DGGE技术及其在瘤胃微生物多样性研究中的应用

基于可靠性强、重现性高、方便快捷等优点,变性梯度凝胶电泳（DGGE）技术已经成为微生物群落多样性和动态分析的强有力工具。本文在阐述PCR—DGGE原理及流程的的基础上,对DGGE技术在瘤胃微生物多样性研究中的具体应用及其局限性与改进方法进行了全面阐述。     

PCR-DGGE分子技术及其在畜牧业中的应用

传统的以微生物培养为手段的研究方法极大地限制了对微生物的研究。作者综述了以16S rRNA 为主要研究对象的DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis)技术的原理及优缺点,以DGGE为主要手段结合PCR 扩增分析对微生物的群落结构和多样性研究的最新动态。     

DGGE技术在瘤胃微生物多态性研究中的应用

变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术是一种新型的用于检测核酸变异和点突变的电泳方法,具有可靠性强、重现性高、方便快捷等优点,可应用于瘤胃微生物群落多样性和动态性分析.本文对DGGE技术的原理、优点、在瘤胃微生物群落多样性和动态性分析方面的应用结果及今后的发展方向进行了全面论述,为更好地认识和应用该技术提供了参考.     

DGGE技市在动物胃肠道微生态研究中的应用

变性梯度凝胶电(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,DGGE)术是通过直接分离核酸片段对微生物群落进行研究,由于其具有可靠性强、重复性好、方便快捷等优点.被广泛应用于微生物群落多样性和动态性分析,并成为微生物分子生态学研究中的热点技术之一.本文主要介绍DGGE技术的原理、工作流程及优缺点.并着重分析了其在动物胃肠道微生态研究中的应用.     

变性梯度凝胶电泳（DGGE）的研究进展

DGGE技术是由Fischer等于1979年提出的一种用于检测DNA突变的电泳技术[1],之后Myers等首次在DGGE的引物中使用“GC夹子”,使得突变检出率大大提高,从而进一步完善了该技术。1993年,Muyzer等将DGGE技术应用于微生物的生态学研究,并且证实了该技术在研究自然界微生物群落的种群差异性和遗传多样性方面具有突出的优越性[2]。与传统的菌种分离培养技术及生理生化指标检测相比,DGGE技术通过对微生物群落的核酸信息进行分析,能更准确、更快速的对菌群进行鉴定,同时可鉴定出自然状态下不可培养的菌株。由于DGGE技术具有重现性高、可靠性强和高效快捷等优点[3],现以用于微生物群落的复杂性分析、检测微生物种群动态变化、对比细菌的富集培养及分离培养、单基因组中rRNA的多样性分析、DNA提取方法比较等方面,在废水、海洋、森林、土壤等环境样品研究以及发酵工艺、植物内生真菌研究、种群演替规律研究等领域广泛应用。     

变性梯度凝胶电泳(DGGE)的研究进展

DGGE技术是由Fischer等于1979年提出的一种用于检测DNA突变的电泳技术[1],之后Myers等首次在DGGE的引物中使用"GC夹子",使得突变检出率大大提高,从而进一步完善了该技术。1993年,Muyzer等将DGGE技术应用于微生物的生态学研究,并且证实了该技术在研究自然界微生物群落的种群差异性和遗传多样性方面具有突出的优越性[2]。与传统的菌种分离培养技术及生理生化指标检测相比,DGGE技术通过对微生物群落的核酸信息进行分析,能更准确、更快速的对菌群进行鉴定,同时可鉴定出自然状态下不可培养的菌株。由于DGGE技术具有重现性高、可靠性强和高效快捷等优点[3],现以用于微生物群落的复杂性分析、检测微生物种群动态变化、对比细菌的富集培养及分离培养、单基因组中r RNA的多样性分析、DNA提取方法比较等方面,在废水、海洋、森林、土壤等环境样品研究以及发酵工艺、植物内生真菌研究、种群演替规律研究等领域广泛应用。     

一种快速的酸奶质量跟踪监测检验新方法

分析酸奶中的菌种组成是酸奶质量控制的重要指标。本文用PCR—DGGE（denaturing gradient gel electrophotesis，变性梯度凝胶电泳）指纹图谱技术对市售某品牌酸奶在1个月内进行了动态监测。共收集了6个生产批次的18个酸奶样品，通过建立16S rDNA V3区PCR—DGGE分析、DGGE图谱条带割胶回收测序等一套完整的检测评价方法．结合常规分离培养方法．对样品微生物组成及其稳定性进行跟踪监测。结果显示。所有供试样品在整个动态监测期内DGGE指纹图谱都出现2条带．显示。其微生物组成比较稳定．割胶回收测序结果表明其微生物组成与厂家标注完全一致．分别为Lactobacillus delbrueckii subsp．balgaricus（保加利亚乳杆菌）和Streptococcus thermophilus（嗜热链球菌）。分离计数结果表明前者比后者低3个数量级．二者的DGGE条带亮度也有显著差别。本研究用菌种组成及其稳定性两个指标对酸奶样品质量进行评价，建立了DGGE评价方法，结果表明。该技术可以作为酸奶质量控制和动态监测的快速简便的新方法。     

DGGE技术在瘤胃微生物多态性研究中的应用

利用传统的方法很难鉴别瘤胃微生物的差异,变性梯度凝胶电泳（DGGE）技术就很好地解决了该问题。DGGE是一种新型的用于检测核酸变异和点突变的电泳方法,具有可靠性强、重现性高、方便快捷等优点,可应用于瘤胃微生物群落多样性和动态性分析。     

DGGE技术在瘤胃微生物多态性研究中的应用

利用传统的方法很难鉴别瘤胃微生物的差异,变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术就很好地解决了该问题.DGGE是一种新型的用于检测核酸变异和点突变的电泳方法,具有可靠性强、重现性高、方便快捷等优点,可应用于瘤胃微生物群落多样性和动态性分析.     

应用PCR-DGGE分析南美白对虾肠道微生物多样性

从南美白对虾肠道中提取微生物基因组总DNA,以细菌16SrRNA基因通用引物341F/534R进行V3高变异区域PCR扩增,长约200bp的PCR产物纯化后经变性梯度凝胶电泳(DGGE)分离,获得微生物群落的特征DNA指纹图谱。通过DGGE图谱的半定量分析,发现样品的优势群落明显。结果表明,PCR-DGGE是研究水产动物肠道微生物多样性的可行方法。