锦鲤疱疹病毒组织灭活疫苗研制初探

本研究的目的是制备针对锦鲤疱疹病毒的组织浆灭活疫苗,用来控制目前集约化养殖鲤鱼大面积暴发的锦鲤疱疹病毒。利用现场采集的病死鱼内脏,匀浆后腹腔注射进行攻毒试验,采集攻毒后病死鱼的内脏匀浆后,加入0.5%甲醛制备组织浆灭活疫苗。确定所制疫苗无杂菌污染后,在实验室内对6组实验鱼采用不同的接种方法进行疫苗接种,同时设立阴性对照组。实验结果表明,所得疫苗可以在一定程度上降低死亡率,但不能100%的控制发病,具体原因有待进一步探讨。     

逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)检测5种养殖石斑鱼的神经坏死病毒

神经坏死病毒(Nervous necrosis virus)是导致多种海水鱼类神经性病害的致病原.发病及死亡的石斑鱼除了表现神经异常症状外,无明显的临床病症,体表及内脏组织也未发现明显病变及寄生虫感染.2003年4～8月,应用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术从福建南部人工养殖的5种石斑鱼即紫石斑鱼(Epinephelus lanceolatus)、马拉巴石斑鱼(E. malabaricus)、青石斑鱼(E. awoara)、赤点石斑鱼(E. akaara)和云纹石斑鱼(E. moara)中检出5个神经坏死病毒分离株.检测了76份石斑鱼样品,这些石斑鱼NNV病毒的平均感染率约为90%.对这些病毒的RT-PCR产物421 bp核酸进行了测序和序列分析,其相同的序列超过99%.将这些序列与GenBank的石斑鱼(Epinephelus spp.)神经坏死病毒相关基因序列作比较,同源性在97%以上.对神经坏死病毒在石斑鱼体内的分布也进行了分析,在脑和眼组织的检出率最高,部分病鱼的肝、脾和肾组织也能检出病毒.结合流行病学特征,可确认神经坏死病毒为该传染病的主要致病原.RT-PCR方法是检测NNV等病原的一种理想的诊断方法.     

聚合酶链式反应（PCR）技术及其在水产业的应用

聚合酶链式反应(Potgnerase Chain Reaction，PCR)由美国PE公司遗传部的Mullis于1984年发明建立，Mullis因此而获93年度诺贝尔化学奖；1985年，Sairi等人首先于《Science》杂志上完整地描述了该反应，1987年美国专利局授予PCR技术专利。1988年，Muilis等人又从黄石公园温泉中分离出嗜热菌Thermus aouaticus并从中提取Tag DNA聚合酶，     

锦鲤养殖严防锦鲤疱疹病毒

疱疹病毒简称KHV（英文为KOI HERPESVIRUS）,该病毒具有很强的传染性,会引起鲤鱼的大量死亡,自从1996年在英国被发现以来,迅速传播到世界上几乎所有的锦鲤养殖国家,据公开报道,1998年在以色列暴发,2003年在日本暴发,传播速度非常之快,对锦鲤养殖业造成巨大的打击,养殖业者更是闻之色变。     

锦鲤疱疹病毒单交叉引物等温扩增检测方法的建立

本文根据锦鲤疱疹病毒(Koi herpes virus,KHV)保守的DNA聚合酶(Sph)基因,设计一组单交叉扩增引物,以构建的Sph基因重组质粒作为标准DNA模板,采用单交叉引物等温扩增技术(Single cross priming amplification,SCPA)进行扩增及优化反应体系,并结合核酸试纸条技术(Nucleic acid test strip detection method),建立了快速可视化检测锦鲤疱疹病毒的单交叉引物等温扩增检测方法(KHV-SCPA)。KHV-SCPA法可在63℃下60min内实现循环扩增,扩增产物经凝胶电泳呈现梯形条带,可特异性地检测出KHV,灵敏度较之常规PCR方法提高约1000倍。结合核酸试纸条检测技术,在3~5min内可对反应产物进行可视化检测。KHV-SCPA检测方法不依赖昂贵的仪器设备与专业技术人员,可应用于锦鲤疱疹病毒的现场快速检测中,为锦鲤疱疹病毒病的准确快速诊断和有效防控提供了技术支撑。     

