基于genic-SSR标记的MCID法鉴定浙江白沙枇杷地方种质资源

【目的】建立基于genic-SSR分子标记的鉴定白肉枇杷种质资源的方法,为白肉枇杷资源的品种审定与产业化利用提供依据。【方法】利用10对多态性枇杷genic-SSR引物对新收集的14份浙江地方白沙枇杷种质进行分子鉴定,并应用人工绘制品种鉴别示意图的方法(MCID法)与12个现有白沙枇杷品种建立品种鉴定图(CID)。【结果】仅用5对SSR引物就可将新收集的白沙枇杷新种质与现有品种区分。应用MCID法,依据扩增的多态性核酸片段与对应的引物构建了26份白沙枇杷资源的CID图。从CID图上可找出区分任意2个品种的引物。随机选择各亚组内、亚组间或小组内、小组间的6份种质进行验证,结果与得到的CID图谱一致。聚类结果表明,26个白沙枇杷种质与品种的聚类模式基本符合这些种质的地理起源与遗传背景信息。【结论】基于genic-SSR的MCID法是一种能有效鉴定白沙枇杷种质资源的方法,可应用于枇杷品种鉴定与品种指纹图谱构建。     

43份云南野生枇杷种质遗传多样性与亲缘关系分析

应用SSR、SRAP等2种分子标记方法,分析了43份云南野生枇杷种质的遗传多样性及其与部分栽培品种、野生近缘种的亲缘关系。结果表明：云南野生枇杷种质具有较丰富的遗传多样性,其多态性位点百分数为91.32%,平均期望杂合度为0.3165,平均香农多样性指数为0.4753;在相似系数0.751水平上,43份材料可被划分入4个大类,其中类Ⅲ在相似系数0.816处可细分为6个亚类;主成分分析则更为直观地展现了种质间的亲缘关系。聚类结果与种质类型相关,并呈现出一定的地域性分布规律。结合形态学特征,鉴定该批云南野生种质以栎叶枇杷种内类型居多,甚至有出现变种的可能。     

枇杷种质资源数量分类研究

 对国家果树种质福州枇杷圃的199份枇杷[Eriobotrya japonica（Thunb.）Lindl.]种质资源,应用数量分类学中的Q型聚类分析方法进行分类,并对86个性状进行R型聚类分析和主成分分析。Q型聚类分析将199份种质资源在L = 87.31水平分为栽培品种和野生资源两大类,在L = 34.92水平分为5个组群,组群内来源地相同的种质资源多聚为小组,显示出较近的亲缘关系;R型聚类分析结果将86个性状明显聚为3组,多数性状表现两两相关或关系密切;主成分分析表明,86个性状可简化为28个主因子,其累积贡献率达74.7%,根据28个因子载荷量,选出影响力比较大的性状58个。     

枇杷属植物及其近缘属植物亲缘关系的RAPD分析

利用RAPD分子标记技术对中国20份枇杷属植物种质资源及其近缘属植物(石楠和石斑木)进行了遗传亲缘关系及分类研究。从300条10碱基随机引物中筛选出24条引物对20份枇杷种质资源的基因组DNA进行扩增,共产生232条谱带,全部为多态性谱带(多态率为100%),表明枇杷属植物种质之间具有丰富的多态性。各种质间的相似性系数为0.33~0.77,并根据相似性系数,利用UPGMA构建了亲缘关系树状图。在相似性系数为0.485时,20份枇杷属植物及其近缘属可分为3大类:所有的枇杷属植物聚在一起构成第1类,而石楠和石斑木分别构成其余2类,这与传统的分类方法一致;但18份枇杷属种质可分为5个亚类,这与枇杷属植物的传统分类法有所不同。初步推论,开花时间和老叶叶背的茸毛可能不是判断枇杷属植物亲缘关系的必要条件,而且枇杷属植物的进化与其生存的地理环境的变迁有着密切联系。     

芥菜种质资源的RAPD和ISSR分析

利用RAPD和ISSR标记对28份芥菜种质资源进行遗传多样性分析,20个RAPD引物共扩增出162条清晰的谱带,其中140条显示多态性,平均每个引物扩增出7.0条多态性谱带.18个ISSR引物共扩增出143条清晰的谱带,其中多态性谱带124条,平均每个引物扩增出6.9条多态性谱带.基于RAPD和ISSR两种标记,利用UPGMA分别构建了28份芥菜资源的聚类树状图.结果表明,RAPD和ISSR分别聚类以及两种标记混合聚类均将28份芥菜种质分为3类:第Ⅰ类群中包括了15份种质;第Ⅱ类群中包括了9份种质;第Ⅲ类群中包括了4份种质.     

