一种先进的畜禽遗传评定方法--动物模型BLUP法

动物模型BLUP法是一种先进的动物育种值估计方法,已广泛应用于畜禽的遗传评定中,本文主要介绍了其基本原理、特征、应用现状,并对其应用前景进行了展望。     

一种先进的畜禽遗传评定方法——动物模型BLUP法

动物模型BLUP法是一种先进的动物育种值估计方法，已广泛应用于畜禽的遗传评定中，本文主要介绍了其基本原理、特征、应用现状，并对其应用前景进行了展望。     

美国奶牛生产性状和体型外貌性状的遗传评定

美国对奶牛生产性能和体型外貌性状的遗传评定采用的是动物模型计算方法，动物模型是计算预期传递力（PTA）最先进的方法。体型外貌性状的遗传评定由美国荷斯坦奶牛协会承担，生产性能的预期传递力、体细胞评分、生产年限和净价值（NetMerit）的计算则由美国农业部家畜改良计划实验室（USDA－AIPL）进行。动物模型的评定方法是根据动物个体与其它评定的个体的亲缘关系来进行的。动物个体本身、祖先和后代的信息，与被评定个体间的所有已知亲缘关系信息综合到一起，并利用了母系信息，包括母系祖先信息和母系后裔信息。在动物模型的遗…     

二郎山山地鸡两品系主要繁殖性状遗传参数的估计及分析

近年来随着统计与计算方法的不断完善,基于动物模型的BLUP(Best linear unbiased prediction)已被广泛应用于畜禽的遗传评定中[1]。畜禽评定的准确性取决与对这些性状遗传规律——性状遗传参数的了解。目前,建立动物模型进行约束最大似然法(Restricted Maximum Likelihood)     

应用优秀种公牛改良中国荷斯坦牛群的效果分析

分析了应用优秀种公牛改良黑龙江省中国荷斯坦奶牛群主要经济性状的效果。结果表明：该地区多年来推广优良种公牛提高了生产水平,改善了奶牛群体型和繁殖力,同时证明了合理利用优秀种公牛仍是目前提高遗传品质,加速牛群育种进展,创造高产长寿奶牛群的有效途径。在种畜遗传评定中分析比较了不同模型育种植的估计结果,论证了采用动物模型进行种畜评定的准确性要高于公畜模型。     

多性状动物模型对考力代羊生长性状遗传参数的估计

用多性状动物模型估计考力代羊体重的遗传参数,从而获得较准确的遗传参数估值。使用1 269只考力代羊的生长发育记录3 332个,用多性状动物模型,分不考虑误差间协方差和考虑误差间协方差两种情况估计考力代羊生长性状的遗传参数。结果表明:不考虑误差间协方差时,直接遗传力估值依次为0.28、0.79、0.77、0.64和0.65;考虑误差间协方差时,则为0.28、0.33、0.30、0.23和0.21。遗传和表型相关在两种情况下都有相同的特点,月龄相差越大,相关越小。说明当不考虑误差间协方差时,分析结果遗传力被过高地估计。     

中国从加拿大奶业网引进奶牛测定日模型遗传评估系统已开始启用

中国农业大学、中国奶业协会联合与加拿大奶业网（CDN）于2006年在北京签署了奶牛测定日模型遗传评估系统的引进协议。2007年中国奶业协会已应用此系统对部分有后裔测定成绩的种公牛进行了个体遗传评估．这标志我国奶牛遗传评估系统已有新的突破。传统动物模型奶牛遗传评估系统存在一定的缺陷，主要包括需要通过测定日记录估计泌乳期记录，估计的过程本身存在较大的误差：对只作用于一定泌乳阶段的系统环境效应．无法在模型中直接考虑：假设性状的育种值在一个泌乳期内保持不变等。为解决上述问题．1993年加拿大圭尔夫大学著名教授Larry Schaeffer首次提出了测定日模型．其原理是利用奶牛泌乳测定日记录直接估计奶牛泌乳测定日育种值，进而得到泌乳期育种值。目前世界上奶业发达国家加拿大、德国、荷兰等国家均采用测定日模型对奶牛进行个体遗传评定。     