锦鲤疱疹病毒GZ1301株的分离与鉴定

2013年4月,广东省一锦鲤养殖场暴发不明病因疾病,濒死锦鲤在塘边游动缓慢直至死亡,死亡率高达100%。现场采样发现,发病锦鲤体长25 cm,眼球凹陷,胸鳍及腹鳍出现出血斑点,解剖发现内脏器官包括肝、脾、肾肿大。细菌分离结果显示,内脏器官肝脏和肾脏中未分离到细菌。提取自然发病鱼的肝、脾、肾、鳃组织DNA作为模板,采用世界动物卫生组织(OIE)推荐的锦鲤疱疹病毒(KHV)检测引物进行PCR扩增,均能扩增出预期大小的特异性产物。NCBI的Blast搜索结果显示,扩增序列与KHV胸苷激酶(thymidine kinase,TK)基因核苷酸序列同源性为99%。病鱼内脏组织研磨过滤除菌后,腹腔注射20尾锦鲤,可复制出与自然发病相似的症状,并于7 d内全部死亡。取病鱼的鳃和肾脏研磨过滤除菌后进行细胞感染实验,结果显示,组织滤液感染CCB细胞后,盲传5代可以观察到典型的细胞病变效应(CPE)。将出现典型CPE的CCB细胞进行超薄切片制备和电镜观察,电镜下病毒呈对称20面体,直径约100 nm。将出现典型CPE的细胞进行间接免疫荧光实验,可以观察到特异性荧光。根据TK基因全长序列建立系统进化树,证实该毒株为KHV亚洲型毒株,暂命名为KHV-GZ1301株。研究结果可为KHV起源进化、分类以及疾病防控提供重要材料。     

应用PCR和RT-PCR技术对4种对虾病毒的检测

探讨了应用PCR和RT－PCR技术对4种主要的对虾病毒进行检测的方法。同时使用该方法检测了对虾天然饵料－－卤虫中的4种对虾病毒。结果显示，含病毒核酸的阳性对照样品分别扩增出了大小为824bp,705bp,260bp和216bp的预期产物，但未能从卤虫样品中检测到此4种病毒的存在。本文报道的病毒检测方法具有快速、灵敏、准确的特点，可以用于进出口贸易中对活体或冰冻对虾，虾苗，对虾饵料等进行相关对虾病毒的检疫，也为制定我国对虾病毒检疫检验规范提供了技术参考。     

锦鲤疱疹病毒ORF72基因克隆及结构功能分析

于辽宁丹东采集感染锦鲤疱疹病毒的活鲤Cyprinus carpio样品,经DNA提取、PCR扩增、重组质粒构建步骤成功克隆锦鲤疱疹病毒ORF72基因,并利用生物信息学软件分析ORF72蛋白结构与功能,构建系统进化树。结果显示:ORF72基因开放阅读框共1113bp,编码蛋白由370个氨基酸组成,理论相对分子质量为40.5KD;ORF72蛋白主要由α螺旋、β折叠、无规则卷曲3种二级结构组成;N端35个氨基酸序列为信号肽序列。跨膜结构分析表明:ORF72蛋白无跨膜区,保守结构域预测表明ORF72含有一个保守结构域,抗原表位分析表明,抗原性较好。结构预测显示:ORF72氨基酸序列存在2个潜在的N-糖基化位点、1个潜在的O-糖基化位点、19个潜在的磷酸化位点。系统进化树分析发现,其与锦鲤疱疹病毒美国株、以色列株属同一分支。     

锦鲤疱疹病毒主要囊膜蛋白基因的PCR扩增与序列分析

为了进一步研究锦鲤疱疹病毒主要囊膜蛋白（KHV-MEP）的功能及锦鲤疱疹病毒（KHV）的感染机制,根据KHV-MEP基因序列设计并合成1对引物,从自然感染KHV发病的锦鲤（Cyprinus carpio Koi）肝组织总DNA中扩增获得特异性基因片段。将所得基因片段克隆到pMD18-T Simple Vector载体中,获得重组质粒T-KMEP;酶切鉴定后进行序列测定,并采用氨基酸亲水性分析软件TMpred对其编码氨基酸序列进行分析;在对该片段所编码氨基酸可能抗原位点分析的基础上,进行PCR改造构建原核表达载体,获得重组表达载体pBV-KMEP1和pBV-KMEP2。所获得的基因片段大小为771bp,该基因片段与GenBank中已登录的KHV-MEP基因（AB178537）的同源性为100%,是一个完整的开放阅读框,所编码的蛋白由256个氨基酸组成,分子量为28.2kD,等电点（PI）为8.65。该序列含有4个跨膜区,可构成主要抗原决定簇。结果显示所获得的目的基因片段就是锦鲤主要囊膜蛋白全基因。     

锦鲤疱疹病毒3型ORF126基因克隆及生物信息学分析

为研究锦鲤疱疹病毒3型(KHV-3)ORF126基因编码蛋白的功能,我们对该蛋白的结构特征进行研究分析。本实验采用PCR扩增技术获得KHV ORF126基因的完整序列,构建pMD19-T-ORF 126重组质粒,应用生物信息学方法分析ORF126基因编码蛋白的理化特征。结果显示:KHV ORF126基因翻译合成273个氨基酸;ExPasy预测该蛋白的理论分子量为29.9kDa,等电点为5.11;信号肽的切割部位最可能位于第19~20位氨基酸之间;跨膜区位于第145~168位氨基酸;抗原表位预测显示抗原性良好;编码蛋白不含N-糖基化位点,含有4个O-糖基化位点和17个磷酸化位点。     