枇杷种质资源坐果的遗传多样性及其相关分析

对国家果树种质福州枇杷资源圃内239份枇杷种质的坐果进行了鉴定评价,结果显示,枇杷种质资源坐果存在丰富的遗传多样性,不同种质类型的枇杷坐果遗传多样性较大,野生枇杷种质坐果达29．5个,大于其他枇杷种质类型,不同国家间枇杷种质坐果遗传多样性不大,但中国13个省（区）间遗传多样性较为丰富,源自云南的种质坐果46．1个,源自台湾的种质坐果仅为9．2个。枇杷种质坐果分布广,种质问差异大,坐果最高的为63．8个,最低的仅为3．8个,平均15．1个,以坐果在6～15个的枇杷种质最多,达150份,占62．8％：高于33个的枇杷种质11份;低于6个的有5份。根据综合分析结果,初步提出了枇杷种质坐果的分级标准。为了解枇杷种质坐果的影响因素,对6个质量性状因子各自不同水平下坐果的差异进行统计分析,结果表明野生枇杷与地方品种、选育品种和野生近缘种的坐果有极显著差异;枇杷种质不同果实排列紧密度间的坐果以及源自云南的枇杷种质与其他省（区）枇杷的坐果均有极显著差异;6个国家（中国、日本、西班牙、新西兰、美国和南非）间、不同果实着生姿态间和果肉颜色间的枇杷种质坐果的差异均不显著。对9个数量性状因子与坐果的相关分析表明,果穗长度和花序支轴数对枇杷种质坐果有极显著影响;花冠直径和侧枝数对坐果有显著影响;其他性状（叶片宽度、总叶片数、叶片长度、中心枝长度和中心枝粗度）对坐果没有影响。本文为枇杷种质资源的坐果生物学研究提供了理论依据。     

黄皮种质资源果实性状多样性分析及其数量分类研究

为深入了解黄皮(Clausena lansium)种质资源果实性状的多样性,根据《黄皮种质资源描述规范和数据标准》,对农业部广州黄皮种质资源圃中保存的96份黄皮种质果实性状进行观测,并结合Q型聚类、R型聚类和主成分分析等方法开展数量分类研究。结果表明,22个描述型性状,平均每个性状的变异类型达3.4个,其中种子形状的变异类型最为丰富,为6个。16个数量性状中,穗粒数的变异系数最大,为58.78%;种子侧径的变异系数最小,为6.34%。Q型聚类分析将96份种质在欧氏距离19.84处分为4个类群,类群内的种质资源以果穗性状、果实大小和果实风味聚类;R型聚类分析将38个果实性状在相关系数1.45时分为4组,多数性状表现两两相关;主成分分析结果表明,第1、第2主成分解释的总变异为28.16%,其分析结果与聚类分析基本一致。     

国家果树种质南京桃资源圃初级核心种质构建

 利用国家果树种质南京桃资源圃中保存的630份资源的60个描述项信息,通过比较分组、逐步聚类和随机3类取样方法,以及取样比例的筛选,进行了初级核心种质构建研究。结果显示：逐步聚类取样方法优于分组取样和完全随机取样方法;逐步聚类取样方法的最适取样比例为15%;不同聚类模型间存在差异,聚类后的取样方法间也存在差异;欧式距离和内平方距离法逐步聚类后优先选取高均偏种质的方法更适宜桃初级核心种质的构建。通过缺失表型添加,构建的初级核心种质包括99份资源,占原始库的15.7%,具100%表型保留比例。经多样性指数、表型方差、变异系数检验,以及数量性状的均值和极差符合率检验,初级核心种质具有良好的代表性。     

