兔病毒性出血症病毒中国株(JX/CHA/97)全基因组分子克隆及序列分析

本研究首次完成了免病毒性出血症病毒（Rabbit hemorrhagic disease virus，RHDV）中国分离株JX／CHA／97全基因组序列的测定与分析。研究结果表明，JX／CHA／97株的全基因组由7437个核苷酸组成，其基因组构成为：5＇端有一个长度仅为9nt的非编码区，随后有2个阅读框架（ORFs）．分别编码一个聚合蛋白和一个结构蛋白。在基因组的3＇端也有一个非编码区，长度为59nt。另外，采用RACE方法获得了RHDV的poly（A）尾序，证明该结构至少含有27个A。根据RHDV衣壳蛋白的基因序列，将JX／CHA／97株与来自世界各地的22株RHDV分离株的基因组序列进行了比较与分析，并绘制了系统发生树。结果表明，RHDV各分离株之间存在较高的序列同源性，可以将它们至少分为6个拓朴群，提示RHDV有朝不同方向发生进化的趋势。     

兔出血症病毒衣壳蛋白P区二聚体的表达及其与受体结合能力分析

为检测兔出血症病毒(RHDV)衣壳蛋白(VP60)P区形成二聚体的能力及其与HBGAs受体结合的能力,作者以pMD19T-VP60为模板扩增包含铰链区H的P区基因(HP)并克隆至原核表达载体pET28a(+)中,转化大肠杆菌BL21(DE3)菌株,经IPTG诱导表达,获得HP蛋白。经SDS-PAGE和Western blot检测,结果显示,HP蛋白主要以包涵体的形式高效表达,经HisTrap亲和柱纯化后可形成二聚体结构。通过HBGAs受体结合试验表明,P区与完整病毒衣壳相似,能与唾液中的HBGAs受体发生结合。本研究为进一步开展RHDV衣壳蛋白与受体的相互作用研究奠定基础。     

中国株兔出血症病毒衣壳蛋白VP60基因在大肠杆菌中的表达及其免疫原性鉴定

应用RT—PCR技术扩增编码兔出血症病毒(rabbit hemorrhagic disease virus,RHDV)WX84株衣壳蛋白VP60基因，将PCR产物按相应的阅读框架克隆到表达性载体pGEX-6P-1中谷胱甘肽转移酶(GST)基因的下游。将重组质粒转化入大肠杆菌BL21株，在1．0mmol／L 1PTG和37C的条件下诱导，VP60—GST基因融合蛋白获了高效表达。经聚丙烯酰胺凝胶电泳和western-blotting试验证实所表达的融合蛋白产物相对分子质量与预期的87000相符。将表达产物经电泳切胶回收目的条带后免疫小鼠，所得抗血清应用间接ELISA检测，与RHDV病毒粒子呈阳性反应。试验结果表明，大肠杆菌中表达的RHDVVP60融合蛋白在抗原性上与天然衣壳蛋白具有一定的相似性。     

鸽圆环病毒福建株全基因组序列分析

运用PCR技术从福建省某地发病信鸽组织中获得鸽圆环病毒（Pigeon circovirus,PICV）福建株（简称fj1株）全基因组序列,并对鸽圆环病毒福建株基因组核苷酸组成、结构及其遗传进行分析。结果表明,所获fj1株全基因大小2037 nt,包含有2个主要的开放阅读框（open reading frame,ORF）：ORF-V1（41～994nt）编码复制相关结构蛋白（the replicated-associated protein,Rep）,ORF-C1（1987～1166nt）编码核衣壳蛋白（the putative capsid protein,Cap）;在V1和C1的5＇端之间存在一个与圆环病毒滚环复制有关的高度保守的环状发夹结构。fj1株与GenBank登录所有鸽圆环病毒核苷酸同源性在84.5%～93.8%之间,与中国浙江鸽圆环病毒分离株zj1和zj2核苷酸同源性分别为88.7%和88.9%。从遗传进化上看,中国3株鸽圆环病毒均处在Cap蛋白起始密码子＂ATG＂分支,但分居不同亚群。     