Detection of Koi herpesvirus: impact of extraction method,primer set and DNA polymerase on the sensitivity of polymerase chain reaction examinations

Since virus isolation is seldom successful, KHV infection is commonly detected by PCR examination. A number of different PCR assays have been described in recent years. However, at present no commonly accepted PCR method is used amongst different laboratories. The aim of this study was to check if the examination of infected fish by different PCR methods yielded comparable results. We used tissue samples of three KHV‐infected koi, one KHV‐infected common carp, one KHV‐infected goldfish and one non‐infected common carp. DNA was extracted with DNAzol Reagent, High Pure PCR Template DNA Preparation Kit and QIAamp DNA Mini Kit. The DNA was tested by PCR with different combinations of published primer sets –KHV‐F and ‐R, KHV‐Gray‐2F and ‐2R and KHV‐TKf and ‐TKr – plus different DNA polymerases – a standard Taq DNA polymerase, a Platinum (hotstart) Taq DNA polymerase and a Platinum (hotstart) Pfx DNA polymerase with proofreading activity. The different extraction methods produced DNA solutions with different yields of DNA and different degrees of homogeneity. Also, the sensitivity of the PCR depended on the choice of the primer set and polymerase. Not all infected fish could be identified with all methods; there were large differences in the sensitivity between methods.     

应用逆转录聚合酶链反应直接检测草鱼出血病病鱼组织的研究

人工感染ＧＣＨＶ－８６１后，对处于潜伏期、发病期和恢复期等不同时期的草鱼内脏组织匀浆上清液进行逆转录聚合酶链反应扩增，除恢复期的１条草鱼外，其余样品均到特异扩增带，对照组都没有，预示着ＲＴ－ＰＣＲ技术对于草鱼出血病的早期诊断、防治及抗病育种具有重要意义。     

Sensitivity of seven PCRs for early detection of koi herpesvirus in experimentally infected carp,Cyprinus carpio L., by lethal and non-lethal sampling methods

Koi herpesvirus (KHV) causes an economically important, highly infectious disease in common carp and koi, Cyprinus carpio L. Since the occurrence of mass mortalities worldwide, highly specific and sensitive molecular diagnostic methods have been developed for KHV detection. The sensitivity and reliability of these assays have essentially focused at the detection of low viral DNA copy numbers during latent or persistent infections. However, the efficacy of these assays has not been investigated with regard to low-level viraemia during acute infection stages. This study was conducted to compare the sensitivity of seven different polymerase chain reaction (PCR) assays to detect KHV during the first hours and days post-infection (hpi; dpi), using lethal and non-lethal sampling methods. The results highlight the limitations of the assays for detecting virus during the first 4 dpi despite rapid mortality in experimentally infected carp. False-negative results were associated with time post-infection and the tissue sampled. Non-lethal sampling appears effective for KHV screening, with efficient detection in mucus samples obtained from external swabs during this early infection period (<5 dpi), while biopsies from gills and kidney were negative using the same PCR assays. Non-lethal sampling may improve the reliability of KHV detection in subclinical, acutely infected carp.     

鳜鱼病毒PCR诊断方法的建立

从ＲＡＰＤ扩增的鳜鱼病毒（ＳＣＶ）核酸电泳带中回收了二个片断，克隆子pUC19质粒（称为ＳＣＶＥ３６９和ＳＣＶＥ４５０），序列分析表明插入片段分别为３６９bp和450bp与ＧenBank序列没有显著的同源，根据克隆序列调计两对引物Ｐ１／Ｐ２和Ｐ３／Ｐ４ ，在健康鳜鱼，病鳜以及提纯的ＳＣＶ核酸中进行ＰＣＲ试验，结果表明，Ｐ１／Ｐ２组引物在ＳＣＶ基因组中扩增出特异性核酸片段，可作为鳜鱼病毒ＰＣＲ诊断，检测片段为３６９bp.     