菠萝蜜遗传多样性的ISSR分析

用ISSR标记方法对76份菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus Lam.)种质资源DNA的遗传多样性进行了检测,24个引物共检测到477条带,其中427条具多态性(占89.52%),平均PIC为0.23,24个引物能把76份种质完全区分开来。遗传距离分析结果显示供试种质的遗传多样性较低,在DNA水平上的遗传相似系数为0.626～0.945,平均为0.775。聚类分析表明,76份菠萝蜜材料在遗传距离系数为0.752处可分为4大类,其中热带植物园的种质WJ2和GSYWJ1与其他种质的遗传距离相对较大,干胞和湿类型不能独立聚类。另外各地区的种质与雷州半岛种质明显分开聚类,而雷州半岛各地区的种质混杂聚类在一起,不能按地区单独聚类。     

橄榄种质资源果实表型性状多样性分析及其数量分类研究

【目的】分析橄榄种质果实表型性状多样性,并根据其多样性进行数量分类。【方法】参考《果树种质资源描述符—记载项目及评价标准》和《橄榄种质资源描述规范和数据标准》等标准进行观测和描述,应用Q型聚类、R型聚类和主成分分析等方法。【结果】11个数量性状中,单果质量的变异系数最大为42.00%,可食率的变异系数最小为3.44%。16个描述性状平均变异类型2.9个,果实形状的变异类型最为丰富,为5个。Q型聚类分析将60份种质资源在欧氏距离为27.81时分为3个组群,组群内的种质资源以果实的形状、大小和品质聚类;R型聚类分析将27个表型性状在相关系数2.27处聚为3组,多数性状表现两两相关或关系密切;主成分分析结果将27个表型性状简化为8个主成分,包含果实形状等16个表型性状。【结论】橄榄种质资源的果实表型性状存在丰富的多样性,果实形状等16个表型性状对数量分类起重要作用。     

吉林省主栽番茄品种的数量分类研究

在对吉林省主栽番茄品种进行调查的基础上,把数量分类学中的Q型聚类分析方法应用于33个番茄品种的分类,并对15个性状进行了R型聚类分析。结果表明:Q型聚类分析的抗寒性应作为番茄品种分类的一级标准,果色、果型单独分别作为分类标准。等级结合线L1(D=4.40)将33个分类单位分为3个类群。R型聚类分析15个性状被分为3个类群,性状间关系不密切,但又相互影响。     

西双版纳黄瓜种质资源形态鉴定和亲缘关系的初步研究

通过对30份西双版纳黄瓜种质资源5个质量性状和13个数量性状的形态鉴定。结果显示:30份西双版纳黄瓜种质在形态水平上具有一定的遗传多样性。与性型分化和侧枝发生相关的5个数量性状的差异较大,变异系数较高。子叶长等8个性状差异不明显。基于形态性状的聚类分析结果,29份种质可分为5组,分组结果与其重要农艺性状基本吻合。     

中国华北和东北地区杓兰属植物的数量分类研究

 在对华北和东北地区杓兰属（Cypripedium L.）植物种质资源调查基础上,应用数量分类学 中的Q 型聚类分析法对38 份杓兰代表样本进行分类研究,并对20 个形态性状进行R 型聚类分析和主成 分分析。Q 型聚类分析将这38 份样品在Lq1 = 0.25 水平分为山西杓兰群和其他杓兰群两个类群,在Lq2 = 0.155 水平将其他杓兰群分为3 个亚群,结果显示大花杓兰（C. macranthos Sw.）与山西杓兰（C. shanxience S. C. Chen）亲缘关系最远,中间过度类型多为大花杓兰与黄囊杓兰（C. calceolus L.）之间的天然杂交后 代。R 型聚类分析树系图显示各性状分布较为分散,相互独立。主成分分析表明20 个性状特征综合成的 9 个主成分中前5 个主成分的累积贡献率高达80.81%,结合其与性状间的相关性,筛选出影响力大的13 个重要性状。     

蜡梅品种的数量分类研究

在对蜡梅品种进行调查的基础上, 根据其形态特征对调查到的62个蜡梅品种进行命名, 把数量分类学中的Q型聚类分析方法应用于蜡梅62个品种的分类, 并对24个性状进行了R型聚类分析和主成分分析。Q型聚类分析的结果表明: 内被片颜色应作为蜡梅品种分类的一级标准, 晕心、乔种和红心不易分别单独作为分类标准, 应将晕心归并到素心中, 乔种和红心归并到紫心当中, 由此将蜡梅品种按照内被片颜色分为素心、紫心和绿心三大类; 此外, 聚类分析还表明中被片的形状即其长宽比在蜡梅品种分类中也起着重要的作用, 因此将其作为蜡梅品种分类的二级标准; R型聚类分析的结果揭示了24个性状特征对进化具有独立作用; 主成分分析表明: 24个性状可综合为9个主成分, 其累积贡献率达77.3% , 根据前9个主成分与性状间的相关性, 选出了影响力比较大的16个性状。     