兔病毒性出血症病毒 VP60蛋白基因研究进展

兔病毒性出血症病毒（RHDV）是引起兔病毒性出血症（RHD）的病原,严重威胁着世界养兔业的健康发展。在RHDV的感染和免疫研究方面,RHDV 的衣壳蛋白VP60作为具有重要免疫原性的主要结构蛋白备受关注,论文对V P60蛋白基因的结构特征、核苷酸变异情况及在诊断方法建立和疫苗预防研究等方面进行了综述,为RHDV防控相关研究提供有用的参考资料。     

兔出血症病毒JL株分离鉴定及VP60基因主要抗原表位分析

采用血凝试验、电镜观察、RT－PCR方法分离鉴定了1株JL株兔出血症病毒（RHDV）,扩增衣壳蛋白VP60基因,将扩增片段克隆到pMDl8－T载体上,经酶切鉴定后测序。结果显示,VP60基因全长1740bp,编码580个氨基酸;JL株与其他RHDV分离株比较,核苷酸同源性为93．7％－99．2％,氨基酸同源性在97．3％－99．5％,在VP606个区中,A、B、D、F是稳定区,氨基酸变异多发生在衣壳蛋白C、E区,表明毒株具有高度保守性;将JL株与国内外标准株蛋白氨基酸变畀及其亲水性、柔性区、抗原区和表面结构进行比较分析,预测RHDV VP60细胞表位。     

一株无血凝性兔出血症病毒的分离鉴定及其衣壳蛋白VP60基因的克隆和序列分析

从临床病料中分离鉴定出1株无血凝性的致病性兔出血症病毒（RHDV），命名为Yaan-1。HA试验测得该毒株原代及经兔体传3代后的肝毒在25℃、37℃和4℃时均无血凝性；但在琼脂扩散试验和对流免疫电泳中均可见分离株与常规RHDV高免血清形成清晰的沉淀线；电镜观察可见30nm左右的病毒粒子。采用RT-PCR方法将Yaan-1株的衣壳蛋白VP60基因进行了克隆测序，序列分析表明VP60基因序列全长1740bp，编码579个氨基酸，测序结果提交GenBank（注册号为DQ069280），并与世界各国的常规RHDV分离株进行比较，结果表明核苷酸同源性为90．0％～98．0％，氨基酸同源性为94．1％～99．0％，氨基酸变异多发生在衣壳蛋白C、E区；同时对Yaan-1株的分子量、等电点、疏水性、跨膜区等分子结构特征进行了分析。本研究首次报道了无血凝性RHDV中国分离株，丰富了地方毒株资源，为明确我国地方株的分子流行病学，以及对VP60蛋白分子特征研究提供了新材料。     

兔出血症病毒衣壳蛋白在昆虫细胞中的表达及对家兔的免疫保护效果

用RT—PCR方法扩增兔出血症病毒（RHDV）衣壳蛋白VP60基因,通过克隆、转化得到重组穿梭载体Bacmid—VP60,用此质粒转染Sf9昆虫细胞,得到重组病毒rAcV—Bac—VP60,经RT—PCR、IFA、SDS-PAGE、Western blotting、HA和HI鉴定,结果显示重组VP60蛋白在Sf9昆虫细胞中得到表达。在不加任何佐剂的情况下,用表达的蛋白免疫3月龄非RHD免疫兔,结果显示,免疫后21天,兔体内可产生抗RHDV抗体,抗体血凝抑制效价为2^6～2^7,该抗体可以抵抗血凝效价为2^10致死剂量RHDV强毒的攻击,本研究为兔病毒性出血症基因工程疫苗的研制奠定了基础。     

兔出血症病毒Yaan株衣壳蛋白VP60基因的克隆和序列分析

采用RT-PCR方法扩增兔出血症病毒（RHDV）Yaan株衣壳蛋白VP60基因,将扩增片段克隆到pMD 18-T载体上,经酶切及PCR鉴定后测序.结果显示,VP60基因全长1 740 bp,编码579个氨基酸.将Yaan株与其他RHDV分离株进行比较,结果显示,核苷酸同源性为90.5%～97.5%,氨基酸同源性为94.3%～99.5%,氨基酸变异多发生在衣壳蛋白C、E区,表明毒株具有高度保守性;同时对Yaan株与国外标准株AST/89的VP60蛋白氨基酸变异及其亲水性、柔性区、抗原区和表面结构进行了比较分析.     

