3种气单胞菌鉴定方法的比较

采用分子生物学检测方法、API 20NE生化鉴定法以及梅里埃（VITEK MS）全自动快速微生物质谱检测法,对60株试验菌株进行种属鉴定,比较3种鉴定方法的准确性和优缺点。对试验菌株进行16S r DNA特异性引物扩增和测序,确定菌株种属,并作为比较3种鉴定方法的标准。随后用API 20NE生化鉴定法和梅里埃（VITEK MS）全自动快速微生物质谱检测法,对试验菌株进行鉴定。结果显示,分子生物学方法和生化鉴定法,对60株菌的检出率均为100%,而质谱仪的检出率仅为60.0%。使用分子生物学法共检出44株气单胞菌（100%）,准确率为100%;使用生化鉴定法对气单胞菌的检出率为88.6%,准确率为59.1%;使用质谱仪对气单胞菌的检出率为54.5%,准确率为38.6%。3种鉴定方法对气单胞菌的检出率和准确率从大到小为：分子生物学法、API 20NE生化鉴定、质谱仪。     

溶藻微生物的研究方法

从溶藻微生物的获得方法、纯化和溶藻方式等3个方面进行了介绍,希望能对我国的水产养殖业和环境科学事业的发展起到积极的促进作用。     

养殖污水中主要分解氨氮微生物的分离鉴定

为研究养殖循环水系统中分解氨氮能力较强的相关微生物,从生物滤料载体上收集正常运行条件下自然生长的生物膜。通过富集培养、分离提纯、DNA提取、PCR扩增、16SrRNA测序等步骤,得到一株具有分解氨氮能力的荧光假单胞菌Pseudomonas fluorescens SS101,菌落为淡黄色。结果显示,广泛存在能够分解养殖污水中氨氮并用于自身生长的微生物,除了常见的硝化细菌,一些特异性微生物也具有此功能。这项研究为进一步探索养殖污水微生物群落、优化生物滤池的污水处理性能提供了新思路。     

微生物实验室管理方法探讨

<正>微生物学是生命科学领域中涉及面广,应用性强的一门学科,而微生物学实验课又是微生物学教学中重要的组成部分,实验教学又在微生物教学中占有重要地位,是关系到能否实现生命科学专业培养目标的一个重要因素之     

质谱技术在微生物鉴定和检测中的应用

质谱技术(Mass Spectrometry, MS)是一种根据离子产生的质量图谱来确定样品中分子组成的分析技术。质谱法不仅可以对传统的目标分析物进行定性和定量分析,还可以用于细菌的快速准确鉴定。基质辅助激光解吸电离飞行时间(Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization-Time of Flight, MALDI-TOF)质谱仪由于能快速准确地鉴定革兰氏阴性菌和阳性菌的种类,因此是生物学中最常用的质谱仪之一。质谱法鉴定微生物是以鉴定每个物种的特征光谱为基础的,然后与仪器内的大型数据库进行匹配。本综述阐述了细菌鉴定面临的挑战和机遇,特别是在微生物学领域中使用MALDI-TOF MS来鉴定微生物和分析抗菌药敏感性。     

产酯酶海洋微生物的筛选、鉴定及系统发育分析

通过以三丁酸甘油酯和α-乙酸萘酯为底物,建立了一种快速、准确的酯酶产生菌的筛选方法,并从样品中分离到 1 株产酯酶活力和稳定性较高的菌株 EB-1,对其进行了形态学、生理生化特征鉴定和 16S rDNA 序列分析.结果表明,该菌株与Bacillus subtilis subsp. subtilis 模式菌株的同源性高达 99.79%;又根据其产黑色素这一特性,最终将其确定为Bacillus subtilis var. niger,其 16S rDNA 序列在 GenBank 的注册号为 EU016526.     

简介微生物制剂的正确使用方法

常使用的微生物有两大类:真菌和细菌。真菌又可分为酵母菌和霉菌,前者常用来口服或作为处理水质使用;后者常用来作处理废水或优化水质的微生物。常用的细菌制剂有杆菌、硝化菌、假性单孢菌、光合菌、链球菌及乳酸菌,而前三者较适合水质处理,后三者则因为链球菌会产生一些抑菌剂     

鱼的鲜度及其鉴定方法

<正> 鱼的鲜度通常是指鱼死后在外界环境及体内的酶和细菌的作用下,逐渐发生变化的程度。它是鱼货质量的最主要项目。及时了解鱼体死后的生物化学变化,尽早采取措施使鱼货保持新鲜。并根据质量情况划分鲜度等级,是水产收购、运销,加工过程的重要环节。根据鱼货鲜度,合理地以质论价,不仅可以鼓励渔民交售鲜鱼,也是促进鱼品保鲜的重要因素。     

赤潮微藻的分类鉴定方法

赤潮微藻的准确分类鉴定是研究赤潮生物学、生理学和生态学的基础.本文介绍了赤潮微藻分类鉴定的常用方法,主要包括形态分类法、化学分类法和分子生物学方法,形态分类法是最传统和直接的赤潮微藻的分类鉴定方法,化学分类法和分子生物学方法可单独使用或作为形态分类法的辅助方法.     

