柑橘黄龙病菌原噬菌体的遗传多样性分析

以采自广东、广西、海南、云南、四川、贵州等6个地区共300份感染柑橘黄龙病菌的DNA样本作为试验材料,通过PCR技术对黄龙病菌携带的3种类型原噬菌体基因进行特异扩增、测序,利用相关生物信息学软件进行遗传多样性分析。结果共鉴定出8种原噬菌体组合;携带单一原噬菌体类型的黄龙病菌株为6个地理种群的优势菌株,占比53.3%,其中以Type 2型为主;3类原噬菌体基因位点中A+T含量均高于G+C,表现出AT偏好特点;重组分析结果显示黄龙病菌间无重组信号,表明未发生重组事件;基因流N_m值均大于1,说明黄龙病菌在各种群中基因交流频繁;中性检验结果显示Tajima’s D、Fu and Li’s D、Fu and Li’s F值均小于0,表明黄龙病菌种群存在过历史扩张。     

基于AFLP技术对陈皮药用柑橘品种遗传多样性的研究

对目前市场流通的陈皮入药柑橘品种的遗传背景进行研究,分析其遗传特性差异。运用AFLP技术分析采自5个省份46份柑橘样品的遗传背景,用NTSYSpc 2.11软件进行聚类分析。结果表明:从12对引物中筛选得到6对AFLP引物组合,共扩增出548个DNA条带,多态性条带为472个,多态性位点百分率86.13%。通过构建系统进化树,在一定程度上实现了陈皮入药柑橘品种的划分。陈皮入药柑橘品种间遗传多样性比较丰富,AFLP分子标记可有效区分不同柑橘品种,为陈皮入药柑橘品种的筛选、划分提供了科学依据。     

贵州修文猕猴桃溃疡病菌遗传多样性分析

为探明贵州修文地区猕猴桃上溃疡病菌的遗传多样性,在修文县多个贵长猕猴桃果园采集感染溃疡病的猕猴桃枝条、叶片、花蕾等材料进行病菌分离,对分离到的病菌进行16S rDNA鉴定及ERIC-PCR遗传多样性分析.结果表明,分离所得的35株病菌均为Pseudomonas syringae pv.actinidiae,在相似系数为...     

红心柚和美国枸橼杂种后代对柑橘溃疡病的抗性评价

为了探究枸橼对柑橘溃疡病(Xanthomonas citri subsp.citri,Xcc)的抗性遗传规律,以感溃疡病品种红心柚为母本,与抗溃疡病种质美国枸橼进行杂交,获得了F₁代杂种,并以F₁自交后获得了F₂代。对F₁杂种进行活体叶片注射接种鉴定,对所有F₂代253株进行离体叶片注射接种鉴定,随后对其中的225株F₂活体叶片进行注射接种鉴定,并对部分F₂代活体叶片接种后进行溃疡病菌定量分析。鉴定结果表明,红心柚和美国枸橼杂交获得的75个F₁全部为感病,没有抗感性状分离。对253株F₂植株离体叶片鉴定结果显示,76株表现为抗病,177株表现为感病。对225株F₂植株活体叶片鉴定结果显示,72株为感病,症状与感病品种‘冰糖橙’类似;118株为较感病,发病程度较‘冰糖橙’轻,与感病亲本红心柚的病症相似;10株为较抗病,抗性接近于抗病亲本美国枸橼;4株为抗病,抗性与抗病种质...     

不同柑橘属种质对柑橘褐斑病菌的抗性评价

【目的】探讨不同柑橘种质及‘梨橙2号’ב晚蜜2号’部分杂交种对柑橘褐斑病菌Alternaria alternata的感病程度及抗性分级标准。【方法】采用室内果实去皮接种观察不同种质的感病程度并根据系统聚类分析法、病斑平均直径法、病情指数法3种抗性评价方法对抗病性进行分级。【结果】大部分宽皮柑橘类种质易感病;甜橙类、柚类和柠檬类种质较抗病。参试的54份种质划分为高抗、抗病、中抗、感病、高感5类,未发现免疫种质;‘胡柚’、‘强德勒’、‘华盛顿脐橙’和‘梁平柚’4个品种为高抗品种。‘梨橙2号’ב晚蜜2号’杂交种抗病性出现分离,可以进行遗传分析。【结论】宽皮柑橘种质及其杂交种和葡萄柚易感病。     