猪繁殖与呼吸综合征病毒CH-la株非结构基因的分子克隆及其基因特征的研究

对猪繁殖与呼吸综合征病毒的非结构基因（ORF1）和非编码区分别进行了克隆和测序，并对其基因特征作了分析。结果表明，CH-1a株ORF1全长11882nt，其中ORF1a长7512nt、ORF1b长4374nt。它们与VR2332株的核苷酸同源性分别为89%、92%；与LV株的核苷酸同源性分别为54%、63.3%。ORF1编码两个聚合蛋白，其中ORF1a编码的聚合蛋白经裂解后产生6个成熟的非结构蛋白（Nsp1α、Nsp1β、Nsp2-5)，以Nsp2的变异性最为显著，它与LV株的氨基酸同源性为41%。ORF1b编码的聚合蛋白经裂解后，产生4个成熟的非结构蛋白（RdRp,CP2-4)，其中RdRp为病毒的复制酶，CP4表现出较大的变异性，与LV株的氨基酸同源性为48%。在ORF1a-ORF1b的衔接区有保守的庚核苷酸滑动序列和拟节结构，它们是核糖体移码翻译所必需的结构。在基因组末端存在非编码区，其中5'NCR长190nt，比LV株5'NCR短31nt，其核苷酸同源性为61%。3'NCR长151nt，比LV株3'NCR长37nt，保守性稍高，其与VR2332株和LV株的核苷酸同源性分别为95.4%和78.2%。在3'NCR末端有一个poly(A)尾巴，长20nt。在Poly(A)尾上游有保守的八核苷酸序列，是复制酶识别并结合的区域。本研究进一步证实CH-1a株在基因型上属于北美洲型。     

猪繁殖与呼吸综合征病毒5′非翻译区中一顺式结构因子对病毒感染必要性的分析

人们广泛认为动脉炎病毒的基因组5′非翻译区（untranslated region,UTR）在病毒基因组RNA复制、亚基因组mRNA转录和蛋白翻译过程中发挥关键作用,然而其结构与功能仍然在很大程度上不为人知。现基于2型猪繁殖与呼吸综合征病毒弱毒（Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV）感染性克隆pAPRRS的基础,构建了一系列5′UTR的5′末端缺失突变体,利用RNA和DNA转染,分析了拯救病毒的遗传学与病毒学特征,发现拯救病毒的5′末端突变位点被一些不知来源的AU-rich外源序列所修复。基于T7启动子与CMV启动子转录起始位点的不同,我们人为引入一段GC-rich的序列以研究病毒的自我修复是否为模板依赖性,结果发现病毒的外源序列修复机制是非模板依赖的。通过二级结构预测分析发现,在PRRSV5′UTR中的第一个茎环结构是病毒感染性必不可少的。     

口蹄疫病毒前导蛋白的分子生物学研究进展

口蹄疫病毒（Foot-and-mouth disease virus ,FMDV）编码的前导蛋白,不仅是一个重要的蛋白酶,而且对于病毒来说是一个重要的毒力因子,其能够作用于宿主细胞的特异性蛋白,抵抗宿主细胞所产生的抗病毒效应。本文章简述了口蹄疫病毒前导蛋白酶的基本特性,例如前导蛋白的基因结构与病毒复制的关系,前导蛋白酶活性的具体特点,以及前导蛋白影响病毒毒力的分子机制。     