基于核酸适配体的PCR法检测溶藻弧菌及其灭活菌

溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)分布广,数量多,发病率高,是水产养殖中常见的条件致病菌,而对溶藻弧菌进行快速准确的识别鉴定是其病害防治的前提和基础。核酸适配体,因为具有较高的亲和特异性,在微生物的识别鉴定方面展现出了巨大的优势。本文利用核酸适配体和适配体筛选产物,通过结合、洗涤、加热分离、PCR扩增以及电泳检测等步骤,对溶藻弧菌进行了检测鉴定。结果表明,适配体和筛选产物都能对溶藻弧菌及其灭活菌进行较好的识别鉴定,适配体筛选产物对溶藻弧菌的检测下限为10~3cfu/mL,而对其灭活菌的检测下限为10~2cfu/mL,适配体对溶藻弧菌及其灭活菌的检测下限都可达到10 cfu/mL。该方法对溶藻弧菌有较好的亲和特异性,并能较好地区分溶藻弧菌与哈维氏弧菌等水产常见病原菌,在水产病害的检测中显示了较好的应用前景。     

用逆转录多聚酶链式反应从凡纳对虾中检出传染性皮下组织和造血器官坏死病毒

传染性皮下组织和造血器官坏死病毒 (ＩＨＨＮＶ) ,是一种细小病毒 ,它能感染所有起源于中胚层和外胚层的对虾组织细胞[1] 。在许多养殖对虾的国家都有ＩＨＨＮＶ ,特别是中美洲国家和地区[2 ] 的对虾养殖业深受其害。随着各国间对虾贸易的急剧增长 ,ＩＨＨＮＶ地理分布范围日益广泛 ,迄今为止 ,已扩散到中国台湾、新加坡、马来西亚、泰国、印度尼西亚、澳大利亚、菲律宾、厄瓜多尔、秘鲁等国家和地区[2 -4] 。红额角对虾 (Ｐｅｎａｅｕｓｓｔｙｌｉｒｏｓｔｒｉｓ)、斑节对虾 (Ｐ .ｍｏｎｏｄｏｎ)、短沟对虾 (Ｐ .ｓｅｍｉｓｕｌｃａｔｕ…     

TaqMan real-time polymerase chain reaction assay for rapid detection of Flavobacterium columnare

Flavobacterium columnare is a ubiquitous Gram-negative bacterium that causes columnaris disease in a wide variety of fish worldwide. Timely detection of this bacterium is important to prevent its spreading and to reduce the economic loss to fish farmers. We developed a TaqMan-based real-time polymerase chain reaction (PCR) targeting a 113 bp nucleotide region of the chondroitin AC lyase gene of F. columnare G₄. Specificity of the assay evaluated with 20 isolates of F. columnare and 15 other taxonomically or ecologically related bacteria revealed that the primers and probe were 100% specific for detection of F. columnare. The sensitivity limit of detection of F. columnare in pure cultures, over a range of dilutions [3.1 × 10⁰–3.1 × 10⁶ colony-forming units (CFU) mL⁻¹], was observed to be ∼3 bacterial cells. The lowest limit of detection in nucleic acids from pure culture of F. columnare was 5.4 fg and the assay was linear with the log of amount of nucleic acid (R²=0.994) over that range (5.4 ng–5.4 fg). In tissues (blood, gills and kidney) of F. columnare experimentally infected fish, the bacterial numbers measured by TaqMan real-time PCR ranged from 3.4 × 10⁰ to 9.5 × 10⁵ CFU mL⁻¹. In both F. columnare experimentally infected and spiked samples, positive PCR results were confirmed by bacteriological culture with 100% agreement. The TaqMan real-time PCR developed in this study is specific, sensitive and reproducible for the detection and quantitation of F. columnare in infected fish.     

对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV) PCR检测方法的建立

对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)病是国际兽疫局(OIE)划定的甲壳类其他重要疾病之一,它分布较广,危害严重,对世界对虾养殖业发展影响重大.本文根据Genbank登录的IHHNV基因序列(AF218266),设计了1对特异性引物,从纯化的IHHNV DNA和感染IHHNV凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)组织DNA中成功地扩增出产物大小为703bp的DNA片段,该对引物对IHHNV DNA的检测灵敏度为19.85fg(8.83×103病毒拷贝),与健康对虾组织DNA、对虾白斑综合征病毒(WSSV) DNA及对虾肝胰腺细小病毒(HPV) DNA无交叉反应.本方法可快速、灵敏、特异地检测出对虾感染和携带IHHNV状况,为对虾健康养殖、无特定病原(SPF)种群选育及流行病调查提供了有效的检测手段.     

应用多聚酶链反应检测生鸡肉中沙门氏菌的研究

目的:建立快速、特异、灵敏的PCR方法以检测生鸡肉中的肠炎沙门氏菌。方法:以肠炎沙门氏菌的sefA基因作为靶序列设计一对引物,将样品增菌后用煮沸法提取细菌基因组DNA进行检测。结果:每克生鸡肉污染3.0×10°CFU肠炎沙门氏菌,经16h增菌培养后可扩增出500bp特异性性DNA带,对28份屠宰场样品的检测结果与传统方法相符合。结论:PCR法适于生鸡肉中肠炎沙门氏菌的快速、准确检测。