不同小生境缙云黄芩形态变异数量分析

运用方差分析、聚类分析及主成分分析等统计分析方法,对缙云山特有植物缙云黄芩(Scutellaria tsinyunensis)在不同小生境下的形态特征进行了研究,结果表明:在研究的36项形态性状中,有77.8%的性状表现出在居群之间差异显著,其中有61.1%的性状差异极显著.聚类分析和主成分分析显示,缙云黄芩的形态特征在整体水平上表现出分化上的无序性,即不同居群的个体常交叉聚在同一个表征群内,但在同一表征群内,同一居群的多数个体常能聚在一起,表明居群之间在形态特征上发生了一定程度的分化,而这种分化还不能清楚地区分不同的居群.     

茭白资源的系统聚类分析及综合评估

对 2 0份有代表性的茭白资源 ,在对 4个营养品质性状和 9个数值型农艺性状观察的基础上进行了系统聚类分析。该分类方法可以很好地将单季茭和双季茭区分开。在品质性状上 ,双季茭不及单季茭 ,早熟品种不及晚熟品种。从中选出了一个品质性状优异的地方品种单季茭黄湾茭。在双季茭中 ,筛选出农艺性状优异、品质性状较好的已在生产上应用的新品系 8970。     

福建地方梨资源果实性状多样性分析及其数量分类研究

对保存的50份福建省地方梨资源的26个果实性状进行数据采集,分析果实性状的分布频率、变异系数和Shannon-Weaver指数,应用Q型和R型聚类分析法对种质和性状进行分类,并基于果实性状进行主成分分析。结果表明:(1)所收集种质的果实描述性状多样性丰富,以果点明显、果锈多、果面粗糙、果肉脆、风味酸甜、无涩味、果心小和成熟期为9月的种质居多,分别占92%、52%、54%、50%、50%、70%、54%和80%。(2)数量性状中维生素C含量变异系数(67.60%)最大,其次为可滴定酸含量(48.26%)、糖酸比(42.22%)和固酸比(41.14%)。(3)描述性状Shannon-Weaver指数范围0.324～1.660,其中颜色和形状较高,多样性最丰富,而数量性状Shannon-Weaver指数范围达1.698～2.074,表现出更丰富的多样性。(4)Q型聚类分析在欧式距离为14.71时将供试种质分为5个组,组内具有一定的特征,组间存在差异,但并未发现按地域聚类的趋势;R型聚类分析在相关系数1.236处将果实性状聚为5组,多数性状间表现两两相关,部分性状间逻辑相关性明显。(5)主成分分析发现前10个主成分反映86.545%的贡献率,各性状贡献率较为分散,性状变异具有多向性;第1主成分的正向增长有利于提高果实内在品质,而第2、4主成分的正向增长有利于提高果实外观品质,第3主成分负向增长有利于增大果实大小。     

利用方差分析和聚类分析法进行香菇种质资源评价

本研究选取了80个香菇菌株,系统地测定了包括农艺、生态、生理生化在内的88个性状,建立了每一性状统一、标准的测定和分析方法,并对每一菌株、每一性状测定值进行规范化处理,然后输入微机系统,在方差分析和聚类分析的基础上作出遗传性状的综合评价,建立香菇种质资源库。     

42个中国南瓜自交系主要农艺性状多样性分析

以42份中国南瓜自交系为材料,对其16个主要农艺性状进行调查和分析。结果表明,中国南瓜在果实性状、叶片性状上差异较大,其中单果质量变异系数最大,达到46．74％,叶长变异系数最小,为11．29％。通过聚类分析,42份材料被分为4个类群,具有一定的地域性特征,对南瓜材料的选择和品种培育有一定指导意义。主成分分析表明．叶片大小、果实形状、单果质量、果实颜色等是植物学多样性的重要指标。