乙型脑炎病毒E蛋白抗原优势区域的鉴定

流行性乙型脑炎（Japanese Encephalitis,JE）是一种人与动物共患的虫媒病毒性疾病,严重危害着人畜的健康。E蛋白是乙型脑炎病毒（Japanese Encephalitis Virus,JEV）的主要结构蛋白,在病毒的吸附、融合、血凝、细胞趋向性、病毒毒力和诱导保护性免疫反应中起重要作用。为了确定该蛋白的抗原优势区域,本研究设计了3对引物,将E蛋白分成3个大段,分别是EF1（1～291aa）、EF2（292～402aa）和EF3（403-500aa）,又将EF1分成4个相互重叠的小片段,分别是EF1-1（1～88aa）、EF1—2（68～155aa）、EF1—3（129～222aa）和EF1—4（202～291aa）,将以上基因片段分别克隆到原核表达载体进行GST融合表达。SDS-PAGE电泳鉴定各融合蛋白均获得表达,各表达产物以包涵体的形式存在。通过Western blot分析表明融合蛋白GST-EF1、GST—EF2、GST—EF1—1、GST-EF1-2、GST—EF1—3和GST—EF1～4均能被阳性血清识别。通过ELISA鉴定,GST-EF2反应性最强,GST-EF1反应性比GST-EF2稍弱,而GST-EF3反应性最弱,GST-EF1-1、GST-EF1—2、GST-EF1—3和GST—EF1—4片段融合蛋白反应性与GST—EF1相似。由此本研究鉴定出1-402aa是E蛋白的抗原优势区域,在此区域内包括了12个Cys的保守区及域Ⅰ、域Ⅱ和域Ⅲ3个主要抗原域。E蛋白抗原优势区域的鉴定,为E蛋白抗原表位的鉴定以及针对于E蛋白诊断试剂的开发奠定了基础。     

RNAi靶向N基因抑制猪繁殖与呼吸综合征病毒的复制

根据编码猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)核衣壳蛋白(N)基因的序列,设计3个干扰靶位(N12、N23、N26),构建siRNA表达载体,转染Marc-145细胞后接毒,测定病毒TCID50、CPE,并利用实时荧光定量PCR及间接免疫荧光检测病毒在Marc-145细胞上的复制情况。结果表明,利用RNAi技术靶向N基因,其中N12干扰靶位可以高效抑制PRRSV的增殖,证实N基因可能是病毒复制所必需的结构基因,所选的干扰靶位是病毒复制的关键性位点。     

Capsid Protein Genetic Analysis and Viral Spread to the Spinal Cord in Cats Experimentally Infected with Feline Calicivirus (FCV)

We investigated primitively the molecular basis of the neural spread of a feline calcivirus isolate (FCV-S) from the spinal cord of a cat that died after manifesting excitation. Experimental infections of cats with three clones from parent virus isolate FCV-S, isolated based on plaque size, were performed, and virus recovery from the spinal cord and the nucleotide and predicted amino acid sequences of the viral capsid protein region (ORF2) were compared. In the experimental infection with the one-time cloned virus (C1L1) isolated from a large plaque, the C1L1 was recovered from the spinal cord. In contrast, seven-times cloned C6L7 (from large plaque) and five-times cloned C5S2 (isolated from small plaque) were not recovered from the spinal cord. Genetic analysis of the capsid protein gene of the three viral clones revealed that four bases were different and two amino acids were different at positions 34 (Val in C6L7 and Ala in C1L1 and C5S2) and 46 (Leu in C6L7 and Pro in C1L1 and C5S2) between C6L7 (with large plaque) and C5S2 (with small plaque). The amino acid at position 434 of C1L1 was different from those of C6L7 and C5S2 (Gly in C1L1, D (Asp) in C6L7 and C5S2). From these results, the plaque size seemed not to be related to the spread of virus to the spinal cord. Clone C1L1, which spread to the spinal cord, had a difference of one amino acid from the other two clones, which may be related to the ability to spread to the spinal cord.     

