RAPD在油用向日葵自交系鉴定和遗传分析中的应用

利用RAPD标记对8个油用向日葵自交系进行了鉴定和遗传分析。从40个UBC引物中筛选出12个能产生稳定遗传多态性的引物，利用其中3个引物提供的RAPD标记可将8个自交系逐一加以鉴别。12个引物对8个自交系共扩增出41条带，其中39条（占95．1％J）具有多态性，每个引物可扩增出1－7条带，平均为3．4条带，不同自交系之间的RAPD遗传距离在0．13－0．85之间，平均为0．42。按UPGMA方法可将8个自交系聚为2大类、4个亚类。     

桂花RAPD分析的引物筛选

从桂花4个品种群(银桂品种群、金桂品种群、丹桂品种群和四季桂品种群)中选取8个桂花样品,用于桂花RAPD分析的引物筛选试验。从Operon公司的OP系统的AB、AC、AD、Y、Z5组共80个10碱基引物中筛选出20个扩增条带多且多态性好的引物,20个引物共扩增116条DNA条带,用100～3000bp的DNAmarker标记片断长度在200～2000bp,多态性条带有72条,多态性位点比率为62.0%。不同引物的扩增带数不同,最多的可扩增出8条DNA条带。     

应用RAPD标记分析黑麦属的遗传多样性

采用随机扩增多态性DNA（RAPD）标记，对黑麦属（Secale L）7个种共12份材料进行了遗传多样性检测。结果表明，被测材料间RAPD标记多态性较高。40个随机引物中，有25个引物（占62．5％）的扩增产物具有多态性。25个引物共扩增出167条带，其中89条带（占53．2％）有多态性，每个引物可扩增出1－10条多态性带，平均3．6条。RAPD标记遗传距离（GD）变异范围为0．1382－0．4512，平均值为0．2712。聚类分析表明，在GD值0．3850水平上，12份材料可聚3类，S.africamum和S.silvestre与其它材料间的遗传分化较大，分别单独聚为一类，其余10份材料则聚为一类。据此认为，RAPD标记可以作为黑麦属物种鉴定的指纹图谱。     

引物及RAPD标记数对芥菜变种聚类分析的影响

利用ＲＡＰＤ标记对１６个芥菜变种的遗传关系进行研究,并在ＵＰＧＡ聚类分析的基础上建立了亲缘关系系统树图和利用不同的引物数和不同的ＲＡＰＤ标记数对芥菜进行聚类分析。结果表明,聚类结果基本一致。即都可将１６个芥菜变种划分为３组：Ｃ组只有茎瘤芥１个变种,Ａ组和Ｂ组的变种数则略有差异。说明少至２种引物的扩增产物（２７个ＲＡＰＤ标记）也能基本反映１６个芥菜变种间的遗传关系。但随着引物数和ＲＡＰＤ标记数的减少,１６个芥菜变种间的平均遗传距离递减,即从１９种引物、２４０个ＲＡＰＤ标记的７．３４减少到２种引物、２７个ＲＡＰＤ标记的２．３４。而遗传距离的变小,使划分芥菜变种的亲缘关系更加困难。因此,在利用ＲＡＰＤ技术研究芥菜变种间的遗传关系时,有必要保证一定数量的引物和ＲＡＰＤ标记。     

苹果RAPD标记的引物筛选与RAPD校正

为筛选适宜苹果的RAPD引物，以苹果富士与舞姿的杂交后代为试材，依据RAPD校正方法、利用引物OPAl3构建了苹果的RAPD校正图谱；在520个RAPD引物中找出了扩增稳定、条带清晰的246个引物，其中扩增条带数在8个以上的有91个引物，可用于苹果的遗传分析。探讨了RAPD-PCR反应条件与RAPD校正的关系，RAPD校正能够提高RAPD-PCR的扩增能力。     

适合多品种番茄RAPD分子标记的引物研究

 由于番茄的遗传背景非常狭窄,实验采用两轮引物筛选,利用27个具有代表性的番茄供试材料,从200个引物中筛选出36个PCR扩增效果多态性丰富的引物,克服了以前一些引物在3～4个材料中具有多态性,但它们在用于大量材料的扩增中多态性差的缺点,为RAPD分子标记技术在番茄遗传研究中的广泛应用奠定了基础。     