广西地方柑橘资源的ISSR分析

【目的】了解和研究广西地方柑橘资源的亲缘关系和遗传多样性。【方法】以10份外省野生和地方柑橘种质为参照,采用ISSR分子标记技术对10份广西地方柑橘种质和8份姑婆山野生柑橘资源的遗传多样性及其亲缘关系进行分析和评价。【结果】从100条ISSR引物中筛选出12条引物对供试材料进行多态性分析。获得总条带67条,其中多态性条带62条,多态位点百分率为92.54%。聚类结果显示28份资源可分为7个组,其中广西资源分布于6个组,姑婆山野生柑橘被聚为同一组,进而可划分为2个亚组。【结论】ISSR标记能较好地区分广西地方柑橘资源,且广西柑橘地方资源遗传多样性丰富。     

基于p23基因的野生柑橘和栽培柑橘上衰退病毒分离株间的遗传特征分析

【目的】比较分析野生柑橘与栽培柑橘上衰退病毒(CTV)分离株间的分子遗传特征,为深入解析CTV的遗传进化提供相关依据。【方法】运用RT-PCR对我国云南、广西、四川、湖南、江西等省(区)的11个野生柑橘上的CTV分离株和4个国内栽培甜橙及柚上的CTV强弱毒代表株分离株的p23基因进行扩增、测序,所获序列与Gen Bank收录的具有代表性的国外CTV分离株的相应基因序列进行比对分析。【结果】野生柑橘与国内外栽培柑橘上CTV分离株的p23基因序列相似率为87.7%~99.3%;密码子中碱基含量GC%AT%,密码子转换数多于颠换数,第3位的碱基替换数最多,其次为第1位,最少是第2位;非同义突变与同义突变的比值(dN/dS)小于1,表明p23基因在进化过程中承受着净化选择。系统聚类分析表明,来自于野生柑橘上的11个CTV分离株在构建的系统发育树中分属不同的簇支,与不同来源地具有较高相似性和较低遗传距离的栽培柑橘上的CTV分离株构成同一组群。【结论】野生柑橘与栽培柑橘上的CTV分离株在碱基含量、密码子转换和颠换率及非同义突变与同义突变比值(dN/dS)等遗传特征方面均表现出一致性,系统发育分析表明,野生柑橘上CTV分离株基于p23基因序列的聚类关系与其地理来源之间无明显相关性。     

基于重测序的广西姑婆山野生柑橘资源遗传演化及分类地位分析

对4个广西姑婆山野生柑橘、1个枳、1个金柑以及14个其他柑橘进行全基因组重测序,每个样本测序数据量约为16 Gb,平均测序深度为54×。通过基因组比对、SNP检测、PCA主成分分析、邻接法构建系统发育进化树,分析广西贺州姑婆山野生柑橘资源遗传多样性、群体结构及分类地位。从20份样品中,共检测出6 782 158个高质量SNP位点。基于这些SNP位点,根据PCA主成分分析和系统进化树分析结果,可将20份样本分为3类：广西姑婆山野柑与莽山野柑聚为一类,金柑与其他柑橘聚为一类,枳聚为单独一类。该研究表明姑婆山野生柑橘资源与莽山野柑一样具有原始性和独特性,应该为独立的属或者柑橘属中独立的种。     

基于SSR的辽宁铁岭地区平榛遗传多样性与居群遗传结构分析

【目的】研究我国铁岭地区平榛的遗传多样性,指导平榛优良品种选育工作。【方法】采用SSR分子标记的方法,对铁岭市3个平榛主产区共124株平榛材料进行遗传多样性和居群遗传结构分析。【结果】利用12株表型差异大的平榛植株,从56对SSR引物中筛选出12对条带清晰、多态性强的引物。12对引物在124株平榛材料中共扩增出75个基因位点,平均等位基因数为6.25个,观测杂合度(Ho)平均值为0.535 6,预期杂合度(He)的平均值为0.615 7。Shannon’s信息指数(I=1.274 2)和Nei’s多样性指数(H=0.613 2)较高,遗传分化系数(Fst=0.061 6)较低,基因流(Nm=7.599 3)较高,居群间遗传距离(GD0.214 5)较小,遗传一致度(GI0.806 9)较大。【结论】研究结果表明我国铁岭地区平榛的遗传多样性较高,居群间的遗传分化水平较低,且在大部分位点均表现偏离Hardy-Weinberg平衡,杂合度不足,居群间有较高的基因流。     