口蹄疫病毒3C蛋白酶的结构及功能研究进展

口蹄疫病毒能引起牛、羊等偶蹄动物发生高度接触性的传染病口蹄疲,该病常常影响着全球畜牧业的发展.FMDV是小RNA病毒科口蹄疫病毒属的成员,口蹄疫病毒为单股正链RNA病毒,病毒基因组全长约8.5 kb,基因组分为5'非编码区、3'非编码区和一个开放阅读框(ORF).基因组的中部是一大的开放阅读框,编码一多聚蛋白,多聚蛋白在翻译的同时,经二级裂解后,形成3种病毒结构蛋白(VP0,VP3和VP1)和8种非结构蛋白(L,2A,2B,2C,3A,3B,3C和3D).其中3C全长639 bp,编码213个氨基酸.3C蛋白酶是小RNA病毒的共同裂解酶,在多聚蛋白成熟过程中起着极为重要的作用,且在抗病毒药物打靶方面具有一定研究价值.因此,对3C蛋白酶的结构及功能研究进展进行综述很有必要.     

Genetic and biological comparison of tick-borne encephalitis viruses from Hokkaido and far-eastern Russia

We compared the biological properties of Oshima 5-10 (tick-borne encephalitis [TBE] virus isolated in Hokkaido, Japan) and Sofjin-HO (Far-Eastern subtype TBE virus) including plaque formation, virus replication and virus protein synthesis in BHK-21 cell cultures to reveal strain differences. We also determined the complete nucleotide sequences of both strains and compared the deduced amino acid sequences. Plaques of Oshima 5-10 were smaller than those of Sofjin-HO. Virus titers in culture fluid of Oshima 5-10 were 1/100 of those of Sofjin-HO at 9 and 12 hr after infection. Less viral protein and RNA syntheses of strain Oshima 5-10 was observed than with Sofjin-HO. Genetic analysis revealed 1.4% of amino acids to differ with Sofjin-HO. No difference between the two strains was detected in the motif sequence of the viral enzyme, cleavage sites of viral protein or glycosylation sites of NS1.     

表达猪瘟病毒E2蛋白的重组腺病毒对猪的免疫效力评价

为了进一步验证含有猪瘟病毒E2基因的重组腺病毒（rAdV—E2）在猪体上的免疫效力,将rAdV—E2按108TCID50／头接种猪2次,同时用野生型腺病毒wtAdV作为阴性对照,当抗体上升到一定程度后用致死剂量的猪瘟强毒石门株进行攻击。结果表明,rAdV—E2免疫组（n=5）所有免疫猪在加强免疫后均产生了猪瘟特异性中和抗体,并于加强免疫后3w达到峰值,攻毒后所有猪只抗体迅速升高,除了一头猪短期体温升高外,未出现任何其它临床症状;而野生型腺病毒wtAdV免疫组（n=5）猪只在攻毒前一直没有检出特异性抗体,攻毒后全部出现典型的猪瘟临床症状和严重的病毒血症,剖检时可见典型猪瘟病理变化。这表明构建的猪瘟病毒E2基因重组腺病毒rAdV—E2免疫猪后产生了很好的免疫效果,有望成为具有开发价值的活载体疫苗。     

Analysis of protein expression by mammalian cell lines stably expressing lactate dehydrogenase-elevating virus ORF 5 and ORF 6 proteins

Lactate dehydrogenase-elevating virus (LDV) has a strict species-specificity. Because only a subset of mouse primary macrophages have been identified that can support LDV replication in vitro, the precise molecular mechanism of viral entry and replication remains unclear. To analyze the LDV envelope proteins, which probably mediate viral attachment to the host cell, we developed a mammalian system for stable co-expression of LDV open reading frame (ORF) 5- and ORF 6-encoded proteins (ORF 5 and ORF 6 proteins), which correspond to envelope VP-3 and M/VP-2, respectively, and compared these expressed proteins to the native ones. Western blotting analysis combined with N-glycanase digestion revealed that ORF 5 and ORF 6 proteins were similar in size to native VP-3 and M/VP-2, and that ORF 5 protein was N-glycosylated, like the native VP-3. Immunofluorescence microscopy revealed that both ORF 5 and ORF 6 proteins were distributed throughout the cytoplasm and were colocalized in most cells. Moreover, ORF 5 protein was localized both in the perinuclear region and the Golgi complex and transported to the cell surface. This mammalian expression system in which the exogenously expressed proteins closely resemble the native proteins will provide the experimental basis for further studies of the interactions between LDV envelope proteins and host cells.