鱼类、对虾病原微生物鉴定技术取得关键突破

1月,由中国水产科学研究院黄海水产研究所黄健研究员等以及多个单位联合发明的“检测多种鱼类病原的基因芯片及其检测方法”获国家发明专利授权,专利号为ZL201010243398．3。由黄健研究员等发明的“检测多种对虾病原的基因芯片及其检测方法”获国家发明专利授权,专利号为ZL201010243399．3。前项发明涉及一种检测多种鱼类病原的基因芯片及其检测方法。17种鱼类病原的探针包括：用于检测14种病毒的探针,用于检测淀粉卵涡边虫和三代虫的探针以及用于检测鱼立克次氏体的探针。后项发明涉及一种检测多种对虾病原的基因芯片及其检测方法。包含的18种对虾病原的探针为：用于检测15种病毒的探针,用于检测镰刀菌、杀鱼丝囊霉菌、变形藻丝囊菌的探针以及检测拟阿脑虫和对虾立克次氏体的探针。     

咔唑法与间苯三酚法测定硫酸软骨素比较研究

硫酸软骨素（chondroitinsulfate,CS）经水解和显色后,分别采用咔唑法与间苯三酚法测定其质量浓度,并对这2种方法进行比较。结果显示,咔唑法P（CS）和间苯三酚法P（CS）分别在0．01～0．05mg·mL-1和0．1～1．0mg·mL-1范围内与其吸光度值呈良好的线性关系。对同一样品进行6次平行试验,咔唑法的相对标准偏差（RSD）为3．90％,问苯三酚法的RSD为4．28％,均具有较高的精密度。对这2种方法分别进行3个不同加标水平的回收率试验,咔唑法的加标回收率为98．0％～102．5％,间苯三酚法为83．2％～106．6％。因此,咔唑法与间苯三酚法均能准确测定CS的质量浓度。     

微生物在饲料开发中的应用

1 用于饲料开发的微生物 微生物种类多,其代谢特征各异,菌体蛋白质含量较高, 能利用的物质也很丰富,这就奠定了其在饲料开发中的重要 地位.因为饲料是动物要进食的,所以用于饲料生产的微生物 必须无毒,同时,动物饲用其代谢产物或菌体后应该有益并且 要适于生产过程中的各种环境.细菌、放线菌、酵母菌和丝状 真菌中的许多种都已用于饲料生产.酵母菌中的酿酒酵母、假 丝酵母、白地霉等用于生产SCP或生理活性物质,细菌中的 乳酸菌、链球菌、肠道细菌、芽胞杆菌、光合细菌等已制成微生 态制剂,用于畜禽饲料生产的芽胞杆菌有枯草芽胞杆菌、地衣 芽胞杆菌、凝结芽胞杆菌、缓慢芽胞杆菌、短小芽胞杆菌、蜡样 芽胞杆菌、环状芽胞杆菌、巨大芽胞杆菌、坚强芽胞杆菌、东洋 芽胞杆菌、纳豆芽胞杆菌、芽胞乳杆菌、丁酸梭菌等,丝状真菌 已用于纤维素等难利用物质的处理和生产饲用酶制剂,放线 菌也已用于生产饲料添加剂.     

病原微生物抗药性的产生机理

大量的实验研究证实,使用抗生素会使病原微生物产生抗药性,使用剂量越高,抗药性也越强。经常使用抗生素的畜禽养殖场一旦停止用药,畜禽就会大量得病甚至死亡。为了使畜禽养殖正常进行,就需要不断地用药,并且还要逐步加大剂量或改变抗生素的种类交替用药。据此,许多从事动物营养和兽药研究的科研工作者认为:微生物的抗药性是由抗生素引发的,而且抗药性一旦获得就不易改变。这一结论是从现象观察获得的,可以很好地解释实践中出现的许多问题。但是其理论依据是不完整的,有些甚至是错误的。事实上,微生物的抗药性是由微生物细胞的内在因素决定的。这个问题的答案涉及微生物学、分子生物学和生物进化等多方面的知识,现叙述如下:     