基于成熟期的杏品种遗传多样性SSR分析

以168份杏育成品种为试材,采用SSR分子标记方法,利用16对多态性好、稳定性强、带型清晰的特征引物,扩增等位基因,研究了不同杏树不同群体的遗传多样性,以期为杏种质资源鉴定和品种亲缘关系分析在分子水平上提供依据。结果表明:杏群体的Nei’s基因多样度平均值为0.715 8,Shannon遗传表型指数为1.497 3,说明杏的总体遗传变异偏高,品种多样性丰富。通过对杏的成熟期进行遗传分析,结果发现,早熟和中熟2个类群的遗传数据相近,推测可能存在相近的遗传关系,晚熟与早熟类群等位基因数据差异较大,说明二者亲缘关系较远。     

基于成熟期的桃品种遗传多样性SSR分析

以95份桃育成品种为试材,利用32对SSR分子标记对桃育成品种进行遗传多样性分析。结果表明:筛选的18对SSR引物共检测出93个等位基因,其中多态性等位基因为50个。桃群体的平均Nei’s基因多样度为0.5652,Shannon遗传表型指数为1.1125,说明桃总群体遗传变异偏低。针对桃的成熟期进行遗传分析,发现早熟和中熟类群遗传数据相似,推测二者亲缘关系相近;同理,推测晚熟品种与前二者关系较远。表明桃的成熟期与其等位基因相关,该研究结果可为进一步研究桃的遗传分析奠定基础。     

铜状元(20%松脂酸铜乳油)对柑橘溃疡病菌的毒力测定

铜状元 ( 2 0 %松脂酸铜乳油 )是我所“松脂酸铜乳油的研制及应用开发”课题组研制的一种有机铜素杀菌剂 ,本试验拟通过室内抑菌试验 ,明确铜状元对柑橘溃疡病菌的毒力 ,并为田间防治试验和示范推广提供理论依据。供试药剂有 :铜状元 ( 2 0 %松脂酸铜乳油 ) ;70 %氧氯化铜可湿性粉剂 (湖南省怀化市兴华化工厂生产、市售 )。将甜橙新鲜溃疡病叶的病斑用 70 %酒精消毒后用无菌水制成细菌悬浮液 ,在牛肉羔蛋白胨培养基上先作分离培养 ,再从这些培养中选无污染者在斜面培养基上作纯培养 (培养温度 2 7± 1℃ )。铜状元溃疡病菌的毒力测定—抑菌…     

基于SSR 标记的四川野生中国樱桃遗传多样性和居群遗传结构分析

 采用SSR 分子标记技术对四川野生中国樱桃5 个居群共133 株的遗传多样性水平及居群的 遗传结构进行了研究。结果显示：10 对SSR 引物共检测到78 个等位基因,平均每位点等位基因7.8 个。 Nei’s 基因多样性指数（H）为0.6112 ~ 0.6689,Shannon’s 信息指数（I）为1.1984 ~ 1.3786。基于分子方 差分析（AMOVA）,92.53%的变异来自居群内,7.47%的遗传变异来自于居群间。居群间遗传距离（GD < 0.2416）、遗传一致度（GI > 0.7854）、遗传分化指数（Fst = 0.0844）以及较强的基因流（Nm = 2.7125）均 表明居群间的遗传分化水平较低,居群内存在显著近交现象（Fis = 0.3986）,且居群在大多数位点上偏离 Hardy-Weinberg 平衡。基于上述结果,分析讨论了居群较高遗传多样性和居群间较低遗传分化形成的可能 原因,并提出野生中国樱桃的保护利用策略。     

不同居群艾种质遗传多样性和遗传结构分析

以12个艾居群和22条SCoT引物为试材,采用NTSYS-pc2.1、Popegen 1.32等分析方法对12个居群的遗传多样性和群体结构特征进行研究,以期为艾新品种选育提供参考依据。结果表明：22条SCoT引物共检测出87个主要等位基因变异,平均每条引物3.95个;多态性信息含量PIC值、Shannon′s多样性指数I值和Nei′s基因多样性指数H平均值分别为0.690、0.483和0.317,表现出较高的遗传多样性。居群每个位点平均等位基因数(Na)、每个位点平均有效等位基因数(Ne)、I和期望杂合度(He)平均值分别为1.444、1.419、0.349、0.238,以安阳汤阴县艾居群Na、I、H值最高。居群遗传相似系数和遗传距离范围为0.795～0.975和0.025～0.229,平均值为0.909和0.097。其中,济源艾居群和黄冈蕲春艾居群的遗传相似系数最高、遗传距离最近。SCoT遗传分化系数(Gst)为0.293,表明群体间的遗传多样性水平较低,9%遗传差异源自群体间。居群间基因流水平(Nm)值为2.022,表明居群间存在一定的基因流,导致居群间的遗传差异小。12个艾居群在...     

