合子优势明显;T404C与腿肌和脾脏质量显著相关(P<0.05),TT基因型个体均值显著高于CC和TC型个体;G3427A与35日龄体质量、49日龄体质量、屠体质量、半净膛质量、全净膛质量和翅质量显著相关(P<0.05),AA基因型是较为优势的基因型;T+985C与各生长、屠体性状都不相关(P>0.05).所构建的单倍型与单个SNP的分析结果较为一致,表明这3个SNPs是鸭生长和屠体性状的重要分子标记.     

影响羔羊屠体性状的遗传和环境因素

为迅速改进羔羊肉的生产可以在杂交育种中使用多胎品种。本试验采用德国黑头羊、得克赛尔、芬兰兰德瑞斯及它们的杂种的羔羊屠体。平均日增重(羔羊生长潜力的最好估计)和屠体尺寸之间的相关比较低(r≤0.32)。这个相关说明,除了屠体性状外,出生重和断奶重可对日增重作出良好估计。在不同羔羊群之间的高价分割肉块百分数产量未见明显差异。     

鹅MTTP基因多态性与脂质指标和屠体性状的相关研究

利用PCR-SSCP技术检测四川白鹅(n=24)和朗德鹅(n=33)MTTP基因的第8、18和21外显子的多态性,计算基因频率和基因型频率,并将发现的多态性与鹅肝脂质指标和屠体性状进行关联分析,研究MTTP基因多态性与鹅肝脂质指标和屠体性状的相关关系。结果发现,鹅MTTP基因第21外显子130 bp处存在G→A突变,该突变位点在朗德鹅群体中表现出AA和BB 2种基因型,AA基因型鹅的肝脂质指标和屠体性状与BB基因型个体差异不显著(P0.05);在四川白鹅群体中仅存在BB基因型,鹅MTTP基因的该突变位点对鹅肝脂质指标和屠体性状的影响不显著。     

鹌鹑MC3R基因的SNPs及其与生长和屠体性状的目关研究

以法国沙维玛特肉用鹌鹑为试验材料,对MC3R基因进行PCR扩增,采用PCR-SSCP技术结合测序分析了MC3R基因在该鹌鹑群体中的多态性.结果表明:该鹌鹑群体中存在3个突变位点,分别是T46C、G73A和T62A,检测到了AA、BB、CC、AB、AC、BC 6种基因型,A等位基因频率为0.429,B等位基因频率为0.335,C等位基因频率为0.236.经过基因型与体重的关联分析得知:各基因型对2、3、5周龄的体重影响显著(P＜0.05);与屠体性状相关分析结果显示,各基因型对宰前活重、全净膛重影响显著(P＜0.5),对半净膛重影响极显著(P＜0.01),但对其相应的产率无影响(P＞0.5).因此推测MC3R基因可能为影响鹌鹑体重和屠体性状的主效基因或与主效基因相连锁.