海洋侧孢短芽孢杆菌S-12-86溶菌酶的分离纯化与冻干技术研究

海洋微生物溶菌酶发酵液经低温离心、超滤浓缩、乙醇提取、Superdex 75 10/300凝胶层析和反相高效液相色谱层析纯化得到电泳纯海洋溶菌酶,分子量为17.1 kD,比活达到3 987.7 U/mg,纯度提高41.98倍,活力回收率为21.7%。对该酶冷冻干燥过程的研究结果表明,海藻糖、蔗糖和麦芽糖对该酶均有一定的冻干保护作用。其中,以海藻糖的保护效果最佳。0.5 mol/L海藻糖与20 mg/ml吐温80复合作为冻干保护剂,使冻干后的溶菌酶活性维持在95%以上,为该酶进一步研究和应用提供了稳定的酶制剂。     

复合微生物制剂去除氨氮的效果

试验研究了在不同质量浓度微生物制剂、不同氨氮质量浓度、不同温度与pH等条件下,复合微生物制剂去除氨氮的效果.试验表明,复合微生物制剂对改善水质,降低水体中的氨氮具有明显作用.结果显示,使用复合微生制剂的最佳质量浓度是10.0 mg/L,在氨氮质量浓度为4.44 mg/L、温度为35℃时制剂的氨氮去除率最高,在碱性的环境中去除氨氮效果优于酸性环境.     

宏基因组技术在开发未培养微生物资源中的应用

不可培养微生物占微生物种类99%以上,使得微生物的多样性资源难以得到全面的开发和利用。宏基因组是指生境中全部微小生物遗传物质的总和。宏基因组学的基本方法是分析微生物环境中的基因组组合,直接分离未培养土壤微生物基因组DNA克隆到可培养微生物中,最后筛选所需要克隆。综述了宏基因组技术在开发和利用未培养微生物资源中的应用概况。     

鱼类肠道微生物总DNA的提取

尝试提取鲫（Ｃａｒａｓｓｉｕｓａｕｒａｔｕｓ）肠道菌群总ＤＮＡ,为研究鱼类肠道菌群结构提供依据。以鲫肠道内容物为样本,用ＰＢＳ多次洗涤,离心样品,沉淀菌体。使用试剂盒法提取肠道菌群总ＤＮＡ,电泳结果显示,样品ＤＮＡ条带明亮,无降解现象,可用于后续分子生物学试验研究;通过设计的细菌通用引物,对其１６ＳｒＤＮＡ基因进行ＰＣＲ扩增,得到较清晰的图谱,条带整齐;表明采用该方法提取鱼类肠道微生物群落的ＤＮＡ较为简单、准确、可行。     

复合微生物制剂对河蟹育苗生产影响的研究

以河蟹蚤状幼体为研究对象,观测复合型活菌净水剂对河蟹育苗过程的影响。在育苗池中加入复合型活菌净水剂,测定河蟹幼体生长过程中水体的氨态氮、亚硝态氮、硫化氢、溶氧、化学耗氧量、pH值、异养菌总数及各期幼体变态率等指标。结果表明:复合型活菌净水剂能明显降低对河蟹蚤状幼体生长影响较大的氨态氮、亚硝态氮等水质因子,并能抑制异养菌的增长,提高各期幼体变态率。     

ONPG单管定量检测法与国标法在检测海水中大肠菌群的比较研究

本实验室根据ONPG显色技术原理建立了大肠菌群单管定量检测技术,即在此基础上利用ONPG单管定量检测方法和国标法对实验室制备的标准菌的菌悬液和水样进行检测,对2种方法的检测结果进行比对.研究结果显示:两种方法对菌悬液、水样的检测结果无统计学差异,ONPG单管定量检测方法检测数据的准确性、精确性和重现性都高于国标法;ON...     

南极微生物产低温蛋白酶菌株的筛选、分子鉴定及部分酶活特性

从南极获得的260株低温细菌中筛选到107株具有蛋白酶活性菌株，其中5株菌所产蛋白酶的活性高于45U／mL。对其进行16S rRNA基因序列的同源性和系统发育分析，结果表明，菌株NJ276、NJ5—9、NJ16—70、NJ345属于假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)，NJ341属于科尔韦尔氏属(Colwellia)。对其中NJ276、NJ341、NJ16—70、NJ345这4株产蛋白酶南极嗜冷菌的生长及分泌蛋白酶的部分酶活特性进行研究，结果表明：(1)4株菌最适生长、产酶温度均为10℃左右；培养2～5d，嗜冷菌生长、产酶量一直处于较高的状态。(2)4株南极嗜冷菌分泌的蛋白酶的酶活反应最适pH值为9。(3)菌株NJ276、NJ5—9分泌的蛋白酶最适酶活温度为50℃；菌株NJ341、NJ345分泌的蛋白酶最适酶活温度为40℃；在0℃时蛋白酶活性是最高活性的30％左右，蛋白酶热稳定性较差，因此菌株NJ341、NJ345分泌的蛋白酶属于低温蛋白酶。