绣线菊属植物的DNA提取和RAPD引物筛选

以10种绣线菊属植物资源为材料,分别用SDS法、高盐低pH法及改良的CTAB法对幼嫩叶片进行DNA提取并进检测比较,利用经过检测的模板对RAPD引物进行筛选。结果表明：采用改良的CTAB法提取的DNA可以用于RAPD分析。对200条10碱基的RAPD引物进行了初筛和复筛,筛出了30条扩增多态性强、稳定性好的引物,作为全部基因组的扩增引物。     

小麦抗赤霉病地方品种的RAPD分析

利用57个RAPD引物对22份小麦抗赤霉病地方品种进行分析发现，48个引(84．21％)共扩增出222条带。平均4．6条。其中，45个引(93．75％)扩增出178条(80．18％)多态性带，每个引物可扩增出1～11条多态性带，且发现一些随机引物对有些材料能进行特异性扩增。22份材料间的RAPD标记遗传距离(GD)变幅为0．152～0．471，平均为0．314。聚类分析表明，RAPD标记能将所有材料区分开。在GD值0．33水平上，供试材料可划分为4类。地理来源相近的材料大多聚在一起。     

椰子种质资源RAPD标记研究中的引物筛选

[目的]对椰子遗传多样性进行深入研究,为进一步开发利用椰子种质资源奠定基础。[方法]利用80个10碱基随机引物,对从中国海南、云南、广东、广西等椰子种植区所采集的67个椰子种质进行随机扩增,以筛选适合于对所有椰子品种进行RAPD分析的引物。[结果]共筛选出30条能扩增出条带清晰、明亮、具多态性且重复性好带型的有效引物。12个随机引物在所有样品中共扩增出340条带,即检测到340个椰子RAPD位点,其中307个位点为多态性位点,占总位点的90.3%。[结论]利用RAPD标记技术对椰子大量样品的系统分析,为椰子的品种鉴定、遗传育种及种质资源的保护与利用提供了依据和背景资料。     

RAPD分析中遗传距离计算方法的比较

为了更有效地应用ＲＡＰＤ分析这一手段研究种群遗传变异，以广州市力康鸡场７个蛋鸡品系为材料，根据ＲＡＰＤ测定的结果，采用Ｎｅｉ、Ｒｏｇｅｒｓｔ和Ｈｅｄｒｉｃｋ的遗传距离公式计算上述７个品系彼此间的亲缘关系，同时提出新的遗传距离计算公式。结论认为Ｒｏｇｅｒｓ的公式较适用于ＲＡＰＤ数据的分析，文中提出的公式跟其他距离公式存在显著相关，但有待进一步验证。     

亚麻RAPD的反应体系优化及引物筛选

对亚麻RAPD反应条件进行了优化：在25μL反应体系中,含10×Buffer,Mg^2＋（1mmol·L^-1）,Taq酶1U,Ge-nome DNA 50ng,dNTP0．25mmol·L^-1,RAPD primer 1．5／μmol·L^-1。PCR反应程序为：94℃预变性4min;94℃变性40s,37℃退火1min,72℃延伸90s。40个循环;72℃延伸10min。同时利用3个有代表性的亚麻品种从70条引物中筛选出12条多态性好、重复性高的引物,为亚麻的分子鉴定奠定了基础。     

利用RAPD引物对四川乳肉兼用牛及其父母本的遗传距离鉴定

为了鉴定四川乳肉兼用牛与父母本的亲缘关系,从50条随机引物中筛选出6条引物对四川乳肉兼用牛及其父母本进行扩增.6条RAPD引物共扩增出334个条带.将这些多态性条带进行聚类分析,结果显示:四川乳肉兼用牛与3个父母本品种牛的遗传差距并不大,在0.01～0.25之间,其中与西门塔尔牛遗传距离最近,与宣汉本地黄牛的遗传距离最远.这与传统的形态学结果一致.     