柑橘不同品种对溃疡病抗病性差异的调查

柑橘溃疡病是目前柑橘生产中重要的细菌性病害,各柑橘产区普遍发生。该病能危害柑橘叶片、枝梢和果实,其中以苗木和幼树受害特别严重,造成落叶、枯梢,     

基于成熟期的梨品种遗传多样性SSR分析

以63个梨主栽品种为试材,采用SSR分子标记技术与毛细管电泳技术相结合的方法,研究了梨不同成熟期的种质资源遗传多样性,以期为梨栽培品种的品种鉴别、亲子关系鉴定、分类及系统关系研究、遗传图谱构建与标记辅助育种在分子水平上提供参考依据。结果表明:3份梨种质的观测等位基因数(Na)平均为14.8,有效等位基因数(Ne)平均为7.363 1,Shannon多样性指数(I)平均为2.195,期望杂合度(Nei)平均为0.845,说明梨总群体遗传变异偏高。依据梨系统将其分为白梨、秋子梨、日本梨、砂梨和西洋梨5个类群,其中白梨系统在Shannon多样性指数和期望杂合度上最高,分别为2.069 9和0.831 1,秋子梨系统最低,分别为0.420 8和0.303 6,白梨与砂梨类群的遗传一致度最高为0.715 2。     

大别山三种杜鹃花资源遗传多样性和遗传结构分析

大别山独特的地理环境为杜鹃花资源提供了独特的生境地,是中国杜鹃花资源重要的多样性分布中心。该研究以大别山黄杜鹃、云锦杜鹃、满山红3个种群为试验材料,采用9个SSR标记对其进行扩增,以期探究种群遗传多样性和遗传结构的特征。结果表明:9个标记位点共扩增出45个等位基因,每个位点的等位基因数为3~7;3个种群中Shannon信息指数平均值为0.87~0.91;平均观察杂合度和期望杂合度为0.523~0.651和0.517~0.536;总近交系数Fit和种群内近交系数Fis平均值分别为0.075 9和-0.173 3,即3个种群内均存在近交现象;9个位点的平均基因流为0.927 0;在聚类分析中,黄杜鹃和云锦杜鹃亲缘关系最近,与满山红最远。该研究为杜鹃花属植物的进化研究奠定了基础。     

枸橼种质对柑橘溃疡病的抗性鉴定

柑橘溃疡病(Xanthomonas citri subsp. citri,Xcc)是严重阻碍柑橘产业发展的世界性检疫病害,防控困难,选育抗病品种为防治溃疡病的唯一有效办法。枸橼C-05是柑橘属独特的抗溃疡病种质,为抗性机理和抗病育种提供了种质基础。为了进一步评价枸橼C-05的抗性,另外收集了13份枸橼种质,对其进行溃疡病的离体和活体抗性评价。叶片形态学观察表明,14份枸橼种质存在较大的形态学差异。采用离体与活体注射接种不同浓度的柑橘溃疡病菌,根据叶片的感病症状、病斑周围黄色晕圈大小等典型溃疡病症状,综合评价枸橼类种质的抗病性。结果表明:枸橼种质之间对溃疡病的抗性存在极大差异,溃疡病的抗性评价综合病情指数显示枸橼C-05、园香橼、矮果香橼、美国枸橼、普通枸橼和印度大果综合病情指数较小,表现为极抗病或抗病,其他枸橼种质表现不同程度的感病性;枸橼种质的抗病或感病性与其叶片形态特征无关。枸橼C-05和5个抗病枸橼种质对柑橘溃疡病具有针对性的抗性,这对进一步研究抗病机理和抗病育种具有重要意义。     

中国石榴居群遗传结构的ISSR分析

为了更有效地保护、利用石榴种质资源,采用PopGen32软件,利用ISSR标记对中国7个石榴主产区46个石榴品种进行了研究分析。结果表明:7个石榴种群遗传多样性依次为:山东种群>陕西种群>云南种群>河南种群>安徽种群>四川种群>新疆种群;7个种群间的基因分化系数(Gst)为0.1911,表明分布在种群间的遗传变异占总遗传变异的19.11%,种群内遗传变异占81.89%,种群间表现出低水平的遗传分化;群间基因流的估测值(Nm)为2.1169,种群间的遗传相似性(I)变化范围为0.9218～0.9759,表明种群间存在较强的基因流,遗传相似性很高,石榴品种间的遗传多样性能够得以维持。