动物模型在荷斯坦牛遗传评定上的应用

本研究应用动物模型在ＢＬＵＰ法微机上评定了北京地区１９６５－１９９２年间出生的荷斯坦牛４１０８０头，建立了一套荷斯坦牛的动物模型评定系统。迭代求解采用间接解法，在阅读数据文件时进行。对于管理组、公牛与牛场互作、永久环境效应、采用Ｇａｕｓｓ－Ｓｅｉｄｅｌ迭代法，对于动物个体和遗传组效应，采用不完全的Ｊａｃｏｂｉ迭代法。提供预期传递力，父母传递力均数、预期生产力、表型均值等有用的遗传和生产信息，在配备     

动物模型在荷斯坦牛遗传评定上的应用

本研究应用动物模型ＢＬＵＰ法在微机上评定了北京地区１９６５￣１９９２年间出生的荷斯坦牛４１０８０头，建立了一套荷斯坦牛的动物模型评定系统。迭代求解采用间接解法，在阅读数据文件时进行。对于管理组、公牛与牛场互作、永久环境效应，采用Ｇａｕｓｓ－Ｓｅｉｄｅｌ迭代法，对于动物个体和遗传组效应，采用不完全的Ｊａｃｏｂｉ迭代法。提供预期传递力、父母传递力均数、预期生产力、表型均值等有用的遗传和生产信息。在配备     

EPD估计的原理与应用

EPD是在BLUP理论的基础上对种用动物遗传值估计的一种参数。EPD值是估计育种值的一半，它是一个容易理解和应用的种畜遗传传递力的值，能很直观地反映种畜价值在其后代中的体现。EPD主要是用在同一品种中2个不同个体间直接遗传效应的比较，从而预测在同一平均遗传值水平上种用动物未来子女的性能差异。EPD适用于动物的出生、发育、母性性状、屠宰性状以及其它特征性状的估计。EPD广泛应用于肉用种公牛价值的评定。对肉牛重要经济性状EPD估计后，以出版物和（或）计算机网络的方式发布，肉牛生产者根据自己的不同需要选用种牛或精液。作者对EPD的估计原理与应用作较为详细的论述。     

奶牛体型线性性状的动物模型遗传评估

本文利用北京市7个奶牛场的奶牛体型线性评定资料,累计收集了4年共1647头母牛的15个线性性状数据,采用最佳线性无偏预测(BLUP,Best Linear Unbiased Prediction)方法,配合个体动物模型(AM,Animal Model),估计了胎次、泌乳月、鉴定日期、奶牛场以及鉴定员等固定环境效应,并计算出了每头奶牛15个线性性状的个体育种值。鉴于奶牛体型线性评定方法在国内正处于推广应用阶段,而BLUP的动物模型方法目前在国内的研究应用也少见报道。本文通过将两者结合起来,估计动物个体的种用价值,结果表明奶牛体型线性评定以第三胎、第三个泌乳月效果较好。经济效益好的场队其牛群也较整齐。不同的鉴定日期、不同的鉴定员对评定结果也略有影响。最后,可以得到剔除固定效应并经过排序用于选择的奶牛个体育种值。处理分析表明效果比较理想,为推动我国的动物育种工作,建议今后在国内大力推广奶牛体型线性评定和动物模型BLUP评估相结合的育种方法和手段。     

北京市奶牛遗传评定概况

本文介绍了北京奶牛中心奶用种公牛遗传评定的发展过程。应用最佳线性无偏预测(BLUP)法估计育种值,经历了从公畜模型向动物模型的转变;中心积累了20多年的育种资料,与中国农大合作编制并实施了动物模型BLUP育种值评定程式,提高了种公牛育种值预测的精确性,加快了奶牛的改良速度;每年出版两期“北京市优秀公牛概要”,逐步与国际奶牛界接轨;建立、实施了奶牛的性能测定体系,使之制度化,测定报告成为奶牛场可靠、科学的生产指导。     

方差组分的最大似然估计

一、引言方差组分估计又称方差分量分析,它大大开阔了方差分析的应用领域.尤其在动植物遗传育种的研究中很有用处,在家畜育种中,多数情况下的遗传参数可以用遗传方差和遗传协方差表示.目前方差组分估计已广泛应用于动物育种的以下几个方面1.构造选择指数.2.混合模型最佳线性无偏估计(Blμp法).     