亚麻RAPD-PCR体系的优化及引物的筛选

[目的]优化亚麻RAPD反应条件,筛选亚麻RAPD引物。[方法]DNA条带扩增采用PCR技术,条带的分离采用琼脂糖凝胶电泳法,成像利用紫外成像系统。[结果]试验优化亚麻RAPD反应条件：25出反应体系中,含10×Buffer,Mg^2＋ （1mmol／L）,Taq酶1U,Genome DNA 50ng．dNTP 0．25mmol／L．RAPD primer1．5μmol／L。PER反应程序为：94℃预变性4min;97℃变性40s,37℃退火1min,72℃延伸90s,40个循环;72℃延伸10min。试验利用3个有代表性的亚麻品种从70条引物中筛选出12条多态性好,重复性高的引物。[结论]该试验筛选出12条引物,并优化了亚麻RAPD反应条件,为亚麻的分子鉴定奠定了基础。     

梨种质资源遗传多样性研究中的RAPD技术引物筛选

[研究目的]RAPD技术已广泛用于种质资源遗传多样性研究,中国梨属植物资源丰富,通过对RAPD多态性引物的筛选,为RAPD技术在梨属种质资源中的应用提供参考;[方法]以梨属44个种和品种为试验材料,通过RAPD扩增技术,筛选RAPD多态性引物;[结果]从50个随机引物中筛选出18个多态性引物,所选出的多态性引物每个引物扩增出的条带数在4～11之间,扩增出的DNA片段分子量大多在450～2000 bp之间,共扩增出118个条带,其中样品间相同的条带数有11条,呈现多态性的条带107条,所选引物的多态百分率达90.8%.[结论]所筛选的18个引物为梨属植物RAPD扩增多态性引物,可广泛用于梨属植物的RAPD扩增技术.     

越橘RAPD研究

采用RAPD分子标记分析了越橘的7个栽培品系,RAPD扩增条带有较强的多态性,多态性在33.3%～100%。聚类结果表明:越橘各种群间遗传距离相对较远,说明各种群地理起源上的差异。利用RAPD指纹图谱,用2个引物就可以很好地区别和鉴定供试的越橘品种和不同的种群。     

石斛兰品种遗传变异的RAPD检测

[目的]利用RAPD技术检测石斛兰品种的遗传变异性。[方法]以4个母本园石斛兰品种和1个试管苗品种为材料,经DNA提取后,采用10 bp随机引物进行RAPD检测其遗传变异性。[结果]绿意(Den.Burana Green)和粉红钻石(Den.Pink Thamond)2个母本园品种未发现变异,熊猫(Den.BigPanda)和泰国白(Den.Thailand White)2个母本园品种变异率分别为3.3%和23.3%;红索尼娅(Den.Red Sonia)试管苗变异率为10.9%。[结论]建立了石斛兰品种遗传变异的RAPD检测技术。     

基于RAPD的四川主要黑山羊品种的界定研究

从24个随机引物中筛选出16个重复性好的多态引物,对四川省9个主要地方黑山羊品种共计576只个体,进行随机扩增多态DNA分析。结果显示：16个引物扩增出125条谱带,其中102条表现出多态性,多态百分率为82.60%;不同引物所扩增出的DNA片断在各群体中的分布频率不同;9个黑山羊品种间的遗传距离指数在0.0365～0.2832,群体间的相似系数为0.7533～0.9642;由引物OPK-03550扩增出的片断在江安黑山羊中未出现,引物OPQ-06800和OPQ-06900扩增出的片断在乐至黑山羊中未出现,而分别其余8个受试群体均有出现,可各自作为区分该黑山羊群体与其余8个黑山羊品种的分子遗传标记。     

草地早熟禾种质资源遗传多样性的RAPD鉴定与分类研究

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)标记,筛选出69个随机引物对32份草地早熟禾品种遗传谱带进行分析,46个引物共扩增出了197条扩增片断,其中多态性带数为195条,每个引物扩增出1～9条多态性带,平均每条引物扩增出4.3条。根据Jaccard相似系数分析RAPD结果,并利用NTSYS软件,按UPGMA平均法进行聚类。结果表明,第一大组群包括18个品种,第二大组群包括3个品种,第三大组群包括2个品种,第四大组群包括8个品种,第五大组群仅1个品种,为C_2。