国际奶牛基因组选择的发展概况

二十一世纪初,基因组选择(Genomic Selection,GS)技术给传统奶牛育种体系带来新的活力。该方法利用基因芯片技术实现规模化的SNP标记多态检测,基于各国积累的大量后裔测定遗传评估结果,实现单个遗传标记或多个遗传标记构成单倍型的遗传效应估计。基因组选择的方法仅利用新生后备种公牛的基因组检测信息,即可实现动物个体的基因组育种值(GEBV)估计,据研究报道,其可靠性高于传统的系谱选择,最高可达75%左右。基因组选择策略实现乳用种公牛的早期选择,极大缩短了奶牛遗传改良的世代间隔,节约选育成本,提高选育效率,目前已在多个奶业发达国家具体实施并公开发布评定结果。本文对国际奶牛基因组选择的发展概况进行归纳综述。     

猪胴体瘦肉率度量与估计方法研究进展

随着人们对动物蛋白质食品需求的不断增长和商品经济的发展,猪胴体瘦肉率评定已成为国内外遗传育种学家、生产者、肉品经营消费者普遍关注的问题。本文将对猪胴体瘦肉率(量)的度量与估计方法进展作一综述。 1 胴体瘦肉率的度量 胴体瘦肉率的评定是随着科学研究的深入而出现     

应用动物模型估计种公牛的育种值

BLUP 法是估计家畜加快遗传效应的最有效方法之一,因此它广泛地应用于种公畜的评定。BLUP 法根据不同育种资料来源可分为固定模型、随机模型、混合模型、公畜模型和动物模型等。目前应用最广的是公畜模型的混合模型,即根据后代(主要是女儿)的记录估计种公畜的育种值,因此它主要应用     

加拿大奶牛遗传评定方法

加拿大是世界上奶业发达的国家之一,其对奶牛的遗传评定有自己的方法。1989年加拿大就已利用动物模型法对其奶牛群进行遗传评定,评定的主要性状是生产性能和体型外貌;而后动物模型法又应用于乳流速度、难产性、在群寿命和体细胞评分。到1999年,加     

基于系谱和基因组信息估计荷斯坦青年母牛体重性状遗传参数

旨在设计利用不同信息来源的模型估计荷斯坦后备牛不同月龄体重性状的遗传参数。本研究于2014—2020年测定并收集了7 122头荷斯坦牛32 338条0～12月龄体重数据,分别利用系谱信息(linear mixed model with pedigree relationship matrix, LM＿A)和系谱-基因组信息构建亲缘关系矩阵(linear mixed model with genotype-pedigree joint relationship matrix, LM＿H),基于母体效应动物模型估计初生重,基于是否考虑初生重作为协变量的单性状动物模型估计2～12月龄各月龄体重遗传力,并利用双性状动物模型估计初生重与其它月龄体重的遗传相关。结果显示,对于初生重,根据赤池信息量准则(Akaike information criterion, AIC),LM＿H方法的拟合程度显著优于LM＿A方法,但两种方法估计的遗传参数相差不大：直接遗传力分别为0.30和0.32,母体遗传力分别为0.08和0.09,个体直接遗传效应和母体遗传效应遗传相关系数分别为-0.65和-0.64;对于2～...     

约克夏猪繁殖性状直接的和母体的加性遗传效应分析

畜禽遗传改良的速度有赖于使生产者能准确地度量生产性能和评估遗传价值的所用手段。建立在动物模型基础上的混合模型方法已成为育种值估计的重要方法,这不仅是因为方法提供了育种值的最佳线性无偏预测值（ＢＬＵＰ）,而且更是因为方法考虑了动物个体间的亲缘关系,同时...     

不同模型估计中国荷斯坦牛生产寿命遗传参数

旨在估计中国荷斯坦牛生产寿命遗传参数,同时比较不同模型的预测可靠性和稳定性。本研究使用单性状动物模型、单性状公畜模型和多性状动物模型对北京地区29个牧场90049头中国荷斯坦母牛的生产寿命数据进行遗传参数估计,所有模型均考虑了场、出生年季、头胎产犊月龄组的固定效应,个体加性遗传效应(动物模型)或父亲遗传效应(公畜模型)的随机效应和残差效应。结果表明,单性状动物模型和单性状公畜模型估计的生产寿命遗传力分别为0.052和0.047,多性状动物模型估计的遗传力较为稳定,介于0.057与0.069之间,多性状动物模型的遗传相关在0.779~0.998之间。对于存在大量在群个体(删失记录)的数据,使用基于前三胎数据的多性状动物模型较为合适,模型预测稳定性更高。本研究对中国荷斯坦牛生产寿命进行了遗传评估,为提高牧场效益、实现平衡育种提供了理论基础。